• Korean Journal of Microbiology
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• v.54 no.1
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• pp.1-8
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• 2018

A prokaryotic cell has various histone-like proteins also known as nucleoid-associated proteins (NAPs). These proteins bind AT-rich sequence at DNA, which induce DNA wrapping, bending, and bridging, and subsequently regulate the gene expression in bacteria. Because NAPs function in transcriptional silencing of virulence genes, it is important to study their roles in gene silencing and specific mechanisms of these proteins. In this review, we discussed two well-known NAPs, H-NS, and HU, and summarized their roles for gene expression in Escherichia coli and Salmonella Typhimurium. Through the oligomerization and filamentation of H-NS, it represses the expression of virulence genes in human pathogenic bacteria, such as Salmonella Typhimurium, and it works with other NAPs positively or negatively. Recently, H-NS also regulates typhoid toxin expression, which causes typhoid fever and systemic disease in human. Additionally, HU regulates the expression of genes related to both virulence and physiology of Salmonella. Therefore, we suggest that NAPs like H-NS and HU are crucial factors to reveal the molecular mechanisms of virulence gene expression in bacteria.

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1995.10a
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• pp.23-27
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• 1995

세포내에서의 유전자 발현의 다양성은 여러 종류의 외부자극에 의해 항상 조절되어 지고 있다. 유전자 발현의 조절기전과정에서 여러 transcription factor들이 중심적 역할을 하는 것이 알려져 있다. Transcription factor의 활성도는 원핵 생물과 진핵 생물 공히 protein phosphorylation과정을 통하여 조절되어지는 공통의 경로를 거치게 된다. 이러한 protein 인산화과정은 상창에 따른 post-translational modification과정으로서 세포표면에 위치한 각각의 수용체(receptor)들이 신호를 인지하여 그 반응으로서 신속하게 transcription factor의 활성을 조절하기 위한 것이다.

• The Microorganisms and Industry
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• v.17 no.2
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• pp.2-10
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• 1991

식물체에서 일어나는 유전자 발현의 광조절 현상은 매우 복잡하다. 이는 각 유전자들이 조직에 따라 질적, 양적, 시간적 측면에서 빛에 대한 반응에 커다란 차이점을 보이고 있기 때문이다. 따라서 식물체를 대상으로 광조절 기작을 연구하는 데는 현상의 복합성과 실험과정의 기술적, 시간적, 경제적 제약이 많기 때문에 이에 관한 연구가 아직 초보적 수준에 머물고 있다. 광합성 세균 중에서 purple bacteria나 green bacteria와는 달리 식물성 광합성을 하며, 식물체보다 세포구조가 훨씬 간단한 cyanobacteria는 유전자 발현의 광조절 기작을 연구하는데 간단, 명료한 'model'로서 기대되는 바 크다. 따라서 이 글에서는 cyanobacteria의 광계와 광합성 색소인 chlorophyll의 생합성 과정을 중심으로 광조절 현상에 대한 최근 연구 동향과 전망을 살펴보고자 한다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2004.04b
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• pp.328-330
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• 2004

유전자 발현은 다양한 전사 인자들의 상호 작용에 의해서 조절되어진다 이러한 전사 인자들에 존재하는 모티프는 직접적으로 조절 작용을 위한 기능을 수행한다. 또한 대부분의 경우에서 여러 모티프가 함께 유전자 발현 기작을 위하여 조절 작용을 한다. 따라서 이러한 모티프들이 어떤 조합으로 함께 전사 과정에 관여하는지 여부를 밝히는 작업은 중요한 일이다. 본 논문에서 진화 연산을 응용하여, 다양한 조건 하에 전사 과정에 중요하게 작용하는 모티프들의 조합을 알아보았고, 그 결과를 기본적인 k-Means 알고리즘 등과 비교하여 제안한 방법이 유전자들의 상관관계에 있어서 보다 우수한 결과를 보임을 알 수 있었다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2008.11a
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• pp.340-343
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• 2008

유전자들은 복잡한 상호작용을 통해 세포의 기능이 조절된다. 상호작용하는 유전자 그룹들을 유전자 조절 네트워크라고 한다. 기존의 유전자 조절 네트워크는 2D microarray 데이터를 이용하여 시간의 흐름에 따른 유전자간의 상호작용을 알 수가 없었다. 이 논문에서는 시간의 변화에 따른 유전자들 간의 조절관계를 살펴 볼 수 있는 조절네트워크 모델링의 방법을 제시한다. 유전자의 발현양을 표시하기 위해 이진 이산화 방법을 사용하였고 3D microarray 데이터에서 유전자 발현 패턴을 찾기 위해 Cube mining 알고리즘을 적용하였고, 유전자간의 관계를 밝히기 위해 시간 관계 규칙탐사 기법을 사용하여 유전자들 간의 시간 관계를 포함한 유전자 조절네트워크를 구축하였다. 이 연구는 시간의 흐름에 따른 유전자간의 상호작용을 알 수 있으며, 모델링된 조절 네트워크를 이용하여 기능이 아직 발견되지 않은 유전자들의 기능을 예측 할 수 있다.

• Journal of Life Science
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• v.23 no.3
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• pp.355-360
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• 2013

Withaferin A is an active component of Withania somnifera, and has anti-inflammatory, anti-tumor, and immune modulatory effects. However, the effects of withaferin A on metalloproteinase (MMP)-9 expression and activity have not been investigated. In this study, we investigated the ability of withaferin A to inhibit MMP-9 expression and activity in PMA-treated human cervical carcinoma Caski cells. Withaferin A markedly inhibited the PMA-induced MMP-9 activity in a dose-dependent manner. Withaferin A decreased not only PMA-induced MMP-9 promoter activity but also PMA-mediated MMP-9 mRNA and protein expression in Caski cells. NF-${\kappa}B$ promoter activity, which is important in MMP-9 expression, was also decreased in combined treatment with withaferin A and PMA. Furthermore, withaferin A markedly suppressed the ability of PMA-mediated migration in Caski cells. Our findings suggest that withaferin A might inhibit PMA-induced migration through the down-regulation of MMP-9 expression and activity.

• Journal of Life Science
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• v.23 no.12
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• pp.1553-1556
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• 2013

Flavonoids are one of the major components found in the peels of citrus fruits. Present evidence has suggested that polymethoxyflavonoids, including nobiletin and tangeretin isolated from Citrus sunki, have many biological properties, such as anti-inflammatory, anti-oxidant, and anti-obesity capabilities. Here, we investigated the effect of Citrus sunki peel extract and its possible mechanisms on oxidative stress-induced MMP-1 expression, a major marker of skin photoaging. $H_2O_2$ induced MMP-1 expression in a dose- and time-dependent manner. Extract of Citrus sunki peel (1-25 ${\mu}g/ml$) dose-dependently decreased MMP-1 mRNA levels. When $H_2O_2$ was combined with Citrus sunki peel extract, the phosphorylation of ERK was further decreased compared to a single treatment with $H_2O_2$ alone. Moreover, U0216, an MEK inhibitor, markedly prevented the production of MMP-1. These data suggest that Citrus sunki peel extract has demonstrated protective activity against oxidative damage on MMP-1 expression, and ERK MAP kinase may be involved.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.20 no.3 s.50
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• pp.229-235
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• 2005

태양광선,특히 자외선 B에 대한 환경적 노출은 편평세포암과 기저세포암을 포함하는 흑색선종 이외의 피부암과 크게 관련된다고 알려져 있다. 염기 류신 지퍼계 전사조절인자인 CChAT/enhancer binding protein-alpha는 표피 각질형성세포에서 다량으로 발현되었고, 각질형성세포의 증식을 억제하며 피부암 발생을 억제하는 유전자로서의 역할이 암시된 바 있다. 최근 자외선 B가 각질형성세포에서 p53에 의한 CCAAT/enhanrer binding protein-alpha의 발현을 강력하게 유도한다는 것이 보고되었다. 이러한 CCAAT/enhancer binding protein-alpha 단백질 발현의 유도는 세포 성장 억제 세포고사와 함께 일어났다. 이 연구는 glycogen synthase kinase-3 길항제가 자외선 B에 의한 CCAAT/enhancer binding protein-alpha 유도를 억제하며 변이 kinase-불활성 GSK의 강제 발현은 자외선 B가 CCAAT/enhancer binding protein-alpha전사조절부위 활성의 증가를 억제한다는 것을 보여주었다. 즉 자외선 B에 의한 CCAAT/enhancer binding protein-alpha의 유도가 p53과 활성 glycogen synthase kinase-3에 의한 것이라는 것을 증명하였다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• v.49 no.3
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• pp.309-320
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• 2007

The purpose of the present study was to determine if monocarboxylate transporter(MCT) isoforms and Basigin(Bsg) are expressed in the efferent ductules(ED) and if MCT1 expression is under estrogen receptor(ER)α-regulation in the ED of male reproductive tract. The presence of MCT isoforms and Bsg mRNAs was detected by real-time polymerization chain reaction(PCR), and ERα-mediated regulation of MCT1 expression in the ED was indirectly determined by immuno- histochemistry. Current study found differential expression of MCT isoforms(MCT1, 2, 3, 4, and 8) and Bsg mRNAs in rat ED according to postnatal ages. In addition, comparison of MCT1 expression in the ED between wild type and ERα knockout mice at different postnatal ages showed basolateral localization of MCT1 in ciliated cells of the ED and, in part, ERα- mediated regulation of MCT1 expression. It is suggested that MCTs would play a role in regulation of function of the ED.

• Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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• v.30 no.5
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• pp.937-942
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• 2001

The present study was conducted to identify the mechanism about the regulation of appetite by examining the expression patterns of vasoactive intestinal peptide in the hypothalamus of either fasted for 24 hours or anorexia mutant mouse. In order to investigate expression pattern of the vasoactive intestinal peptide, immunohisto-chemistry was employed along with reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and dot blotting. Immunohistochemistry has shown that level of expression of vasoactive intestinal peptide and appetite-suppessing neuropeptide, was lower in the suprachiasmatic nucleus (SCN) and higher in the paraventricular nucleus (PVN) of the anorexia mutant group than in the comparable regions in the control group. This pattern was repeated in the fasting group, which also showed lower and higher levels of vasoactive intestinal peptide expression in the SCN and PVN respectively, In contrast, the vasoactive intestinal peptide mRNA level in the entire hypothalamus via RT-PCR and dot blotting was similar in the fasting and control groups, while it was significantly increased in the anorexia mutant group.