• Title/Summary/Keyword: 유전자원 평가

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국가농업생명자원의 통합관리 효율화를 위한 농업유전자원 정보관리시스템(GMS) 개선 및 운영 현황

  • 유은애;유동수;조규택;강만정
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2022.09a
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    • pp.53-53
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    • 2022
  • 대한민국의 농업생명자원 중 식물유전자원은 농촌진흥청 국립농업과학원 농업유전자원센터와 지방자치단체, 대학, 연구소 등 전국 79개 관리기관에서 보존하고 있으며 책임기관인 농업유전자원센터에서는 종자 1,599종 246,097자원, 관리기관은 영양체자원 1,476종 26,254자원을 관리하고 있다. 유전자원 관리(수집/증식/등록/평가/분양 등) 업무 중 생산되는 대량의 정보를 관리하기 위해서 농업유전자원 정보를 DB 구축하였다. 구축된 정보는 학명 등 기초정보, 형태·저항성 등 특성 정보, 화상·종자량·활력·분양·증식 등으로 구분하여 데이터베이스화하고, 이 정보를 관리하기 위한 농업유전자원관리시스템(Germplasm Management System, GMS)을 운영하였으나 개선전 프로그램은 설치 후 주기적인 업데이트를 해야하고, 하드웨어 교체시 프로그램을 재설치를 해야하는 번거로움이 존재하였다. 이러한 문제를 해결하기 위해 HTML5 방식으로 개선하였다. 개선 프로그램은 웹 브라우저(크롬, 마이크로소트 엣지 등)에 실행 주소(genebank.rda.go.kr/gms)를 입력만 하면 전국 79개 관리기관에서 자원을 접수하고 평가한 정보를 어디에서든 확인이 가능하다(메뉴사용 및 권한설정은 필요). 개선된 농업유전자원 정보관리시스템은 국가적 차원의 통합관리를 지원하여 농업생명자원을 효율적으로 관리하고 수요자가 원하는 자원에 대한 적절한 정보제공을 함으로써 농업생명자원의 활용 촉진에 기여할 것으로 기대된다.

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Year-dependent variations of organic acid contents in pre-matured fruits of 175 Korean Prunus mume landraces. (국내 수집 매실유전자원의 청매실 함유 유기산 함량의 연차 변이)

  • Gwak, Bo-Kyeong;Eom, Soyeong;Wimonmuang, Kanphassorn;Kang, Hee-Kyoung;Lee, Young-Sang
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2018.10a
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    • pp.115-115
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    • 2018
  • 매실나무(Prunus mume)의 풋과일인 매실은 피로회복, 소화촉진, 살균 및 항균작용 등 다양한 생리활성을 갖고 있다. 본 연구는 국내 수집 매실 유전자원 172점의 핵심 기능성 물질인 유기산의 함량 특성을 평가하고자 2017년과 2018년 2년간 청매실을 수확하여 옥살산(OA), 사과산(MA), 구연산(CA)의 함량을 HPLC를 이용하여 분석하고 그 연차 변이를 평가하였다. 전체 유전자원 매실의 2년간 총유기산(TA) 함량은 평균 5.5% (최소 3.9%-최대 7.8%)이었으며, MA와 CA 및 OA의 평균 함량은 각각 2.7%, 2.8%, 0.1%였다. 대상 자원 내 유기산별 함량 변이는 CA (RSD=30%)가 MA (RSD=21%)보다 높게 나타났다. 2018년산 매실은 2017년산에 비교할 때 MA와 OA는 함량이 낮아 연차 변이가 인정되었으나 CA는 차이가 없었다. 비록 연차 변이는 있었으나 유전자원별 함량은 MA와 CA 및 TA에서 모두 2017년산과 2018년산간 정의 상관이 인정되어 유기산 함량이 높고 낮은 자원의 특성은 유지됨을 알 수 있었다. 대상 유전자원 중 TA함량이 가장 높았던 자원은 구산매, 용흥흥매, 상금백옥매 등이었으며, 함량이 낮은 자원은 한산매, 지곡매 등이었다. 상기 결과를 통해 매실 유기산 함량관련 국내 매실 유전자원의 유전적 다양성과 연차 변이의 영향을 평가할 수 있었다.

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Evaluation of Morphological Traits in Perilla frutescens Germplasm (들깨 유전자원의 형태적 특성)

  • Do Yoon Hyun;Kyung Jun Lee;Gyu-Taek Cho;Seungbum Lee;Ik Jang;Eunae Yoo;Sookyeong Lee;SeongHoon Kim
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2020.08a
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    • pp.40-40
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    • 2020
  • 들깨(Perilla frutescens L.)는 꿀풀과 1년생 초본으로 한국, 중국 등의 동부 아시아가 원산지로 식용, 약용 및 공업용 등 다양한 용도로 이용되고 있다 들깨는 우리나라에서 오랜시간 재배해 왔으나 체계적인 연구기간이 짧아, 다른 유료작물에 비해 육성품종이 적고 유전자원의 체계적인 수집평가가 이루어지지 않았다. 특히 외국에서는 들깨와 근연종을 이용하여 색소 및 정유성분에 대한 연구를 하는데 비해 우리나라에서는 주로 식용으로만 연구가 진행되고 있다. 들깨 육종에 있어서 중요한 것은 유전자원 확보와 이를 정리 보존하여 우량한 육종재료를 효율적으로 이용하는 것이다. 본 연구에서는 국내에서 수집한 들깨 44자원의 형태적 특성을 조사하여 품종 육성을 위한 기초자료를 제공하고자 하였다. 본 연구에 사용된 들깨 자원은 경북 수집 10자원으로 가장 많았으며 전북 8자원, 경남 7자원, 강원과 경기에서 각각 6자원, 충남 3자원, 전남과 충북에서 각각 2자원이었다. 화색은 들깨 44자원 모두 흰색이었으며 줄기색은 연녹색이 29자원, 녹색 9자원, 자주색 4자원으로 조사되었다. 잎의 앞면은 녹색 27자원, 연녹색 10자원, 진녹색 7자원이었으며 뒷면색은 녹색 26자원, 연녹색 18자원으로 조사되었다. 잎의 모양은 장타원형 21자원, 피침형 15자원, 심장형 7자원이었으며 잎의 모용은 23자원이 적음, 14자원이 보통, 6자원이 많게 조사되었다. 잎의 길이는 35자원이 15.1cm이상으로 조사되었고 잎넓이는 11.1cm이상인 자원이 37자원으로 조사되었다. 종피색은 갈색이 28자원, 회색이 6자원, 암갈색이 3자원 순으로 조사되었다. 본 실험에서 조사된 들깨 유전자원의 형태적 특성은 들깨 선발에 있어 기초 정보로 활용 가능할 것이며 추가적으로 농업형질, 기능성 물질 분석등의 들깨 육종 프로그램을 위한 다양한 평가 및 선발이 필요할 것이다.

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Evaluation of Baby-leaf Growth and Leaf Red Color Intensity for Amaranthus Germplasm (아마란스(Amaranthus ssp.) 유전자원의 어린잎 생육과 엽 적색도 평가)

  • Lee, Jun-Gu;Jang, Yoon-Ah;Um, Yeong-Cheol;Lee, Sang-Gyu
    • Journal of agriculture & life science
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    • v.46 no.6
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    • pp.59-65
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    • 2012
  • This study evaluated the baby-leaf growth, leaf red color intensity, and phytochemical compounds, such as total phenols and total flavonoids using domestic Amaranthus accessions, to select promising germplasm for the use of baby-leaf vegetable. The 39 accessions, upper 15% of 262 Amaranthus germplasm collection showing high red color intensity in baby-leaf, measured as Hunter's a value, were primarily selected. The eleven accessions including IT199970, showing stable red color intensity in baby-leaf both in high-temperature and low temperature cultivation, were finally selected as promising germplasm for the use of baby-leaf vegetable Amaranthus. The leaf red color intensities when they were cultivated at low temperature period were generally higher than those at low temperature period, and all the eleven selected germplasm, including four Amaranthus sub-species and five unknown species, showed stable red color expression in baby-leaf. The total phenol and total flavonoid contents were also presented for finally selected germplasm including their baby-leaf fresh weights. These finally selected germplasm could be potentially used as baby-leaf vegetable resources, through fortifying the color balance of salad vegetable.

Evaluation of waterlogging tolerance using chlorophyll fluorescence reaction in the seedlings of Korean ginseng (Panax ginseng C. A. Meyer) accessions (엽록소 형광반응을 이용한 인삼 유전자원의 습해 스트레스 평가)

  • Jee, Moo Geun;Hong, Young Ki;Kim, Sun Ick;Park, Yong Chan;Lee, Ka Soon;Jang, Won Suk;Kwon, A Reum;Seong, Bong Jae;Kim, Me-Sun;Cho, Yong-Gu
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • v.49 no.3
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    • pp.240-249
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    • 2022
  • Measuring chlorophyll fluorescence (CF) is a useful tool for assessing a plant's ability to tolerate abiotic stresses such as drought, waterlogging and high temperature. Korean ginseng is highly sensitive to water stress in paddy fields. To evaluate the possibility of non-destructively diagnosing waterlogging stress using chlorophyll fluorescence (CF) imaging techniques, we screened 57 ginseng accessions for waterlogging tolerance. To evaluate waterlogging tolerance among the 2-year-old Korean ginseng accessions, we treated ginseng plants with water stress for 25 days. The physiological disorder rate was characterized through visual assessment (an assigned score of 0-5). The physiological disorder rates of Geumjin, Geumsun and GS00-58 were lower than that of other accessions. In contrast, lines GS97-62, GS97-69 and GS98-1-5 were deemed susceptible. Root traits, chlorophyll content and the reduction rates decreased in most ginseng accessions. Further, these metrics were significantly lower in susceptible genotypes compared to resistant ones. All CF parameters showed a positive or negative response to waterlogging stress, and this response continuously increased over the treatment time among the genotypes. The CF parameter Fv/Fm was used to screen the 57 accessions, and the results showed clear differences in Fv/Fm between the susceptible and resistant genotypes. Susceptible genotypes had an especially low Fv/Fm value of less than 0.8, reflecting damage to the reaction center of photosystem II. It is concluded that Fv/Fm can be used as a CF parameter index for screening waterlogging stress tolerance in ginseng genotypes.

Determination of Seed Fatty Acids Using Near-Infrared Reflectance Spectroscopy(NIR) in Mung Bean(Vigna radiata) Germplasm (녹두 유전자원 지방산 함량 대량평가를 위한 근적외선분광법의 적용)

  • Lee, Young-Yi;Kim, Jung-Bong;Lee, Sok-Young;Kim, Min-Hee;Lee, Jung-Won;Lee, Ho-Sun;Ko, Ho-Cheol;Hyun, Do-Yoon;Gwag, Jae-Gyun;Kim, Chung-Kon;Lee, Yong-Beom
    • The Korean Journal of Food And Nutrition
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    • v.23 no.4
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    • pp.582-587
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    • 2010
  • 본 연구에서는 녹두 유전자원의 지방산 함량을 신속 대량 검정하는 기술을 개발하여 유전자원 활용 및 육종 촉진에 기여하고자 하였다. 유전자원 평가에 적합한 신속하고 비파괴적인 지방산 함량 평가기술을 개발하기 위해 공시자원 1,125점의 녹두 종자를 종실상태와 분쇄한 분말상태로 근적외선분광분석기(NIR)를 이용하여 1,104~2,494 nm에서의 스펙트럼을 얻고 이들 중 스펙트럼이 중복되지 않는 원산지가 다양한 대표자원 106점을 선발하여 일반적인 방법으로 지방산 함량을 분석하고, 이 값과 NIR 스펙트럼 흡광도값 간의 상관분석을 위한 calibration set로 활용하였다. 그 결과 palmitic acid, stearic acid, oleic acid, linoleic acid, linolenic acid 및 total fatty acid에 대한 NIR 흡광도와의 상관계수 $R^2$이 각각 0.74, 0.18, 0.12, 0.72, 0.48 및 0.78로 나타났고, 이들 중 $R^2$가 높은 검량식을 미지의 시료 10점으로 검증한 결과, palmitic, linoleic 및 total fatty acid에 대한 검증 상관계수 $R^2$이 0.96, 0.74, 0.81로 나타나, 다양한 녹두 유전자원의 지방산함량 신속 대량 예측에 유효하게 활용될 수 있는 것으로 나타났다. 한편, 공시된 녹두 유전자원 115점 중에서 자원번호 IT208075 자원은 저 지방산 자원($14.24\;mg\;g^{-1}$)으로 선발되었고, IT163279 자원은 고 지방산 자원($18.43\;mg\;g^{-1}$)으로 선발되어 향후 녹두작물의 성분육종에 유용할 것으로 생각된다.

Evaluation of Morphological Traits in Eggplant germplasm (가지 유전자원의 형태적 특성)

  • Seungbum Lee;Kyung Jun Lee;Gyu-Taek Cho;Ik Jang;Eunae Yoo;Sookyeong Lee;SeongHoon Kim;Do Yoon Hyun
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2020.08a
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    • pp.41-41
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    • 2020
  • 가지(Solanum melongena L..)는 가지과 식물로 인도 동부가 원산지로 추정이 되며 우리나라를 포함해서 전세계적으로 널리 이용되고 있다. 가지는 다른 과채에 비해 비타민 함량은 낮으나 무기질과 폴리페놀, 식이섬유가 풍부하고 항균, 항암, 항산화활성을 가지는 것으로 보고되어 있다. 본 연구에서는 국내외에서 수집된 가지 유전자원의 형태적 특성을 조사하여 품종 육성을 위한 기초자료를 제공하고자 하였다. 본 연구에 사용된 가지 자원은 필리핀 78자원, 영국 78자원, 중국 45자원, 한국 12자원 등 16개 국가에서 수집된 459자원을 대상으로 하였다. 가지 유전자원의 생육 특성은 반직립형 437자원으로 가장 많았으며 직립형 15자원, 수평형 7자원으로 조사되었다. 하배축의 안토시아닌은 301자원이 있는 것으로 조사되었고 줄기 안토시아닌 축적은 258자원에서 조사되었다. 가시의 여부는 줄기에 31자원, 잎에 30자원이 조사되었으며 IT189682는 특이적으로 줄기에서만 가시가 조사되었다. 화색의 경우 흰색 31자원, 자주 207자원, 연자주 217자원, 흰자주 4자원으로 조사되었으며 꽃의 크기는 중간이 340자원으로 대부분을 차지했으며 큰 꽃 28자원, 작은 꽃 1자원(IT136568)으로 조사되었다. 과실의 형태는 원형 77자원, 타원형 27자원, 난형 31자원, 서양배형 57자원 곤봉형 88자원, 원통형 84자원, 긴원통형 95자원으로 다양하게 조사되었으며 과실 성숙색은 녹색 94자원, 흰색 16자원, 녹자주 67자원, 백자주 21자원, 자주 240자원, 주황 8자원, 노랑 13자원으로 조사되었다. 과실의 길이는 1.4(IT283605) ~ 40.5cm(K003875)로 평균 17.4cm였으며 두께는 0.7(IT283605) ~ 13.7cm(K162043)으로 평균 5.6cm 조사되었다. 본 실험에서 조사된 가지유전자원의 형태적 특성은 가지 선발에 있어 기초 정보로 활용 가능할 것이며 추가적으로 농업형질, 기능성 물질 분석등의 가지 육종 프로그램을 위한 다양한 평가 및 선발이 필요할 것이다.

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Customers' Needs Analysis for Distribution and Utilization of Plant Genetic Resources in RDA-Genebank (농업유전자원은행의 식물유전자원 분양 활용에 대한 수요자 요구도 분석)

  • Kim, Chang-Yung;Cho, Gyu-Taek;Baek, Hyung-Jin;Lee, Sok-Young;Lee, Myung-Chul;Lee, Young-Yi;Choi, Yu-Mi
    • Korean Journal of Plant Resources
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    • v.26 no.2
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    • pp.328-335
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    • 2013
  • The National Agrobiodiversity Center is the nodal agency assigned as the National Agricultural Genebank of the Rural Development Administration. Its main role is to collect, conserve, evaluate and distribute plant genetic resources. As of 2010, NAC has distributed a total of 380,981 accessions in the last 20 years (1991-2010) or an average of about 19,000 accessions per year. To meet customers' demands for germplasm and derive quality improvements, a mail survey in 2011 was conducted among the genetic resource users in 2010. Most of the clients obtained information on the germplasm conserved in the national genebank from the NAC website or NAC staff, and they sought specific traits in the samples. Most users received the materials within 15 days, and wanted useful data together with genetic resource. Korean landrace was the most frequently requested accessions. According to the survey results, it is supposed that useful genetic resources should be preferentially collected and their characterization/evaluation should be strengthened to enhance the utilization of genetic resources.