Paenibacillus woosongensis의 유전체 부분 염기서열로부터 유추된 xylanase 유전자를 PCR 증폭하여 대장균에 클로닝하였다. Xylanase 유전자는 211 아미노산으로 구성된 단백질을 코드하며 633 뉴클레오티드로 이루어졌다. 아미노산 잔기배열을 분석한 결과 xylanase는 glycosyl hydrolase family 11에 속하며 Paenibacillus의 xylanase와 85-89% 상동성을 보였다. Xylanase 유전자를 T7 promoter로 과잉발현한 결과 그 발현량이 높지 않았으며, 균체내 외에서 모두 효소활성이 관찰되었다. 재조합 대장균의 균체파쇄상등액을 사용하여 효소 반응특성을 조사한 결과 pH 5.5와 $60^{\circ}C$에서 최대 반응활성을 보였다. 한편 xylanase의 기질로 xylan과 xylooligosaccharides를 사용하였을 때 xylose와 xylotriose가 주된 최종 반응산물로 관찰되었으며 xylobiose는 분해하지 못하였으나 이보다 중합도가 큰 xylooligosaccharides는 분해하였다.
Bacillus sp. DSNC 101은 탄소원으로 2.0% oat spelts xylan, 질소원으로 2.0% yeast extract, 그리고 인산염으로 0.4% K2HPO4를 함유한 pH 8.0의 xylanase 생산 배지에서 4$0^{\circ}C$에서 3일간 배양하였을 때 305.0 unit/ml의 xylanase 활성도를 나타내었다. 본 균주는 xylan, 가용성 전분, 볏짚 분말, Avicel, maltose, 그리고 lactose를 유일한 탄소원으로 사용하였을 때 xylanase를 생산하였으나 glucose, xylose, 그리고 arabinose를 사용하였을 때는 xylanase를 생산하지 않았다. 여러 가지 기질들에 대한 배양 상징액의 분해 활성을 조사한 바, xylan 분해 활성 외에 Avicel, carboxymethyl cellulose, 그리고 전분 및 PNPX에 대한 분해 활성은 나타내지 않았다. Xylanase 합성은 glucose에 의해서는 억제되었으나 xylose에 의해서는 억제되지 않았다. 배양 상징액을 이용한 xylan 분해 산물은 xylobiose를 포함한 소당류들이었으며 xylose는 거의 생성되지 않았다.
고온, 호알칼리성 Bacillus K-17 균주에서 한가지 xylanase 유전자를 pBR322를 벡터로 이용하여 클로닝시켰다. Xylan을 함유하는 LB 한천배지에서 분해환을 형성하는 대장균 형질전환주에서 재조합 플라스미드 pAXl13을 분리하였으며, 본 pAXl13 은 pBR322와 고온, 호알칼리성 Bacillus K-17균주 염색체 DNA의 4.3Kb HindIII 절편으로 구성되어 있었다. Biotin으로 표식된 pAXl13을 probe로 하여 상동성시험을 하여 본 결과, pAXl13에 존재하는 4.3Kb Hind III 절편은 고온, 호알칼리성 Bacillus K-17 균주 유래임을 확인하였다. pAXl13 을 가지는 E. coli 균주가 생성하는 xylanase는 균체외에 존재하였으며 그 효소학적 성질은 고온, 호알칼리성 Bacillus K-17 균주의 xylanase I 과 II중에서 xylanase I과 동일하였다.
Xylan를 기질로 직접 alcohol 발효를 목적으로 각종 토양을 균원시료로 하여 xyla를 분해, 자화하는 효모를 분리하여 동정하고 몇 가지 중요한 성질을 조사하였다. Xylanase를 생산하는 XB-33 효모는 Cryptococcus ater 유연균으로 동정되었다. XB-33 균주의 xylanase 생성은 xylan에 의해 induction되고 xylose나 glucose에 의해서는 repression되었다. 또한 xylan 농도는 1% 수준에서 가장 높았으며, 배양일수 6일째 그 황성이 최고치를 나타내었다. XB-33 균주가 생성 분비하는 xylanase를 DEAE-Sephadex A50으로 colum chromatography 하여 부분 정제한 후 이의 생화학적 특성을 검토한 결과 xylanase의 최적작용 pH는 5.0, 최적 온도는 5$0^{\circ}C$였으며 pH 5.0~7.0에서와 온도 6$0^{\circ}C$ 이하에서 의 효소활성은 비교적 안정하였고 xylan에 대한 xylanase의 작용양상을 조사하기 위해 TLC한 결과 최종산물로서 xylose가 확인되었다. 그리고 xylanase의 xylan에 대한 Km치는 20(mg/ml)이었다.
토양으로부터 세포외 xylanase를 다량 생산하는 균주를 분리하고 분리균의 형태적 내지는 생화학적인 특성을 조사하여 Bacillus stearothermophilus No.236로 동정하였다. 본 분리균은 초기 pH가 pH 6.5 인 0.75% xylan, 0.35% yeast extract, 1.06% $K_2$HPO$_4$, 0.61% NaH$_2$PO$_4$.2$H_2O$, 0.20% (NH$_4$)$_2$SO$_4$, 0.05% MnSO$_4$ 0.07% MgSO$_4$ 0.05% CaCO$_3$의 조성을 지닌 배지에서 5$0^{\circ}C$, 28시간 진탕배양했을 때 배양액 $m\ell$당 약 0.85units로서 가장 높은 효소생산량을 나타내었다. 또 본 xylanase는 xylan에 의해 유도 생산되는 세균 xylanase로서는 그 예가 극히 드문 exo-type의 효소인 것으로 판단되었다.
경주지역에 있는 목재 저장소의 토양으로부터 내별성 xylanase를 생산하는 호열성 세균인 DG-22 균주가 분리되었다. 형태적, 생화학적, 계통학적 연구에 근거하여 이 분리균은 Paenibacillus 속하는 종으로 판명되었다. 이 균주에서 xylanase의 생산은 성장배지에 xylan을 첨가함으로서 유도되었고 glucose또는 xylose에 의해서 억제되었다. Cellulase 활성은 탐지되지 많았다. 효소 활성을 위한 최적온도와 pH는 각각 $80^{\circ}C$와 5.0-5.5이었다. 이 조효소는 $60^{\circ}C$매서 안정하였고 $70^{\circ}C$에서는 2시간 추에도 60%의 활성을 유지하였다. 배양상등액의 zymogram 분석을 통해 22 kDa과 30 kDa 크기의 xylanase활성 band를 확인하였다
알칼리성 xylanase를 생산하는 균주를 토양으로부터 분리한 후 동정을 실시한 결과 Bacillus alcaiophilus으로 판명되었다. B. alcalophilus AX2000으로 명명한 본 균주는 pH 10.5에서 생육이 가장 좋았으며 효소활성도 가장 높았고 배지 중에 탄소원과 질소원으로서 0.5%(w/v) birchwood xylan과 0.5%(w/v) polypeptone/yeast extract를 각각 사용하였을 경우에 최대의 xylanase생산성을 나타내었다. Xylanase의 생합성근 glucose에 의한 catabolite repression을 받았으며 고농도의 xylose에 의해 효소의 생합성이 저해되었다. 조효소의 최적활성은 pH 10과 $50^{\circ}C$에서 나타났으며, pH 5에서 11까지의 넓은 pH범위에서 활성이 안정하게 유지되었고 효소의 열 안정성은 20~$60^{\circ}C$에서 30분간 처리시 90%이상의 잔존활성을 나타내었다.
Xylanase plays important roles in a broad range of industrial production as a biocatalyst, and its applications commonly require immobilization on supports to enhance its stability. Aluminum hydroxide, a carrier material with high surface area, has the advantages of simple and low-cost preparation and resistance to biodegradation, and can be potentially used as a proper support for xylanase immobilization. In this work, xylanase from Thermomyces lanuginosus was immobilized on two types of aluminum hydroxide particles (gibbsite and amorphous Al(OH)3) through adsorption, and the properties of the adsorbed enzymes were studied. Both particles had considerable adsorptive capacity and affinity for xylanase. Xylanase retained 75% and 64% of the original catalytic activities after adsorption to gibbsite and amorphous Al(OH)3. Both the adsorptions improved pH and thermal stability, lowered activation energy, and extended lifespan of the immobilized enzyme, as compared with the free enzyme. Xylanase adsorbed on gibbsite and amorphous Al(OH)3 retained 71% and 64% of its initial activity, respectively, after being recycled five times. These results indicated that aluminum hydroxides served as good supports for xylanase immobilization. Therefore, the adsorption of xylanase on aluminum hydroxide particles has promising potential for practical production.
A xylanase was purified from a commercial crude xylanase, Pulpzyme HC, and used for the bleaching of kraft pulp in the absence or in the presence of nonionic surfactants, Tween 20, Tween 80, and Igepal C930. The purified xylanase has a molecular weight of 23,500 as determined by a reducing SDS-PAGE. Tween 20 was most effective to enhance the efficiency of the enzymatic bleaching of kraft pulp by xylanase.
Thermo-tolerant bacterium producing the xylanase was isolated from soil and identified as Bacillus pumilus. This strain, named Bacillus pumilus TX703, was able to grow ad produce xylanase at the culture temperature of 5$0^{\circ}C$. The maximum xylanase production was obtained when 1%(w/v) birchwood xylan and 1% (w/v) soytone were used as carbon source and nitrogen source, respectively. The biosynthesis of xylanase was under the catabolite repression induced by glucose in the culture medium, and it was completely inhibited in the presence of 0.2% (w/v) glucose. The maximum activity of xylanase was observed from pH8.0 to 9.0 and from 50 to 6$0^{\circ}C$ and the enzyme was highly heat-stable, whose activity remained was over 50% at 8$0^{\circ}C$, and was quite stable from pH5.0 to 10.0.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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