• 제목/요약/키워드: Acid DNase

검색결과 23건 처리시간 0.027초

골육종의 생화학적 표지자에 관한 연구 (Biochemical Markers for Osteosarcoma)

  • 이창우;조우진;조재림;김태승;황건성
    • 대한골관절종양학회지
    • /
    • 제7권2호
    • /
    • pp.41-50
    • /
    • 2001
  • 목적 : 골육종 환자의 조직과 혈청에서 DNase, RNase, 5'-nucleotidase, alkaline phosphatase 및 amylase 활성도를 측정하여 그 활성도의 변동을 보았고 이들 효소가 골육종의 표지자로 이용될 수 있는지 알아보았다. 대상 및 연구방법 : 골육종 환자의 혈청과 종양조직은 1 2예로부터 얻었으며, 이에 대한 대조조직은 동일 환자의 정상부위에서 채취하였다. 조직 추출액을 얻어서 핵산, 단백함량, 그리고 효소 활성도의 측정에 사용하였다. DEAE-cellulose chromatography에 의해 골육종 조직의 acid DNase, neutral RNase, RNase inhibitor와 단백을 분리하고 그활성도와 단백 함량을 측정하였다. 결과 : 골육종 조직의 acid DNase, RNase, 5'-nucleotidase, alkaline phosphatase 활성도는 유의하게 상승하였고, 효소활성도의 양성율도 높게 나타났다. neutral RNase의 활성도가 특히 높았으며, RNase inhibitor는 neutral RNase와 복합을 이루면서 그 활성도가 유의하게 증가하였다. 혈청 neutral RNase 활성도가 유의하게 상승하였다. DEAE-cellulose column chromatography에 의해 acid DNase는 단일효소로서, 그리고 neutral RNase는 5개의 isozyme으로 분리되었다. 결론 : 이들 효소의 병용이 골육종의 생화학적 표지자로서 이용될 수 있을 가능성을 시사하였다. 또한 혈청 neutral RNase활성도의 측정이 골육종의 생화학적 표지자로서의 역할을 시사하였다. acid DNase와 neutral RNase가 골육종의 발생과 억제과정에 작용하고 있을 가능성을 시사하였다.

  • PDF

Fenbendazole에 저항성과 감수성을 지닌 염전위충의 분비배설물에서의 DNase 활성 비료 (Comparison of DNase activities from excretory/secretory productsof Haemonchus contortus fenbendazole-resistantand -susceptible isolates)

  • 곽동미
    • 대한수의학회지
    • /
    • 제44권3호
    • /
    • pp.455-462
    • /
    • 2004
  • Change in ${\beta}$-tubulin nucleic acid and protein sequences was the only known difference between Haemonchus contortus fenbendazole (FBZ)-resistant and -susceptible isolates. This change was sufficient to determine the pathologic effect induced by FBZ treatment. This research was initiated to investigate further differences from these two isolates. Since ${\beta}$-tubulin is involved in formation of microtubule, which has functions in secretory vesicle transport, DNase activities from excretory/secretory products (ESP) of the two isolates were compared, based on pH, sensitivity to DNase inhibitors, molecular masses and production of 3'-OH. The most significant difference detected was that a 38.5 kDa DNase activity was identified from ESP of H. contortus FBZ-susceptible isolates but not from those of H. contortus FBZ-resistant isolates. However, it was shown that the 38.5 kDa DNase is expressed with similar level of activity in intestine and whole worm of H. contortus FBZ-resistant and -susceptible isolates. This result demonstrated that the secretory transport pathway of the 38.5 kDa DNase was inhibited by unknown mechanisms, which may be related with ${\beta}$-tubulin sequence change in FBZ-resistant isolates. Other DNases of 34, 36 and 37 kDa were detected from ESP of both H. contortus FBZ-resistant and -susceptible isolates. Overall DNase activities found from ESP of these two isolates were not inhibited by 10 mM EDTA at pH 5.0, but largely inhibited by pH 7.0. In addition, DNase activities in two isolates produced DNA fragments with mixtures of 3'- hydroxyls (OH) and 3'-phosphates (P) at each pH although the 3'-end labeling ratios at pH 5.0 and 7.0 were shown different. Identification of inhibition of the 38.5 kDa DNase secretion in FBZ-resistant isolates suggests existence of further differences, in addition to ${\beta}$-tubulin sequence change, in two isolates. This shows complex effect of FBZ on H. contortus biological mechanisms.

Purification and Characterization of an Acid Deoxyribonuclease from the Cultured Mycelia of Cordyceps sinensis

  • Ye, Maoqing;Hu, Zheng;Fan, Ying;He, Ling;Xia, Fubao;Zou, Guolin
    • BMB Reports
    • /
    • 제37권4호
    • /
    • pp.466-473
    • /
    • 2004
  • A new acid deoxyribonuclease (DNase) was purified from the cultured mycelia of Cordyceps sinensis, and designated CSDNase. CSDNase was purified by $(NH_4)_2SO_4$ precipitation, Sephacryl S-100 HR gel filtration, weak anion-exchange HPLC, and gel filtration HPLC. The protein was single-chained, with an apparent molecular mass of ca. 34 kDa, as revealed by SDS-PAGE, and an isoelectric point of 7.05, as estimated by isoelectric focusing. CSDNase acted on both double-stranded (ds) and single- stranded (ss) DNA, but preferentially on dsDNA. The optimum pH of CSDNase was pH 5.5 and its optimum temperature 55. The activity of CSDNase was not dependent on divalent cations, but its enzymic activity was inhibited by high concentration of the cation: $MgCl_2$ above 150 mM, $MnCl_2$ above 200 mM, $ZnCl_2$ above 150 mM, $CaCl_2$ above 200 mM, NaCl above 300 mM, and KCl above 300 mM. CSDNase was found to hydrolyze DNA, and to generate 3-phosphate and 5-OH termini. These results indicate that the nucleolytic properties of CSDNase are essentially the same as those of other well-characterized acid DNases, and that CSDNase is a member of the acid DNase family. To our knowledge, this is the first report of an acid DNase in a fungus.

병원성(病原性) 포도구균(葡萄球菌)의 동정(同定)을 위한 Coagulase, Deoxyribonuclease (DNase) 및 내열성(耐熱性) Nuclease 생산능(生産能)의 비교(比較) (Comparison of Coagulase, Deoxyribonuclease (dnase), and Thermostable Nuclease Tests for Identification of Pathogenic Staphylococcus aureus)

  • 김종면;송희종;정옥봉
    • 대한수의학회지
    • /
    • 제21권2호
    • /
    • pp.99-104
    • /
    • 1981
  • A total of 251 clinical isolates (human origin, 43 strains and bovine udder origin 208 strains) of the Staphylococcus that fermented mannitol aerobically were tested for their ability to produce coagulase, DNase, and thermostable nuclease. Of these, 158 isolates coagulated human or bovine plasma, produced DNase, and thermostable, nuclease and were identified as St. aureous, 146 of which produced a 1+ to 3+ clot. The remaining 12 isolated produced a -clot in citrate treated plasma but produced 1+ to 3+ clot in ethylenedi-aminetetraacetic acid (EDTA) treated plasma. It was found that 7 coagulase positive isolates failed to produced thermostable nuclease. In these organisms, we found out of the clot formation is not by coagulase activity but utilization of citrate, because EDTA treated plasma is not coagulated. Among 93 isolates which did not coagulate citrate-or EDTA treated plasma and thermostable nuclease negative, 28 strains produced DNase were identified as St. epidermidis, and other strains were not identification further. It was found that thermostable nuclese production appears to be a consistent property of St. aureus and the test is easy to perform, is rapid became quite distinct within 2 to 4 hour, and is not influenced by as many factors and variations as the coagulase test.

  • PDF

Crlz1 promoter의 상위에 인접한 DNase I hypersensitive site 8의 enhancer 기능 (DNase I Hypersensitive Site 8 as an Enhancer is Mapped in the Upstream Vicinity of the Crlz1 Promoter)

  • 최승영;강창중
    • 생명과학회지
    • /
    • 제22권9호
    • /
    • pp.1201-1206
    • /
    • 2012
  • Crlz1 유전자는 B 세포 분화 과정 중 pre-B 세포 분화 단계에서 특이적으로 발현됨이 밝혀져 있다. Crlz1 유전자의 발현과 연관되는 3개의 DNase I hypersensitive site (HSS8, 9, 10)가 Crlz1 유전자의 전사 시작점으로부터 바로 위쪽의 chromatin 상에서 발견되었고, 그 중에서 HSS9/10은 Crlz1 promoter 지역에 해당하며 매우 높은 전사 활성을 가지는 것으로 이미 보고 되었다. 본 연구에서는 앞의 연구에서 더 나아가 HSS8이 Crlz1 promoter의 전사활성을 약 2 배 증가시키는 enhancer의 역할을 하고 있는 현상을 밝혔으며, 또한 HSS8의 위치가 Crlz1 유전자의 전사 시작점을 기준으로 하였을 때 -1055와 -1159 사이, 즉 104 bp 길이의 chromatin DNA 상에 존재하며, 이러한 HSS8의 위치는 luciferase reporter의 활성 측정으로 비교 분석되어진 deletion construct들의 전사 활성에 대한 결과와도 잘 부합되었다.

양식 넙치에서 분리한 Staphylococcus epidermidis의 생물학적 및 생화학적 특성 (The Biological and Biochemical Characteristics of Staphylococcus epidermidis Isolated from Diseased Cultured Flounder, Paralichthys olivaceus)

  • 심두생;정승희;박형숙;전세규
    • 한국어병학회지
    • /
    • 제7권1호
    • /
    • pp.23-36
    • /
    • 1994
  • 최근 7월부터 9월사이 고수온기에 경남일대의 육상수조식 넙치양식장에서 8균주의 Staphylococcus epidermidis를 분리하여 이들의 생물학적 및 생화학적 특성을 알아보았다. 분리균주는 BHIA, HIA, Staphylococcus No. 110 및 ETGP에서 잘 발육하였으며, 식염농도 2.0~3.0%, $30^{\circ}C$ 전후 그리고 pH는 7.0 전후에서 발육상태가 좋았다. 또한 DNase, coagulase에는 전 균주가 음성이었으며, 용혈성은 FSJ-2균주만이 약한 음성을 나타내었고, ureas 양성, novobiocin 저항성에는 음성을 나타내었다. 탄수화물의 분해능에서 전 균주는 가스를 생산하지 않았고 혐기적 조건하에서 포도당과 maltose를 분해하였으며 mannitol은 FSJ-19균주만이 약하게 분해한 것을 제외하고는 전 균주가 음성이었다. 호기적 조건하에서 전 균주는 포도당, fructose, galactose, sucrose, maltose 및 dextrin을 분해하였다. 분리균주의 임상적인 주요 특성에서 8개의 균주는 4가지의 다른 biotype code를 나타내었으며, 약제 감수성 그룹에서도 4가지의 다른 패턴을 나타내었다. 이상의 결과는 Bergey's manual of systematic bacteriology에 기재된 S. epidermidis의 coagulase, urease, DNase, $\beta$-galactosidase, novobiocin 저항성 및 포도당의 혐기적 분해성과 잘 일치하였고, 또한 Mickelsen et al.(1985)이 기재한 biotype과 약재 감수성 패턴이 잘 일치하여 본 분리균을 S. epidermidis로 동정하였다.

  • PDF

Proteus mirabilis 전사 조절 단백질의 DNA 결합 특성 (DNA Binding Specificity of Proteus mirabilis Transcription Regulator)

  • 강종백
    • 미생물학회지
    • /
    • 제47권2호
    • /
    • pp.158-162
    • /
    • 2011
  • Proteus mirabilis 전사 조절($\underline{P}$roteus $\underline{m}$irabilis $\underline{t}$ranscription $\underline{r}$egulator ) 단백질의 중금속 결합 부위에 대한 아미노산 서열분석에서 PMTR 단백질은 ZntR (아연 저항성) 단백질이 아닌 CueR (구리 저항성) 단백질과 동일한 환경이다. 그리고 겔시프트 법(gel shift assay) 실험에 의하면 PMTR 단백질은 Escherichia coli의 zntA (zinc-translocating P-type ATPase gene) 프로모터에 결합하지 않고 copA (copper-translocating P-type ATPase gene) 프로모터와 Proteus mirabilis에서 atpase (copper-translocating P-type ATPase gene) 프로모터에 결합하였다. DNase I protection 실험에서 PMTR 단백질 결합부위와 DNase I 민감성 염기들이 관찰되었다. P. mirabilis atpase 프로모터에서 민감성 염기로 주형가닥(template strand)에서 C와 A 그리고 비주형가닥(non-template strand)에서 G와 C 염기들이다. 이런 민감성 염기들은 다른 MerR 패밀리 단백질에서 또한 관찰되었으며, 이것은 단백질에 의한 DNA bending을 의미한다.

Role of Exopolymeric Substances (EPS) in the Stability of the Biofilm of Thiomonas arsenivorans Grown on a Porous Mineral Support

  • Michel, Caroline;Garrido, Francis;Roche, Emilie;Belval, Sylvain Challan;Dictor, Marie-Christine
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제21권2호
    • /
    • pp.183-186
    • /
    • 2011
  • Biochemical methods were selected to evaluate the role of exopolymeric substances in the stability of biofilms used in bioremediation processes. Biofilms of Thiomonas arsenivorans formed on pozzolana were thus treated with pronase (protein target), lectins (Con A or PNA), calcofluor or periodic acid (polysaccharides target), DNase (DNA target), and lipase (triglycerides target). Neither protease nor DNase treatments had any effect on bacterial adhesion. Lectins and calcofluor treatments mainly affected young biofilms. Lipase treatment had a noticeable effect on biofilm stability whatever the biofilm age. Results suggest that it would be an increased resistance of mature biofilms that protects them from external attacks.

Biochemical thuringiensis, 23 serovars의 생화학적 특성 (Biochemical characterization of Bacillus thuringiensis, 23 serovars)

  • Lee, Hyung-Hoan;Park, Mi-Yeoun;Lee, Chang-Woon
    • 한국미생물·생명공학회지
    • /
    • 제14권2호
    • /
    • pp.205-208
    • /
    • 1986
  • Bacillus thuringiensis 균주중 23 serovars의 생화학적 특성을 비교 연구하였다. 23개의 혈청성 균주는 모두 그람염색에 양성반응을 나타냈고, 내독소와 아포를 형성하며, KIA배지에서 산과 알칼리를 생산하고, 포도당배지에서 깨스를 생산하며, 전분을 가수분해하고, nitrate을 환원하나, H$_2$S 와 indole을 생산하지 않았고, 또한 lysine, ornithine, phenylalanine, malonate, lactose, dulcitol, adonitol, inositol, sorbitol, arabinose, raffinose, rhamnose, maltose, xylose을 분해치 않고, oridase를 생산하지 않았다. 18 serovars는 MR 검사에서 양성 이였고, 15 serovars는 VP검사에서 양성이였다. 4 serovars 는 citrate을 이용했다. 5 serovars는 포도당 배지에서 산을, 2 serovars는 DNase를, 15 serovars는 lecithinase를 생산했다. 12 serovars는 arginine을, 11 serovars는 sucrose를, 2 serovars는 manitol을, 9 serovars는 salicin을 분해했다. serovar tochigiensis만이 hemolysis를 하지 않았다.

  • PDF

바이칼의 담수 스폰지에서 분리한 방선균의 특성 연구 (Characterization of Actinomyces Isolated from Freshwater Sponges in Lake Baikal)

  • 정유정;정요찬;안태석
    • 미생물학회지
    • /
    • 제47권2호
    • /
    • pp.130-136
    • /
    • 2011
  • 러시아의 바이칼에 존재하는 고유종인 Baikalospongia과 Lubomirskia의 sponge로부터 방선균을 분리하였다. 분리된 방선균은 16S rRNA gene 분석 결과, Streptomyces griseoplanus, S. halstedii, S. violascens, S. flavovirens, S. microflavus에 각각 속하였다. 이 방선균들은 온도, 탄소이용, enzyme 활성, fatty acid 조성 등의 실험 결과에서, 각각 서로 다른 특징을 나타냈었다. 분리된 방선균의 배양온도는 30-37, pH는 8-9, 염분농도는 0-1.5에서 가장 잘 자라는 것으로 확인되었다. 주요 cellular fatty acid는 anteiso-$C_{15:0}$, iso-$C_{15:0}$ and iso-$C_{16:0}$로 나타났다. 특히 ATS-BA-19는 DNase와 chitinase 활성을 나타내었고, ATS-BA-16는 cellulase와 protease 활성을 나타내는 것으로 확인되었다. 또 두개의 분리된 방선균에서 그람음성 균주인 Pseudomonas aeruginosa에서 생장을 저해함을 확인하였다.