• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2005.11b
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• pp.244-246
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• 2005

최근 바이오 데이터 분석에는 데이터 양의 급격한 증가와 이에 따른 문제의 복잡성도 함께 증가하고 있다. 이 결과 다양한 분석 툴들의 유연한 조합과 고성능, 고처리 컴퓨팅이 가능한 분석 시스템이 절실히 요구되고 있다. 본 논문에서는 병렬 컴퓨팅 환경을 이용하고 워크플로우 기반에서 다양한 생물정보 분석 툴들을 자유롭게 조합하여 작업을 수행할 수 있는 바이오워크벤치를 소개한다. 바이오워크벤치 내에는 컴퓨팅 자원 및 작업정보에 대한 모니터링 툴, 각 툴 들과 데이터를 손쉽게 가공할 수 있도록 고안된 인터페이싱 툴 워크플로우 디자인 툴을 포함 하고 있다. 이 기능모듈을 활용함으로써 다양한 생물정보 분석 툴을 이용하는 과정에서 효율적인 분석을 수행을 지원하는 바이오 워크벤치의 기능 및 아키텍쳐을 제시한다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2002.10e
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• pp.580-582
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• 2002

이동 에이전트는 네트워크 내에서 스스로 이동하면서 사용자 또는 다론 개체 대신 행동할 수 있는 컴퓨터 프로그램을 말하며 이동 에이전트가 적용될 수 있는 분야로는 전자상거래, 정보 검색, 병렬／분산 처리, 네트워크 관리 등이 있다. 본 논문에서는 유휴 컴퓨팅자원뿐만 아니라 개별 사용자에 의해 사용중인 컴퓨팅 자원을 포함하는 분산／병렬 처리 환경에서의 스케줄링 방법에 대해 연구하였다. 컴퓨팅 자원이 사용 중일지라도 부하가 적을 경우 적절한 방법으로 분산처리 환경에 포함시킨다면 전체 컴퓨팅 자원들의 사용율은 증대할 것이다. 본 논문에서는 세 가지 스케줄링 방법을 적용하여 작업 노드들을 그룹으로 구성하고, 이동 에이전트를 통해 작업 그룹에 속한 노드들에게 분해할 수 없는 다수의 작업을 할당하여 처리토록 한다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2019.10a
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• pp.118-120
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• 2019

특정 어플리케이션을 주로 실행하는 소규모 고성능 컴퓨팅 시스템을 구축하는데 있어서 가장 중요한 점은 해당 어플리케이션의 효율을 최대한 끌어내기 위한 하드웨어를 선택하는 것이다. 하지만 최근 고성능 컴퓨팅을 위한 프로세서의 다양성은 점점 심화되고 있고 이는 최적의 프로세서 선택 및 시스템의 구성을 힘들게 하고 있다. 이에 본 논문에서는 고성능 컴퓨팅에 주로 사용되는 주요한 프로세서를 사용한 시스템을 NAS 병렬 벤치마크를 기반으로 그 특성과 성능을 분석하여 응용프로그램의 특성에 적합한 프로세서 및 시스템의 선택을 지원하고자 한다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2011.04a
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• pp.1264-1267
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• 2011

시퀀싱 기술의 발달로 최근에는 비교적 저렴한 비용으로 개인의 유전체 시퀀싱 데이터를 산출할 수 있게 되었다. 하지만 이를 기반으로 하는 기존의 분석 방법은 매우 고가의 컴퓨팅 환경을 요구하기 때문에 분석을 위한 비용이 매우 높은 문제가 있다. 본 논문에서 클라우드 컴퓨팅 환경의 병렬 CNV 검출알고리즘을 제안한다. 제안하는 방법은 모양 기반의 CNV 검출 알고리즘인 CNV_shape을 MapReduce 기법으로 개발한 것으로 시퀀싱 데이터를 레퍼런스 서열에 매핑한 결과로부터 리드 커버리지 (read coverage)를 계산하여 커버리지가 감소하거나 증가하는 일정 길이 이상의 영역을 검출하는 방법이다. 클라우드 컴퓨팅 환경에 적용하고 노드의 밸런싱 유지를 위한 방법으로 파티셔닝 기법을 사용하였다. 또한 실 데이터를 이용한 실험을 통해 제안하는 방법의 효율적 데이터 처리를 보인다.

• 한국IT서비스학회:학술대회논문집
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• 2005.05a
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• pp.526-531
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• 2005

D-클래스는 보안에 응용될 수 있는 가능성을 가지고 있으나 D-클래스의 계산은 NP-완전문제로서 행렬크기 증가에 의한 연산 량 증가 문제 해결을 위해 병렬 컴퓨팅 환경에서의 병렬 알고리즘 설계 및 구현이 필요하다. 본 논문은 그리드 컴퓨팅 환경에서의 D-클래스 계산을 위해 Globus 가 설치된 클러스터를 구축하고. MPICH를 이용 효율적인 D-클래스 계산 알고리즘을 설계 및 구현, 실행 결과 그리고 연산 량을 줄일 수 있는 수식 연구와 연구한 수식에 기반한 순차 알고리즘을 논한다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2003.10a
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• pp.13-15
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• 2003

이 연구는 이동 에이전트 시스템에 기반한 가상의 병렬분산 컴퓨팅 환경에서 병렬로 수행되는 인공신경망 시뮬레이터를 구현하는 것을 목적으로 하며, 학습세션 수준에서 병렬로 학습하는 병렬 인공신경망 시뮬레이터의 성능을 대표적인 벤치마크 문제인 NetTalk을 대상으로 평가한 결과, 개발한 시뮬레이터가 상당히 효과적임을 알 수 있다.

• Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea CI
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• v.41 no.6
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• pp.23-37
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• 2004

Since java thread is an object which is treated as independent process within one execution space in the multiprocessing environment, we can use it for independent process of parallel processing. Using thread and synchronization mechanism of java enables us to write parallel application program easily. Therefore, a lot of results are exist which is apply the feature of java that support parallel processing to the distributed computing environment. In this paper, we introduce a system of environment that support parallel execution of thread which is included in legacy java program. The system named TORB(Transparent Object Request Broker) enables us parallel execution of legacy java program after simple converting process, since it support the feature of programming transparency. TORB is extended version of distributed programming tool that is published by our research team. And it had only typical distributed processing feature that is execute a specified function at the specified computer.

• Journal of KIISE:Computing Practices and Letters
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• v.8 no.3
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• pp.251-260
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• 2002

The parallel/distributed processing with a lot of the idle hosts on the web has the high coot-performance ratio for large-scale applications. It's processing has to show the solutions for unpredictable status such as heterogeneity of hosts, variability of hosts, autonomy of hosts, the supporting performance continuously, and the number of hosts which are participated in computation and so on. In this paper, we propose the strategy of adaptive tack reallocation based on performance the host job processing, spread out geographically Also, It shows the scheme of dynamic host management with dynamic environment, which is changed by lots of hosts on the web during parallel processing for large-scale applications. This paper implements the PDSWeb (Parallel/Distributed Scheme on Web) system, evaluates and applies It to the generation of rendering image with highly intensive computation. The results are showed that the adaptive task reallocation with the variation of hosts has been increased up to maximum 90% and the improvement in performance according to add/delete of hosts.

• Electronics and Telecommunications Trends
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• v.36 no.3
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• pp.133-144
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• 2021

High-performance computing (HPC) is the underpinning for many of today's most exciting new research areas, to name a few, from big science to new ways of fighting the disease, to artificial intelligence (AI), to big data analytics, to quantum computing. This report captures the summary of a 9-day program of presentations, keynotes, and workshops at the SC20 conference, one of the most prominent events on sharing ideas and results in HPC technology R&D. Because of the exceptional situation caused by COVID-19, the conference was held entirely online from 11/9 to 11/19 2020, and interestingly caught more attention on using HPC to make a breakthrough in the area of vaccine and cure for COVID-19. The program brought together 103 papers from 21 countries, along with 163 presentations in 24 workshop sessions. The event has covered several key areas in HPC technology, including new memory hierarchy and interconnects for different accelerators, evaluation of parallel programming models, as well as simulation and modeling in traditional science applications. Notably, there was increasing interest in AI and Big Data analytics as well. With this summary of the recent HPC trend readers may find useful information to guide the R&D directions for challenging new technologies and applications in the area of HPC.

• Journal of KIISE:Computing Practices and Letters
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• v.6 no.6
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• pp.555-568
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• 2000

The World Wide Web has become the largest virtual system that is almost universal in scope. In recent research, it has become effective to utilize idle hosts existing in the World Wide Web for running applications that require a substantial amount of computation. This novel computing paradigm has been referred to as the advent of global computing. In this paper, we implement and propose a mobile object-based global computing framework called Tiger, whose primary goal is to present novel object-oriented programming libraries that support distribution, dispatching, migration of objects and concurrency among computational activities. The programming libraries provide programmers with access, location and migration transparency for distributed and mobile objects. Tiger's second goal is to provide a system supporting requisites for a global computing environment - scalability, resource and location management. The Tiger system and the programming libraries provided allow a programmer to easily develop an objectoriented parallel and distributed application using globally extended computing resources. We also present the improvement in performance gained by conducting the experiment with highly intensive computations such as parallel fractal image processing and genetic-neuro-fuzzy algorithms.