By using DL-acetonitrile as enzyme inducer, 90 bacteria were isolated from a field soil. Among the isolated strains, the strain WJ-003 showed the highest activity for production of D-lactic acid from DL-lactonitrile, and was partially identified as Pseudomonas sp. The production condition of D-lactic acid from DL-lactonitrile using resting cells as an enzyme source was optimized as follows: the reaction mixture contained 10 mM of DL-lactonitrile, 20 g of wet cells in 11 of 20 mM potassium phosphate buffer (pH 7.0) and the reaction was carried out at $30^{\circ}C$. After 18 h of reaction, 0.843 g/l of D-lactic acid was produced which corresponded to a conversion ratio of 93.7% and an optical purity of 99.8%. Additionally, when 10 mM of DL-lactonitrile was added once more to the reaction mixture at 14 h, 1.64 g/1 of D-lactic acid was produced after 28 h. In this experiment, the conversion ratio was 91.1% and optical purity 99.8%.
Acanthoside-D, contained in Acanthopanax chilsanensis is known as a ginseng-like substance. This work was focused to set up analytical and preparative conditions for Acanthoside-D purification. The ethanol extract from the powder of the trunk of Acanthopanax chilsanensis was partitioned with hexane. A $\mu$-Bondapak $C_{18}$ (3.9$\times$300 mm, $10\mu\textrm{m}$) column was used to separate Acanthoside-D from the trunk of Acanthopanax chilsanensis. From the experimental results, the mobile phase used for isolating Acanthoside-D from the extract was water/acetonitrile/methanol=80/14/6 %(v/v). The flow rate of mobile phase was 1.0 mL/min, and UV wavelength was fixed at 210 nm. Finally on a semi-preparative column (3.9$\times$ 300 mm, $15\mu\textrm{m}$, Lichrospher 100RP-18) with the same mobile phase composition, the allowable maximum injection volume increased to 250 $\mu\ell$
The nucleophilic substitution reactions of Y-O-aryl phenyl phosphonochloridothioates with substituted anilines ($XC_6H_4NH_2$) and deuterated anilines ($XC_6H_4ND_2$) are kinetically investigated in acetonitrile at $55.0^{\circ}C$. The deuterium kinetic isotope effects (DKIEs) invariably increase from an extremely large secondary inverse ($k_H/k_D$ = 0.439; min) to a primary normal ($k_H/k_D$ = 1.34; max) as both substituents of nucleophile (X) and substrate (Y) change from electron-donating to electron-withdrawing. These results are opposite to the DKIEs on Y-O-aryl methyl phosphonochloridothioates, and can be rationalized by the gradual transition state (TS) variation from backside to frontside attack. The trigonal bipyramidal pentacoordinate TS is proposed for a backside attack, while the hydrogen-bonded, four-center-type TS is proposed for a frontside attack. The negative values of the cross-interaction constants (${\rho}_{XY(H)}$ = -0.38 for $XC_6H_4NH_2$ and ${\rho}_{XY(D)}$ = -0.29 for $XC_6H_4ND_2$) indicate that the reactions proceed by a concerted $S_N2$ mechanism.
The nucleophilic substitution reactions of 1,2-phenylene phosphorochloridate (1) with substituted anilines ($XC_6H_4NH_2$) and deuterated anilines ($XC_6H_4ND_2$) are investigated kinetically in acetonitrile at $-15.0^{\circ}C$. The studied substrate of 1,2-phenylene phosphorochloridate is cyclic five-membered ring of phosphorus ester, and the anilinolysis rate of 1 is much faster than its acyclic analogue (4: ethyl phenyl chlorophosphate) because of extremely small magnitude of the entropy of activation of 1 compared to 4. The Hammett and Bronsted plots exhibit biphasic concave upwards for substituent X variations in the nucleophiles with a break point at X = 3-Me. The values of deuterium kinetic isotope effects (DKIEs; $k_H/k_D$) change from secondary inverse ($k_H/k_D$ < 1) with the strongly basic anilines to primary normal ($k_H/k_D$ > 1) with the weakly basic anilines. The secondary inverse with the strongly basic anilines and primary normal DKIEs with the weakly basic anilines are rationalized by the transition state (TS) variation from a predominant backside attack to a predominant frontside attack, in which the reaction mechanism is a concerted $S_N2$ pathway. The primary normal DKIEs are substantiated by a hydrogen bonded, four-center-type TS.
The nucleophilic substitution reactions of bis(N,N-dimethylamino) phosphinic chloride (3) with substituted anilines ($XC_6H_4NH_2$) and deuterated anilines ($XC_6H_4ND_2$) are investigated kinetically in acetonitrile at $65.0^{\circ}C$. The anilinolysis rate of 3 is rather slow to be rationalized by the conventional stereoelectronic effects. The magnitudes of ${\rho}_X$ (= -6.42) and ${\beta}_X$ (= 2.27) values are exceptionally great. The deuterium kinetic isotope effects (DKIEs; $k_H/k_D$) are secondary inverse ($k_H/k_D$ = 0.69-0.96). A concerted $S_N2$ mechanism involving a backside attack is proposed on the basis of secondary inverse DKIEs and the variation trend of the $k_H/k_D$ values with X. The anilinolyses of six phosphinic chlorides in MeCN are briefly reviewed by means of DKIEs, steric effects of the two ligands, positive charge of the reaction center phosphorus atom, and selectivity parameters to obtain systematic information on phosphoryl transfer reaction mechanism.
The kinetic studies on the reactions of dipropyl chlorophosphate (3O) with substituted anilines ($XC_6H_4NH_2$) and deuterated anilines ($XC_6H_4ND_2$) have been carried out in acetonitrile at $55.0^{\circ}C$. The obtained deuterium kinetic isotope effects (DKIEs; $k_H/k_D$) are primary normal ($k_H/k_D$ = 1.09-1.01) with the strongly basic anilines while secondary inverse ($k_H/k_D$ = 0.74-0.82) with the weakly basic anilines. The steric effects of the two ligands on the rates are extensively discussed for the anilinolyses of the ($R_1O$)($R_2O$)P(=O or S)Cl-type chlorophosphates and chlorothiophosphates. A concerted mechanism is proposed with a frontside nucleophilic attack involving a hydrogen-bonded four-center-type transition state for the strongly basic anilines and with a backside attack transition state for the weakly basic anilines on the basis of the DKIEs, primary normal and secondary inverse with the strongly and weakly basic anilines, respectively.
The aminolyses of anilinothioethers $(C_6H_5N(CH_3)CH_2SC_6H_4Z)$ in acetonitrile with benzylamines $(XC_6H_4CH_2NH_2)$ have been investigated. The rates are much lower in acetonitrile than in methanol (with aniline). The Bronsted ${\beta}_X$ values are similar but ${\beta}_Z$ values are smaller compared to those for the reactions in MeOH with anilines. The large negative ${\rho}_{XZ}({\cong}-0.8$, after correction for fall-off) value is interpreted to indicate a frontside attack $S_N2$ mechanism, in which the two oppositely changed reaction centers in the TS, $-N^{{\delta}+}{\cdots}S^{{\delta}-}-$, are in close vicinity increasing the interaction between nucleophile and leaving group. The inverse secondary kinetic isotope effects ($k_H/k_D$ < 1.0) are observed with deuterated benzylamines $(XC_6H_4CH_2ND_2)$.
Prajapati, Ritu;Seong, Su Hui;Kim, Hyeung Rak;Jung, Hyun Ah;Choi, Jae Sue
Natural Product Sciences
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v.26
no.3
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pp.214-220
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2020
Brassica oleracea var. gongylodes (red kohlrabi) is a biennial herbaceous vegetable whose edible bulbotuber-like stem and leaves are consumed globally. Sliced red kohlrabi tubers were extracted using methanol and the concentrated extract was partitioned successively with dichloromethane (CH2Cl2), ethyl acetate (EtOAc), n-butanol (n-BuOH) and water (H2O). Repeated column chromatography of EtOAc fraction through silica, sephadex LH-20 and RP-18 gel led to isolation of eleven compounds of which compound 1 was a new glycosylated indole alkaloid derivative, 1-methoxyindole 3-carboxylic acid 6-O-β-D-glucopyranoside. Others were known compounds namely, β-sitosterol glucoside (4), 5-hydroxymethyl-2-furaldehyde (5), methyl-1-thio-β-D-glucopyranosyl disulfide (6), 5-hydroxy-2-pyridinemethanol (7), (3S,4R)-2-deoxyribonolactone (8), n-butyl-β-D-fructopyranoside (9), uridine (10) and three fructose derivatives, D-tagatose (11), β-D-fructofuranose (12) and β-D-fructopyranose (13). Similarly, isolation from CH2Cl2 fraction gave two known indole alkaloids, indole 3-acetonitrile (2) and N-methoxyindole 3-acetonitrile (3). The structure elucidation and identification of these compounds were conducted with the help of 13C and 1H NMR, HMBC, HMQC, EIMS, HR-ESIMS and IR spectroscopic data, and TLC plate spots visualization. Compounds 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 and 9 are noted to occur in kohlrabi for the first time. Different bioactivities of these isolated compounds have been reported in literature.
Nucleophilic substitution reactions of Y-aryl methyl (8) and Y-aryl propyl (10) chlorothiophosphates with substituted anilines and deuterated anilines are investigated kinetically in acetonitrile at $55.0^{\circ}C$. A concerted mechanism is proposed for 8 based on the negative ${\rho}_{XY}$ (= -0.23) value, while a stepwise mechanism with a rate-limiting leaving group departure from the intermediate is proposed for 10 based on the positive ${\rho}_{XY}$ (= +0.68) value. The deuterium kinetic isotope effects (DKIEs; $k_H/k_D$) are 0.89-1.28 and 0.62-1.20 with 8 and 10, respectively. Primary normal and secondary inverse DKIEs are rationalized by a frontside attack involving hydrogen bonded, four-center-type transition state and backside attack involving in-line-type transition state, respectively.
Barai, Hasi Rani;Adhikary, Keshab Kumar;Lee, Hai Whang
Bulletin of the Korean Chemical Society
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v.34
no.6
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pp.1829-1834
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2013
The nucleophilic substitution reactions of Y-aryl ethyl isothiocyanophosphates with substituted X-anilines and deuterated X-anilines were investigated kinetically in acetonitrile at $75.0^{\circ}C$. The free energy relationships with X in the nucleophiles exhibited biphasic concave downwards with a break point at X = H. A stepwise mechanism with rate-limiting bond formation for strongly basic anilines and with rate-limiting bond breaking for weakly basic anilines is proposed based on the negative and positive ${\rho}_{XY}$ values, respectively. The deuterium kinetic isotope effects (DKIEs; $k_H/k_D$) changed gradually from primary normal with strongly basic anilines, via primary normal and secondary inverse with aniline, to secondary inverse with weakly basic anilines. The primary normal and secondary inverse DKIEs were rationalized by frontside attack involving hydrogen bonded, four-center-type TSf and backside attack involving in-line-type TSb, respectively.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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