• Title/Summary/Keyword: 유전다양도

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Genetic characteristics of Pacific abalone, Haliotis discus hannai in Dokdo Island, Korea (독도연안에 서식하는 전복의 유전학적 특성)

  • Park, Choul-Ji;Lee, Jeong-Ho;Noh, Jae-Koo;Kim, Hyun-Chul;Min, Byoung-Hwa;Myeong, Jeong-In
    • The Korean Journal of Malacology
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    • v.25 no.3
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    • pp.197-201
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    • 2009
  • This study was conducted to investigate the genetic characteristics of wild population of Pacific abalone, Haliotis discus hannai in Dokdo island. We used six polymorphic microsatellite marker to investigate the genetic diversity and population structure. The loci Hdh1321 and Hdh512 had the highest number of allele (34 and 22 respectively) and loci Hdh145 and Awb083 had the lowest (5 and 7 respectively). The mean number of allele per locus was 14.8. The average observed and expected heterozygosities were 0.664 and 0.824 respectively, and the average $F_{IS}$ was 0.195. We compared the population genetic parameters of Dokdo population with previously published data of the same species. At the result, the parewise $F_{ST}$ test showed significant difference between the Dokdo population and six populations (published data), suggesting that the genetic relationship of Dokdo population was separated from six populations.

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Genetic Diversity and Population Structure in East Asian Populations of Plantago asiatica (동아시아 질경이 집단의 유전적 다양성과 집단구조)

  • Huh, Man Kyu
    • Journal of Life Science
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    • v.23 no.6
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    • pp.728-735
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    • 2013
  • Plantago asiatica (Plantaginaceae) is a wind-pollinated plant that grows mainly on fields in East Asia. Starch gel electrophoresis was used to investigate the allozyme diversity and population structure of 18 populations of this species. Although the plantain populations were isolated and patchily distributed, they maintained a high level of genetic diversity; the average percentage of polymorphic loci was 57.1%, the mean number of alleles per locus was 2.07, and the average heterozygosity for 18 populations was 0.201. The combination of a predominant wind-pollinated, mix-mating reproduction, large population sizes, high gene flow between subpopulations, and a propensity for high fecundity may explain the high level of genetic diversity within populations. A direct gradient in overall genetic diversity is associated with latitude. Genetic diversity of P. asiatica is markedly decreased from $35^{\circ}3^{\prime}$ to high latitude and decreased from $35^{\circ}3^{\prime}N$ to low latitude, whereas there does not show a longitudinal gradient in genetic diversity.

A Sampling Strategy Considering Genetics Diversity of Abies Koreana in Yeongsil, Mt. Halla Using nSSR Makers (nSSR 마커를 이용한 한라산 영실 구상나무의 유전다양성을 고려한 표본추출전략)

  • Chae, Seung-Beom;Lim, Hyo-In
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2019.10a
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    • pp.27-27
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    • 2019
  • 본 연구는 멸종위기 아고산수종 구상나무의 보존 복원을 위한 유전다양성을 고려한 표본추출전략을 구명하는데 그 목적이 있다. 2019년 9월에 한라산 영실 집단($14,000m^2$)에서 총 152개체를 대상으로 선발된 10개의 nSSR 마커를 이용하여 유전다양성 및 공간적 유전구조를 분석하였다. 평균 유전다양성은 관찰된 대립유전자수(A)가 7.2개, 유효대립유전자수($A_e$)가 3.6개, 이형접합도 관찰치($H_o$)가 0.528, 이형접합도 기대치($H_e$)가 0.595이며, 고정지수(F)는 0.071 이었다. 조사구내 구상나무 성목 152개체는 평균 수고 3.6 m, 흉고직경 17.3 cm로 나타났다. 구상나무의 개체목간 평균거리는 3.94 m, 임분밀도는 700 본/ha 이며 개체의 공간적 분포는 임의분포 형태로 나타났다. 구상나무의 유전변이에 대한 공간적 자기상관성(spatial autocorrelation) 분석 결과, 조사구의 구상나무는 약 15 m 이내에서 분포하는 개체들 간 유전적 유사성이 있게 분포하는 것으로 나타났으며 임분밀도가 높고 수고가 낮은 특성으로 인하여 비교적 작은 유전군락이 형성된 것으로 사료된다. 결과적으로 영실의 구상나무 집단의 보존 복원을 위한 표본추출전략은 15 m의 간격을 두고 개체를 선발하는 것이 타당한 것으로 나타났다.

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Genetic Diversity of Wild Tea(Camellia sinensis L.) in Korea (우리나라 야생 차나무(Camellia sinensis L.)의 유전적 다양성)

  • Oh, Chan-Jin;Lee, Sol;You, Han-Choon;Chae, Jeong-Gi;Han, Sang-Sub
    • Korean Journal of Plant Resources
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    • v.21 no.1
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    • pp.41-46
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    • 2008
  • Molecular relationship and genetic diversity of 21 wild tea collections which grown natural region in Korea were investigated based on PCR-RFLP analysis using DFR genes. Approximately 1.4kb fragment of the DFR gene from wild tea samples were successfully amplified use DFR 4+5 primer pair. On the bases of restriction fragment length polymorphism(RFLP) analysis using Hpa II and Mse I enzymes, three different band patterns shown from Hpa II enzyme and showed genetic diversity between same region wild tea group. Six kind of restriction enzyme profiles obtained from digested with restriction endonuclease Mse I and shown two kind of restriction enzyme profiles collected from same region wild tea at Ungpo. The results of RFLP analysis indicated that wild tea showed genetic diversity among different regions of tea groups, but also between same region wild tea.

Clinical pharmacogenetics (임상약물유전학)

  • 권준택
    • Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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    • 1997.11a
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    • pp.81-85
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    • 1997
  • 인체에 투여된 약물의 반응은 개체간에 현저한 차이가 있으며 특히 환자에게 투여된 약물의 효과가 상이하게 나타남으로써 치료의 실패나 흑은 약물의 유해작용으로 나타나기도 한다. 이러한 개체 상호간의 약물반응의 차이는 환경적인 요소, 영양학적인 요소, 연령, 병용한 다른 약물 및 이미 앓고 있는 질병 등에 의해서도 영향을 받으나 특히 유전적으로 결정된 약물대사 능력의 차이에 의해서도 기인된다. 이러한 측면에서 약물 대사의 유전적인 다양성과 비정상적인 반응을 다루는 약물유전학의 중요성은 최근 두드러지게 대두되고 있다. 특히 유전적인 요인으로 개체간의 차이는 효소의 유전적인 결핍과 관련이 있으며 이 결핍은 생체이물질에 대한 반응의 다양성을 설명할 수 있는 약물대사 능력의 다형성에 기인한다. 또한 약물반응의 다양성은 인종간, 특히 동양인과 서양인에서의 약물반응에서도 차이가 있어 각 인종간의 약물반응의 차이에 대한 연구와 이의 원인규명에 대하여 많은 관심이 집중되고 있다. 이와 같은 견지에서 약물용량과 약물반응, 특히 약동학적 변화의 인종간의 차이와 각 개인의 차이 및 이의 원인에 대하여 살펴보고자 한다.

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A Genetic Algorithm with Modified Mutation for the Traveling Salesman Problem (외판원 문제를 위한 변형된 돌연변이를 적용한 유전 알고리즘)

  • 김정숙;홍영식
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 1998.10a
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    • pp.744-746
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    • 1998
  • 외판원(Traveling Salesman Problem)는 계산 복잡도가 매우 높으므로 이를 해결하려는 다양한 방법들이 제시되어 왔다. 최근에는 특히 휴리스틱(Heuristic) 에 기반한 유전 알고리즘(Genetic Algorithm)에 위한 방법이 관심을 집중시키고 있고, 이를 위한 다양한 교잡(Crossiver)연산자와 돌연변이(Mutation) 연산자들이 발표되고 있다. 돌연변이연산자는 지역해에 빠지는 것을 방지하며, 유용한 유전 특성을 잃어버릴 위험이 있는 교잡 연산자의 단점을 보완할 수 있다. 본 논문에서는 새로운 돌연변이 연산자를 개발하여 적용한 유전 알고리즘으로 외판원 문제를 해결한다.

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A Study On the neo Niching Algorithm for Optimal Design of Electric Machinery (전기기기 최적설계를 위한 새로운 니칭 유전 알고리즘 연구)

  • Cho, Dong-Hyeok;Jung, Hyun-Kyo;Lee, Cheol-Gyun
    • Proceedings of the KIEE Conference
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    • 2001.04a
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    • pp.47-49
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    • 2001
  • 전기기기 최적화에 있어서 많이 사용되는 일반적인 유전 알고리즘이나 진화 알고리즘은 하나의 해에 수렴되는 이유로 설계에 있어서 다양한 요구조건을 만족시키는게 어렵다. 따라서 여러개의 해를 최종적으로 제시하는 니칭 유전 알고리즘은 전기기기 최적화에 있어서 효율적으로 사용될 수 있다. 본 논문에서는 다양한 해를 빠르고 강력하게 찾을 수 있는 새로운 니칭 유전알고리즘을 제안하고자 한다. 제안한 방법의 우수성을 보이기 위해 기존의 알고리즘인 sharing과 determinstic crowding과 비교한다.

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Genetic diversity of Forsythia ovata Nakai (Oleaceae) based on inter-simple sequence repeats (ISSR) (ISSR 자료에 기초한 만리화(물푸레나무과)의 유전적 다양성)

  • Kim, Sang-Yong;Kim, Young-Dong;Kim, Jin-Seok;Yang, Byeong-Hoon;Kim, Sung-Hee;Lee, Byung-Chun
    • Korean Journal of Plant Taxonomy
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    • v.39 no.1
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    • pp.48-54
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    • 2009
  • We investigated the genetic diversity of an endemic rare species, Forsythia ovata Nakai by examining 93 ISSR amplicons in 84 individuals distributed among five populations. The overall percentage of polymorphic ISSR amplicons was 54.8% and mean number of amplicons per ISSR primer was 6.6. The amount of genetic diversity was relatively lower than other shrub species. The Mt. Seokbyeong and Mt. Seorak B populations had the highest level of genetic diversity. Although the Seokgae-jae population had the lowest level of genetic diversity, the population was genetically the most distinctive from the other populations. About 30.6% of the total variation was allocated between five populations, which was slightly higher than other shrub species. Such a pattern of genetic variation may have resulted from the limited distribution and small population sizes of F. ovata. The UPGMA dendrogram based on Nei's genetic distance showed some decisive geographic patterns. These results suggest that, in addition to the preservation of the natural stands, the conservation of larger number of populations with small number of individuals per population is more effective for the dynamic ex situ conservation and for maintaining the genetic diversity of F. ovata than smaller number of populations with large number of individuals.