Kim, Ho-Kyung;Gyuseong Cho;Hur, Woo-Sung;Lee, Wanno;Hong, Wan-Shick
Proceedings of the Korean Nuclear Society Conference
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1996.05d
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pp.133-138
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1996
For the application of hydrogenated amorphous silicon (a-Si:H) p-i-n structural diode as the alpha particle spectroscopy, the induced charge collection was simulated based on a relevant non-uniform charge generation model. The simulation was accomplished for two extreme cases of the incident direction of alpha particle, p-and n-side, respectively. As expected, for the complete charge collection, the hole collection should be severely considered due to its poor mobility and the full depletion bias required. For the comparison of signal corresponding to the detector configuration or structure, although n-i-p configuration shows a wider range of linearity to the energy, p-i-n configuration is more suitable in the viewpoint of linearity and signal value for the considering energy range.
The existence in nature of two isomers of 28-nortriterpenes is known. One is normal D/E cis form and the other is $17\alpha$-hydrogen D/E trans form. Since the latter cannot exist with ring D in the chair conformation, the chiroptical method is not applicable to determination of the absolute configuration. The stereochemical assignment would now be made by NMR data. Confirmation of this view could be provided by the synthesis of $3\beta, 21\beta-{dihydroxy-16-keto-28-nor-17}\alpha, \;18\beta-{olean-12-ene}$ as a model compound.
Conformations and cofigurations were studied for some ${\alpha},{\beta}$-unsaturated phenylhydrazones which have similar structures to the stucture of butenedial bistosylhydrazone, a precursor of tetrahedrane, by the analysis of their nmr spectra. The chemical shift difference between two solvents, benzene and aliphatic solvents, was applied for the assigning syn and anti structures of phenylhydrazone isomers as a convenient method. In this work, it was found that the phenylhydrazones have syn configurations and also found that the dihedral angles of $CH_a-CH_b$ are around $150^{\circ}$ at room temperature from the the interpretation of the vicinal spin-spin coupling constants. These results were discussed in concerning with their conformations.
With explosively growing PPI databases, the computational approach for a prediction and configuration of PPI network has been a big stream in the bioinformatics area. Recent researches gradually consider physicochemical properties of proteins and support high resolution results with integration of experimental results. With regard to current research trend, it is very close future to complete a PPI network configuration of each organism. However, direct applying the PPI network to real field is complicated problem because PPI network is only a set of co-expressive proteins or gene products, and its network link means simple physical binding rather than in-depth knowledge of biological process. In this paper, we suggest a protein functional flow model which is a directed network based on a protein functions' relation of signaling transduction pathway. The vertex of the suggested model is a molecular function annotated by gene ontology, and the relations among the vertex are considered as edges. Thus, it is easy to trace a specific function's transition, and it can be a constraint to extract a meaningful sub-path from whole PPI network. To evaluate the model, 11 functional flow models of Homo sapiens were built from KEGG, and Cronbach's alpha values were measured (alpha=0.67). Among 1023 functional flows, 765 functional flows showed 0.6 or higher alpha values.
Synthesis of novel cyclopropyl pyrimidine and purine nucleoside derivatives 2~8 with ${\alpha}$-configuration was successfully accomplished using an epoxide-ring opening reaction, lactonization, a hydroboration-oxidation reaction and a Mitsunobu reaction as the key steps. Antiviral activities against HSV-1 and -2, HIV-1 and -2, coxsackie B1and B3 viruses and poliovirus were assayed. Three compounds 4, 7 and 8 exhibit cytotoxicity-derived antiviral activity only in HIV-1 and -2.
Proceedings of the Korean Biophysical Society Conference
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2002.06b
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pp.36-36
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2002
In the present study, we investigated effects of extracellular zinc (Zn$\^$2+/) on T-type Ca$\^$2+/ channel isoforms (${\alpha}$lG, ${\alpha}$lH, and ${\alpha}$lI) stably expressed in HEK 293 cells. Ca$\^$2+/ currents were measured using 10 mM Ca$\^$2+/ as a charge carrier under whole cell-ruptured patch configuration. Zn$\^$2+/ blocked the ${\alpha}$lH currents with a 100- and 200-fold higher potency (IC$\sub$50/ = 2.5 ${\mu}$M) when compared with those for blockade of the ${\alpha}$1G and ${\alpha}$1I currents, respectively.(omitted)
${\alpha}$-L-Arabinofuranosidase was purified from the culture supernatant of Bacillus sp. DSNC 101. The enzyme had a molecular weight of 56 kDa. Optimum temperature and pH for ${\alpha}$-L-arabinofuranosidase activity were 55$^{\circ}C$ and 7.0 respectively. The Michaelis constant(Km) and maximal reaction velo-city(Vmax) for p-nitrophenyl-${\alpha}$-L-arabinofuranoside were 1.0 mM and 113.6 U/mg protein, respe-ctively. ${\alpha}$-L-Arabinofuranosidase was completely inhibited by HgCl$_2$ and CuSO$_4$. The enzyme was spe-cific for the ${\alpha}$-linked arabinoside in the furanoside configuration. The enzyme was produced during growth on agricultural residue such as rice straw, but not during growth on spelt xylan, glucose or cellobiose.
MB4-03, an $\alpha$-amylase inhibitor was isolated from the culture broth of Streptomyces sp. DMCJ-49 and purified through ion-exchange chromatography, adsorption, and gel filtration. The results of various instrumental analyses showed that the inhibitor was one of oligosaccharides that had glucoses as its major component and that its molecular weight was about 2000. And one methyl group which seemed to be related with the inhibitory activity of this compound was identified. From the CMR spectrum, it was elucidated that this compound was composed of $\alpha$ -D-glucopyranoses which were linked together by $\alpha$ (I -, 4) bond configuration. As the inhibitory effect of this compound was reduced after incubation with $\beta$-amylase, the maltose units was seemed to exist at non-reducing terminal side of it.
We constructed grating- tuned external cavity semiconductor lasers using Littman and Littrow configuration, for which the wavelengths are tuned by rotation of the grating. This wavelength tunable semiconductor laser is one of the main devices of WDM optical communication. In Littman configuration, the wavelength range of about 60 nm (The C- and L-band range of 1,530~1,590 nm) was obtained by changing the incidence angle of the grating about $\pm$1$^{\circ}$ from the incidence angle of 70$^{\circ}$. In the 40 nm tuning range, the output power variation was less than 1.25 ㏈ and the side mode suppression ratio(SMSR) was 32 ㏈. In Littrow configuration (The incidence angle and the first order diffraction angle is the same, i.e. $\alpha$=$\delta$), the wavelength tuning range was about 80 nm for the same conditions used in Littman configuration except the incidence angle ($\alpha$=49$^{\circ}$). In 60 nm tuning range, the output power variation was less than 1.5 ㏈ and SMSR was 35 ㏈.
Phenylglycine was obtained as the sole metabolite when .alpha.-aminophenylacetonitrile was ted to the culture broth of Aspergillus furmigatus furmigatus. The isolated phenylglycine showed L-configuration with 80% optical purity. Examination of the hydrolysis of the substrate to phenylglycine with cell free extracts, and the supernatant fraction and the particulate fraction both of which were obtained after ultracentrifugation of the cell free extract at 100,000g, indicated that the nitrile group hydrolyzing enzymes, nitrilase existed not only in cytoplasm, but in microsome fractions.
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