Bolser, Dan;Dafas, Panos;Harrington, Richard;Schroeder, Michael;Park, Jong
Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
/
2003.10a
/
pp.26-51
/
2003
Large scale protein interaction maps provide a new, global perspective with which to analyse protein function. PSIMAP, the Protein Structural Interactome Map, is a database of all the structurally observed interactions between superfamilies of protein domains with known three-dimensional structure in thePDB. PSIMAP incorporates both functional and evolutionary information into a single network. It makes it possible to age protein domains in terms of taxonomic diversity, interaction and function. One consequence of it is to predict the most important protein domain structure in evolution. We present a global analysis of PSIMAP using several distinct network measures relating to centrality, interactivity, fault-tolerance, and taxonomic diversity. We found the following results: ${\bullet}$ Centrality: we show that the center and barycenter of PSIMAP do not coincide, and that the superfamilies forming the barycenter relate to very general functions, while those constituting the center relate to enzymatic activity. ${\bullet}$ Interactivity: we identify the P-loop and immunoglobulin superfamilies as the most highly interactive. We successfully use connectivity and cluster index, which characterise the connectivity of a superfamily's neighbourhood, to discover superfamilies of complex I and II. This is particularly significant as the structure of complex I is not yet solved. ${\bullet}$ Taxonomic diversity: we found that highly interactive superfamilies are in general taxonomically very diverse and are thus amongst the oldest. This led to the prediction of the oldest and most important protein domain in evolution of lift. ${\bullet}$ Fault-tolerance: we found that the network is very robust as for the majority of superfamilies removal from the network will not break up the network. Overall, we can single out the P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases superfamily as it is the most highly connected and has the highest taxonomic diversity. In addition, this superfamily has the highest interaction rank, is the barycenter of the network (it has the shortest average path to every other superfamily in the network), and is an articulation vertex, whose removal will disconnect the network. More generally, we conclude that the graph-theoretic and taxonomic analysis of PSIMAP is an important step towards the understanding of protein function and could be an important tool for tracing the evolution of life at the molecular level.
This study explores the effective visual resources in the “regularity in chemical reactions” unit of ninth grade science textbooks (2009 revised version). The frequency and role of visual resources were initially examined, and the students’ perceptions of visual resources were investigated. The results of the analysis represented the learning material presentation (68%), motivational categories (14%), guide to inquiry procedures (9%), and inquiry results and summaries (8%). According to the investigation of the students’ perceptions of visual resources, the most effective visual resource for motivation is a photograph depicting physical and chemical changes, such as in bread baking and the most effective for learning material presentations in mass conservation, definite proportion, and stoichiometric concept units were a cartoon, graph, and formula representing stoichiometric phenomena, respectively. The most effective resource for guide to inquiry (experimental) procedures were photographs of both instruments and sequential experiment processes; and in the inquiry results and summary category, incomplete tables and graphs for students to work on themselves. The aims of this research are to increase the usefulness of visual resources in the teaching-learning activity and provide informative supplements for the development and improvement of visual resources, according to the students’ perceptions.
Recently, interest in ground subsidence in urban areas has increased after a large sinkhole occurred near the high-story building area in Jamsil, Seoul, Korea, in 2014. If a massive sinkhole occurs in an urban area, it is crucial to assess its risk rapidly. Access to humans for on-site safety diagnosis may be difficult because of the additional risk of collapse in the disaster area. Generally, inspection using drones equipped with high-speed lidar sensors can be utilized. However, if the sinkhole is created vertically to a depth of 100 m, similar to the sinkhole in Guatemala, the drone cannot be applied because of the wireless communication limit and turbulence inside the sinkhole. In this study, a three-dimensional (3D) scanning system was fabricated and operated using a towed cable in a massive vertical sinkhole to a depth of 200 m. A high-speed lidar sensor was used to obtain a continuous cross-sectional shape at a certain depth. An inertial-measuring unit was applied to compensate for the error owing to the rotation and pendulum movement of the measuring unit. A reconstruction algorithm, including the compensation scheme, was developed. In a vertical hole with a depth of 180 m in the mining area, the fabricated system was applied to scan 0-165 m depth. The reconstructed shape was depicted in a 3D graph.
The Journal of The Korea Institute of Intelligent Transport Systems
/
v.9
no.3
/
pp.85-93
/
2010
This paper proposes a new dynamic hardware allocation and binding algorithm of a simultaneous allocation and binding for SOC design automation. The proposed algorithm works on scheduled input graph and simultaneously allocates binds functional units, interconnections and registers by considering interdependency between operations and storage elements in each control step, in order to share registers and interconnections connected to functional units, as much as possible. This paper shows the effectiveness of the proposed algorithm by comparing experiments to determine number of function unit in advance or by comparing separated executing allocation and binding of existing system.
Purpose: Maximizing human comfort in design of medical environments depends immensely on specialized architects particularly critical care design; the study proposes Evidence-Based Design as an apparent analog to Evidence-Based Medicine. Healthcare facility designs are substantially based on the findings of study in an effort to design environments that augment care by improving patient safety and being therapeutic. On SPSS (Statistical Package for Social Science) t-test is applied to simulate two independent variables of PDR (Pre Design-Research) and POE (Post- Occupancy Evaluation). PDR is conducted on relatively new hospital Hallym University Dongtan Sacred Heart Hospital to analyse visibility from researchers' point of view, here the ICU is arranged in I-Shape. POE is applied on Dongguk University Ilsan Hospital to simulate walking on LogWare where two NS are designed based on L- Shape and Seoul St. Mary's Hospital, The Catholic University of Korea where five NS are functional for ICU Intensive Care Unit, Surgical Intensive Care Unit (SICU), Medical Intensive Care Unit (MICU), Critical Care Unit (CCU), Korean Oriental Medical Care Unit which are mostly arranged in U-Shape, and walking pattern is recognized to be in a zigzag path. Method: T-Test is applied on two dependent communication variables: walkability and visibility, with confidence interval of 95%. This study systematically analyses the Nurse Station (NS) typo-morphology, and simulates nurse horizontal circulation, by computing round route visits to patient's bed, then estimating minimum round route on LogWare stop sequence software. The visual connectivity is measured on depth map graphs. Hence the aim is to reduce staff stress and fatigue for better patients care by minimizing staff horizontal travel time and to facilitate nurse walk path and support space distribution by increasing effectiveness in delivering care. Result: Applying visibility graph and isovist field on space syntax on I- Shape, L- Shape and U- Shape ICU (SICU, MICU and CCU) configuration, I-shape facilitated 20% more patients in linear view as they stir to rise from their beds from nurse station compared to U-shape. In conclusion, it was proved that U-Shape supply minimum walking and maximum visibility; and L shape provides just visibility as the nurse is at pivot. I shape provides panoramic view from the Nurse Station but very rigorous walking.
The transient characteristics of separately excited d-c motor driven by thyristor d-c chopper is studied in this paper. The armature controlled system is applied. As a result of theoretrical analysis the following conculsions were drawn: (1) For the transient analysis, it is recognized that the state transition analysis is a more general method and powerful tool than the state equation method or signal flow graph method, although it includes iterative matrix calculations. And the system is dealt with a finite width sampled-data system in the state transition analysis. (2) The transient characteristics of the motor angular velocity and its torque to the sampling duration variation are compared with those due to the amplitude variation of d-c chopper voltage as follows. The attenuation rate of the transient characteristics is equal in both cases, but the initial value of the transient characteristics in former case is greater than in latter case. (3) The roots of characteristics equation of the system lie inside the unit circle of the Z-plane. Therefor the system is stable. Further it is found that as the sampling duration is decreased the relative stability is lessened.
We present several distributed algorithms for localizing nodes of a wireless sensor network. Our algorithms determine locations of nodes based on the connectivity between nodes. The basic idea behind our algorithms is to estimate distances between nearby nodes by counting their common neighbors. We analyze the performance of our algorithms experimentally. The results of experiments show that our algorithms achieve performance improvements upon the existing algorithms
The Journal of Korean Institute of Communications and Information Sciences
/
v.9
no.2
/
pp.70-76
/
1984
In this paper, a functional m-redundant system, which is m-fault tolerant, is defined based on the graph-theory. This system is designed to be t(t$\geq$m) fault-diagnosable by comparing its unit's outcomes without additive test functions, so, the system down for diagnosis is not needed. The diagnostic model for this system is presented. It is to avail the redundancy of the system effectively. It is shown that this model can be converted into Preparata's model. Thus, the diagnostic characteristics of a functional m-redundant system is analyzed by the method originated by Preparata et al.
Journal of Electrical Engineering and information Science
/
v.3
no.1
/
pp.117-125
/
1998
In this paper, in order to investigate the fading reduction effect of narrowband and broadband signals in an indoor multipath propagation environment, both the received narrowband signal while a vehicle unit in motion and the frequency sweeped broadband signal received by vertical polarized antenna, horizontal polarized antenna and circularly polarized antenna are analyzed. Specifically, in order to evaluate polarization diversity effect, we examined the difference of fading reduction effect between the polarization diversity reception and the space diversity reception. Using the correlation coefficient and correlation graph for the polarization diversity branches, the diversity effect is evaluated. And also, using the cumulative distribution for the received signal strength simulated by diversity reception, the diversity effect is also estimated. From the evaluation results it was found that the polarization diversity which use a circularly polarized antenna at the transmitting end and the vertical and horizontal polarized antenna branches at the receiving end is markedly excellent.
Journal of The Korean Association of Information Education
/
v.3
no.1
/
pp.125-133
/
1999
This paper is to provide a provision, in the system of virtual studying on the base of web, that can be used when learners(student) don't feel interesting anymore in the situation of unit studying and wanders in virtual space. No doubt, It's possible to provoke learner's interesting with providing such as fine multi-media, graph, and animation. But This study propose a method for learner who is apt to tired of studying although activity program is developing.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.