본 연구는 백포도주의 첨가량(0, 3.75, 7.24, 10.48, 13.50%)을 달리하여 제조한 무 피클을 0, 1, 2, 3, 4주까지 저장하면서 품질특성을 살펴보았다. 피클과 조미액의 당도는 백포도주의 첨가량이 증가함에 따라 유의적(p<0.001)으로 감소하였으며, 저장기간이 경과함에 따라 역시 감소하였다. 피클과 조미액의 염도는 백포도주의 첨가량이 증가하고, 저장기간이 길어짐에 따라 유의적(p<0.001)으로 감소하였다. 피클과 조미액의 pH는 백포도주 첨가량에 따라 유의적(p<0.001)으로 높게 나타났으며, 0~4주의 저장기간에 따라서는 유의적(p<0.001)으로 감소하였다. 조미액의 L값은 백포도주의 첨가량이 증가함에 따라 유의적(p<0.001)으로 증가하였으며, a값과 b값은 감소하는 경향을 나타내었고, 무피클의 L값은 백포도주의 첨가량이 증가함에 따라 유의적(p<0.001)으로 감소하였으며, a값과 b값은 증가하는 경향을 나타내었다. 무 피클의 경도는 백포도주의 첨가량이 증가할수록 제조 1주후까지는 유의적(p<0.001)으로 증가하는 경향을 나타내었다. 하지만, 저장기간이 경과함에 따라서는 유의적(p<0.001)으로 감소하였다. 관능검사 결과 외관, 맛, 전반적인 기호도에서 백포도주 10.48%를 첨가한 무 피클이 가장 높게 나타났다. 백포도주를 첨가한 피클의 품질특성을 살펴본 결과, 백포도주를 첨가하지 않은 대조군에 비해 아삭함이 오랜 기간 동안 유지되고, 비교적 높은 기호도 및 관능검사의 결과를 나타내어 백포도주를 첨가하는 것이 피클의 저장기간에 따른 품질특성을 높이는데 도움이 될 것이라 판단된다.
The mitogen-activated protein kinase HOG1 (high-osmolarity glycerol response pathway) plays a crucial role in the response of yeast to hyperosmotic shock. Trichosporonoides oedocephalis produces large amounts of polyols (e.g., erythritol and glycerol) in a culture medium. However, the effects of HOG1 gene knockout and environmental stress on the production of these polyols have not yet been studied. In this study, a To-HOG1 null mutation was constructed in T. oedocephalis using the loxP-Kan-loxP/Cre system as replacement of the targeted genes, and the resultant mutants showed much smaller colonies than the wild-type controls. Interestingly, compared with the wild-type strains, the results of shake-flask culture showed that To-HOG1 null mutation increased erythritol production by 1.44-fold while decreasing glycerol production by 71.23%. In addition, this study investigated the effects of citric acid stress on the T. oedocephalis HOG1 null mutants and the wild-type strain. When the supplementation of citric acid in the fermentation medium was controlled at 0.3% (w/v), the concentration of erythritol produced from the wild-type and To-HOG1 knockout mutant strains improved by 18.21% and 21.65%, respectively.
Kim, Yun Hee;Song, Hyun-Ok;Ko, Kyung Min;Singaravelu, Gunasekaran;Jee, Changhoon;Kang, Junsu;Ahnn, Joohong
Molecules and Cells
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제25권4호
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pp.566-571
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2008
Calcineurin (Cn) is a calcium/calmodulin-dependent serine/threonine protein phosphatase that has diverse functions in different cell types and organisms. We screened proteins interacting with the C. elegans CnA homolog, TAX-6, by the yeast two-hybrid system. CNP-3 (Calcineurin interacting protein-3) is a novel protein that physically interacts with the catalytic domain of TAX-6. It is strongly expressed in the nuclei of intestine, hypodermis, dorsal uterine regions and spermatheca. Expression begins around the 60-cell stage and proceeds during all larval stages and the adult. To elucidate the biological function of cnp-3 we isolated a cnp-3 deletion mutant. Since CNP-3 binds CnA, we looked at factors associated with calcineurin loss-of-function mutants, such as brood size, body size, serotonin- and levamisole-mediated egg-laying behavior. The cnp-3(jh145) single mutant had no gross defects compared to wild-type animal. However, the phenotypes of the double mutants, tax-6(p675);cnp-3(jh145) and cnb-1(jh103);cnp-3(jh145), were more severe in terms of brood size, body size and serotonin-mediated egg-laying defects than tax-6(p675) and cnb-1(jh103), respectively. These results suggest that dysfunction of cnp-3 enhances certain calcineurin loss-of-function phenotypes in C. elegans.
To investigate the genetic relationship among 12 species belonging to the Fusarium section Martiella, Dlaminia, Gibbosum, Arthrosporiella, Liseola and Elegans, the internal transcribed spacer(ITS) regions of ribosomal DNA (rDNA) were amplified with primer pITS1 and pITS4 using the polymerase chain reaction(PCR). After the amplified products were digested with 7 restriction enzymes, restriction fragment length polymorphism (RFLP) patterns were analyzed. The partial nucleotide sequences of the ITS region were determined and compared. Little variation was observed in the size of the amplified product having sizes of 550bp or 570bp. Based on the RFLP analysis, the 12 species studied were divided into 5 RFLP types. In particular, strains belonging to the section Martiella were separated into three RFLP types. Interestingly, the RFLP type of F. solani f. sp. piperis was identical with that of isolates belonging to the section Elegans. In the dendrogram derived from RFLP analysis of the ITS region, the Fusarium spp. examined were divided into two major groups. In general, section Martiella excluding F. solani f. sp. piperis showed relatively low similarity with the other section. The dendrogram based on the sequencing analysis of the ITS2 region also gave the same results as that of the RFLP analysis. As expected, 5.8S, a coding region, was highly conserved, whereas the ITS2 region was more variable and informative. The difference in the ITS2 region between the length of F. solani and its formae speciales excluding F. solani f. sp. piperis and that of other species was caused by the insertion/deletion of nucleotides in positions 143-148 and 179-192.
Background: Brucella infection induces brucellosis, a zoonotic disease. The intracellular circulation process and virulence of Brucella mainly depend on its type IV secretion system (T4SS) expressing secretory effectors. Secreted protein BspJ is a nucleomodulin of Brucella that invades the host cell nucleus. BspJ mediates host energy synthesis and apoptosis through interaction with proteins. However, the mechanism of BspJ as it affects the intracellular survival of Brucella remains to be clarified. Objectives: To verify the functions of nucleomodulin BspJ in Brucella's intracellular infection cycles. Methods: Constructed Brucella abortus BspJ gene deletion strain (B. abortus ∆BspJ) and complement strain (B. abortus pBspJ) and studied their roles in the proliferation of Brucella both in vivo and in vitro. Results: BspJ gene deletion reduced the survival and intracellular proliferation of Brucella at the replicating Brucella-containing vacuoles (rBCV) stage. Compared with the parent strain, the colonization ability of the bacteria in mice was significantly reduced, causing less inflammatory infiltration and pathological damage. We also found that the knockout of BspJ altered the secretion of cytokines (interleukin [IL]-6, IL-1β, IL-10, tumor necrosis factor-α, interferon-γ) in host cells and in mice to affect the intracellular survival of Brucella. Conclusions: BspJ is extremely important for the circulatory proliferation of Brucella in the host, and it may be involved in a previously unknown mechanism of Brucella's intracellular survival.
Severe combined immunodeficiency (SCID) is a life-threatening syndrome of recurrent infections and gastro-intestinal alterations due to severe compromise of T cells and B cells. Clinically, most patients present symptoms before the age of 3 months and without intervention SCID usually results in severe infections and death by the age of 2 years. Its association with intestinal anomalies as multiple intestinal atresias (MIA) is rare and worsens the prognosis, resulting lethal. We describe the case of a four year-old boy with SCID-MIA. He presented at birth with meconium peritonitis, multiple ileal atresias and underwent several intestinal resections. A targeted Sanger sequencing revealed a homozygous 4-bp deletion ($c.313{\Delta}TATC$; p.Y105fs) in tetratricopeptide repeat domain 7A (TTC7A). He experienced surgical procedures including resection and stricturoplasty. Despite parenteral nutrition-associated liver disease, the patient is surviving at the time of writing the report. Precocious immune system assessment, scrutiny of TTC7A mutations and prompt surgical procedures are crucial in the management.
To investigate the mutational spectrum of laccase (Lac) genes (lac -A and lac -B) involved in degrading lignin which is the recalcitrant cell wall polymer, the genes of the Pleurotus ostreatus mutants induced by gamma ray radiation were amplified by PCR and were cloned. All partial lac-A genes of 4 mutants (PO-6, -7, -14 and -15) consisted of 1763 base pairs due to the deletion of two bases (491-nt and 492-nt) and addition of one base (875-nt) in 1764 base pairs of lac -A gene of PO-1. Totally 36 mutational hot spots were detected and 32 positions were mutated in all of those 4 mutants simultaneously. These mutations were predominantly A : T -> G : C transitions (40%). Putative amino acid sequences of lac -A genes of mutants have one simultaneous mutated residue (from Thr-44 to Ala-44). The 1764 bp of partial lac -B gene was cloned only in PO -5 mutant and contained 19 mutated bases. These mutations were predominantly G : C->A : T transitions (45%). Lac-B protein of PO-5 has two mutated residues of Glu-290 and His-363 from Ala-290 and Phe-363, respectively. The hyper-mutational positions were concentrated in specific regions of between 50-nt and 900-nt in lac genes. These results suggested that the mutational hotspots responded to gamma radiation could be in some genes, at least lac -A and lac -B of p. ostreatus.
컴퓨터 세포동결기를 이용하여 생쥐 배아를 동결할 때 액체질소 (L$N_2$)의 분사속도가 해빙 후 배아의 미세구조, 기능 및 발달에 미치는 영향을 알아보고자 하였다. 이를 위해 배아는 동결을 하지 않은 대조군 (control) 및 동결군에서 L$N_2$의 분사속도에 따라 고속분사군 (120 infusion/min group 1), 저속분사군 (50 infusion/min; group 2)으로 나누었다. ICR 계열의 생쥐의 2 세포기 배아를 사용하였으며, 동결 및 해빙은 저속동결-급속해빙 방법을 사용하였다. 각 군에 따라 해빙 후 배아의 생존율과 세포질이 양호하고 분절화가 없는 2세포기 배아를 대상으로 포배 발달율 및 할구수를 측정하였다. 공초점 현미경을 이용하여 배아 내에서의 $H_2O$$_2$, 활성 미토콘드리아의 분포, 막전위차 및 actin filament를 측정하였으며, TUNEL 방법을 이용하여 DNA 분절화를 확인하였다. 동결-해빙 후 건강한 2 세포기 배아의 회수율은 group 1 (50.7%)에 비해 group 2 (34.6%)에서 현저히 감소했다 (p<0.05). 포배기 배아의 발생율 (86.7%, 76.7% vs. 44.0%)과 할구수 (79.5$\pm$12.9, 71.6$\pm$8.0 vs. 62.5$\pm$4.7)는 대조군 혹은 group 1에 비해 group 2에서 유의한 차이를 보였다 (p<0.05). H$_2$0$_2$의 상대적 강도는 group 2에서 유의하게 증가하였다 (15.3$\pm$3.0, 16.6$\pm$1.6 vs. 23.4$\pm$1.8, p<0.05). 활성 미토콘드리아의 분포는 정상적인 배아에서는 균등하게 분포하는 반면 배발달이 정지된 배아에서는 원형질막 주위에 몰리고 응집된 양상을 보였다. 그러나 대조군, group 1, group 2에서는 모두 균등하게 분포하여 각 군간에 차이가 없었다. 미토콘드리아의 JC-1 염색 결과는 대조군과 group 1의 경우 590 nm의 파장으로 발산되는 미토콘드리아가 group 2에 비하여 유의하게 증가하였다 (17.2$\pm$3.8, 17.4$\pm$1.3 vs. 13.2$\pm$2.0, p<0.05). 2세포기 배아내 미세섬유 (actin filament)는 대조군 및 group 1의 경우 균일하게 분포하는 반면, group 2에서는 부분적인 결손과 응집현상이 관찰되었다. DNA 분절율 (30.8%, 36.0% vs. 65.6%; p<0.05)은 group 2에서 유의하게 증가하였다. 동결시 액체질소의 분사속도는 해빙 후 배아 발달에 매우 중요한 요인으로 작용하며, L$N_2$의 분사속도의 증가는 동결과 정에서 하강 온도의 미세한 변화를 감소시켜 세포내 골격구조와 미토콘드리아의 상해를 감소시켜 $H_2O$$_2$의 발생과 DNA 분절화를 감소시켜 배아 발생을 호전시키는 것으로 사료된다.
방향족 화합물은 독성 환경오염물질로 생태계와 인간의 건강에 해로운 영향을 미친다. 그중 chlorotoluene과 nitrotoluene 화합물은 수생생물에 독성을 나타내며 인간의 피부, 눈, 호흡기를 자극한다. 본 연구에서는 폐수의 chlorotoluene과 nitrotoluene 화합물을 저렴하고 간단하게 검출하고자 재조합 미생물 바이오센서를 개발하였다. BTEX (benzene, toluene, ethylbenzene, xylene) 분해 조절 유전자 xylR를 Po' (upstream activating sequences를 제거한 DmpR 조절단백질 promoter Po) 또는 Pu (XylR 고유의 프로모터)::lacZ 유전자(${\beta}$-galactosidase 유전자)의 upstream에 연결한 플라스미드를 제작한 후, E. coli $DH5{\alpha}$에 형질 전환하였다. 유도 화합물 존재 하에서, 아가로스에 고정된 이 재조합 바이오센서 세포는 유도 화합물에 의해 ${\beta}$-galactosidase를 발현하고 기질인 chlorophenol red ${\beta}$-D-galactopyranoside (CPRG)를 분해하여 1~2시간에 붉은색을 나타내었다. BTEX 화합물 중, 특이적으로 o-, m-, p-chlorotoluene ($0.1{\mu}M-100 mM$) 그리고 o-, m-, p-nitrotoluene (0.1 mM-100 mM)에서 높은 반응을 나타내었으며 Po'가 Pu보다 높은 반응성을 보여주었다. 아가로스에 고정된 바이오센서는 $4^{\circ}C$에서 21일간 보존 후에도 활성의 큰 변화 없이 안정하였으며, chlorotoluene과 nitrotoluene 화합물들로 spike된 전처리 하지 않은 폐수 시료 중에서도 좋은 반응을 보여 주어 폐수 중 chlorotoluene과 nitrotoluene 화합물의 간단한 초기 검출에 활용될 수 있음을 제시하였다.
흑두로 제조한 청국으로부터 혈전용해력이 우수한 균을 선발하여 동정하였으며, 그를 Bacillus subtilis BB-1로 명명하였다. 이 균은 혈전용해효소 isozyme을 적어도 5개이상 생성하는 균주로 확인되었다. 이 균으로부터 크로모좀을 분리하여 shot gun법으로 혈전용해효소 유전자를 크로닝하였으며, 이 유전자를 BSF-1이라 명명하였다. 이 유전자는 714개의 아미노산을 암호화하고 있으며 기존에 밝혀진 혈전용해효소 유전자와 상동성은 검출되지 않은 새로운 혈전용해효소 유전자였다. 혈전용해효소활성 최적 pH 및 온도는 5.0과 $35^{\circ}C$였다. 기질특이성은 적혈구 배지 또는 skim milk, gelatin등에 전혀 분해활성이 없었다. 이는 혈전만을 특이적으로 분해하는 기질특이성을 보였으며, 혈전분해효소로서의 이용가능성이 충분한 것으로 판단된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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