• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2000.10b
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• pp.458-460
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• 2000

본 논문에서는 유전자 알고리즘(GA)과 Support Vector Machine(SVM)을 결합하여 사용한 얼굴 인식 시스템을 제안한다. 기존의 SVM을 이용한 얼굴 인식 연구에서는 얼굴 전체 영상을 SVM의 입력벡터로 사용하는데 반해, 본 연구에서는 GA를 이용하여 얼굴 영상 중에서 개인별로 식별 능력이 우수한 특징들만을 선택하여 이를 SVM의 입력벡터로 사용한다. 조명, 표정, 안경 착용 등 다양한 변화가 있는 Yale 얼굴 데이터베이스를 사용하여 실험한 결과, 얼굴 전체 영상을 사용한 경우보다 더 좋은 인식률을 보였다. 또한 제안된 방법에 의한 얼굴 인식 시스템은 각 개인별로 식별력이 우수한 특징들만을 저장하므로, 얼굴인식 시스템을 구성하기 위해 저장될 정보의 양이 현저하게 감소하게 된다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2003.10b
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• pp.850-852
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• 2003

이 논문에서는 여러 가지 도구를 논리적인 순서로 사용함으로써 이루어지는 작업을 워크플로우로 보고, 이러한 관점에서 바이오인포매틱스 도구를 통합하는 새로운 멀티에이전트 시스템을 제안한다. 제안한 시스템은 기존의 도구를 랩퍼 에이전트로 구현하고, 에이전트간의 통신은 XML 형식의 메시지로 이루어진다. 수신 에이전트는 송신 에이전트가 전송하는 정보를 명시적으로 알리지 않고도 메시지로부터 필요한 정보를 추출할 수 있다. 제안한 시스템의 이러한 특징은 바이오인포매틱스 도구와 데이터베이스의 통합을 용이하게 한다. 또한, 제안한 시스템에서는 워크플로우를 여러 가지 제어 구조를 이용하여 정의할 수 있으며. 워크플로우 진행을 모니터링할 수 있는 기능을 제공한다. 제안한 시스템의 가용성을 보이기 위해 박테리아 Sphingomonas Chungbukensis DJ77 의 유전자 주해(gene annotation) 작업에 제안한 시스템을 적용하여 구현하고 있다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2004.04b
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• pp.337-339
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• 2004

우리는 대규모의 유전자 데이터베이스에서 원하는 패턴을 빠르고 정확하게 찾고 싶어한다 하지만 지금까지 나온 대부분의 검색방법들은 인덱스의 크기를 실제 데 이 터 보다 훨씬 크게 만들어 사용해왔다. 그런 방법들은 기하급수적으로 증가하고 있는 데 이 터를 처 리 하는 데는 비효율적이다. 따라서 인덱스 크기를 실제 데이터보다 작게 만들면서도 원하는 패턴을 빨리 찾을 수 있는 효율적 인 방법 이 필요하다. 이렇게 하기 위해서는 일정한 크기의 데이터를 작은 크기의 데이터로 줄인 후, 이 데이터를 이용하여 인덱스를 만들어야 한다. 이 논문에서는 일정한 크기의 문자열(=윈도우)을 작은 크기의 숫자들(=서명)로 표현해서 인덱스를 구축한 후, 이를 이용해 우리가 원하는 패턴을 최소한의 디스크 접근을 통해 빠르게 찾을 수 있는 방법을 제시한다.

• Journal of Life Science
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• v.23 no.11
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• pp.1325-1335
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• 2013

Working dogs, such as rescue dogs, military watch dogs, guide dogs, and search dogs, are selected by in-training examination of desired traits, including concentration, possessiveness, and boldness. In recent years, genetic information has been considered to be an important factor for the outstanding abilities of working dogs. To characterize the molecular features of the canine genes related to phenotypes for working dogs, we investigated the 24 previously reported genes (AR, BDNF, DAT, DBH, DGCR2, DRD4, MAOA, MAOB, SLC6A4, TH, TPH2, IFT88, KCNA3, TBR2, TRKB, ACE, GNB1, MSTN, PLCL1, SLC25A22, WFIKKN2, APOE, GRIN2B, and PIK3CG) that were categorized to personality, olfactory sense, and athletic/learning ability. We analyzed the chromosomal location, gene-gene interactions, Gene Ontology, and expression patterns of these genes using bioinformatic tools. In addition, variable numbers of tandem repeat (VNTR) or microsatellite (MS) polymorphism in the AR, MAOA, MAOB, TH, DAT, DBH, and DRD4 genes were reviewed. Taken together, we suggest that the genetic background of the canine genes associated with various working dog behaviors and skill performance attributes could be used for proper selection of superior working dogs.

• The Journal of the Korea Contents Association
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• v.10 no.6
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• pp.49-54
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• 2010

As information on gene sequences is not only diverse but also extremely huge in volume, high-performance computer and information technology techniques are required to build and analyze gene sequence databases. This has given rise to the discipline of bioinformatics, a field of research where computers are utilized to collect, to manage, to save, to evaluate, and to analyze biological data. In line with such continued development in bioinformatics, the Korea Institute of Science and Technology Information (KISTI) has built an infrastructure for the biological information, based on the information technology, and provided the information for researchers of bioscience. This paper analyzes the reference fields of Genbank, the most frequently used gene database by the global researchers among the life information databases, and proposes the interface method to NDSL which is the science and technology information integrated service provided by KISTI. For these, after collecting Genbank data from NCBI FTP site, we rebuilt the database by separating Genbank text files into the basic gene data and the reference data. So new tables are generated through extracting the paper and patent information from Genbank reference fields. Then we suggest the method of connection with the paper DB and the patent DB operated by KISTI.

• Journal of Life Science
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• v.13 no.3
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• pp.291-297
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• 2003

A human endogenous retroviral family (HERV-W) has recently been described that is related to multiple sclerosis-associated retrovirus (MSRV) sequences that have been identified in particles recovered from monocyte cultures from patients with multiple sclerosis. Two pol fragments (HWP-FB10 and HWP-FBl2) of HERV-W family were identified and analysed by the PCR approach with cDNA library of human fetal brain. They showed 89 percent nucleotide sequence similarity with that of the HERV-W (accession no. AF009668). Deletion/insertion or point mutation in the coding region of the pol fragments from human fetal brain resulted in amino acid frameshift that induced a mutated protein. Phylogenetic analysis of the HERV-W family from GenBank database indicates that the HWP-FB10 is very closely related to the AC000064 derived from human chromosome 7q21-q22. Further studies on the genetic relationship with neighbouring genes and functional role of these new HERV-W pol sequences are indicated.

• Journal of Life Science
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• v.31 no.9
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• pp.834-839
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• 2021

Authors previously reported the results of analyses of COGs (Clusters of Orthologous Groups of proteins) in 711 prokaryotes. The data of COGs were significantly updated for 2020 using 1,309 prokaryotic genomes. Here, we report the results of analyses of 3,455,853 proteins comprising 4,877 updated COGs in terms of COGs and prokaryotes. The numbers of COGs in each prokaryote ranged from 97 to 2,281, with an average of 1,430.0 and a standard deviation of 414.2. Mean numbers of COGs at the phylum level were minimal 497.86 for Mollicutes and maximal 1,642.90 for Cyanobacteria. The top 10 species with the highest COG retention numbers were all Proteobacteria, and 9 out of the bottom 10 were those that could not be cultured in vitro. The numbers of proteins belonging to each COG ranged from 2 to 22,048, with over 12,000 proteins up to the top 11. Five of the top 11 were COGs that bind to DNA and were involved in the gene expression, indicating the importance of regulating gene expression in prokaryotes in a changing environment. COG data are expected to be widely utilized as they can be used for the identification of genes included in the genome and the selection of genes for the strain improvement.

• The Journal of the Korea Contents Association
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• v.22 no.10
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• pp.554-562
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• 2022

Humans technological advancements have resulted in the depletion of whale resources. Accordingly, the International Whaling Commission was established to preserve whale resources and ensure the orderly development of the whaling industry. After a commercial whaling moratorium came into effect, the international trade of whale meat and related products was banned. However, There is a systematic activity through illegal remodeling ships because whales incidentally caught may be distributed in Korea and have a significant economic benefit. Although suspected illegal whaling is actively cracked down, but it is still insufficient to prevent illegal whaling and distribution. To prevent this, stereoscopic crackdowns utilizing air forces and patrol ships are effective, and it is necessary to quickly separate the captured ship and crew to prevent the destruction of evidence. For the transparent distribution of whale meat, it is necessary to advance related technologies such as whale species identification and individual identification of forensic science institutions based on whale DNA database of the National Institute of Fisheries Science. Accordingly, the Korea Coast Guard Research Center is directly conducting research on related national R&D project. To increase the efficiency of identifying whale-related evidence at crime scene, a rapid test kit that responds specifically to whale bloodstrains is developing and evidence transport packs are manufacturing and distributing, while identification technologies are also being advanced.

• Journal of Life Science
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• v.31 no.10
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• pp.913-921
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• 2021

Limb-girdle muscular dystrophy (LGMD) which is characterized by progressive muscle weakening of the hip and shoulder shows both dominant and recessive inheritances with many pathogenic genes including TTN. This study performed to identify genetic causes of a male patient with late onset (45 years old) autosomal recessive LGMD and atrial flutter. By application of the whole exome sequencing, we identified bi-allelic variants of TTN gene in the patient. One allele had a single missense variant of [c.24124G>T (p.V8042F)], while the other allele consisted of three missense variants of [c.29222G>C (p.R9741P) + c.67490A>G (p.H22497R) + c.75376C>T (p.R25126C)]. The p.V8042F allele was transmitted from his mother, while the other haplotype allele was putatively transmitted from his father. His two unaffected sons had only the p.R9741P. These variants have been not reported or rarely reported in the public human genome databases (1,000 Genome, gnomAD, and KRGDB). Most variants were located in the highly conserved immunoglobulin or fibronectin domains and were predicted to be pathogenic by the in silico analyses. The TTN giant protein plays a key role in muscle assembly, force transmission at the Z-line, and maintenance of resting tension in the I-band. In conclusion, we think that these bi-allelic compound heterozygous mutations may play a role as the genetic causes of the LGMD phenotype.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2004.10c
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• pp.514-516
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• 2004

위성의 개발을 위해서는 오랜 개발기간과 많은 예산, 축적된 기술이 요구된다. 또한 위성에는 다양한 분야의 기술이 사용되어지기 때문에 각 서브시스템마다 독자적인 개발환경을 구축할 필요가 있다. 특히 위성의 찌어. 임무수행 및 지상과의 통신 등을 담당하는 탑재소프트웨어는 위성의 용도 및 목적에 따라 개발환경이 크게 달라진다. 실시간 운영체제는 무엇을 사용하는지, 개발 및 검증을 위한 도구로 어떤 프로그램을 사용하는지, 내외부의 인터페이스는 어떠한 방식으로 수행할지, 새로운 기능의 CPU나 하드웨어에 대한 제어 등 위성의 탑재소프트웨어를 개발하기 위해서는 많은 검토 항목들이 고려되어야 한다. 새로운 위성을 개발할 경우 신기술의 적용과 새로운 시스템위성시스템의 검증 및 개발을 위한 개발검증장비가 요if되며, 위성시스템의 변경 때마다 개발검증장비를 새로이 구축하게 되면 많은 기간과 막대한 비용이 위성개발 시마다 소요된다. 위성선진국에서는 다양한 위성의 개발 시 비용절감 및 개발기간 단축을 위하여 범용위성용 개발검증장비를 개발하여 이용하고 있는 추세이다. 국내에서는 다목적실용위성 1호가 발사되어 성공적으로 임무를 수행하고 있으며 다목 실용위성 2호가 개발되어 현재 통합 및 조립시험이 진행 중이다. 그러나 새로운 위성시스템의 사전 검증 및 신기술의 적용을 위한 범용위성 시스템 테스트베드에 대한 기술은 미비한 실정이다. 이러한 범용위성용 개발검증장비의 기반기술을 확보하기 위하며 현재 위성전자전산시스템 개발검증장비에 대한 연구가 수행되고 있다. 본 논문에서는 현재 수행되고 있는 PowerPC를 이용한 위성 탑재소프트웨어 개발검증시스템의 설계 및 개발현황에 대하여 소개한다.이스는 실험정보가 저장된 데이터베이스, 분석결과가 저장된 데이터베이스, 그리고 유전자 정보 탐색을 위한 데이터베이스로 분류해 데이터를 효율적으로 관리할 수 있게 하였다. 본 시스템은 LiNUX를 운영체계로 하고 데이터베이스는 MYSQL로 하여 JSP, Perl. 통계처리 언어인 R로 구현되었다.프트웨어를 사용하지 않고도 국내의 순수 솔루션인 리눅스 기반의 LonWare 3.0 다중 바인딩 기능을 통해 저 비용으로 홈 네트워크 구성 관리 서버 시스템 개발에 대한 비용을 줄일 수 있다. 기대된다.e 함량이 대체로 높게 나타났다. 점미가 수가용성분에서 goucose대비 용출함량이 고르게 나타나는 경향을 보였고 흑미는 알칼리가용분에서 glucose가 상당량(0.68%) 포함되고 있음을 보여주었고 arabinose(0.68%), xylose(0.05%)도 다른 종류에 비해서 다량 함유한 것으로 나타났다. 흑미는 총식이섬유 함량이 높고 pectic substances, hemicellulose, uronic acid 함량이 높아서 콜레스테롤 저하 등의 효과가 기대되며 고섬유식품으로서 조리 특성 연구가 필요한 것으로 사료된다.리하였다. 얻어진 소견(所見)은 다음과 같았다. 1. 모년령(母年齡), 임신회수(姙娠回數), 임신기간(姙娠其間), 출산시체중등(出産時體重等)의 제요인(諸要因)은 주산기사망(周産基死亡)에 대(對)하여 통계적(統計的)으로 유의(有意)한 영향을 미치고 있어 $25{\sim}29$세(歲)의 연령군에서, 2번째 임신과 2번째의 출산에서 그리고 만삭의 임신 기간에, 출산시체중(出産時體重) $3.50{\sim}3.99kg$사이의 아이에