• Title/Summary/Keyword: 유전체 분석

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Low-Temperature Sintering and Phase Change of BaTi4O9-Based Ceramics Middle-k LTCC Dielectric Compositions by Glass Addition (Glass 첨가에 의한 BaTi4O9계 중유전율 LTCC 유전체의 저온소결 및 상변화 거동)

  • Choi, Young-Jin;Park, Jae-Hwan;Nahm, Sahn;Park, Jae-Gwan
    • Journal of the Korean Ceramic Society
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    • v.41 no.12 s.271
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    • pp.915-920
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    • 2004
  • The main phase of $BaTi_{4}O_9$-based ceramics was transformed to $BaTi_{5}O_{11}$ caused by the sintering with borosilicate glass, which was analyzed by using XRD and TEM. We considered that the phase change from $BaTi_{4}O_9$-based ceramics to the Ti-rich $BaTi_{5}O_{11}$ phase resulted from borosilicate glass selective absorbing of Ba ions from the $BaTi_{4}O_9$. In these results, we found a dependence on the amounts of the glass frits and the annealing temperature, and the phase change is also dependent of the main phases of $Ba_{4}Ti_{13}O_{30},\;and\;Ba_{2}Ti_{9}O_{20}$, which are involved in the $BaO-TiO_2-based$ Ti-rich region. In the case of sintering of middle- and high- permittivity material with additional glass frits for middle- and high- dielectric coefficients LTCC composition, control of weight fraction of the glass frits accompanying low-temperature sintering property with appropriate phase change is required.

Anti-tumor effect of new compound, 127, through the induction of apoptosis (새로운 화합물 c-127의 세포고사 유도에 의한 항암효과)

  • Baek, Ki Hwan;Han, A Lum;Shin, Sae Ron;Jin, Chun Mae;Yoon, Young Wook;Yu, Seung Taek;Kim, Jong Duk;Choi, Du Young
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • v.52 no.6
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    • pp.696-700
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    • 2009
  • Purpose : We screened more than 350 compounds with an endoperoxide ring structure in search of an anti-leukemic drug and found that compound 127 (c-127) could induce significant cytotoxicity in HL-60 cells. In this study, we investigated the molecular mechanisms of compound 127-induced antitumor activity on HL-60 cells. Methods : HL-60 cells were cultured in Rosewell Park Memorial Institute 1640 and cell viability was measured by MTT [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide], a tetrazole assay. Apoptosis was assessed by a DNA fragmentation test. Apoptotic machineries were determined by Western blot analysis. Results : C-127 could induce a cytotoxic effect at 24 h and apoptosis at 6 h, which was demonstrated with MTT assay and DNA fragmentation test, respectively. The apoptotic effect of this drug was caused by the activation of the intracellular caspase-8,3 activation, the cleavage of pro-apoptotic Bid, and the increase of c-Jun expression accompanied with JNK (Jun N-terminal kinases) phosphorylation. On the contrary, it increased the expression of anti-apoptotic Bcl-2 levels, leading to the induction of the induction of anti-apoptotic effect. Taken together, the present study demonstrated that c-127 was a potent inducer of cytotoxicity on HL-60 cells through apoptotic mechanisms, which included the activation of caspase family, the regulation of Bcl-2 family, and the activation of JNK signaling pathway. Conclusion : Our results suggest that c-127 has a strong antitumor activity through the regulation of various apoptotic machineries on HL-60 cells. The compound may be utilized as an effective and potentially therapeutic drug in leukemia.

Distribution of DArT Markers in a Genetic Linkage Map of Tomato (토마토 유전자연관지도 상의 DarT 마커 분포)

  • Truong, Hai Thi Hong;Graham, Elaine;Esch, Elisabeth;Wang, Jaw-Fen;Hanson, Peter
    • Horticultural Science & Technology
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    • v.28 no.4
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    • pp.664-671
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    • 2010
  • A genetic linkage map was constructed using 188 $F_9$ RILs derived from a cross between $Solanum$ $lycopersicum$ H7996 (resistant to bacterial wilt) and $S.$ $pimpinellifolium$ WVa700 (highly susceptible to bacterial wilt). The map consisted of 361 markers including 260 DArTs, 74 AFLPs, 4 RFLPs, 1 SNP, and 22 SSRs. The resulting linkage map was comprised of 13 linkage groups covering 2042.7 cM. The genetic linkage map had an average map distance between markers of 5.7 cM, with an average DArT marker density of 1/7.9 cM. Based on the distribution of anchor SSR markers, 11 linkage groups were assigned to 10 chromosomes of tomato except chromosomes 5 and 12. The DArT markers were distributed across the genome in a similar way as other markers and showed the highest frequency of clustering (38.8%) at ${\leq}$ 0.5 cM intervals between adjacent markers, which is 3 times higher than AFLPs (13.5%). The present study is the first utilization of DArT markers in tomato linkage map construction.

Molecular Cloning and Characterization of myo-Inositol Dehydrogenase from Enterobacter sp. YB-46 (Enterobacter sp. YB-46의 myo-Inositol dehydrogenase 유전자 클로닝과 특성분석)

  • Park, Chan Young;Kim, Kwang-Kyu;Yoon, Ki-Hong
    • Microbiology and Biotechnology Letters
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    • v.46 no.2
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    • pp.102-110
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    • 2018
  • A bacterial strain capable of metabolizing myo-inositol (MI) and converting to other substances was isolated from soil of orchard. The isolate, named YB-46, was grown on minimal medium supplemented with MI as the sole carbon source and was presumed to belonging to genus Enterobacter according to the 16S rDNA sequence. Escherichia coli transformant converting MI into unknown metabolites was selected from a metagenomic library prepared with fosmid pCC1FOS vector. Plasmid was isolated from the transformant, and the inserted gene was partially sequenced. From the nucleotide sequence, an iolG gene was identified to encode myo-inositol dehydrogenase (IolG) consisting of 336 amino residues. The IolG showed amino acid sequence similarity of about 50% with IolG of Enterobacter aerogenes and Bacillus subtilis. The His-tagged IolG (HtIolG) fused with hexahistidine at C-terminus was produced and purified from cell extract of recombinant E. coli. The purified HtIolG showed maximal activity at $45^{\circ}C$ and pH 10.5 with the highest activity for MI and D-glucose, and more than 90% of maximal activity for D-chiro-inositol, D-mannitol and D-xylose. $K_m$ and $V_{max}$ values of the HtIolG for MI were 1.83 mM and $0.724{\mu}mol/min/mg$ under the optimal reaction condition, respectively. The activity of HtIolG was increased 1.7 folds by $Zn^{2+}$, but was significantly inhibited by $Co^{2+}$ and SDS.

레이저 유도 형광법(Laser Induced Fluorescence)을 이용한 플라즈마 방전 표시기(Plasma Display Panel)내의 전계 측정에 관한 연구

  • 김정훈;이준학;최영욱;양진호;황기웅
    • Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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    • 1999.07a
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    • pp.232-232
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    • 1999
  • 교류형 플라즈마 방전 표시기(AC Plasma Display Panel, AC PDP)에 사용되는 플라즈마는 그 부피가 너무 작아서 플라즈마에 변화를 일으키지 않고 그 물성을 관측하기란 쉬운일이 아니다. 그래서 주로 PDP 내의 물성을 관측하는 데 시뮬레이션에 의존하게 된다. 그 물성중에 PDP내의 전계 분포에 대한 정보는 방전의 형성 및 소멸에 대한 많은 단서를 제공하고 있다. 특히 AC PDP의 경우, 유전체에 형성되는 벽적하(wall charge)가 방전의 형성 및 PDP 구동에 중요한 역할을 하는데, 이는 PDP 내의 전계 분포를 살펴봄으로써 대략 예측할 수 있다. 본 연구에서는 시뮬레이션에 의존하지 않고, 직접 레이저 유도 형광법을 이용하여 AC PDP 내의 전계를 측정하였다. 방전 가스인 헬륨(He)의 에너지 준위는 전계의 크기에 따라 에너지 준위가 변화하여, Rydberg(n$\geq$8) 준위가 여러 개의 준위로 나누어지는 현상이 일어나는데, 이를 Stack 효과라고 한다. 따라서 전계의 세기가 커짐에 따라서 각 준위와 준위 사이 값(splitting)이 커지는데, 이를 이용하면 전계를 측정할 수 있다. 즉, 헬륨 원자를 여기시키는 레이저 파장을 변화시키면서 관측되는 레이저 유도 형광 신호를 관측하면, 준위의 splitting을 관측할 수 있다. 본 연구에서는 PDP 내의 전계의 시간적 변화를 관측하였다. 50%, 40kHz의 구형파를 PDP의 두 전극에 가하였을 때, 플라즈마가 켜진 상태뿐만 아니라 플라즈마가 꺼진 후에도 전계에 의한 Splitting 신호가 관측이 되었는데, 전계로 환산하였을 때, 그 값은 대략 수 kV/cm의 값을 갖았는데, 이는 wall charge에 의한 값으로 사료된다.결과로 생각되어진다.플라즈마의 강도값을 입력하여 플라즈마의 radiation을 검출하고, 스퍼터링 공정중 실질적인 in-situ 정보로 이용하였다. PEM을 통하여 In/Sn의 플라즈마 강도변화를 조사하였다. 초기 In/Sn의 플라즈마 강도(intensity)는 강도를 100하여, 산소를 주입한 결과, plasma intensity가 35 줄어들었고, 이때 우수한 ITO 박막을 얻을 수 있었다. Pulsed DC power를 사용하여 아크 현상을 방지하였다. PET 상에 coating 된 ITO 박막의 표면저항과 광투과도는 4-point prove와 spectrophotometer를 이용하여 분석하였고, AES로 박막의 두께에 따른 성분비를 확인하였다. ITO 박막의 광투과도는 산소의 유량과 sputter 된 In/Sn ion의 plasma emission peak에 따라 72%-92%까지 변화하였으며, 저항은 37$\Omega$/$\square$ 이상을 나타내었다. 박막의 Sn/In atomic ratio는 0.12, O/In의 비율은 In2O3의 화학양론적 비율인 1.5보다 작은 1.3을 나타내었다.로 보인다.하면 수평축과 수직축의 분산 장벽의 비에 따라 cluster의 두께비가 달라지는 성장을 볼 수 있었고, 한 축 방향으로의 팔 넓이는 fcc(100) 표면의 경우 동일한 Ed+Ep값에 대응하는 팔 넓이와 거의 동일한 결과가 나타나는 것을 볼 수 있다. 따라서 이러한 비대칭적인 모양을 가지는 성장의 경우도 cluster 밀도, cluster 모양, cluster의 양 축 방향 길이 비, 양 축 방향의 평균 팔 넓이로부터 각 축 방향의 분산 장벽을 얻어낼 수 있을 것으로 보인다. 기대할 수 있는 여러

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Cloning of a $\Delta5$ desaturase from Thraustochytrium sp. 26185 and Functional Expression in Pichia Pastoris (Thraustochytrium sp. 26185 균주에서의 $\Delta5$ desaturase 유전자 클로닝 및 Pichia pastoris 내에서의 기능적 발현)

  • Chung Tae-Ho;Lee Su-Jin;Oh Hyo-Jeong;Kim Geun-Joong;Hur Byung-Ki
    • KSBB Journal
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    • v.20 no.2 s.91
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    • pp.93-99
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    • 2005
  • Polyunsaturated fatty acids, that is PUFAs, are important constituents of membranes particularly found in the retina and central nervous system. In microorganism-based PUFAs biosynthesis, the genus Thraustochytrids is well evaluated for their potential as a promising candidate in the practical production of PUFAs, such as AA and DHA. In this study, we attempted to optimize a method of total nucleic acid extraction from this microorganism as a preliminary experiment. Using the extracted nucleic acid and degenerated primers for direct PCR, we isolated a $\Delta5$ desaturase gene that contained 1320-nucleotide and encoded 439 amino acids. This gene exhibited an expected function, when expressed in P. pastoris in the presence of appropriate exogenous substrate, as an evidence for $\Delta5$ desaturase activity (conversion of DGLA to AA). These results and information could provide a basis for the construction of engineered strains suitable for the practical production of PUFAs.

Genome wide association test to identity QTL for dressing percentage in Hanwoo (전장 유전체 관련성 분석을 통한 한우 도체수율 관련 양적형질좌위 탐색)

  • Lee, Seung Hwan;Lim, Dajeong;Dang, Chang Gwan;Chang, Sun Sik;Kim, Hyeong Cheul;Jeon, Gi Jun;Yeon, Seong Hum;Jang, Gul Won;Park, Eung Woo;Oh, Jae Don;Lee, Hak Kyo;Lee, Jun Heon;Kang, Hee Sul;Yoon, Duhak
    • Korean Journal of Agricultural Science
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    • v.40 no.2
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    • pp.155-162
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    • 2013
  • Genome-wide association study was performed on data from 266 Hanwoo steers derived from 66 sire using bovine 10K mapping chip in Hanwoo (Korean Cattle). SNPs were excluded from the analysis if they failed in over 5% of the genotypes, had median GC scores below 0.6, had GC scores under 0.6 in less than 90% of the samples, deviated in heterozygosity more than 3 standard deviations from the other SNPs and were out of Hardy-Weinberg equilibrium for a cutoff p-value of $1^{-15}$. Unmapped and SNPs on sex chromosomes were also excluded. A total of 4,522 SNPs were included in the analysis. To test an association between SNP and QTL, GWAS for five genetic mode (additive, dominant, overdominant, recessive and codominant) was implemented in this study. Three SNPs (rs29018694, ss46526851 and rs29018222) at a threshold p< $1.11{\times}10^{-5}$ were detected on BTA12 and BTA21 for dressing percentages in codominant and recessive genetic mode. The G allele for rs29018694 has 4.9% higher dressing percentage than A allele, while the T allele for ss46526851 has 2.57 % higher dressing percentage than C allele. Therefore, rs29018694 SNP showed a bigger effect than the other two SNPs (ss46526851 and rs29018222) in this study. In conclusion, this study identifies three loci with moderate effects and many loci with infinitesimally small effect across genome in Hanwoo.

SREBP as a Global Regulator for Lipid Metabolism (지질대사 조절에서 SREBP의 역할)

  • Lee, Wonhwa;Seo, Young-kyo
    • Journal of Life Science
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    • v.28 no.10
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    • pp.1233-1243
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    • 2018
  • Sterol regulatory-element binding proteins (SREBPs) are a family of transcription factors that regulate lipid homeostasis and metabolism by controlling the expression of enzymes required for endogenous cholesterol, fatty acid (FA), triacylglycerol, and phospholipid synthesis. The three SREBPs are encoded by two different genes. The SREBP1 gene gives rise to SREBP-1a and SREBP-1c, which are derived from utilization of alternate promoters that yield transcripts in which distinct first exons are spliced to a common second exon. SREBP-2 is derived from a separate gene. Additionally, SREBPs are implicated in numerous pathogenic processes, such as endoplasmic reticulum stress, inflammation, autophagy, and apoptosis. They also contribute to obesity, dyslipidemia, diabetes mellitus, and nonalcoholic fatty liver diseases. Genome-wide analyses have revealed that these versatile transcription factors act as important nodes of biological signaling networks. Changes in cell metabolism and growth are reciprocally linked through SREBPs. Anabolic and growth signaling pathways branch off and connect to multiple steps of SREBP activation and form complex regulatory networks. SREBPs are activated through the PI3K-Akt-mTOR pathway in these processes, but the molecular mechanism remains to be understood. This review aims to provide a comprehensive understanding of the role of SREBPs in physiology and pathophysiology at the cell, organ, and organism levels.

교류형 플라즈마 방전 표시기 방전유지 전압의 전압 상승 시간의 변화에 따른 방전 현상의 변화

  • 김중균;양진호;윤차근;황기웅
    • Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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    • 1999.07a
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    • pp.229-229
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    • 1999
  • 교류형 플라즈마 방전 표시기(AC Plasma Display Panel, AC PDP)의 구동에서의 방전 현상은 기입방전, 유지방전, 소거 방전이 있다. 이중 유지 방전은 표시장치로서의 휘도와 계조의 표현을 위한 방전으로 표시기로서의 효율을 결정하게 된다. 본 연구에서는 유지 방전 전압의 상승 시간의 변화에 따른 방전현상과 휘도, 효율의 변화를 살펴 보았다. 방전 현상에서의 가장 큰 변화는 교류형 플라즈마 방전 표시기의 방전 개시 전압과 방전 유지 전압의 변화이다. 유지 전압의 상승시간이 증가할수록 방전 개시 전압과 방전 유지 전압의 변화이다. 유지 전압의 상승 시간이 증가할수록 방전 개시 전압과 방전 유지 전압의 차(sustain margin)는 감소하여 상승 시간이 1$\mu$s/100V 이상의 영역에서는 방전 개시 전압과 방전 유지 전압이 차이가 없어지게 된다. 이는 방전 유지 전극 위의 유전체에 쌓이게 되는 벽전하(wall charge) 양의 감소에 의한 방전 약화의 영향을 보여질 수 있다. 그러나 방전 유지 전압의 형태와 전류의 시간적인 변화를 살펴보면 이러한 약한 방전은 벽전하의 감소에 의한 방전 시의 전계 감소보다는 방전 전류의 발생 시간이 방전 전압이 증가하여 최고점에 이르지 못한 시간에 위치하여 방전이 형성될 때의 전계가 강하지 못하기 때문인 것을 알 수 있다. 방전 전류를 측정한 결과에 의하면 방전 전류의 시작은 변위 전류가 흐르고 난 후부터 시작되며 그 결과 방전 전류가 최고점에 도달하는 시간은 방전 전압 상승 시간이 길어질수록 낮은 전압에서 형성되게 된다. 또한 방전 유지 전압의 상승 시간이 길어질수록 플라즈마 방전표시기의 휘도와 효율은 낮아지고 이 결과 또한 약한 전계에서의 방전에 의한 결과로 생각되어진다.플라즈마의 강도값을 입력하여 플라즈마의 radiation을 검출하고, 스퍼터링 공정중 실질적인 in-situ 정보로 이용하였다. PEM을 통하여 In/Sn의 플라즈마 강도변화를 조사하였다. 초기 In/Sn의 플라즈마 강도(intensity)는 강도를 100하여, 산소를 주입한 결과, plasma intensity가 35 줄어들었고, 이때 우수한 ITO 박막을 얻을 수 있었다. Pulsed DC power를 사용하여 아크 현상을 방지하였다. PET 상에 coating 된 ITO 박막의 표면저항과 광투과도는 4-point prove와 spectrophotometer를 이용하여 분석하였고, AES로 박막의 두께에 따른 성분비를 확인하였다. ITO 박막의 광투과도는 산소의 유량과 sputter 된 In/Sn ion의 plasma emission peak에 따라 72%-92%까지 변화하였으며, 저항은 37$\Omega$/$\square$ 이상을 나타내었다. 박막의 Sn/In atomic ratio는 0.12, O/In의 비율은 In2O3의 화학양론적 비율인 1.5보다 작은 1.3을 나타내었다.로 보인다.하면 수평축과 수직축의 분산 장벽의 비에 따라 cluster의 두께비가 달라지는 성장을 볼 수 있었고, 한 축 방향으로의 팔 넓이는 fcc(100) 표면의 경우 동일한 Ed+Ep값에 대응하는 팔 넓이와 거의 동일한 결과가 나타나는 것을 볼 수 있다. 따라서 이러한 비대칭적인 모양을 가지는 성장의 경우도 cluster 밀도, cluster 모양, cluster의 양 축 방향 길이 비, 양 축 방향의 평균 팔 넓이로부터 각 축 방향의 분산 장벽을 얻어낼 수 있을 것으로 보인다. 기대할 수 있는 여러 장점들을 보고하고자 한다.성이 우수한 시

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Complete genome sequence of the polycyclic aromatic hydrocarbons biodegrading bacterium Idiomarina piscisalsi strain 10PY1A isolated from oil-contaminated soil (기름으로 오염된 토양에서 분리된 다환방향족탄화수소 분해 세균 Idiomarina piscisalsi 10PY1A의 유전체 염기서열 해독)

  • Nzila, Alexis;Jung, Byung Kwon;Kim, Min-Chul;Ibal, Jerald Conrad;Budiyanto, Fitri;Musa, Musa M.;Thukair, Assad;Kim, Sang-Jun;Shin, Jae-Ho
    • Korean Journal of Microbiology
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    • v.54 no.3
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    • pp.289-292
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    • 2018
  • Using pyrene as the enrichment nutrient, a bacterial strain 10PY1A, was isolated by enrichment culture from oil-contaminated sea sand of Arabian Gulf in Saudi Arabia, and this strain belongs to the species Idiomarina piscisalsi, based on 16S RNA gene sequence analysis. The genome of I. piscisalsi strain 10PY1A contains 2,346 protein-coding sequences and an average GC content of 47.4% in its chromosome (2.59 Mbp). Genes encoding proteins related to the degradation of pyrene were existed in the strain 10PY1A genome, indicating that this strain can be used to degrade polycyclic aromatic hydrocarbons in oil-contaminated marine flora and soil.