• Title/Summary/Keyword: 유전자독성

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Microarray Analysis of Gene Expression in RAW Cells Treated with Carthami Flos Herbal Acupuncture Solution (홍화약침액(紅花藥鍼液)이 RAW Cell 유전자발현(遺傳子發顯)에 미치는 영향(影響))

  • Kang, Seung-Beom;Kim, Jong-In;Kim, Yong-Seok;Kang, Sung-Keel;Koh, Hyung-Kyun
    • Journal of Acupuncture Research
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    • v.25 no.1
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    • pp.139-154
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    • 2008
  • 목적 : 홍화(紅花)는 활혈거어(活血祛瘀), 해독지통(解毒止痛)의 효능이 있어 관절염, 동맥경화(動脈硬化), 종양(腫瘍), 월경부조(月經不調), 뇌혈전(腦血栓)에 사용되어 왔다. 이에 홍화약침액(紅花藥鍼液)의 분자생물학적 효능 분석을 하고자 Lipopolysaccharide(LPS)로 염증을 유발한 RAW 264.7 cell의 유전자(遺傳子) 발현(發顯)에 미치는 영향을 Microarray를 통하여 관찰하였다. 방법 : RAW cell을 배양하고 홍화약침액(紅花藥鍼液)의 세포 독성을 확인한 후 (1) LPS, (2) 홍화약침액(紅花藥鍼液), (3) 홍화약침액(紅花藥鍼液)과 LPS를 처치했을 때의 유전자 발현양상을 microarray를 이용하여 관찰하였다. 대조군에 비해 2배 이상 발현의 차이가 있는 경우를 유의한 것으로 보았다. 결과 : 8,170개의 유전자 중 (1) LPS를 처치하였을 경우 35개의 유전자에서 발현이 상승되었고, (2) 홍화약침액(紅花藥鍼液)을 처치하였을 경우 11개의 유전자에서 발현이 상승되고 53개의 유전자에서 발현이 억제되었으며, (3) 홍화약침액(紅花藥鍼液)과 LPS를 동시에 처치하였을 경우에는 47개의 유전자에서 발현이 상승되었고 11개의 유전자에서 발현이 억제되었다. LPS 자극으로 발현이 상승되었지만 홍화약침액(紅花藥鍼液)을 처치할 때 발현이 억제되는 유전자는 SUMO1/sentrin specific protease 7(SENP7), Serine(or cysteine) proteinase inhibitor, clade B(ovalbumin), member 7(SERPINB7), M-phase phosphoprotein, mpp8(HSMPP8), Glycogenin 2(GYG2), InaD-like(Drosophila)(INADL), Copine III(CPNE3), Loss of heterozygosity, 11, chromosomal region 2, gene A(LOH11CR2A), Chromosome 9 open reading frame 33(SHC3), NADH dehydrogenase(ubiquinone) 1 beta subcomplex, 2, 8kDa(NDUFB2)로 9개가 있었다. 요약 : 홍화약침액(紅花藥鍼液)이 LPS로 염증을 유발시킨 RAW 264.7 cell의 유전자 발현에 미치는 영향을 Microarray를 통해 분석하였다. 홍화약침액(紅花藥鍼液)이 LPS로 발현을 항진시킨 35개의 유전자 중 9개를 효과적으로 억제하는 것을 확인하여 염증 치료 기전을 시사하는 유용한 자료를 얻을 수 있었으며 홍화약침액(紅花藥鍼液)이 발현을 항진시킨 유전자들을 통해 혈관생성과 종양억제 등 보다 넓은 범위에 대한 연구가 가능할 것으로 사료된다.

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무당개구리에서 내분비계장애물질에 의한 발생독성 평가

  • Gang, Han-Seung;Gye, Myeong-Chan;Kim, Mun-Gyu
    • Proceedings of the Korea Society of Environmental Biology Conference
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    • 2005.12a
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    • pp.22-35
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    • 2005
  • 내분비계 장애물질 (Endocrine Disruptors: EDs)이란 ‘내분비 기능에 변화를 일으켜, 생체 또는 그 자손의 건강에 위해한 영향을 미치는 외인성 물질’로서 세계야생생물보호기금 (World Wildife Fund: WWF)의 목록에는 67 여종, 일본 후생성에서는 142 여종의 물질을 내분비계 장애물질로 분류하고 있다. 이렇게 분류된 내분비계장애물질 가운데에는 많은 종류의 농약이 포함되어 있으며, 이들이 자연상태계에 미치는 영향에 대한 많은 보고가 있다. 양서류는 먹이연쇄의 중위포식자로 내분비계 장애물질의 순환 및 생채축적 회로에서 중요한 위치를 갖는다. 또한 농경지나 계류 등에 서식하며 산란하는 습성이 있다. 이러한 서식지는 농약 등에 노출받기 쉬우므로 환경오염평가 대상동물로 중요하다. 본 연구에서는 국내에서 사용되고 있는 제초제, 살충제 등이 양서류 발생에 미치는 영향을 평가하고, 이들 물질에 의한 노출을 평가할 수 있는 biomarker 유전자를 발굴하고자 하였다. 우리나라 전역에 많이 분포하는 무당개구리(Bombina orientalis)의 초기 배아발생 과정에서 이들 농약을 처리하였을 때, 물질의 종류에 따라 정도의 차이는 있으나 농도 의존적으로 배아 및 올챙이의 치사율이 높게 나타났다. 또한 농약은 배아 및 올챙이의 기형을 유발하였다. 기형의 종류는 농약에 따라 서로 상이한 형태로도 나타났으나, 특히 몸통휨 또는 꼬리휨등의 척추골 기형이 많이 나타났다. 환경 위해성 평가 biomarker 유전자로서 골격계 형성에 관여하는 Sox9 유전자를 선택하였다. 무당개구리에서 처음으로 Sox9 유전자를 동정하였으며, 농약을 처리한 실험군에서의 Sox9 유전자의 발현 양상은 대조군에 비하여 높게 나타났다. 본 연구결과 생태계에서 내분비계 장애물질의 위해성 평가를 위해 양서류 초기배아의 치사 및 기형의 정도를 관찰하는 방법이 유효할 것으로 사료된다. 또한 야생동물의 biomarker 유전자를 발굴과 이를 이용한 위해성 평가는 더욱 정밀한 평가법으로 유용할 것이다.

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Analysis of Gene Expression in Benzo[a]pyrene-exposed Sebastes schlegeli using Differential Display Polymerase Chain Reaction (DD-PCR을 이용한 벤조피렌 노출 조피볼락의 차등 발현 유전자 분석)

  • Yum Seungshic;Woo Seonock;Choi Eunseok;Kim Sojung;Oh Rora;Lee Sukchan;Lee Taek Kyun
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • v.20 no.1
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    • pp.67-73
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    • 2005
  • 오염물질의 노출에 의해 발현이 변화되는 유전자의 발굴은 외부환경 자극에 대한 적응이나 반응의 메커니즘을 알아내는뎨 중요한 정보를 제공하며, 오염물질에 반응하는 유전자는 환경오염을 감지하는 분자 마커로 개발될 수 있다. DD-PCR 기법은 차등 발현 유전자들을 발굴해내기 위한 유용한 방법으로 사용되어 왔고, 본 연구는 이 방법을 이용하여 벤조피렌에 반응하는 조피볼락 유전자들의 발굴을 목적으로 진행되었다. 간조직에서 추출한 RNA로부터 벤조피렌의 노출에 의해 발현 양이 달라진 12개의 클론을 발굴하였고, 그 염기서 열을 분석하였다. 또한 벤조피렌의 노출시간을 각각 6, 12, 24시간으로 달리한 조피볼락에서 12개의 클론 중 4개의 클론에 대해 northern blot 분석이 실시되었으며, 이들 모두 노출시간에 따 라 발현양이 증가 또는 감소하는 것이 확인되었다. 본 연구결과는 오염물질의 영향에 의한 유전자들의 발현에 관한 전반적인 지식을 제공하였고, 나아가 환경오염이나 외부 스트레스를 감지해 낼 수 있는 바이오마커의 개발을 위한 첫 단계로서의 정보를 제공할 수 있을 것으로 생각된다.

The Correlation between Toxin Genotype and Antibiotic Resistance in Methicillin Resistant Staphylococcus aureus Isolated from Clinical Specimen of Intensive Care Unit (중환자실의 임상검체로부터 분리된 Methicillin 내성 Staphylococcus aureus의 독소유전자형과 항생제내성의 상관관계)

  • Park, Chul;Seong, Chi Nam
    • Korean Journal of Clinical Laboratory Science
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    • v.48 no.3
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    • pp.202-209
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    • 2016
  • This study is aimed to determine the correlation between the toxin gene types and antibiotic resistance from MRSA (methicillin-resistant Staphylococcus aureus). Fifty-two strains of MRSA, between January 2014, and December 2014, were isolated from clinical specimens obtained from 2,664 cases in the intensive care unit of a hospital in Suncheon, Jeonnam, Korea. Genes encoding mecA, enterotoxin (SE), toxic shock syndrome toxin-1 (TSST-1), exfoliative toxin (ET), and Panton-Valentine leukocidin (PVL) were detected by multiplex PCR-mediated amplification using specific primers. Toxin genes (seg and sei) were present in 40 strains (76.9%), followed by tst in 34 strains (65.4%). Other genes (eta, etb, sea, sed, see, seh, sej, and pvl) were not detected. Forty strains (76.9%) of MRSA had 2 or more toxin genes simultaneously; 5 coexistent toxin-genes (seb, sec, seg, sei, tst) were the most common in 28 strains (53.8%), and 6 strains (11.5%) had seg and sei genes. The coexistence of genes were 72.5~100%, showing a high correlation among genes (seb, sec, seg, sei and tst). As strains (seb, sec, tst) that had particular toxin genes (seb, sec, seg, sei, tst) in multiple showed 100% resistance to ciprofloxacin, clindamycin, erythromycin, we were able to find that seb, sec, and tst genes have a close relationship to the aforementioned antibiotics. It showed a higher resistance to ciprofloxacin, clindamycin, erythromycin, and tetracycline compared with strains that had toxin genes independent from multiple toxin genes.

Cytotoxicity and Apoptosis of Various Concentrations of Doxorubicin in Methylcholanthrene- induced Rat Fibrosarcoma(MCA) Cells (Methylcholanthrene 유도 섬유육종세포주에서 Doxorubicin 농도에 따른 세포독성과 자멸사의 변화)

  • 정진용;왕영필;나석주
    • Journal of Chest Surgery
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    • v.34 no.6
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    • pp.447-453
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    • 2001
  • Background: Although pulmonary resection is the standard approach for the management of pulmonary metastases from soft tissue sarcoma, most of them are unresectable and chemotherapy remains the only option. The effectiveness of the cytotoxic drugs may be limited by the toxicities that occur before the therapeutic dose is reached. The regional administration of doxorubicin using pulmonary arterial perfusion in a rodent model can produce 10 to 25 times higher concentrations in the lung than systemic administration with minimal systemic toxicities. However, it is unclear whether a high concentration of doxorubicin has beneficial effects for killing cancer cells. Material and Method: We studied this to evaluate the dose-dependent cytotoxic and apoptotic effects of doxorubicin on methylcholanthrene-induced rat fibrosarcoma(MCA) cells. This study examined the cytotoxicity and apoptosis-related gene expressions(Fas, FasL, Bax, caspase 1, caspase 2, caspase 8, Bcl-2, Bcl-xL, Bcl-xS) in MCA cells after 24 hours exposure to various concentrations of doxorubicin such as 1, 5, 10, 50, and 100 $\mu$M. Result: Dose-dependent cytotoxicity was observed after 24 hours exposure to doxorubicin. However, peak apoptosis after 24 hours exposure was observed at 5 $\mu$M of doxorubicin. Above 5 $\mu$M, apoptotic activity was decreased with dose-increment. All mRNA levels of apoptosis-related genes after 24 hours exposure were up-regulated above the control level at 1 $\mu$M of doxorubicin and then decreased by doxorubicin dose-increment except caspase 8, which showed higher levels than the control level at 5 $\mu$M. Apoptosis-related protein levels were highest at 1 $\mu$M of doxorubicin and then decreased by doxorubicin dose-increment. However, Bax and Bcl-xL proteins steadily showed higher levels than the control throughout the different concentrations of doxorubicin. Conclusion: These results suggest that apoptosis is the main cytotoxic mechanism in low concentrations of doxorubicin in MCA cells and apoptosis-related genes, such as Bax, caspase 8, and Bcl-xL, are involved. At high concentrations, doxorubicin still can kill MCA cells, even when apoptosis is inhibited, and have its propriety for achieving much cytotoxicity against MCA cells.

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Toxicity of the Adenoviral Vector Mediated Gene Therapy (아데노바이러스 유전자치료제의 독성)

  • Chung, In-Jae
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • v.24 no.1
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    • pp.71-77
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    • 2009
  • Adenoviral vector(AdV) has been the most widely used viral vector for delivering an exogenous therapeutic gene to human. As of this date, more clinical trials utilize recombinant AdV to treat cancer and monogenic inherited disease as well as vaccine applications. However, the number of clinical trials had dropped markedly following the tragic death of a patient ongoing an AdV therapy for the treatment of an ornithine transcarbamylase deficiency(OTCD). This review is an attempt to provide the information on toxicity generated by AdVmediated gene transfer. It would serve as a sobering reality to researchers and clinicians exploring the use of AdV, as to the complications involved in human application.

Novel Gene Delivery Carrier Using Chitosan-Lipoic Acid Comb-Type Copolymer (키토산-리포산 빗살형 공중합체를 이용한 유전자 전달체 개발)

  • Kwon, Sang-Kyoo;Kim, Sung-Wan;Kim, Young-Jin
    • Polymer(Korea)
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    • v.34 no.6
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    • pp.501-506
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    • 2010
  • Natural chitosan has high molecular weight and the poor solubility in water. Water-soluble chitosan with low molecular weight was prepared by the hydrolysis method. In order to develop an efficient gene delivery carrier, chitosan was conjugated with lipoic acid to form the comb-type copolymer. The copolymer with the amphiphilic property formed the self-assembled nanoparticles in the aqueous solution. The average size of nanoparticles was 217.6 nm and the average size of nanoparticles/DNA complex was 170 nm. New chitosan-lipoic acid copolymer showed the low cytotoxicity and 10 times higher transfection efficiency than that of the pure chitosan.

Effect or Onion(Allium cepa L.) Ectract on Tyrosinase Gene Expression (양파(Allium cepa. L)추출물이 Tyosinase 유전자 발현에 미치는 효과)

  • 조남철;윤연희;이혜진;손현정;김양경;최근희;나명석;이황희;진종언
    • The Korean Journal of Food And Nutrition
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    • v.14 no.3
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    • pp.228-232
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    • 2001
  • Melanin 생선에 관여하는 tyrosinase 유전자의 발현을 억제하는 물질을 탐색하고자 tyrosinase promoter를 지닌 B16 mouse melanoma cell.에 양파 methanol 추출물을 처리한 바 양파 methanol추출물은 10.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$, 100.0 $\mu\textrm{g}$/$m\ell$, 1.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$ 농도에서 대조군에 비해서 약 15%, 23%, 57%의 억제효과를 나타냈으며, 세포생존율은 1.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$, 10.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$, 100.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$ 1.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$의 농동에서 약 126%, 92%, 85%, 64%로서 세포독성이 낮게 나타났다. Ethyl acetate butyl alcohol. 그리고 물 용매 분획물은 tyrosinase 유전자의 발현을 억제하는 효과가 없었지만 methylene chloride용해 분획물은 10.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$과 100.0$\mu\textrm{g}$/$m\ell$의 농동에서 약 87%와35%의 발현율을 나타냄으로써 대조군에 비해 크게 억제하였다.

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Prediction and Annotation of ABC Transporter Genes from Magnaporthe oryzae Genome Sequence (벼도열병균 게놈서열로부터 ABC transporter 유전자군의 예측 및 특성 분석)

  • Kim, Yong-Nam;Kim, Jin-Soo;Kim, Su-Young;Kim, Jeong-Hwan;Lee, Jong-Hwan;Choi, Woo-Bong
    • Journal of Life Science
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    • v.20 no.2
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    • pp.176-182
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    • 2010
  • Magnaporthe oryzae is destructive plant-pathogenic fungus and causes rice blast. The pathogen uses several mechanisms to circumvent the inhibitory actions of fungicides. ATP-binding cassette (ABC) transporters are known to provide protection against toxic compounds in the environment. PC facilitated bioinformatic analysis, particularly with respect to accessing and extracting database information and domain identification. We predicted ABC transporter genes from the M. oryzae genome sequence with computation and bioinformatics tools. A total of thirty three genes were predicted to encode ABC transporters. Three of thirty three putative genes corresponded to three known ABC transporter genes (ABC1, ABC2 and ABC3). Copy numbers of the ABC transporter genes were proven by Southern blot analysis, which revealed that twenty genes tested exist as a single copy. We amplified the DNA complementary to RNA corresponding to eleven of these by reverse transcriptase polymerase chain reaction.

Lack of p53 Gene Nucleotide Change in Mutation Hot Spots During HeLa Cell Apoptosis by Adriamycin (아드리아마이신에 의한 HeLa 세포의 자살 과정 중 p53 유전자의 돌연변이 빈발 부위에서의 핵산 변화의 부재)

  • Ryu, Seung-Wook;Kim, Jung-Woo;Kim, Eun-Hee
    • The Journal of Natural Sciences
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    • v.9 no.1
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    • pp.31-37
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    • 1997
  • Apoptosis is an important event in the anticancer drug therapy. p53 was demonstrated to serve a key component to lead tumor cell death by inducing apoptosis. However, recent study showed the presence of p53 independent apoptotic pathway (Gaftenhaus et al., 1996). We were curious to know it apoptosis induced by adriamycin, a genotoxic anticancer agent, involved p53 gene mutation. Thus this study investigated the p53 gene mutation status among HeLa cell population during apoptosis induced by adriamycin. Under our experimental condition, 12 hour treatment of 1 ${\mu}m$ adriamycin caused apoptosis which was monitored by DNA fragmentation assay. In order to see the p53 gene mutation status, exons of 5, 7 and 8 of p53 gene, where previously reported p53 mutation hot spots reside, were amplified by PCR and nucleotide sequence change was scanned. However, no nucleotide change was observed among apoptotic HeLa cell population. Therefore this study demonstrated that adriamycin induced apoptosis without causing p53 gene damage.

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