• Korean Journal of Clinical Laboratory Science
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• v.54 no.4
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• pp.249-255
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• 2022

Alzheimer's disease (AD) represents a major public health concern and has been identified as a research priority. Clinical research evidence supports that the core cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers for AD, including amyloid-β (Aβ42), total tau (T-tau), and phosphorylated tau (P-tau), reflect key elements of AD pathophysiology. Nevertheless, advances in the clinical identification of new indicators will be critical not only for the discovery of sensitive, specific, and reliable biomarkers of preclinical AD pathology, but also for the development of tests that facilitate the early detection and differential diagnosis of dementia and disease progression monitoring. The early detection of AD in its presymptomatic stages would represent a great opportunity for earlier therapeutic intervention. The chance of successful treatment would be increased since interventions would be performed before extensive synaptic damage and neuronal loss would have occurred. In this study, the importance of developing an early diagnostic method using cognitive decline biomarkers that can discriminate between normal, mild cognitive impairment (MCI), and AD preclinical stages has been emphasized.

• Annals of Clinical Microbiology
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• v.17 no.1
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• pp.23-27
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• 2014

Rapidly growing mycobacteria are ubiquitous in the environment and are increasingly being recognized as opportunistic pathogens. Recently, a new species, Mycobacteium conceptionense, has been validated from the Mycobacterium fortuitum third biovariant complex by molecular analysis. However, there are few reports, and postsurgical wound infection by this species is rare. We report a case of postsurgical wound infection caused by M. conceptionense in an immunocompetent patient that was identified by a sequencing analysis of 16S rRNA, hps65, and rpoB genes.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.47 no.1
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• pp.30-37
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• 2011

This ultra real-time PCR (UPCR) based diagnosis system for avian influenza A virus (AIV) subtype was designed. The target primer in this study was derived from H5N1 subtype-specific 133 bp partial gene of hemagglutinin (HA), and was synthesized by using PCR-based gene synthesis on the ground of safety. UPCR was operated by Mini-Opticon Q-PCR Quantitative Thermal Cycler using aptamer-based molecular beacon, total 10 ${\mu}l$ of reaction mixture with extraordinarily short time in each steps in PCR. The detection including UPCR and analysis of melting temperature was totally operated within 15 min. The AIV-specific 133 bp PCR product was correctly amplified until 5 molecules of HA gene as minimum of templates. This kind of PCR was drafted as UPCR in this study and it could be used to detect not only AIV subtype, but also other pathogens using UPCR-based diagnosis.

• Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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• 2006.02a
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• pp.57-61
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• 2006

Microarray란 유리, 실리콘, 플라스틱 등의 매체위에 생체분자를 집적하여 만든 플랫폼을 의미한다. 현재 이러한 플랫폼에 DNA, 화학물질, 유기물질 등 바이오소재를 집적하여 다양한 연구용 제품들이 출시되어 있으며, 수년간 Microarray를 이용한 연구가 진행되어 최근에는 질병진단/예후예측 등의 포괄적인 정보를 포함하는 임상용 microarray제품도 등장하고 있다. 디지탈지노믹스(주)는 2000년 이후로 6년의 기간동안 연구자에게 다양한 종류의microarray를 공급하여 왔으며, 현재 국내에서 가장 많은 종류의 microanay 분석 시스템을 확보하고 있다. 따라서 다양한 연구자들에게 가장 적합한 microarray를 소개할 수 있음은 물론, 그 결과분석 데이터를 제공함으로써 양질의 데이터와 서비스를 제공하고 있다. 특히 디지탈지노믹스(주)에서는 최근에 Combimatrix사의 microarray 시스템을 도입하여, 연구자가 원하는 맞춤형 microarray를 제작할 수 있는 새로운 형태의 차세대 플랫폼을 제공할 수 있게 되었다. 이 기술은 연구자의 목적에 맞게 microarray 제작이 가능하도록 가변적인 특성을 가지고 있으며 높은 민감도 및 재현성을 보여주는 우수한 기술력을 보여준다. Microarray 분야는 그 플랫폼과 분석기술이 나날이 발전하고 있으며, 그 응용범위도 날로 넓어 지고 있다. 그 활용범위의 예를 보면, 1) 유전체 수준에서 발현양상 분석, 2) 약물에 대한 반응성 분석, 3) 질환에 대한 원인 유전자 규명 및 진단제 개발, 4) 독성유전체에서의 약효 및 유효성 분석, 5) 대량의 SNP 분석, 6) 대량의 단백질 수준에서의 발현분석 등이 있으며, 일일이 다 언급하기 힘들 정도로 그 응용범위가 넓어지고 있다. 이러한 microarray기술은 관심 있는 대상에 대한 검색(screening)의 기능과 더불어 분석된 데이터를 기초로 제품화 플랫폼으로써 다시 활용될 수 있는 장점을 가지고 있다. 디지탈지노믹스(주)에서는 구축되어 있는 microarray 분석 시스템을 이용하여 질병 진단, 약물반응성 진단 및 플랫폼 개발에 대한 내부연구도 심도 있게 수행하고 있으며, microarray 기술을 응용하여 산업화, 제품화 할 수 있는 구체적인 사례와 모범답안을 만들기 위해 노력하고 있다.

• Journal of Life Science
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• v.18 no.7
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• pp.1011-1014
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• 2008

The ability or inability to taste phenylthiocarbamide (PTC) is a classic inherited trait that has been best-studied in human populations. Also, variation in PTC perception has been correlated with dietary preferences and thus may have important consequence for diet-related diseases in modem populations. The recent identification of the TAS2R38 gene (PTC gene) which is a member of TAS2R family of bitter taste receptor genes and three common polymorphisms in the gene is highly correlated with taste sensitivity to PTC. Balancing natural selection has acted to maintain high frequency of both alleles of the gene in human population. Future detailed studies of the relationships between molecular mechanisms and taste function may have therapeutic implications, such as helping patients to consume beneficial bitter-tasting compounds.

• Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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• v.11 no.1
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• pp.106-109
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• 2011

MCG는 3-methylcrotonyl-CoA의 결핍으로 발생하는 선천성 leucine 대사 장애이다. 무증상에서 간질지속증 등의 다양한 임상양상을 보이며 주로 신생아대사이상선별검사에서 의심되어, 소변 유기산 검사를 통해 3- hydroxyisovaleric acid의 증가의 소견이 보인다. 치료는 leucine 제한 식이와 L-carnitine의 복용 등의 식이요법이 있다. 서울아산병원에서 MCG로 확진된 9가계 11명의 환자를 대상으로 임상상과 분자 유전학적 특성을 조사하였다. 9명은 신생아 대사이상검사로 발견되었으며, 나머지 2명은 가족검사를 통해서 진단되었다. 총 2-10세($2.6{\pm}1.96$년)까지의 관찰 기간 동안 모든 환자는 정상 발달을 보였으며, 신경학적 이상이나 대사불균형의 이상소견은 보이지 않았다. 총 18개의 대립유전자 중 17개에서 돌연변이를 발견하였으며, p.D280Y 돌연변이가 66.7%의 대립유전자에서 확인되어, 한국인 MCG에서 흔한 돌연변이임을 알 수 있었다. 또한 p.S342K, p.P459S, p.552S, p.Q496H, p.T556A 등 대부분의 돌연변이가 이전에 보고된 바가 없던 돌연변이로 한국인 MCG환자의 유전학적 특성이 다른 민족과 다름을 시사한다.

• Proceedings of the Korean Society for Food Science of Animal Resources Conference
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• 2006.05a
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• pp.117-121
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• 2006

본 연구는 한우의 도체 품질을 결정하는 육질 등급 판정 항목이자 경제적으로 매우 중요한 근내지방도, 배최장근 단면적 및 등지방두께에 대한 개체별 유전능력 차이를 조기에 식별하는 선발 기술을 개발하기 위해 세포내 지방산 농도 및 다양한 세포 및 지질대사를 조절하는 지 방산결합 단백질(H-FABP) 유전자의 전체 염기서열을 분석하여 SNP를 검출하고, SNP marker가 한우의 도체 및 육질 형질에 미치는 영향에 대하여 분석하고자 수행하였다. 염기 서열 분석 결과 총 6개의 SNP를 검출하였고, 이들 중 4개의 주요 SNP를 선발하여 PCR-RFLP기법으로 genotyping하고, 각 SNP marker가 한우 도체 및 육질 형질에 미치는 영향을 통계분석 하였다. H-FABP의 C3523T SNP marker가 한우의 배최장근 단면적 및 등지방 두께에 유의적인 영향을 미쳤다(p<0.05). 따라서, 본 연구를 통해 개발된 한우 H-FABP 유전자의 특정 SNP marker는 배최장근 단면적은 넓고 등지방두께는 얇은 우수한 고급육을 생산하는 한우의 조기 식별 및 육질진단에 매우 유용한 SNP분자 표지로 활용할 수 있을 것으로 기대된다.

• Applied Chemistry for Engineering
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• v.24 no.1
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• pp.1-9
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• 2013

As the medical paradigm is changing from disease treatment to disease prevention and an early diagonosis, the demand to develop techniques for the detection of minute concentrations of biomolecules is increasing. Among the various techniques to sense the minute concentration of biomolecules, the biosensors utilizing the matured semiconductor techniques are presented here. To understand such biosensors, the structure and working principle of a MOSFET (Metal-oxide-semiconductor field-effect transistor) which is the basic semiconductor device is firstly introduced, and then the ISFET (Ion sensitive FET), BioFET (Biologically modified FET), Nanowire FET, and IFET (Ionic FET) are introduced, and their applications to biomedical fields are discussed.

• Applied Chemistry for Engineering
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• v.32 no.1
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• pp.49-54
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• 2021

Plasma-polymerized methyl methacrylate (MMA) thin films were synthesized by remote plasma, and effects of plasma power, reaction pressure and direct-indirect plasma on the growth rate and chemical bonding were investigated with alpha-step, FT-IR, XPS and Langmüir probe method. As the plasma power and pressure increased, the tendency of growth rate showed maximum value at a certain range. FT-IR and XPS analyses revealed that composition ratio of C/O and hydrocarbon (C-C) % in the deposited films increased with plasma power, but ester (COO) C % decreased with it. Direct plasma method was effective for fast growth rate, but indirect plasma method was favorable for maintaining the chemical structure of MMA.

• The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
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• v.15 no.1
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• pp.36-40
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• 2010

Ballast water has been known as a major vector for global dispersal of toxic dinoflagellates and other microalgae. In this study, biodiversity in ships’ ballast water was examined using a dinoflagellate-oriented PCR primer set and species-specific real-time PCR. While motile dinoflagellates could be observe at very low cell densities by light microscopy,a wide range of dinoflagellate taxa including parasitic and phototrophic pico-dinoflagellates as well as harmful species to marine fish/shellfish was detected when techniques for cloning/sequencing of SSU rDNA of sample cells were used. Present result suggests that molecular methods including species-specific PCR primers may offer rapid and accurate detection of invasive species in ballast water.