• Korean Chemical Engineering Research
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• 제49권6호
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• pp.840-845
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• 2011

아가로오스 분해산물은 생리활성이 우수하여 의약품 및 기능성 화장품 원료로 사용될 뿐만 아니라 바이오에탄올 생산을 위한 효모 발효용 기질로 검토되고 있어 상당한 주목을 받고 있다. 이에 따라 고성능 아가레이즈 탐색에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. 최근 본 연구팀에서는 남해안에서 신규 아가레이즈를 생산하는 미생물인 Pseudoalteromonas sp.를 분리하였다. 본 연구에서는 음이온교환수지를 이용하여 미생물 배양액으로부터 아가레이즈를 분리 정제하기 위한 크로마토그래피 조건을 최적화 하였다. 황산암모늄을 첨가하여 배양 상등액으로부터 침전된 단백질을 회수하고 이를 투석하여 조효소액을 얻었다. 음이온 교환수지인 DEAE-Sepharose 레진이 충진된 칼럼에 조효소액을 로딩하여 아가레이즈를 분리하였다. 410 ${\mu}g$의 단백질 로딩 시 흡착에 적합한 평형 pH는 7.5~8.0 이었고, 적정한 resin의 부피는 3 mL였다. 등용매 용출에서 용출액 중의 NaCl 농도가 증가함에 따라 용출되는 단백질 양이 증가하여 400 mM의 NaCl에서 최대에 달하였다. 최종적으로, NaCl 농도를 1,000 mM까지 선형적으로 증가시키며 아가레이즈를 분리하였다. Lugol 용액을 이용한 염색법으로 용리액 중의 아가레이즈의 존재를 확인하였다.

• BMB Reports
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• 제35권2호
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• pp.172-177
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• 2002

We previously reported that cholesteryl ester transfer protein (CETP) inhibitory peptides (designated $P_{28}$ and $P_{10})$ have anti-atherogenic effects in hypercholesterolemic rabbits (Biochim. Biophys. Acta (1998) 1391, 133-144). To further investigate those effects, we studied rabbit plasma that was collected after 30 h of a $P_{28}$ or $P_{10}$ injection. We found that there is a strong correlation between the in vivo CETP inhibition effects and alterations of lipoprotein particle size distribution in rabbit plasma, as determined on an agarose gel electrophoresis and gel filtration column chromatography. In vivo effects of the peptide were observed again in C57BL/6 mice that expressed simian CETP. The $P_{28}$ or $P_{10}$ peptide ($7\;{\mu}g/g$ of body weight) that was dissolved in saline was injected subcutaneously into the mice. The $P_{28}$ injection caused the partial inhibition of plasma CETP activity up to 50%, decreasing the total plasma cholesterol concentration by 30%, and increasing the ratio of HD/total-cholesterol concentration by 150% in the CETP-transgenic (tg) mice. The CETP inhibition by the $P_{28}$ or $P_{10}$ made alterations that modulated the size re-distribution of the lipoproteins in the blood stream. Particle size of the very low (VLDL) and low density lipoproteins (LDL) from the peptide-injected group was highly decreased compared to the saline-injected group (determined on the gel filtration column chromatography). In contrast, The HDL particle size of the $P_{28}$-injected group increased compared to the control group (saline-injected). The expression level of the CETP mRNA of the $P_{28}$-injected CETP-tg mouse appeared lower than the saline-injected CETP-tg mouse. These results suggest that the injection of the CETP inhibitory peptide could affect the CETP expression level in the liver by influencing lipoprotein metabolism.

• Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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• 제25권1호
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• pp.77-86
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• 1998

The uptake of glucose for metabolism and growth is essential to most animal cells and is mediated by glucose-transporter (GLUT) proteins. The aim of this study was to determine which class of glucose transporter molecules was responsible for uptake of glucose in the mouse early embryo and at which stage the corresponding genes were expressed. In addition, co-culture system with vero cell was used to investigate the effect of the system on GLUT expression. Two-cell stage embryos were collected from the superovulated ICR female and divided into 3 groups. As a control, embryos were cultured in 0.4% BSA-T6 medium which includes glucose. For the experimental groups, embryos were cultured in either co-culture system with vero cells or glucose-free T6 medium supplemented with 0.4% BSA and pyruvate as an energy substrate. 2-cell to blastocyst stage embryos in those groups were respectively collected into microtubes (50 embryos/tube). Total RNA was extracted and RT-PCR was performed. The products were analysed after staining ethidium bromide by 2% agarose gel electrophoresis. Blastocysts were collected from each group at l20hr after hCG injection. They were fixed in 2.5% glutaraldehyde, stained with hoechst, and mounted for observation. In control, GLUT1 was expressed from 4-cell to blastocyst. GLUT2 and GLUT3 were expressed in morula and blastocyst. GLUT4 was expressed in all stages. When embryos were cultured in glucose-free medium, no significant difference was shown in the expression of GLUT1, 2 and 3, compared to control. However GLUT4 was not expressed until morular stage. When embryos were co-cultured with vero cell, there was no significant difference in the expression of GLUT1, 2, 3 and 4 compared to control. To determine cell growth of embryos, the average cell number of blastocyst was counted. The cell number of co-culture ($93.8{\pm}3.1$, n=35) is significantly higher than that of control and glucose-free group ($76.6{\pm}3.8$, n=35 and $68.2{\pm}4.3$, n=30). This study shows that the GLUT genes are expressed differently according to embryo stage. GLUTs were detectable throughout mouse preimplantation development in control and co-culture groups. However, GLUT4 was not detected from 2- to 8-cell stage but detected from morula stage in glucose-free medium, suggested that GLUT genes are expressed autocrinally in the embryo regardless of the presence of glucose as an energy substrate. In addition, co-culture system can increase the cell count of blastocyst but not improve the expression of GLUT. In conclusion, expression of GLUT is dependent on embryo stage in preimplantation embryo development.

• 농업과학연구
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• 제26권2호
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• pp.33-38
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• 1999

재래산양의 유전자원 보존과 유전적 개량을 위하여 재래산양과 수입산양의 genomic DNA의 유전적 다형을 분석하기 위하여 수행되었으며 재래산양과 수입산양의 유전적 판별 분석은 RAPD 기법을 이용하였으며 공시품종은 재래산양 30두, 재래산양 교잡종 10두, 수입산양 10두를 이용하였다. 재래 산양육과 수입 산양육의 판별을 위한 시료는 재래 산양육 10두와 수입 산양육 10두를 이용하였다. 이들로부터 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 재래산양, 수입산양 및 재래산양 교잡종으로부터 추출된 genomic DNA는 전기영동에 의해 약 23kb 크기의 DNA을 얻을 수 있었으며 UV spectrophotometer를 이용하여 흡광도 A 260과 A 280의 비율로 측정한 결과, 그 비율이 1.75~2.10의 범위로 순도는 비교적 양호한 결과를 얻었다. 2. 순수 재래산양의 유전자원의 보존을 위한 재래산양의 유전자 감식여부를 탐색하기 위하여 약 110 여종의 random primer를 이용한 RAPD 기법에 의하여 재래산양, 수입산양 및 교잡종의 다형성을 분석한 결과 random primer OPO-19(5'-CAA ACG TCG G-3')를 이용하였을 때 재래산양에서만 396bp에서 band가 나타났으며 수입산양과 교잡종에서는 band가 나타나지 않았다. 3. 또한, 재래 산양육과 수입 산양육의 유전적인 차이를 구명하기 위하니 RAPD 기법에 의한 genomic DNA의 다형성 분석에 있어서도 random primer OPO-19(5'-CAA ACG TCG G-3')를 사용하였을 때 396bp에서 재래 산양육에서는 band가 나타났지만, 수입 산양육에서는 band가 나타나지 않았다.

• Journal of Periodontal and Implant Science
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• 제35권2호
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• pp.299-310
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• 2005

The severe form of chronic periodontitis(CP) has been reported to be strongly associated with the presence of allele 2 of composite IL-1B(+3954) and IL-1A(+4845) genetic polymorphisms(genotype positive). However, other studies have reported conflicting findings. These might have resulted from differences in ethnic background and disease entities. The aim of this study was to determine the distribution of IL-1A(+4845), IL-1B(+3954), IL-1B(-511), and IL-1 RN(VNTR) genetic polymorphisms in children as a future Korean population. The study population consisted of 92 children from the Dept. of Pediatric Dentistry, Chonnam National University Hospital. Genomic DNA was obtained from buccal swab. The IL-1A(+4845), IL-1B(+3954), and IL-1B(-511) genes were genotyped by amplifying the polymorphic region using multiplex polymerase chain reaction(PCR), followed by restriction enzyme digestion and gel electrophoresis. IL-1 RN(VNTR) polymorphism were then evaluated by PCR amplification and fragment size analysis in agarose gel. The allele 2 frequency was 41.3%, 4.3%, 47.8%, and 9.9% for IL-1A(+4845), IL-1B(+3954), IL-1B(-511), and IL-1 RN respectively. The frequency of genotype with allele 2 carriage for IL-1A(+4845), IL-1B(+3954), IL-1B(-511), and IL-1 RN was 77.1%, 7.6%, 63.0%, and 15.2% respectively. The allele 2 frequency in IL-1B(+3954) was significantly higher in female than in male population(p<0.05). The negative association was shown between the presence of allele 2 in IL-1B(-511) and in IL-1B(+3954), and the carriage rate of IL-1B(+3954) allele 2 tended to lower in IL-1B(-511) allele 2(P=0.056). Only 7.3% of children carried the composite genotype of IL-1A(+4845) and IL-1B(+3954). These results suggest that the polymorphism of IL-1B(+3954) and the positive composite genotype was relatively rare in Korean population.

• Journal of Periodontal and Implant Science
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• 제35권3호
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• pp.549-561
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• 2005

이 연구의 목적은 새로이 제작된 chitosan-poly(L-lactic acid)(PLLA) 다층 다공성 차폐막의 생체적합성 및 골세포활성도 및 골재생능을 평가하는 것이다. 제작된 차폐막을 24 well에 넣고 clonal osteoblast-like cell line(MC3T3-E1)을 접종한 군을 실험군으로, 차폐막을 사용하지 않은 대조군으로 하였다. 배양 1일, 7일 및 14일째에 각 well에서 세포수를 측정하였다. 주사전자현미경을 이용하여 차폐막에 부착된 세포의 형태관찰을 시행하였다. RNA 추출 및 RT-PCR을 실시한 후, agarose gel상에서 전기영동하여 조골세포 표식자인 collagen type I(COL), osteopontin(OP) 및 osteocalcin(OC) mRNA의 발현을 관찰하였다. 제작된 매트릭스의 생체적합성 및 골재생능을 관찰하기 위하여 백서의 두개골에 직경 8mm의 원형 결손부를 형성한 후 차폐막을 이식한 군을 실험군으로, 아무 것도 넣지 않은 군을 대조군으로 하여 4주 경과 후 실험동물을 희생시킨 후 조직학적관찰을 시행하였다. 시간경과에 따른 부착세포수 관찰결과, 배양 14일까지 조골세포의 수가 지속적으로 증가하였고, 주사전자현미경으로 세포의 형태 관찰결과, 배양된 세포들은 중층의 형태로 성장하면서 시간경과에 따라 세포가 응집되는 양상을 나타내었다. 관찰 기간동안 COL, OP, 및 OC mRNA의 발현이 관찰되어 배양 전 기간동안 조골세포의 형질이 잘 유지되고 있음을 알 수 있었다. 백서 두개골 결손부에 이식된 차폐막은 염증반응 없이 주위 조직과 우수한 생체적합성을 나타내었으며, 차폐막을 이식하지 하지 않은 대조군에 비해 높은 신생골 형성을 나타내었다. 이상의 관찰결과로 새로이 제작된 chitosan-PLLA 차폐막은 우수한 생체적합성 및 골재생능을 나타냄을 알 수 있었으며, 향후 이를 골조직 재생 및 치주조직유도재생 분야에 응용될 수 있을 것으로 생각된다.

• Journal of Radiation Protection and Research
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• 제33권2호
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• pp.53-59
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• 2008

X선과 같은 고에너지 방사선에 의한 DNA 손상 중 간접적인 손상을 확인하기 위하여 탄탈륨(Ta) 박막위에 동결건조 과정으로 만들어진 pGEM-3Zf(-) plasmid DNA 단일층(monolayer)의 박막을 만든 다음, 에너지가 1.5 keV인 Al $K{\alpha}$ X선을 0분, 3분, 7분, 10분 동안 초고진공 상태에서 이 DNA 단일층에 조사하여 평균 흡수선량(mean absorbed dose)의 변화에 따른 DNA 손상을 관찰하였다. 또한 3 eV의 낮은 에너지 전자선을 조사하여 그 결과를 X선을 조사한 경우와 비교하였다. X선과 낮은 에너지 전자선으로 조사된 plasmid DNA를 전기영동(electrophoresis) 방법을 이용해 supercoiled DNA와 unsupercoiled DNA로 분리한 후 각각을 정량적으로 분석하였다. Supercoiled DNA는 X선과 3 eV 전자선의 조사에 따른 평균흡수선량이 증가함에 따라 선형적으로 감소했다. 그와 반대로 circular DNA와 crosslinked form 1 DNA는 평균흡수선량이 증가함에 따라 선형적으로 증가했다. 이것은 supercoiled DNA가 낮은 에너지 전자와 상호작용하여 외가닥 절단(single strand break)을 일으켰고 그 결과 unsupercoiled DNA로 변화되었음을 보여준다. 본 실험을 통해 X선과 같은 고에너지 방사선에 의한 DNA의 간접적 손상이 일어남을 관찰할 수 있었고, DNA의 이온화 에너지보다 작은 에너지($0{\sim}10\;eV$)를 갖는 전자에 의해서도 DNA 손상이 일어날 수 있음을 확인할 수 있었다.

• 한국자원식물학회지
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• 제18권1호
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• pp.15-21
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• 2005

염류내성 식물은 염류농도의 변화에 따라 세포내의 삼투압을 유지하기 위한 화합물을 합성하는 기작을 가지고 있는데 이런 화합물은 주로 proline, glycine, betaine, polyols, sugar등으로 체내에 축적함으로서 고농도의 염류에 견디는 것으로 알려져 있다. Betaine은 미생물에서 2단계 반응을 통해 choline에서 합성되는데, 첫단계는 choline dehydrogenase (CDH)에 의해서 촉매되고(Bet A gene), bet B 유전자의 산물인 betaine aldehyde dehydrogenase(BADH)에 의해 수행된다. 본 실험에서는 Bet A, Bet B 유전자를 아그로박테리움에 도입하여 새로운 conjugants 2 종을 획득하였으며 (Agrobacterium tumefaciens MP90/pBet A, Agrobacterium tumefaciens MP90/pBet B), 먼저 재조합된 binary vector가 식물에서 발현 및 형질 전환되는지 여부를 조사하기 위해서 이미 담배에 형질전환을 시켰으며, 형질전환된 담배에서는 ,고농도의 kanamycin배지에서 생장이 가능하였고, PCR에 의하여 NPT II, Bet A, Bet B gene를 조사한 결과 담배 유식물체 모두 band가 형성되어 형질전환체임을 확인할 수 있었다. 인삼에 Beth, BetB gene의 도입은 1M의 mannitol이 함유된 식물호르몬 무첨가 MS 배지에서 단일배 발생방법에 형질전환체를 획득하였으나, 형질전환체의 발생빈도$(12\%)$가 매우 낮았다.

• 한국식품과학회지
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• 제37권4호
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• pp.611-617
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• 2005

본 연구에서는 E. coli. Salmonella, Shigella, Vibrio 등 4속의 주요 식중독유발 그람 음성 세균들을 대상으로 반복성 염기서열인 REP DNA sequence를 응용한 REP-PCR을 실시하였다. 이전의 보고에서 이들 4속의 식중독 유발세균 중 각각 혹은 일부를 대상으로 반복성 염기서열을 이용한 PCR을 적용한 사례는 있지만 그때 적용한 primer, PCR 반응조건 및 전기영동조건 등이 다양하였다. 그러므로 본 연구에서는 이와같은 4속의 세균들에 대하여 최적화된 동일한 primer와 PCR 반응조건 및 전기영동조건을 표준조건으로서 적용하였다. 그 결과로서 모든 4속의 식중독 세균 균주마다 REP-PCR 후 생성되는 fingerprinting pattern에서 속마다 1-3개의 공통적이며 독특한 band가 생성되는 것이 확인되어 이러한 pattern을 이용한 속 수준의 분리 동정과 그와 같은 주요 band들 이외의 부수적인 band들을 고려하여 종 수준까지의 분리도 가능함을 확인하였다. 따라서 본 연구를 통하여 반복적 DNA 염기서열을 이용한 REP-PCR이 주요 식중독 세균의 분리 동정 방법으로 사용될 수 있음을 확인하였다. 또한 본 연구를 통하여 얻은 결과는 더 많은 속(genus)의 식중독세균을 대상으로 한 새로운 분리 동정 방법을 확립하기 위하여 사용될 수 있을 것이다.

• 한국식품과학회지
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• 제35권4호
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• pp.591-597
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• 2003

국내에서 시판되는 감자와 수입 감자스낵류로부터 상용 DNA 추출 kit 및 CTAB-phenol/chloroform 추출법등을 이용하여 시료특성에 따른 genomic DNA를 추출방법을 선정하고 PCR 정성검사를 실시하였다. 생감자의 경우 STE 용액으로 과량의 전분을 제거한 다음 DNA를 추출한 경우 순도 높은 DNA를 추출할 수 있었으며 상용 추출 kit를 이용한 경우 lysis buffer와 함께 ${\alpha}-/{\beta}$-amylase를 각각 또는 혼합으로 처리하거나 추출된 DNA 용액에 마지막 단계에서 효소를 처리한 시료군에서 고순도의 DNA를 추출할 수 있었으며, 효소 처리군에서는 ${\alpha}-/{\beta}$-amylase를 혼합으로 처리한 경우에 DNA 추출수율이 높았다. 냉동가공감자의 경우 silica-coated bead법을 이용하여 효소를 처리한 경우와 CTAB-페놀 클로로포름 처리군에서 DNA가 추출되었다. 또한, 각 방법으로 추출한 DNA에 대하여 감자의 내인성 유전자인 Pss 프라이머를 사용하여 PCR을 한 결과 모든 시료에서 추출된 DNA에 대하여 내부표준유전자 증폭산물이 검출되었다. 고도의 가공처리를 거친 수입 감자스낵(fabricated potato chips)과 냉동가공 감자(frozen fried potato) 등은 계면활성제인 CTAB(cetyl trimethyl ammonium bromide)과 페놀-클로로포름 혼합액을 이용하여 추출하고 이를 template로 하여 PCR 증폭을 실시하였다. 그 결과, Fig. 8에 제시한 바대로 감자의 내인성 유전자인 Pss 특이적 산물인 216bp의 산물이 냉동감자가공품과 감자칩에서 검출되었으며 재조합유전자인 New leaf plus 유래의 증폭산물(234bp)와 New lear Y유래의 증폭산물(225bp)는 검출되지 않았다. 본 실험의 결과 시료의 가공특성과 적용한 추출 kit 및 방법에 따라 genomic DNA 순도 및 추출수율이 크게 차이가 났으며 이것이 결국 PCR 결과에 의음성 혹은 의양성 등에 영향을 미치게 될 것으로 판단된다. 또한, 동일한 DNA추출방법에 의해서도 DNA가 추출되지 않은 경우가 있어서 동일한 시료에서 2회 반복 추출하는 것이 의음성결과를 피할 수 있는 방법으로 판단된다.