Lee, Gun-Joo;Han, Joon-Hee;Shin, Jong-Hwan;Kim, Heung Tae;Kim, Kyoung Su
The Korean Journal of Mycology
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v.41
no.2
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pp.112-117
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2013
Phytophthora capsici is one of major limiting factors in production of pepper and other important crops worldwide by causing foliage blight and rot on fruit and root. Increased demand for the replacement of fungicides has led to searching a promising strategy to control the fungal diseases. To meet eco-friendly agriculture practice, we isolated microorganisms and assessed their beneficial effects on plant health and disease control efficacy. A total of 360 bacterial strains were isolated from rhizosphere soil of healthy pepper plants, and categorized to 5 representative isolates based on colony morphology. Among the 5 bacterial strains (GJ-1, GJ-4, GJ-5, GJ-11, GJ-12), three bacterial strains (GJ-1, GJ-11, GJ-12) presented antifungal activity against P. capsici in an fungal inhibition assay. In phosphate solubilization and siderophore production, the strain GJ-1 was more effective than others. The strain GJ-1 was identified as Bacillus sp. using 16S rDNA analysis. Bacillus sp. GJ-1 was also found to be effective in inhibiting other plant pathogenic fungi, including Rhizoctonia solani, Pythium ultimum and Fusarium solani. Therefore, the Bacillus sp. GJ-1 can serve as a biological control agent against fungal plant pathogens.
Three actinobacterial strains exhibiting broad spectrum antibiotic activities were isolated from soil, and characterized. Through the comparative analysis of 16S rRNA genes, the three isolates could be assigned to the genus Streptomyces, as S. tanashiensis, S. nashivillensis, and S. rubiginosohelvolus were found to be the mostly related species, but the strains formed independent phylogenetic lineage. Each strain exhibited different antimicrobial profile against Gram-positive bacteria Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus, Gram-negative bacteria Salmonella typhi, Enterobacter cloacae, Serratia marcescens, and Pseudomonas aeruginosa, and also fungi Candida tropicalis and Candida krusei. In addition to the antimicrobial profile, the strains also differed in API ZYM test results, which implies that the three strains might produce difference antimicrobial substances.
The antagonistic microorganisms against Streptococcus sanguis, S. salivarius and S. mutans causing the dental caries of oral diseases were isolated from Korean traditional soy sauce. Twenty five strains were isolated by pairing culture, paper disc culture and dual culture methods. The isolate NG 06 strain was observed with various cultural and physiological test, and $Biolog^{(R)}$ Bacterial Identification System. The strain was identified as Bacillus racemilacticus. The isolate NG 16 strain was confirmed to Gram-positive, rods, endospore production, utilization of melibiose, casein hydrolysis and starch hydrolysis. Also the second strain NG 16 was identified as $\beta$. amyloliquefaciens.
In order to develop environment friendly fungicide for the control of citrus green mold (Penicillium digitatum) using endophytic bacteria, the 21 bacterial isolates were isolated from citrus leaves in seven different orchards in Jeju Province. Among the 21 bacterial isolates, 5 bacterial isolates presented antifungal activity against green mold pathogen P. digitatum. The CB3 isolate, which showed the most strong antagonistic effect, was selected through opposite culture against the pathogen. The rod-shaped, gram-positive bacterium CB3 was identified as Bacillus velezensis based on morphological, physiological characteristics, 16S rDNA, and gyr A gene sequence analysis. The isolate CB3 showed strong antifungal activity against two citrus postharvest pathogen P. digitatum. Citrus fruits were treated by wound inoculation with P. digitatum pathogen, and the control efficacy of CB3 culture broth was 66.7% ($1{\times}10^8$ cfu/ml). In conclusion, The stability of CB3 and its strong antifungal activity also lead us to believe that it has potential for application as an environment friendly biological control agent.
From soil samples, 380 antagonistic microorgnisms were isolated. Among the isolates, 42 strains had mycelia growing inhibition ability against Fusariun solani, ginseng root rot causing pathogen. Isolates CHA 1 and S-PFHR 6 were proposed as antagonists for this study and they were identified as Promicromonospora sp. and Pseudomonas pseudoalcaligenes respectively. As an antagonism against hyphae of F. solani in dual culture test, CHA 1 and S-PFHR 6 inhibited linear growing, caused abnormal branching, and the membrane projection which formed by cell wall destruction. The secondary metabolites contained in the culture filtrates which prepared from PD broth and Nutrient broth inhibited the spore germination to 14.3%. The culture filtrate of S-PFHR 6 which prepared by a little amount of soil extract addition to nutrient rich medium had more strongly. inhibited the spore germination and spore germination decreased to less than 4.0% in it. The soil used in this study had fungistasis and the germination rate of macroconidia and chlamydospore of F.solani was 19.4% and 17.7% respectively. The steam sterilized soil lost fungistasis and germination rate of conidia increased to more than 97.9%. The soils amended with the propagule of CHA 1 and S-PFHR 6 increased fungistasis and the germination rate of macroconidia decreased to 14.7% and 11.7% respectively in each treatments. But the soil ammended with glucose and asparagine annulled fungistatic ability and the germination rate of macroconidia increased to more than 48.0%. As an antagonistic activity of the secondary metabolites of two antagonistic isolates in soil, the germination rate of macroconidia of F. solani was 9.3% in the soil amended with the culture filtrate of CHA 1 but the culture filtrate of S-PFHR 6 had no such activity. In the soil which treated with antagonist propagule or culture filtrate, the chlamydospore germination rate was lower than that in natural soil. The addition of glucose and asparagine to antagonist propagule treated soil did not enhanced the chlamydospore germination.
Chan-Jung Lee;Hye-Sung Park;Seong-Yeon Jo;Gi-Hong An;Ja-Yun Kim;Kang-Hyo Lee
Journal of Mushroom
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v.22
no.2
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pp.60-66
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2024
This study was conducted to selection and investigate appropriate conditions for mass production of antagonistic microbes to control cobweb disease caused by Cladobotryum mycophilum. A grampositive bacterium was isolated from spent substrate of Agaricus bisporus and showed significant antagonistic activity against Cladobotryum mycophilum. The bacterium was identified as Bacillus altitudinis. based on the cultural, biochemical and physiological characteristics, and 16S rRNA sequence. The isolate is saprophytic, but not parasitic nor pathogenic to cultivated mushroom whereas it showed strong inhibitory effects against C. mycophilum cells in vitro. The control efficacy of B. altitudinis HC7 against cobweb disease of C. mycophilum was up to 78.2% on Agaricus bisporus. The suppressive bacterium may be useful for the development of biocontrol system. To define the appropriate conditions for the mass production of the Bacillus altitudinis HC7, we have investigated appropriate culture conditions and effects of various nutrient source on the bacterial growth. The appropriate initial pH and temperature were determined as pH 6.0 and 30℃, respectively. The appropriate concentration of medium elements for the growth of pathogen inhibitor bacterium(Bacillus altitudinis HC7) was determined as follows: 3.0% soluble startch, 10% soytone, 1.0% (NH4)2HPO4, 1.0 mmol KCl, and 0.5% L-asparagine.
Choi, Ki Chun;Jeong, Kwang Hwa;Lee, Joung Kyong;Youn, Chang;An, Seung Hyun;Yook, Wan Hang
Journal of The Korean Society of Grassland and Forage Science
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v.19
no.1
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pp.31-40
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1999
This study was conducted to investigate the effects of rhizosphere bacterium and pathogenic fungi on the growth of corn(Zea may L.) in continuous corn cultivation soil(CCCS) and non-continuous cultivation soil(NCCS). Corn was established by seeding into pots of 30 cm in diameter and 50 cm in depth containing 1 : 1 mixture of soil and vermiculite. Rhizobacterium and pathogenic fungi were inoculated into the soils. The field experiment was carried out at the Animal Research Station, College of Agriculture, Chonnam National University. Sample of corn was taken from each pot at 50 days and 90 days after sowing. Corn was cultivated in a vinyl house with three replications under natural daylight conditions. The bacterium used in this study was Bacillus subtilis. B. subtilis was directly isolated and identified from forage rhizosphere soil. Dry matter(DM) of coron plant in treatment without B. subtilis was lower than that in treatment of B. subtilis. DM of corn plant inoculated with B. subtilis was higher than that of corn inoculated with pathogenic fungi in both CCCS and NCCS. DM of corn plant in NCCS was more increased than that in CCCS. The effect of B. subtilis inoculation on the growth of corn was better in NCCS than in CCCS. However, DM of corn plant was apparently decreased by the inoculation of the pathogenic fungi in both CCCS and NCCS.
In order to isolate novel oligotrophic bacteria exhibiting antifungal activities, soils were collected from pepper-cultivated fields of Yeongyang, Jecheon, Nonsan, Eumsong and Goesan area in Korea. From soils in pepper cultivated area, a total of 9,354 strains were isolated as oligotrophic bacteria by the R2A dilution method. Among 9,354 oligotrohic bacteria candidates, 1A strain was selected by screening against Phytophthora capsici causing phytophthora blight of hot pepper in the greenhouse and field. The strain was identified as Bacillus vallismortis based on its 16S rDNA sequence and key characteristics as compared with those of authentic cultures of B. vallismortis(KACC 12149) and B. mojavensis(KACC 12096). The strain showed broad spectrum of antibiotic activity in vitro test, as revealed in its strong inhibitory activity to the genera Phytophthora, Collectotrichum, Botrytis and Fusarium, but not to Rhizoctonia and Magnaporthe. In pot experiments, infection rate of hot pepper in the non-treated pots was about 89%, while it was only 29% in the pots treated with 1A strain. The result indicated B. vallismortis 1A is a potential biocontrol agent for phytophthora blight of hot pepper
This study was performed to develop a formulation using an antagonistic bacterium Bacillus amyloliquefaciens A-2 to control tomato leaf mold caused by Fulvia fulva. B. amyloliquefaciens A-2 was grown in a medium with rice oil and mixed with various carrier and additives. One of the formulations, A2-MP, showed the best disease control value among the tested formulations. The disease control value of A2-MP at 100-fold and 500-fold diluted treatment was not significantly different from that of chemical fungicide triflumizole in a growth chamber. Although disease control effect was decreased by serial diluted treatment of the prepared A2-MP, 1,000-fold diluted treatment of A2-MP still showed high disease control value of 72.0%. For the green house experiments, the disease control values of A2-MP was indicated as 79.4% which is similar to that of chemical fungicide, triflumizole showing 79.6%. When the disease control activity of the formulation A2-MP was compared in tomato production conditions, disease control values of 100-fold diluted A2-MP and 3,000 fold diluted triflumizole exhibited 60%, 81.6%, respectively. The disease control efficiency by A-2MP was 73% of the disease control value of chemical fungicide. The formulation A-2MP maintained the stable bacterial viability and disease control activity when stored at $4^{\circ}C$. This result suggested that A-2MP develped from B. amyloliquefaciens A-2 could be used to control tomato leaf mold.
In the course of screening for antifungal agents, a bacterial strain, DM3 was isolated from a mud sample collected at Daechon in Chungnam province and identified as Bacillus licheniformis based on API 50CHB test. It has antifungal activity against 12 plant pathogenic fungi in paper disc assay. At the 95% lethal dose of gamma radiation ($^{60}Co$, 10 kGy, $D_{10}=2.32\;kGy$), the antifungal activity deficient mutant (mDM3) against Colletotrichum gloeosporioides was induced From 2-D electrophoresis analysis, serine hydroxymethyltransferase (45.0 kDa), hypothetical protein(40.7 kDa), NifU protein homolog(15.4 kDa), and resolvase(12.5 kDa) homologous proteins were detected only in B. licheniformis DM3. Lysozyme(18.1 kDa) and alkyl hydroperoxide reductase(15.6 kDa) homologous proteins were expressed uniquely in B. licheniformis mDM3. Further studies are needed to reveal that these proteins from B. licheniformis DM3 could be closely related to the antifungal activity against plant pathogenic fungi.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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