• 한국미생물·생명공학회지
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• 제28권5호
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• pp.291-297
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• 2000

A strain producing high levels of compaction was isolated from soil and identified as Penicillium sp. Y-8515 based on the morphological characteristics and ribosomal RNA sequence analysis. Optimization of several different carbon and nitrogen sources for the effective production of compaction was performed resulting in the medium compositions containing 5%(w/v) glucose, 1.0 % soybean meal, 0.5% yeast extract, 0.5%(NH$_4$)$_2$$SO_4$, 0.25%,$ NaH_2$$PO_4$, 0.25% $CaCO_3$. The fixed con-centration of glucose(5%, w/v) and relatively lower concentrations(less than 2.5%, w/v) of soybean meal stimu-lated the transformation of the growth morphology from filamentous to pellet form. Comparing to that by filamentous form, the production of compactin by pellet form increased up to 1.5 folds. In a fed-batch fermentation, continuous feeding of the mixture of glucose and nitrogen source at the ratio of 10:1 showed 3.5-fold more produc-tion yield of compaction comparing to the batch mode.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제35권3호
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• pp.196-202
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• 2007

본 연구에서는 최근 심혈관 순환계의 새로운 위험인자로 등장한 homocysteine을 생체 내에서 전환시키는 효소인 cystathionine ${\beta}$-synthase의 돌연변이에 관한 연구를 수행하였다. 인간의 cystathionine ${\beta}$-synthase에 돌연변이가 생기면 그 효소활성에 문제가 발생하여 homocysteine이 생체에 축적되어 부작용을 일으키는 homocystinuria라는 유전병이 생기게 되는데 여러 돌연변이 중 G3O7이 serine으로 치환된 돌연변이가 많은 비중을 차지한다. 한편 인간의 cystathionine ${\beta}$-synthase는 heme을 prosthetic group로 가지고 있어서 여러 스펙트럼 연구에 장애가 있으나, 같은 기능을 갖고 인간의 cystathionine ${\beta}$-synthase와 높은 상동성를 가지는 효모 유래의 cystathionine ${\beta}$-synthase는 heme을 포함하고 있지 않아 스펙트럼 연구에 용이한 점을 이용하여 인간의 G3O7에 해당하는 G247의 부위를 serine으로 치환, 정제하여 그 생화학적 특성을 살펴보았다. 효모의 G247S는 C 말단이 잘린 truncated form과 전체단백질이 모두 함유된 full length form의 두 가지를 이용하여 실험하였다. 두 돌연변이 단백질 모두에서 기질로써 L-homocysteine과 L-serine을 이용한 방사선 동위원소 $C^{14}$을 사용하여 활성을 측정한 바 활성이 전혀 검출되지 않았으며 ${\beta}$-mercaptoethanol과 L-cysteine을 기질로 이용한 방법에서도 황화수소를 검출할 수 없었다. 또한 UV-visible spectrum과 CD spectrum에서도 PLP의 특이적인 흡수지대인 410 nm에서의 흡수를 전혀 검출 할 수 없었다. 또한 PLP의 검출방법인 KCN과의 incubation실험에서도 PLP를 검출할 수 없었다. 보고된 인간 cystathionine ${\beta}$-synthase 결정3차 구조를 분석하여 본 바, G307은 조효소 PLP의 근방에 위치하여 bulky한 R group인 serine으로 치환될 경우 효소와 PLP의 결합을 극도로 저지하여 활성을 저지하는 것으로 생각된다 G247S를 고농도의 PLP와 incubation하여도 활성이 회복되지 않으며 단백질로의 PLP의 incorporation이 관찰되지 않았다. 이는 인간의 G307S환자가 PLP를 투여하여도 병세의 호전이 없는 이유를 설명하고 있다. 결론적으로 G307S 돌연변이에 기인한 homocystinuria 환자는 CBS의 활성이 전무하며 PLP의 투여에도 효과가 없음이 효모를 이용한 본 연구에서 확인되었다.

• 생명과학회지
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• 제22권2호
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• pp.142-147
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• 2012

효모 Saccharomyces diastaticus가 포자형성기에 세포질에서 생산된다고 알려진 포자형성 특이 glucoamylase (SGA)가 세포 외로 분비되는 단백질임을 증명하고자 S. dastaticus의 SGA promoter와 예상되는 분비신호서열 다음에 reporter gene으로 사용한 고초균의 CMCase 구조유전자를 융합한 재조합 플라스미드 pYSC25를 제작하고 수주세포인 S. diastaticus YIY345에 형질전환 하였다. 형질전환체를 1% CMC를 포함하는 최소한천배지에서 배양한 후 Congo red 염료로 염색하여 생성된 투명환으로부터 SGA의 분비서열에 의해 세균의 CMCase가 효모세포외로 분비되는 것을 확인하였다. 효모세포부위 별 CMCase의 활성분포를 측정하여 SGA 분비서열의 분비효율을 추정하기 위해 효모세포 배양액을 배양상등액, periplasmic 및 세포질 분획으로 나눈 다음 효소활성을 측정한 결과 CMCase 활성의 76%가 배양상등액과 periplasmic 부위에 존재하였으며 N-연결형 당쇄가 일어났으므로 SGA 분비서열은 효과적으로 작용함을 알 수 있었다. 대조균인 고초균에서 생산된 CMCase에서는 당쇄가 일어나지 않은 것을 확인하였다. 이상의 결과로부터 SGA는 아미노 말단에 존재하는, 24개의 아미노산으로 구성된 분비서열을 보유한 분비성 단백질임을 확인하였다.

• 한국균학회지
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• 제47권1호
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• pp.51-61
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• 2019

우리나라 금강의 물과 주변 토양에 분포하는 야생 효모들의 종 다양성을 확립하고자 세종특별자치시 불티교와 햇무리교를 흐르는 금강 중류의 물과 주변 토양에서 야생 효모들을 분리, 동정하였고 이들 중 국내 미기록 효모들을 선별하여 이들의 균학적 특성을 조사하였다. 세종시 불티교 밑의 물과 주변 토양들로부터 32종, 37균주의 야생 효모들을 분리, 동정하였다. 이들 중 Holtermanniella takashimae SW048 (NNIBRFG9314), Cystofilobasidium infirmominiatum SW013 (NNIBRFG9310), Mrakia cryoconite SW015(NNIBRFG9316), Pichia sporocuriosa SW085(NNIBRFG9326)와 Cryptococcus aspenensis SW008 (NNIBRFG9309) 5균주들을 국내 미기록 효모 균주들로 최종 선별하였고, 이들은 구형-난형으로 출아에 의해 영양증식을 하였다. M. cryoconite SW015 외 모두 자낭포자를 형성하였고, P. sporocuriosa SW085 와 C. aspenensis SW008 균주는 20% 포도당을 함유한 YPD 배지에서도 생육하는 내당성 야생 효모들이었다. 또한, 세종시 햇무리교의 물과 주변 토양시료에서 모두 8종 26균주의 야생 효모들을 분리, 동정하였고 이들 야생 효모들 중 Occultifur kilbournensis HB060 (NNIBRFG9317), Sampaiozyma vanillica HB014 (NNIBRFG9332), Xenoramularia neerlandica HB039 (NNIBRFG9335), Candida norvegica HB315 (NNIBRFG9306), C. melibiosicaHB316 (NNIBRFG9305), C. quercuum GB014 (NNIBRFG9307)와 C. succiphila GB015 (NNIBRFG9308) 7균주 국내 미기록 효모들로 분류되었다. O. kilbournensis HB060와 X. neerlandica HB039는 자낭포자와 의균사를 형성하지 못하였고 C. norvegica HB315는 5 % NaCl를 함유한 YPD 배지에서 생육하는 내염성을 보였다. 본 연구결과는 앞으로 금강의 야생 효모 종 다양성 확립에 귀중한 자료로 활용될 것이다.

• BMB Reports
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• 제33권2호
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• pp.155-161
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• 2000

The saccharomyces cerevisiae Rad27, a structure-specific endonuclease for the okazaski fragment maturation has been known to interact genetically and biochemically with Dna2, an essential enzyme for DNA replication. In an attempt to define the significance of the interaction between the two enzymes, we expressed and purified both Dna2 and Rad27 proteins. In this report, Rad27 could not form a complex with Dna2 in the three different analyses. The analyses included glycerol gradient sedimentation, protein-column chromatography, and coinfection of baculoviruses followed by affinity purification. This is in striking contrast to the previous results that used crude extracts. These results suggest that the interaction between the two proteins is not sufficiently stable or indirect, and thus requires an additional protein(s) in order for Rad27 and Dna2 to form a stable physical complex. This result is consistent with our genetic findings that Schizosaccharomyces pombe Dna2 is capable of interacting with several proteins that include two subunits of polymerase $\delta$, DNA ligase I, as well as Fen-1. In addition, we found that the N-terminal modification of Rad27 abolished its enzymatic activity. Thus, as suspected, we found that on the basis of the structure determination, N-terminal methionine indeed plays an important role in the nucleolytic cleavage reaction.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제8권4호
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• pp.301-304
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• 1998

Methylobacterium organophilum can use nitrogen in the form of ammonium ions ($($NH_4$)_2SO_4\;and\;NH_4Cl) and from nonammonium sources such as glycine, alanine, peptone, and yeast extract. When potassium was limited, significantly more PHB was produced when the ammonium ion was the nitrogen source rather than a nonammonium form. With ammonium, the amount of PHB produced was 0.50-0.53 g PHB/l or $52.0~53.2\%$ of the dry cell weight. If nitrogen was from a nonammonium source, the respective values were 0.04~0.06 g PHB/1 or $8.1~11.3\%$ of dry cell weight. When ammonium sulfate was the sole source of nitrogen under potassium-limited conditions, cell growth and PHB accumulation increased as the pH increased from 6.0 to 7.5. Cell growth and PHB amount at pH 7.5 were 2.50 g dry cell weight/1 and 1.40 g PHB/1, respectively.

• 미생물학회지
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• 제30권6호
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• pp.519-523
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• 1992

The glucoamylase of Candida tsuubaensis was purified to homogeneity form culture filtrate by means of ultrafiltration, Sephacryl S-200 gel filtration and Sp-Sephadex C-50 chromatography. The purified enzyme was a glycoprotein with a molecular mass of approximately 50 kDa, which was a monomeric protein. Km values were 5.8 mg/ml for soluble starch and 0.04 mM for maltose. Glucoamylase also released only glucose from both pullulan and isomaltose. The analysis of amino acid composition revealed that the enzyme contained a high content of acidic and polar amino acids. In addition, Western blotting analysis indicates that C. tsukubaensis glucoamylase is resistant to glucose repression.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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• pp.380-383
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• 2000

불완전 곰팡이의 일종인 Aureobasidium pullulans ATCC 42023 균주를 이용한 pullulan의 최적조건 및 pH 조절에 따른 pullulan의 생성 그리고 균체형태와 고분자 pullulan 생산에 미치는 영향을 조사 하였다. 삼각플라스크 내에서 최대의 pullulan 생산은 초기 pH 6.5일때 11.98 g/l의 pullulan을 생산하였고, 회분식 발효에서는 산소 공급속도 0.5 vvm일때 15.16 g/l의 최대의 pullulan생산량을 나타내었다. pH조절에 따른 실험에서는 pH 4.5일때 13.31 g/l의 pullulan 생산량을 보였고, 이때 균체의 형태는 효모형과 균사형태의 성장을 하였다. 그러나 분자량 생성면에서는 pH 6.5일때 100만 이상의 고분자가 가장 많이 생산되었다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제27권3호
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• pp.425-432
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• 1998

The strain producing L-lactic acid from starch was isolated from kimchi. The isolated strain was identified as a homofermentative Streptococcus sp. through its morphological, cultural, biochemical characteristics, and named Streptococcus sp. JEJ-6. Lactic acids are of two types, one L-specific and the other D-specific form in a stereospecific form. Streptococcus sp. JEJ-6 produced selectively L-lactic acid from all of the tested carbon sources. The optimum conditions for the L-lactic acid production from the isolated microorganism were determined. For the maximum yield of L-lactic acid from Streptococcus sp. JEJ-6, the cell should be harvested at the early stationary phase, and the growth temperature, pH, and NaCl concentration should be 37$^{\circ}C$, pH 7.0 and 0.1%, respectively. 4% Soluble starch as substrate and organic nitrogen sources such as peptone and yeast extract should be used for the best yield. The optimum pH of the nicotinamide adenine dinucleotide(NAD)-dependent and NAD-independent lactate dehydrogenase(LDH) activities was pH 8.5 and pH 7.0, respectively.

• BMB Reports
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• 제41권2호
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• pp.132-138
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• 2008

AtbZIP16 and AtbZIP68 are two putative G group bZIP transcription factors in Arabidopsis thaliana, the other three members of G group bZIPs are GBF1-3 which can bind G-box. Members of G group have conservative protein structure: highly homological basic region and a proline-rich domain in the N-terminal region. Here, we report that AtbZIP16 and AtbZIP68 could bind cis elements with ACGT core, such as G-box, Hex, C-box and As-1, but with different binding affinities which from high to low were G-box > Hex > C-box > As-1; AtbZIP16 and AtbZIP68 could form homodimer and form heterodimer with other members of G group; N-terminal proline rich domain of AtbZIP16 had transactivation activity in yeast cells while that of AtbZIP68 did not; AtbZIP16 and AtbZIP68 GFP fusion protein localized in the nucleus of onion epidermal cells. These results indicated that AtbZIP16 and AtbZIP68 were two new members of GBFs. In Arabidopsis, AtbZIP16 and AtbZIP68 may also participate in light-responsive process in which GBF1-3 are involved.