• 제목/요약/키워드: 1,4-Diketopiperazine

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동충하초의 Diketopiperazine 성분 (Diketopiperazines from Cordyceps militaris)

  • 김선범;황방연;이미경
    • 생약학회지
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    • 제44권4호
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    • pp.336-343
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    • 2013
  • In a continuation of investigation on Cordyceps militaris, thirteen compounds were isolated from the $CH_2Cl_2$ and n-BuOH-soluble fraction of C. militaris. They were identified as twelve diketopiperazines such as cyclo($\small{L}$-Gly-$\small{L}$-Pro) (1), cyclo($\small{L}$-Ala-$\small{L}$-Pro) (2), cyclo($\small{L}$-Ser-$\small{L}$-Pro) (3), cyclo($\small{L}$-Val-$\small{L}$-Pro) (4), cyclo($\small{L}$-Thr-$\small{L}$-Pro) (5), cyclo($\small{L}$-Pro-$\small{L}$-Pro) (6), cyclo($\small{L}$-Thr-$\small{L}$-Leu) (7), cyclo($\small{L}$-Tyr-$\small{L}$-Ala) (8), cyclo($\small{L}$-Phe-$\small{L}$-Ser) (9), cyclo($\small{L}$-Phe-$\small{L}$-Pro) (10), cyclo($\small{L}$-Tyr-$\small{L}$-Pro) (11) and brevianamide F (13), and an amino acid, tryptophan (12). Their structures were identified on the basis of chemical evidences and spectroscopic analysis including 1D-NMR ($^1H$, $^{13}C$), 2D-NMR (HSQC, HMBC) and MS spectral data. Among the isolated compounds, compounds 1, 2, 6-11 are first reported from C. militaris.

북극유래 박테리아, Pseudomonas aeruginosa로 부터 대사산물들의 분리 및 항진균 활성 (Isolation of secondary metabolites from an Arctic bacterium, Pseudomonas aeruginosa and their antimicrobial activities)

  • 윤의중;김민주;한세종;임정한
    • 미생물학회지
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    • 제52권4호
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    • pp.415-420
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    • 2016
  • 북극 유래 박테리아인 Pseudomonas aeruginosa 균주의 대사산물에 대한 화학적 연구는 벤조산 유도체 6번을 포함하여, 두 개의 diketopiperazine 1과 2, 두 개의 phenazine alkaloid 3과 4, indole carbaldehyde 5번을 분리하였다. 화합물들의 구조는 1D 과 2D NMR, 및 MS 기법들과 기존 보고된 문헌 값 과의 비교에 의하여 동정되었다. 분리된 화합물들 중 5번과 6번은 북극 척지해 해수의 P. aeruginosa로 부터 처음으로 보고 되었다. 대사산물들 1-6의 항균 활성은 Staphylococcus aureus과 and Candida albicans에 대하여 측정하였다.

항생물질 Bicyclomycin의 작용기전

  • 박형근
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 1997년도 추계학술대회
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    • pp.19-25
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    • 1997
  • Bicyclomycin(BCM)은 1972년에 일본 Hokkaido, Sapporo지방의 토양균중의 하나인 Streptomyces Sapporoneosis의 배양액으로부터 최초로 분리된 항생물질로서 특히 Gram(-) 박테리아인 Escherichia coli. Klebsiella, Shigella, Salmonella, Citrobacter, Enterobacter cloacae, Neisseria gonorrhoeae등에 대한 선택적인 항균효과를 가지고 있고 Streptomycin, Kanamycin, Chloramphenicol, Tetracyclin, Aminobenzylpenicillin 및 naldixic acid 등에 대해 교차내성을 가지고 있지 않다. BCM은 구조적인 면에서 [4.2.2]bicyclic구조를 가지고있는 특이한 항생물질로서 C(1)-triol부분, diketopiperazine부분 그리고 C(5)-C(5a)exomethylene의 3 부분으로 크게 나눌수 있다(Fig. 1). BGM은 E. coli에 대한 항균력으로서 250-500 $\mu\textrm{g}$/mL의 MIC value를 가지고 있고 급성독성으로서 LD$_{50}$가 4g/kg 이상으로 거의 독성이 없는 것이 특징이다. 현재 Fujisawa pharmaceutical Ltd.로부터 Bicozamycin이라는 상품명으로 설사치료제 용도로 시판되고 있다.

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Minority report; Pseudomonas aeruginosa의 정족수 인식(쿼럼 센싱) 신호물질로써의 Diketopiperazines과 Pyocyanin (Minority report; Diketopiperazines and Pyocyanin as Quorum Sensing Signals in Pseudomonas aeruginosa)

  • 이준희
    • 미생물학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.85-92
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    • 2008
  • Pseudomonas aeruginosa는 기회 감염성 병원균으로, Cystic fibrosis, 미생물 감염성 각막염,화상 부위 2차 감염 등의 다양한 질병을 초래한다. 정족수 인식(쿼럼 센싱)이라고도 알려져 있는 세포간 신호전달 기전이 이러한 감염에서 중요한 역할을 하기 때문에 P. aeruginosa의 정족수 인식 시스템들이 집중적으로 연구되어 왔다. P. aeruginosa의 정족수 인식 시스템들을 소개하는 많은 문헌들이 주로 두 개의 주요 acyl-homoserine lactone (AHL) 계열 정족수 신호물질들인 N-3-oxododecanoyl homoserine lactone (3OC12)과 N-butanoyl homoserine lactone (C4)에 초점을 맞추어 설명하고 있지만, 실제로는 몇 가지 새로운 신호물질들이 발견되어져 왔고, 그들이 P. aeruginosa의 병독성과 신호전달에 중요한 역할을 할 수 있음이 제안되어져 왔다. 그 중 하나가 PQS(Pseudomonas quinolone signal; 2-heptyl-3-hydroxy-4-quinolone)인데, 이 물질은 현재 P. aeruginosa의 잘 규명된 주요 신호물질로 인식되고 있다. 이에 더하여, 최근의 연구들은 또 다른 가능성 있는 P. aeruginosa신호물질들을 제안해 왔는데, diketopiperazines (DKPs)과 pyocyanin이 그들이다. DKPs는 환형 dipeptide로써 이를 구성하는 아미노산의 종류에 따라 다양한 구조를 가진다. P. aeruginosa의 배양액에서 검출된 몇몇 DKPs들이 기존에는 AHL에만 특이적으로 반응한다고 알려졌던 Vibrio 랸�N갸 LuxR biosensor를 활성화 시킬 수 있다는 것이 발견되어 새로운 신호물질로 제안되었다. Pyocyanin (1-hydroxy-5-methyl-phenazine)은 P. aeruginosa가 생산하는 여러 phenazine 화합물들 중의 하나로써, 특징적인 청록색을 띄는 산화-환원 활성물질이다. 이 물질도 정체 성장기 동안 일부 정족수 인식의 조절을 받는 유전자들의 발현을 증가시키는 최종 신호 인자로 최근 제안되었으며, 그 신호는 또 다른 전사 조절 인자인 SoxR에 의해 매개된다고 제안되었다. 본 논문에서는 P. aeruginosa에서 새롭게 발견, 제안되고 있는 이들 신호 전달 물질들에 대해 자세히 다루어 보기로 한다.

히말라야의 토양 곰팡이, Preussia sp. 배양액으로부터 추출된 화학 성분들 및 항 염증 활성 (Chemical constituents from the culture filtrate of a Himalayan soil fungus, Preussia sp. and their anti-inflammatory activity)

  • 윤의중;서승석;임정한;김일찬;한세종
    • 미생물학회지
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    • 제54권1호
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    • pp.18-23
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    • 2018
  • 히말라야산의 동토에서 발견된 Preussia sp.로부터 신규 벤조산 유도체 benzyl 2,4-di(benzyloxy)benzoate (1)와 6개의 알려진 화합물들(2-7)이 분리되었다. 신규물질 및 다른 화합물들의 구조는 1D-와 2D NMR실험 및 문헌값과의 비교에 의하여 결정되었다. 화합물 2-7은 동 속 및 Sporormiaceae과에서 처음으로 얻어졌다. 분리된 물질들은 쥐의 대식세포 RAW 264.7 cells에서 lipopolysaccharide (LPS) 처리에 의하여 유도된 nitric oxide (NO)의 생성량 억제를 측정하였다. 화합물 1번과 2번은 100 mg/ml의 농도로 처리했을 때 LPS에 의하여 유도된 NO 생성량을 각각 50.7% 및 88.5%까지 억제하는 것을 보였다.

Crystal Structure and Spectroscopic Properties of Cyclic Dipeptide: A Racemic Mixture of cyclo(ᴅ-Prolyl-ʟ-Tyrosyl) and cyclo(ʟ-Prolyl-ᴅ-Tyrosyl)

  • Hong, Yong Pyo;Lee, Sung-Hong;Choi, Jong-Ha;Kashima, Ayana;Nakamura, Go;Suzuki, Takayoshi
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제35권8호
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    • pp.2299-2303
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    • 2014
  • Two diastereoisomers of cyclo(Pro-Tyr) have been synthesized simultaneously. The crystal structures and conformations of both cyclo($\small{L}$-Pro-$\small{L}$-Tyr) and a racemic mixture of cyclo($\small{D}$-Pro-$\small{L}$-Tyr) and cyclo($\small{L}$-Pro-$\small{D}$-Tyr), abbreviated as rac-cyclo($\small{D}$-Pro-$\small{L}$-Tyr/$\small{L}$-Pro-$\small{D}$-Tyr), have been determined by a single-crystal X-ray diffraction study at low temperature. The crystals of rac-cyclo($\small{D}$-Pro-$\small{L}$-Tyr/$\small{L}$-Pro-$\small{D}$-Tyr) belong to orthorhombic space group $Pna2_1$ with a = 10.755 (1), b = 12.699 (1), c = 9.600 (1) ${\AA}$ and Z = 4. The tyrosine side chain is folded towards the diketopiperazine (DKP) ring. The DKP ring adopts a twist boat conformation with pseudo symmetry $C_{2v}$. The pyrrolidine ring has an envelope conformation with the N5, C4, C7 and C8 atoms in a plane. The crystal of rac-cyclo($\small{D}$-Pro-$\small{L}$-Tyr/$\small{L}$-Pro-$\small{D}$-Tyr) is stabilized by hydrogen bonds between amide N2-H2 and carbonyl oxygen O2 in the neighbor. The hydroxyl group of tyrosine residue is also hydrogen bonded to the oxygen of the carbonyl group of the DKP ring in the next molecule. The spectroscopic properties of both isomers are also described.

키틴분해 박테리아 Bacillus idriensis (CGH18)의 항산화 활성 (Antioxidant Activity of a Chitin-degrading Bacterium Bacillus idriensis (CGH18))

  • 정명은;홍주완;이정임;곽명국;김호준;손재학;송영선;오광석;서영완
    • KSBB Journal
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    • 제28권4호
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    • pp.217-224
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    • 2013
  • A bacterium CGH18 exhibiting antioxidizing and chitin-degrading activities in the colloidal chitin culture medium was isolated from salt-fermented crab. This strain was identified as Bacillus idriensis based on 16S rDNA sequence homology search. Its crude extract was partitioned between n-BuOH and $H_2O$. The organic layer was further partitioned between $CH_2$ $Cl_2$ and $H_2O$. Antioxidant activities of crude extract and its solvent fractions were evaluated using five different bioassay methods, including the degree of occurrence of intracellular reactive oxygen species (ROS), peroxynitrite scavenging (ONOO), and oxidative damage of genomic DNA. All fractions exhibited significant antioxidant activity in bioassay systems used.

아스파탐의 열안정성에 미치는 온도와 pH의 영향 (Effect of Temperature and pH on Thermal Stability of Aspartame)

  • 김우정;정남용
    • 한국식품과학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.311-315
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    • 1996
  • 아스파탐을 가열할 때 온도 및 pH가 아스파탐의 열안정성에 미치는 영향을 조사하였다. 아스파탐 용액을 $60-100^{\circ}C$로 가열하였을 때 가열온도가 높아질수록 아스파탐의 분해속도가 빨라졌으며 이 때의 활성화 에너지는 20.77 Kcal/mole이었다 또한 열분해물질인 DKP와 ${\alpha}$-AP는 아스파탐의 열분해와 함깨 생성속도가 증가하였으며, 분해산물 증 DKP량이 ${\alpha}$-AP보다 현저하게 많이 생성되었다. 가열 중 pH의 변화는 $60{\sim}80^{\circ}C$에서는 10시간 가열동안 비교적 완만하게 감소하였고 $100^{\circ}C$에서는 초기 pH 4.52에서 3.92로 감소하였다가 그 후 다시 완만하게 감소하였다. 1%아스파탐 용액을 pH $3{\sim}7$의 범위로 조절하여 $100^{\circ}C$에서 가열하였을 때 pH $3.0^{\circ}C4.5$의 산성범위에서 안정하였고 PH7에서 불안정하였으며, 초기 1시간 가열 후 pH 7에서의 열분해 속도상수는 0.83으로 다른 pH의 열분해 속도상수의 값인 $0.045{\sim}0.286$에 비해 큰 차이를 보였다. 따라서 아스파탐은 pH 7과 고온에서 매우 불안정함을 보여 주었다.

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