• 제목/요약/키워드: viroid

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Occurrence of Chrysanthemum stunt viroid in Chrysanthemum in Korea

  • Chung, Bong-Nam;Lim, Jin-Hee;Choi, Seong-Youl;Kim, Jeong-Soo;Lee, Eun-Jung
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제21권4호
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    • pp.377-382
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    • 2005
  • Infection rate of Chrysanthemum stunt viroid (CSVd) in 64 commercial chrysanthemum cultivars cultivated in Korea ranged from 9.7 to 66.8$\%$. Symptoms on leaves of CSVd-infected chrysanthemum included yellow spots, chlorosis, vein clearing, vein bending and crumpling. CSVd induced flower malformation in 'Scot', color change in 'Sharotte', and color breaking in 'Sharon'. CSVd caused reduction of plant height, leaf size, flower size and the flowers number by $32-50\%,\;26-35\%$, $14-36\%\;and\;14-75\%$, respectively. In conclusion, CSVd affected plant height, leaf size and flower quality in chrysanthemum plants.

환상 및 선상감자 걀쪽바이로이드 RNA분자의 전기영동적 분리를 위한 효과적인 조건에 관한 연구 (Determining an Effective Electrophoretic Gel System for Separation of the Circular and Linear Potato Spindle Tuber Viroid RNA Molecules)

  • 이재열;김한집
    • 한국식물병리학회지
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    • 제3권4호
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    • pp.239-244
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    • 1987
  • 감자 걀쪽바이로이드(PSTV) RNA분자를 포함한 저분자량의 식물성 RNA분자에 대해서 0M부터 8M까지의 요소농도구배를 가진 폴리아크릴아마이드겔을 이용하여 1/40, 1/10로 희석한 완충액조건과 $17^{\circ}C,\;37^{\circ}C,\;57^{\circ}C$의 온도조건에서 전기영동을 실시하였다. 바이로이드의 RNA분자가 환상과 선상의 두가지 분자로 나뉘어지는 변성조건에서는 1/40로 희석한 TBE완충액을 포함하는 요소농도구배겔을 $57^{\circ}$에서 전기영동을 실시하는 것이 효과적이었다. 변성된 환상의 바이로이드분자에 대한 전기 영동적 이동성은 주로 요소의 농도에 따라 영향을 받는 것으로 보이는데, 이와 더불어 저 농도의 TBE완충액이 요소농도구배겔에서 환상과 선상바이로이드분자 사이에서 전기영동적 분리를 증가시켜 주었다.

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RT-PCR 기법을 이용한 감자 걀쭉 바이로이드 (Potato Spindle Tuber Viroid)의 검정 (Detection of Potato Spindle Tuber Viroid Using RT-PCR Technique)

  • 정영희;전재홍;최경화;김현순;정혁
    • 한국식물병리학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.205-209
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    • 1997
  • PSTVd 를 접종시킨 감자의 Superior 품종으로부터 PSTVd RNA를 분리하여 역전사효소와 PSTVd genome 중 356 uncleotides를 증폭할 수 있는 PSTVd 특이적 primer 쌍을 사용하여 RT-PCR를 수행한 결과 356 nuclcotides의 DNA 절편이 증폭되었고 이 절편을 sequencing인 결과 PSTVd 의 유전자임을 확인하였다. 감염된 잎과 괴경에수 모두 RT-PCR 기법을 이용한 PSTVd 의 검정이 가능하였고 특히 RT 반응시 downstream primer만을 이용할 때보다 downstream과 upstream primer를 동시에 사용할 때가 PSTVd 의 검정에 더 효과적이었다.

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Effective Application of CF11 Cellulose for Detection of Apple scar skin viroid in Apple

  • Chung, Bong-Nam;Cho, In-Sook;Cho, Jeom-Deog
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제25권3호
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    • pp.291-293
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    • 2009
  • The low virus titer in woody plant tissues and the presence of inhibitor compounds such as polyphenols, tannins and polysaccharides are common difficulties that compromise purification of plant viroids from their woody hosts. A simple, reliable method of RNA isolation using CF11 cellulose column on a microcentrifuge tube scale for detecting Apple scar skin viroid (ASSVd) in apple was developed. Total RNA extracted from leaf, woody bark and the fruit skin was used for reverse transcription. RT-PCR products could be detected from RNA prepared from dormant woody bark, fruit skin and fresh leaves with both the CF11 cellulose column method and NucliSens extractor in February, August and November. Meanwhile, with the RNeasy kit RT-PCR, products were detected only in leaves and not from bark or fruit skin. The PCR product, about 330 base pairs, was analyzed by agarose gel electrophoresis. The CF11 cellulose column method was effective for detecting ASSVd. The method enabled the processing of a large numbers of samples of dormant woody bark, leaf and fruit skin of apple.

Apple Scar Skin viroid 발생상황 및 Real-time RT-PCR을 이용한 상대정량 분석 (Occurrence of Apple Scar Skin viroid and Relative Quantity Analysis Using Real-time RT-PCR)

  • 김대현;김현란;허성;김세희;김민아;신일섭;김정희;조강희;황정환
    • 식물병연구
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    • 제16권3호
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    • pp.247-253
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    • 2010
  • 우리나라 사과 및 배 주산단지 12개 지역을 대상으로 ASSVd에 대한 진단 결과, 사과 및 배나무 전체 1,193주에서 20주가 바이로이드가 검출되어 1.7%의 이병율을 나타내었다. 품종별 감염상황을 살펴본 결과, 사과는 '홍로' 품종이 이병율이 3.6%로 타 품종에 비해 많이 감염되어 있음을 알 수 있었다. 국내에서 확인된 후지 등 주요 품종에서의 ASSVd 병징은 주로 과피 얼룩반점 증상이었으나, 후지품종 과피에 발생한 코르크(corking) 반점증상이 ASSVd 감염과 연관된 것으로 새롭게 확인하였다. 본 증상은 앞으로 유관으로 바이로이드 감염여부를 판단하는 중요한 지표가 될 것으로 판단된다. ASSVd에 감염된 사과를 대상으로 real time RT-PCR을 이용하여 ASSVd을 진단하고 시료간 상대 정량값을 분석하였다. real time RTPCR은 기존 RT-PCR에 비하여 전기영동이 필요없이 신속하고 간편하게 해석할 수 있으며, 오염의 위험성이 적었다. 특히 시료 간에 상대적인 정량값을 알 수 있기 때문에 시료를 비교 분석하는데 유효하다.

충남 예산 지역의 국화에서 바이러스 및 바이로이드 병들의 발생 현황 (Occurrence of Viruses and Viroids in Chrysanthemum Plants (Dendranthema morifolium) Cultivated in Yesan-gun, Chungcheongnam-do in Korea)

  • 방윤현;송은경;이영혜;류기현
    • 식물병연구
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    • 제28권4호
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    • pp.237-244
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    • 2022
  • 국화(Dendranthema morifolium)는 한국에서 경제적으로 중요한 화훼식물에 포함되고, 바이러스와 바이로이드 병들에 의해 경제적 피해를 받고 있다. 본 연구에서는 충청남도 예산군에서 재배된 국화 350개체를 대상으로 7종의 바이러스들과 2종의 바이로이드들(Chrysanthemum chlorotic mottle viroid, CChMVd; Chrysanthemum stunt viroid, CSVd; Cucumber mosaic virus, CMV; Chrysanthemum virus B, CVB; Chrysanthemum stem necrosis orthotospovirus, CSNV; Impatiens necrotic spot orthotospovirus, INSV; Potato virus X, PVX; Tomato aspermy virus, TAV; Tomato spotted wilt orthotospovirus, TSWV)을 검정하였다. 그 결과 2종의 바이러스들(CVB-CN-Y, TAV-CN-Y)과 2종의 바이로이드들(CChMVd-CN-Y, CSVd-CN-Y)이 검정되었다. CVBCN-Y는 6개의 국화 식물체들에서 검정되었고, TAV-CN-Y는 한개가 국화 식물체에서만 검정되었다. CChMVd-CN-Y는 97개의 국화 식물체들에서 검정되었으며, CSVd-CN-Y는 21개의 국화 식물체들에서 검정되었다. CVB-CN-Y는 CVB-GS1과 86.9% 염기서열 상동성을 보였으며, TAV-CN-Y는 3개의 분리주들(TAV-Chj, TAV-P, TAV-V)과 100% 염기서열이 일치하였다. CChMVd-CN-Y는 CChMVd-Horst와 99.5% 염기서열 상동성을 보였으며, CSVd-CN-Y는 4개의 분리주들(Au1.1, K4pop, Sagae, Tochigi)과 99.7% 염기서열 상동성을 보였다. 본 연구는 2021년 예산군에서 재배된 국화들을 대상으로 바이러스 및 바이로이드들을 검정하고 그들의 감염률에 관한 보고서이다.

Sensitive method for the detection of Apple scar skin viroid(ASSVd) by nested reverse transcription-polymerase chain reaction

  • Lee, Sung-Joon;Kim, Chung;Sim, Sang-Mi;Lee, Dong-Hyuk;Lee, Jai-Youl
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.143.2-143
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    • 2003
  • A rapid and sensitive assay for the specific detection of plant viroids using reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR) has been developed already. The nested RT-PCR assay cloud be applied for the detection of apple scar skin viroid(ASSVd) from young leaves and other tissues. ASSVd has central conserved region(CCR), terminal left(T$\sub$L/) and terminal right(T$\sub$R/) domain. Primers were designed from these regions. Primer sets were successfully applicable for the amplification of full length or partial region of ASSVd by nested RT-PCR. Nested RT-PCR assay was more sensitive and accurate method to detect ASSVd from young trees during the early time of apple cultivation.

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Resistance to Viruses of Potato and their Vectors

  • Palukaitis, Peter
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제28권3호
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    • pp.248-258
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    • 2012
  • Potato (Solanum tuberosum) is one of the most important food crops worldwide and yields of potato can be affected by virus infection. While more than 40 viruses have been found in potato, only nine viruses (potato leafroll virus, potato viruses A, M, S, V, X and Y, potato moptop virus and tobacco rattle virus) and one viroid (potato spindle tuber viroid) have a significant economic impact on potato, worldwide. This review describes the geographical distribution of the most important viruses infecting potato and the genes for resistance or tolerance that have been identified against these various infectious agents. In some cases such resistance genes have been found only in other Solanum species. Few genes for resistance to the vectors of these viruses have been obtained and even fewer have been deployed successfully. However, transgenic resistance in potato has been achieved against seven of these disease agents.

식물체에 감염성 질병을 유발하는 바이로이드 검출 및 진단 방법 (The Detection and Diagnosis Methods of Infectious Viroids caused Plant Diseases)

  • 이세희;김양훈;안지영
    • 생명과학회지
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    • 제26권5호
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    • pp.620-631
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    • 2016
  • 바이로이드는 매우 작은 RNA 분자로 구성되어 있으며, 외피 단백질이 없고 오로지 식물에만 감염되어 질병을 유발한다. 바이로이드 감염 질병을 예방하거나 진단하는 것은 상당히 어려운 일이며, 이는 병징이 초기에는 발견되지 않고 수확기에 접어들어서 발견되기 때문이다. 한편, 혈청학적인 방법은 식물 병원체를 검출하기 위해 주로 사용되었으나 바이로이드는 핵산인 RNA로만 구성되어 있기 때문에 이 방법으로 검출할 수가 없다. 때문에 바이로이드를 검출하기 위해 주로 사용되는 방법은 분자 생물학적인 방법으로, 초기에는 바이로이드의 분자적인 크기와 구조적 특징을 이용한 겔 전기 영동 방법이 주로 사용되었다. 그 후에는 역전사 반응과 중합효소 연쇄반응을 접목시킨 역전사 중합효소 연쇄반응(RT-PCR) 방법이 활용되었고, 그에 대한 효율적인 결과 확인을 위해 형광 물질을 도입한 실시간 역전사 중합효소 연쇄반응(Real-time RT-PCR)이 도입되었다. 그러나 그들은 온도를 변화시키기 위한 값비싼 기기와 전문적인 인력이 필요함으로 현장에서는 활용되기가 어렵다. 최근 개발된 고리 기반의 등온 증폭법(Loop-mediated isothermal amplification)의 경우, 온도의 변화가 필요 없어 비싼 온도 조절 기기가 필요하지 않다. 또한 매우 높은 증폭 효율을 지니며 반응 시간이 짧은 등의 여러 장점을 지니고 있기에 최근 현장 진단용 기술에 도입되고 있다. 이러한 배경으로, 이 총설에서는 바이로이드 유발 질병에 대하여 요약하고 그에 대한 검출 및 진단 방법에 대한 연구 동향에 대하여 기술하였다.