• The Monthly Diabetes
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• s.257
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• pp.36-37
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• 2011

당뇨병은 유전적인 영향을 많이 받는다. 부모가 당뇨병에 걸린 사람은 그렇지 않은 사람보다 당뇨병에 걸릴 가능성이 크다고 보고 있다. 실제로 당뇨병환자 중 약 50~60% 이상이 자기 가족이나 친척 중에 당뇨병환자가 1명 이상 있는 것이 보통이다. 그러나 당뇨병의 원인 유전자를 찾기 위한 노력에도 아직 뚜렷하게 밝혀내지 못한 상태이며 여러 유전자가 함께 작용하는 복합 유전질환으로 인식되고 있다. 또한, 이들 유전자가 다른 유전 인자나 환경 인자와 동시에 겹치면 당뇨병으로 발생할 가능성이 크다고 본다. 세계적으로 당뇨병을 앓는 사람의 수가 매우 증가해 현재 전 세계인구의 약 6.4%인 2억 8,000명이 당뇨병을 앓고 있으며 비만 인구 급증과 함께 당뇨병환자의 수가 더욱 증가할 것으로 전망되고 있다. 그럼에도, 아직 다 파헤쳐지지 않아 더욱 궁금한 당뇨병의 원인 유전자에 대해 알아보도록 하자.

• Proceedings of the Korea Inteligent Information System Society Conference
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• 2005.05a
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• pp.258-265
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• 2005

전자상거래의 확산에 따라 인터넷 쇼핑몰에서의 구매활동은 일반적인 현상이 되었다. 그 결과, 유사한 업종이나 업태의 인터넷 쇼핑몰이 범람하게 되었고 업체들 간의 경쟁도 심화되어 차별화된 서비스를 제공하지 않는 업체는 도태되기 쉬운 상황이다. 본 연구에서는 치열한 경쟁환경 하에서 인터넷 쇼핑몰의 차별화된 마케팅 서비스의 수단으로써 이용되고 있는 상품추천시스템의 개선된 모형을 제시하고자 한다. 본 연구에서 제안하는 모형은 전역 최적화 기법 중의 하나인 유전자 알고리즘을 데이터 마이닝의 도구로 활용한 인터넷 쇼핑몰에서의 개인화된 상품추천시스템 모형이다. 유전자 알고리즘은 추출하기가 어려운 소비자의 성향을 데이터를 통해 추출하고 이에 맞는 상품군을 선택할 수 있도록 해주는 최적화 기법으로 상품추천시스템의 추천엔진으로써 유용할 것으로 기대된다. 본 연구에서는 제안한 유전자 알고리즘에 기반한 추천 규칙들이 장착된 웹 기반의 개인화된 상품추천시스템의 프로토타입을 개발하고 이에 대한 실제 사용자들의 이용 만족도를 확인함으로써 본 연구에서 제안한 방법론의 유용성을 확인하고자 한다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2006.10c
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• pp.246-251
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• 2006

마이크로어레이 실험은 수 천에서 수 만개의 유전자 발현 결과를 동시에 측정할 수 있어 질병의 발현 형질 분류 등에 유용하게 이용되고 있다. 그러나 마이크로어레이 실험은 동일한 플랫폼의 실험이라 할지라도 환경 등에 따라 그 실험 결과에 차이가 나는 등 오차를 항상 포함하고 있다. 또한 마이크로어레이 실험은 아직 고가의 실험으로 분류되어 다수의 샘플에 대한 반복 실험 결과를 얻기 어려운 상황이다. 따라서 이종의 플랫폼, 데이터 포맷, 정규화 기법 등이 서로 다른 데이터를 효율적으로 통합하여 유용한 정보를 추출하는 새로운 방식의 개발이 필요하다. 본 논문은 이와 같은 문제를 해결하기 위한 기초 단계 연구 결과이다. 마이크로어레이 실험 데이터로부터 통계적 방법을 이용하여 유의(informative) 유전자를 추출하고 유전자 온톨로지(Gene Ontology : GO)와의 연계를 통하여 유전자 정보의 기능적 분류 결과를 사용자에게 제공하는 유전자 기능 분석 시스템의 설계 및 구현 방안을 보인다. 본 시스템의 실험방법에서는 3-Fold Filtering 기법을 통하여 발현 차가 큰 유전자를 추출하고, t-검정 기법에 의하여 이들 유전자를 순위화 하였으며, 이 중 상위 100개의 유전자를 유의 유전자로 추출하였다. 다음, 이 들 유의 유전자의 t-검정 값을 GO의 유전자 기능을 나타내는 해당 텀 (term)에 가중치로 부과하여 각 유전자들과 기능적으로 연관성이 높은 텀들을 추출한다. 또한 본 연구의 유효성을 검증하기 위하여 본 시스템에 의한 마이크로어레이 데이터 분석 결과를 전문가에 의한 유전자 기능 분석 결과와 비교한다.투명성 있는 서비스를 제공하고 높은 신뢰성과 안정성이 확보될 수 있도록 구성하고자 한다. Query 수행을 여러 서버로 분산처리하게 함으로써 성능에 대한 신뢰성을 향상 시킬 수 있는 Load Balancing System을 제안한다.할 때 가장 효과적인 라우팅 프로토콜이라고 할 수 있다.iRNA 상의 의존관계를 분석할 수 있었다.수안보 등 지역에서 나타난다 이러한 이상대 주변에는 대개 온천이 발달되어 있었거나 새로 개발되어 있는 곳이다. 온천에 이용하고 있는 시추공의 자료는 배제하였으나 온천이응으로 직접적으로 영향을 받지 않은 시추공의 자료는 사용하였다 이러한 온천 주변 지역이라 하더라도 실제는 온천의 pumping 으로 인한 대류현상으로 주변 일대의 온도를 올려놓았기 때문에 비교적 높은 지열류량 값을 보인다. 한편 한반도 남동부 일대는 이번 추가된 자료에 의해 새로운 지열류량 분포 변화가 나타났다 강원 북부 오색온천지역 부근에서 높은 지열류량 분포를 보이며 또한 우리나라 대단층 중의 하나인 양산단층과 같은 방향으로 발달한 밀양단층, 모량단층, 동래단층 등 주변부로 NNE-SSW 방향의 지열류량 이상대가 발달한다. 이것으로 볼 때 지열류량은 지질구조와 무관하지 않음을 파악할 수 있다. 특히 이러한 단층대 주변은 지열수의 순환이 깊은 심도까지 가능하므로 이러한 대류현상으로 지표부근까지 높은 지온 전달이 되어 나타나는 것으로 판단된다.의 안정된 방사성표지효율을 보였다. $^{99m}Tc$-transferrin을 이용한 감염영상을 성공적으로 얻을 수 있었으며, $^{67}Ga$-citrate

• Korean Journal of Environmental Agriculture
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• v.38 no.4
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• pp.296-306
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• 2019

BACKGROUND: Temperature is known to be the main factor affecting development, growth and reproduction of organisms and also a physical factor directly related to insect survival. Insects as ectothermal species should be responsive to climate changes for their survival and develop various survival strategies under the unfavorable temperature such as low temperature. The purpose of this study is to identify genes contributing to adaptation of low temperature. METHODS AND RESULTS: To identify genes contributing to adaptation of low temperature, the transcriptomic data were obtained from fat body in Plutella xyostella larvae via next generation sequencing. We identified structural proteins, heat shock proteins, antioxidant enzymes, detoxification proteins, and cryoprotectant mobilization and biosynthesis-related proteins. Genes encoding chitinase, cuticular protein, Hsp23, chytochrome protein, Glutathione S transferase, and phospholipase 2 were up-regulated under low temperature. Proteins related to energy metabolism such as UDP-glycosy ltransferase, trehalase and trehalose transporter were down-regulated. CONCLUSION: When insect pests were exposed to low temperature, changes in gene expression of fat body could provide some hints for understanding temperature adaptation strategies.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• v.25 no.6
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• pp.1385-1395
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• 2014

Economic traits of livestock are affected by environmental factors and genetic factors. In addition, it is not affected by one gene, but is affected by interaction of genes. We used a linear regression model in order to adjust environmental factors. And, in order to identify gene-gene interaction effect, we applied data mining techniques such as neural network, logistic regression, CART and C5.0 using five-SNPs (single nucleotide polymorphism) of FASN (fatty acid synthase). We divided total data into training (60%) and testing (40%) data, and applied the model which was designed by training data to testing data. By the comparison of prediction accuracy, C5.0 was identified as the best model. It were selected superior genotype using the decision tree.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.54 no.4
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• pp.477-479
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• 2018

A Gram-positive, rod-shaped, ivory colored, and motile, Lactobacillus koreensis 26-25 was isolated from Korean kimchi. Strain 26-25 showed the ability of conversion from major ginsenosides into minor ginsenosides for which whole genome was sequenced. The whole genome sequence of Lactobacillus koreensis 26-25 consisted of one circular chromosome comprised of 3,006,812 bp, with a DNA G + C content of 49.23%. The whole genome analysis of strain 26-25 showed many glycosides hydrolase genes, which may contribute to identify the genes responsible for transformation of major ginsenosides into minor ginsenosides for its high pharmacological effects.

• Journal of Plant Biotechnology
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• v.44 no.1
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• pp.82-88
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• 2017

Transgenic lily plants have been obtained after particle bombardment, using PDS-1000/He system and scale explants of lilies, followed by PPT (D-L-phosphinothricin) selection. In this study, scales of the lily plants cv. 'red flame' were bombarded with a plasmid containing the bar gene as a selectable marker, and the AtSIZ gene as a gene of interest, showing salt tolerance and drought tolerance respectively, and both being driven by the CaMV 35S promoter. For optimization of a protocol, factors which optimized and showed a high transformation efficiency under following conditions, were considered: a bombardment pressure of 1100 psi, a target distance of 6 cm and $1.0{\mu}m$ of gold particle, and 24-h pre-culture and post-culture on MS medium containing 0.2 M sorbitol and 0.2 M mannitol as osmoticum agents. After bombardment, all the bombarded scales of lily were transferred to MS medium without selective agents, for a week. Subsequently, these bombarded scales were transferred to a selection MS medium containing 10 mg/l PPT, and incubated for a month for further selection, after which they were cultured for another 4-8 weeks with a 4-week subculture regime on the same selection medium. After transferring into hormone-free MS medium, the PPT-resistant scales with shoots were successfully rooted and regenerated into plantlets. PCR analysis revealed that the surviving putatively transformed plantlets indicated the presence of both the bar gene and the AtSIZ gene. In conclusion, when 100 scales of lily cv. Red flame are bombarded, this study produced approximately 17-18 transgenic plantlets with an optimized bombardment protocol. The protocol described here can contribute to the breeding program of lilies.

• Journal of the Korean Applied Science and Technology
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• v.39 no.6
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• pp.916-923
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• 2022

Water samples were collected from three spots(Namcheon, Changwoncheon and Cheongwoonji) in Changwon and genomic DNA was isolated from them. Quantitative PCR was performed with the isolated DNA as template and primers targeting five different class A extended-spectrum beta-lactamase(ESBL) genes(bla_OXA-1, bla_SHV, bla_TEM, bla_CTX-M-1, bla_CTX-M-9). The number of total ESBL genes from each sample showed large variations between each sample. Thirty nanograms of DNA from Namcheon contained 1.93×10⁶ copies of ESBL genes whereas the same amount of DNA from Changwoncheon contained 1.47×10⁵ copies of ESBL genes. However, the same amount of DNA from Cheongwoonji pond contained only 9.5×10³ copies of ESBL genes. The ratio of each ESBL genes showed little difference between Namcheon river and Changwoncheon river, but DNA from Cheongwoonji pond showed a large difference from the rest. bla_OXA-1 gene was present at 65.3%, and bla_CTX-M-1 gene 33.6% for Namcheon comprising together almost 99%. bla_OXA-1 gene was present at 64.1%, and bla_CTX-M-1 gene 19.1% for Changwoncheon comprising together over 83%. bla_CTX-M-1 gene was present at 87.5% and bla_CTX-M-9 genes 9.8% for Cheongwoonji, a pond which is a closed and isolated environment.

• The Korean Journal of Applied Statistics
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• v.24 no.5
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• pp.861-869
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• 2011

One of the main objects of recent genetic studies is to understand genetic factors that induce complex diseases. If there are interactions between loci, it is difficult to find such associations through a single-locus analysis strategy. Thus we need to consider the gene-gene interactions and/or gene-environment interactions. The MDR(multifactor dimensionality reduction) method is being used frequently; however, it is not appropriate to detect interactions caused by a small fraction of the possible genotype pairs. In this study, we propose a relative risk interaction explorer that detects interactions through the calculation of the relative risks between the control and disease groups from each genetic combinations. For illustration, we apply this method to MDR open source data. We also compare the MDR and the proposed method using the simulated data eight genetic models.

• Proceedings of the Korean Environmental Sciences Society Conference
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• 2005.05a
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• pp.276-277
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• 2005

PHAs와 같은 유해유기화학물질의 환경노출에 따른 건강영향을 파악하기 위해서 요중대사산물의 배설량, 유전적감수성 등의 생체지표분석법을 동시에 측정하여 정확한 노출량을 평가하고자 하였다. 또한 직업적, 비직업적 노출인구에 영향을 미칠 수 있는 흡연, 음주, 식이 등의 생활습관과의 상호관련성도 평가하였다. 그 결과 비교적 소량의 PAHs에 노출되는 일반인구에서 요중 1-OHP 및 2-naphthol의 배설량에 가장 큰 영향을 미치는 인자는 흡연이었으며 요중 1-OHP의 배설량은 음주여부, GSTM1 유전자의 다형성에 의해서도 영향을 받음을 알 수 있었다.