• 제목/요약/키워드: streptomyces

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Streptomyces sp. 에 의한 참깨 시들음병 (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum) 및 역병 (Phytophthora nicotianae var. parasitica)의 생물학적(生物學的) 방제(防除) (Biological Control with Streptomyces sp. on Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum and Phytophthora nicotianae var. parasitica Causing Sesame Wilt and Blight)

  • 정봉구;홍기성
    • 한국균학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.231-237
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    • 1991
  • 참깨 시들음병과 역병에 대한 괄항균(括抗菌) Streptomyces spp.의 길항현상과 생물학적 방제 효과를 구명코져 참깨 시들음병(F. oxysporum f. sp. vasinfectum)과 역병(P. nicotianae var. parasitica)이 발생한 포장에 이병주로 부터 병원균을 순수분리(純粹分離)하였고 괄항균(括抗菌)은 충북일원의 고추, 참깨포장의 72점의 흙으로 부터 공시 병원균에 효과있는 괄항균(括抗菌)을 대치배양법(對峙培養法)으로 선발하였다. 선발된 괄항균(括抗菌) St-11 과 St-20 을 공시하여 병원균에 대한 균사저지원, 괄항균(括抗菌) 배양 여액에서의 병원균의 생육저지, 발아억제 빛 lysis 를 관찰 조사하였고 괄항균(括抗菌) 현독액(縣獨液 )(St-11) 을 종자에 처리할 경우 참깨생육에 아무런 영향이 없었다. 온실에서 괄항균(括抗菌)의 토양접종에 의한 참깨시들음병과 역병에 대한 방제효과는 병원균 단독 접종구에 비하여 40-78% 의 방제효과를 보였다.

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Xylanase를 생산하는 Streptomyces sp. YB914의 특성과 효소 생산성 (Characterization and Xylanase Productivity of Streptomyces sp. YB914)

  • 윤기홍
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.383-388
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    • 2009
  • 토양으로부터 세포외로 xylanase를 분비 생산하는 방선균 YB-914가 분리되었으며, 형태, 배양, 생화학적 특성을 조사한 결과 Streptomyces 속 균주로 확인되었다. 분리균의 배양상등액에 존재하는 xylanase는 pH 5.5과 $55^{\circ}C$의 반응조건에서 반응성이 가장 높았으며, pH 4.5~7.0 범위에서 최대활성의 80% 이상을 나타냈다. Xylanase의 생산을 위한 배지를 최적화하기 위해서 G.S.S 배지성분을 여러 종류의 탄수화물로 대체하였다. Oat spelt xylan, corn cob xylan, 밀기울 및 유당과 같은 탄수화물은 Streptomyces sp. YB914의 xylanase 생산성을 증가시키는 것으로 확인되었으며, galactose와 arabinose는 효소 생산을 크게 억제하였다. Oat spelt xylan(1%)와 유당(1.5%)을 함유한 변형배지에서 xylanase의 최대생산성이 48 U/mL로 확인되었다.

Comparative Genomics Reveals the Core and Accessory Genomes of Streptomyces Species

  • Kim, Ji-Nu;Kim, Yeonbum;Jeong, Yujin;Roe, Jung-Hye;Kim, Byung-Gee;Cho, Byung-Kwan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제25권10호
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    • pp.1599-1605
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    • 2015
  • The development of rapid and efficient genome sequencing methods has enabled us to study the evolutionary background of bacterial genetic information. Here, we present comparative genomic analysis of 17 Streptomyces species, for which the genome has been completely sequenced, using the pan-genome approach. The analysis revealed that 34,592 ortholog clusters constituted the pan-genome of these Streptomyces species, including 2,018 in the core genome, 11,743 in the dispensable genome, and 20,831 in the unique genome. The core genome was converged to a smaller number of genes than reported previously, with 3,096 gene families. Functional enrichment analysis showed that genes involved in transcription were most abundant in the Streptomyces pan-genome. Finally, we investigated core genes for the sigma factors, mycothiol biosynthesis pathway, and secondary metabolism pathways; our data showed that many genes involved in stress response and morphological differentiation were commonly expressed in Streptomyces species. Elucidation of the core genome offers a basis for understanding the functional evolution of Streptomyces species and provides insights into target selection for the construction of industrial strains.

녹비작물 추출물의 감자 더뎅이병균에 대한 항균력 검정 (Antimicrobial Activity against Potato Common Scab (Streptomyces scabiei) of Green Manure Crop Extracts)

  • 박종인;정희정;배용희;강권규;노일섭
    • 한국자원식물학회지
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    • 제24권5호
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    • pp.622-627
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    • 2011
  • 본 연구는 시판되고 있는 10종의 녹비작물로부터 추출한 추출물을 이용하여 감자 더뎅이병균(Streptomyces scabiei)에 대한 항균활성을 검정함으로서 감자 더뎅이병 경감을 위한 녹비작물 선발의 기초자료로 활용하고자 하였다. 10종의 녹비작물에 대하여 hexane, ether, ethylacetate, methanol 및 water로 순차적으로 용매분획을 하였다. 그 결과 DPPH free radical 소거능은 ether, methanol 및 water 추출물에서 소거능이 높게 나타났다. 감자 더뎅이병균(Streptomyces scabiei)에 대한 항균활성은 methanol, ethylacetate, ether 및 water 용매를 이용한 모든 녹비작물 추출물의 0.25 mg/mL 농도에서부터 높은 항균활성을 나타내었다. 특히, methanol 용매를 이용한 하우스솔고 추출물은 감자 더뎅이병균에 대하여 다른 녹비작물 보다 더 높은 항균력을 나타내었다. 이상의 결과들로부터 하우스솔고의 이용은 감자 더뎅이병 경감을 위한 최적의 녹비작물로 생각되었다.

Escherichia coli에서의 Streptomyces coelicolor A3(2)의 acetyl xylan esterase 발현 양상 (Expression Pattern of Acetyl Xylan Esterase of Streptomyces coelicolor A3(2) in Escherichia coli)

  • 이인숙;윤석원;정상운;오충훈;김재헌
    • 미생물학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.83-88
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    • 2003
  • streptomyces coelicolor A3(2)의 acetyl xylan esterase 유전자를 Escherichia coli께 클로닝하여 그 발현양상을 조사하였다. 이를 위하여 유전자 전체 DNA를 PCR증폭을 통하여 제조하였다. PCR산물의 염기서열을 분석한 결과 1,008개의 nucleotide로 구성된 하나의 open reading frame이 존재함을 확인하였고, 이것은 335개의 아미노산으로 이루어진 약 38 kDa의 단백질을 생성할 것으로 예측할 수 있었다. 이 유전자의 염기 서열은 streptomyces lividans의 acetyl xylan esterase와 98%의 상동성을 가졌다. 그런데 Escherichia coli (pLacl)에서 IPTG유도에 의해 두가지의 acetyl xylan esterase가 발현되었으며 각각의 분자량은 38 kDa과 34 kDa이었다. 이중에서 38 kDa의 단백질은 N-말단의 signal peptide를 포함한 전체 단백질이고,34 kDa의 단백질은 41번과 42번의 두 알라닌 잔기사이의 펩티드 결합이 끊어져 생산된 것으로 추정되었다.

Optimal Production Conditions of Streptomyces griseus Trypsin (SGT) in Streptomyces lividans

  • Koo, Bon-Joon;Kim, Joung-Mee;Byun, Si-Myong;Hong, Soon-Kwang
    • BMB Reports
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    • 제32권1호
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    • pp.86-91
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    • 1999
  • The sprT gene encoding Streptomyces griseus trypsin (SGT) was introduced into Streptomyces lividans TK24 and Streptomyces lividans 1326 to study which strain would be better to overexpress the extracellular proteinase. Various media with different compositions were also used to maximize the productivity of SGT in heterologous hosts. The SGT productivity was best when the transformants of S. lividans TK24 and 1326 were cultivated in R2YE medium, and their relative trypsin activity of the culture broth measured with an artificial chromogenic substrate, N-${\alpha}$-benzoyl-DL-arginine-${\rho}$-nitroanilide, were 382 units/ml and 221 units/ml, respectively. They produced high levels of SGT in GYE medium but relatively lower than those in R2YE medium, and negligible amount of SGT was produced in Ferm, RASF, LIVID, and NDSK media. Considering non-SGT associated activity in Pronase powder, it was estimated that the transformant of S. lividans TK24 can produce SGT in R2YE 3.5 times more than the amount by S. griseus 10137 from which the sprT gene had been originated. The growth of S. lividans reached the maximum level of cell mass at 5 d of culture, but SGT production started in the stationary phase of cell growth and kept increasing until the ninth day of culture in R2YE medium, but in GYE media the productivity reached at the maximum level at 7 d of cultivation.

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토양 방선균 Streptomyces sp. MG 121의 항균활성 및 고추 생육에 미치는 효과 (Effects of Streptomyces sp. MG 121 on Growth of Pepper Plants and Antifungal Activity)

  • 임태헌;조성현;김진호
    • 식물병연구
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    • 제13권2호
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    • pp.93-97
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    • 2007
  • 비경작 산림 토양으로부터 고추 역병균과 탄저병균에 대한 항균활성, 불용태 인산의 가용화 및 식물체 초기생육촉진 효과를 보이는 방선균을 분리하였다. 선발된 미생물의 16S rDNA 염시서열을 분석한 결과, Streptomyces sp.로 동정되었다. Streptomyces sp. MG 121 균주는 고추열매를 이용한 역병과 탄저병을 80% 이상 억제하였다. MG 121균주 배양액의 식물체 엽면살포는 식물체의 초기생육을 10% 이상 촉진시키는 것으로 나타났다. 불용태 인산의 가용화 활성을 측정한 결과, 유리인산의 농도는 144시간 후 $762{\mu}g/ml$까지 증가하였다.

신규의 Aminopeptidase M 저해제 MR-387A 및 B 생산균주의 수리동정 (Numerical Identification of a Strain Producing Novel Aminopeptidase M Inhibitors MR-387A and B)

  • 정명철;박동진;김창진;김수일;고영희
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제38권3호
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    • pp.196-201
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    • 1995
  • 토양으로부터 분리한 신규의 aminopeptidase M 저해제 MR-387A 및 B를 생산하는 균주 SL-387의 화학동정 및 수리동정을 하였다. 배양학적 및 형태학적 특성과 화학지표에 의하여 분리균주는 Streptomyces에 속하는 것으로 판단되었다. 종의 동정을 위하여 41개 동정 단위형질에 대하여 조사한 후 TAXON 프로그램을 사용하여 수리동정을 하였다. 분리균주는 Streptomyces의 주군집 18에 속하는 균주로 Streptomyces eyagawaensis와 공유도계수($S_{SM}$) 75.6%로 가장 유사 하였다. 이상의 화학동정 및 TAXON 분석에 의하여 분리균주 SL-387은 Streptomyces neyagawaensis이거나 그 유연 균주인 것으로 동정 되었다.

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Streptomyces coelicolor A3(2)로 부터 세포외 lipase의 정제와 특성 (Purification and Characterization of Extracellular Lipase from Streptomyces coelicolor A3(2))

  • 심문수;김재헌
    • 미생물학회지
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    • 제33권4호
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    • pp.237-241
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    • 1997
  • Streptomyces coelicolor A3(2) 배양액의 lipase(EC 3.1.1.3)는 ${\alpha}$-naphthyl-butyrate에 대하여 활성을 나타내어 ${\alpha}$-naphthyl-acetate에 활성을 나타내는 esterase와 구분할 수 있었다. Streptomyces coelicolor A3(2) 세포외 lipase를 Sephadex G-100, DEAE-Cellulose 그리고 Phenyl-Sepharose CL4B 크로마토그래피의 과정을 통해 16% 수율로 15배 분리정제 하였다. SDS-폴리아크릴아마이드 겔 전기영동에서는 34.7 kDa정도의 분자량을 갖는 것으로 나타났다. Tributyrin를 기질로 사용하였을 때 이 lipase의 최적활성조건은 pH 8에서 9 그리고 $37^{\circ}C$였다. 기질로서 triacylglycerol의 지방산 길이가 증가할수록 활성은 감소하였다. A-factor에 의해 lipase활성이 억제되므로 배양초기의 낮은 lipase활성과 관련될 것으로 보인다.

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참깨 역병(Phytophthora nicotianae var. parasitica) 및 시들음병(Fusarium oxysporum f. sg. vasinfectum)에 길항적인 Streptomyces spp.의 분류 동정 (Identification of Antagonistic Streptomyces Species on Phytophthora nicotianae var. parasitica and Fusarium oxysporum sporum f. sg. vasinfectum Causing Sesame Wilt and Blight)

  • 정봉구;서상오
    • 한국균학회지
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    • 제20권1호
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    • pp.65-71
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    • 1992
  • 참깨 역병(疫病) 및 시들음병에 길항효과(拮抗效果)가 우수(優秀)한 2균주(菌株)에 대하여 형태적(形態的), 배양적(培養的) 및 생리적(生理的) 특징(特徵)에 근거하여 동정하였다. 형태적(形態的)특정으로서 포자(胞子)사슬모양이 공시균(供試菌) St-11은 꾸불꾸불한 모양(Rectus-flexibilis)인 반면(反面) 분리균주(分離菌株) St-20은 고리모양(Rectinaculum-apertum)이었다. 포자(胞子)의 세포벽표면(細胞壁表面)의 모양은 St-11이 매끄러운 모양(Smooth form)이었으나 St-20은 바늘모양(Spiny form)이었다. 배양적(培養的) 특징(特徵)으로서 기중(氣中) 균사체(菌絲體)의 색깔은 뒷면과 함께 모두 회색계통(灰色系統)이었으며 대체로 공시배지(供試培地)에서 균(菌)의 생장(生長)은 양호(良好)하였다. Soluble pigment 는 공시균주(供試菌株) St-11과 St-20 모두에서 형성(形成)되지 않았다. 공시균(供試菌) St-11은 의 분해능(分解能)과 Gelatin 액화능(液化能)은 음성 반응을 보인 반면 St-20은 전분(澱粉)의 분해능(分解能)은 양성반응, Gelatin 액화능(液化能)은 음성이었다. 이상의 여러 시험결과에 따라 공시균주 St-11은 Streptomyces bikiniensis로 St-20 은 Streptomyces echinoruber로 동정하였다.

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