International journal of advanced smart convergence
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v.13
no.3
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pp.253-258
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2024
This paper explores the factors influencing the degree of freedom in open-world games, taking <The Legend of Zelda: Tears of the Kingdom> as a case study, it is carefully analyzed in comparison to similar well-known games such as <Genshin>,<Elden Ring>, and <Far Cry>. It also analyzes how the player skill system and its synergy with the combination of interactive elements can effectively enhance the freedom of the game. The results show that the diversity of player skill systems not only significantly enhances the in-game strategy and depth of exploration, but also the rich combination of interactive elements further enhances players' tactical flexibility. This paper also points out that simply expanding the map size while neglecting the content richness and balance of quest design can have negative impacts on the game. This study aims to provide game developers with insights that emphasize the application of skill diversity and interactive elements to improve players' gameplay freedom and overall experience.
Oo, Thaung Naing;Lee, Don Koo;Combalicer, Marilyn;Kyi, Yin Yin
Journal of Korean Society of Forest Science
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v.97
no.2
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pp.171-180
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2008
The characterization of tree species and forest stand conditions is useful in the planning of activities aimed to conserve biodiversity. The main objective of this study was to describe tree species diversity, species composition and stand structure of tropical deciduous forests distributed in three regions in Myanmar. Forest inventory was conducted in the Oktwin teak bearing forest, the Letpanpin community forest and Alaungdaw Kathapa National Park. According to the Jackknife estimator of species richness, 85 species (${\pm}18.16$), 70 species (${\pm}5.88$) and 186 species (${\pm}17.10$) belonging to 31 families were found in the Oktwin teak bearing forest, 33 families in Letpanpin community forest and 53 families in Alaungdaw Kathapa national park, respectively. Shannon's diversity indices were significantly different among the forests (p<0.05). It ranged from 3.36 to 4.36. Mean tree density (n/ha) of the Oktwin teak bearing forest, Letpanpin community forest and Alaungdaw Kathapa National Park were 488 (${\pm}18.6$), 535 (${\pm}15.6$) and 412 (${\pm}14.1$), while basal areas per hectare were $46.96m^2({\pm}3.23),\;49.01m^2({\pm}5.08)\;and\;60.03m^2({\pm}3.88)$, respectively. At the family level, Verbenaceae, Myrtaceae and Combretaceae occupied the highest importance value index, while at the species level it was Tectona grandis, Lagerstoremia speciosa and Xylia xylocarpa.
In spite of variation in coat color, size, and production traits among indigenous Bangladeshi cattle populations, genetic differences among most of the populations have not been investigated or exploited. In this study, we used a high-density bovine single nucleotide polymorphism (SNP) 80K Bead Chip derived from Bos indicus breeds to assess genetic diversity and population structure of 2 Bangladeshi zebu cattle populations (red Chittagong, n = 28 and non-descript deshi, n = 28) and a semi-domesticated population (gayal, n = 17). Overall, 95% and 58% of the total SNPs (69,804) showed polymorphisms in the zebu and gayal populations, respectively. Similarly, the average minor allele frequency value was as high 0.29 in zebu and as low as 0.09 in gayal. The mean expected heterozygosity varied from $0.42{\pm}0.14$ in zebu to $0.148{\pm}0.14$ in gayal with significant heterozygosity deficiency of 0.06 ($F_{IS}$) in the latter. Coancestry estimations revealed that the two zebu populations are weakly differentiated, with over 99% of the total genetic variation retained within populations and less than 1% accounted for between populations. Conversely, strong genetic differentiation ($F_{ST}=0.33$) was observed between zebu and gayal populations. Results of population structure and principal component analyses suggest that gayal is distinct from Bos indicus and that the two zebu populations were weakly structured. This study provides basic information about the genetic diversity and structure of Bangladeshi cattle and the semi-domesticated gayal population that can be used for future appraisal of breed utilization and management strategies.
The genetic diversity of Schistosoma haematobium remains largely unstudied in comparison to that of Schistosoma mansoni. To characterize the extent of genetic diversity in S. haematobium among its definitive host (humans), we collected S. haematobium eggs from the urine of 73 infected schoolchildren at 5 primary schools in White Nile State, Sudan, and then performed a randomly amplified polymorphic DNA marker ITS2 by PCR-RFLP analysis. Among 73 S. haematobium egg-positive cases, 13 were selected based on the presence of the S. haematobium satellite markers A4 and B2 in their genomic DNA, and used for RFLP analysis. The 13 samples were subjected to an RFLP analysis of the S. haematobium ITS2 region; however, there was no variation in size among the fragments. Compared to the ITS2 sequences obtained for S. haematobium from Kenya, the nucleotide sequences of the ITS2 regions of S. haematobium from 4 areas in Sudan were consistent with those from Kenya (> 99%). In this study, we demonstrate for the first time that most of the S. haematobium population in Sudan consists of a pan-African S. haematobium genotype; however, we also report the discovery of Kenyan strain inflow into White Nile, Sudan.
Colorectal cancer (CRC) is the leading cause of common malignant neoplasm worldwide. Many studies have analyzed compositions of gut microbiota associated with various diseases such as inflammatory bowel diseases (IBD) and colon cancer. One of the most representative bacteria involved in CRC is enterotoxigenic Bacteroides fragilis (ETBF), a species belonging to phylum Bacteroidetes. We used ETBF colonized mice with azoxymethane (AOM)/dextran sulphate sodium (DSS) and zerumbone, a compound with anti-bacterial effect, to determine whether zerumbone could restore intestinal microbiota composition. Four experimental groups of mice were used: sham, ETBF colonized AOM/DSS group, ETBF colonized AOM/DSS group zerumbone 60 mg kg-1 (ETBF/AOM/DSS + Z (60)), and only zerumbone (60 mg kg-1)-treated group. We performed reversible dye terminators-based analysis of 16S rRNA gene region V3-V4 for group comparison. Microbiota compositions of ETBF/AOM/DSS + Z (60) group and ETBF colonized AOM/DSS group not given zerumbone were significantly different. There were more Bacteroides in ETBF/AOM/DSS + Z (60) group than those in ETBF colonized AOM/DSS group, suggesting that B. fragilis could be a normal flora activated by zerumbone. In addition, based on linear discriminant analysis of effect size (LEfSe) analysis, microbial diversity decreased significantly in the ETBF colonized AOM/DSS group. However, after given zerumbone, the taxonomic relative abundance was increased. These findings suggest that zerumbone not only influenced the microbial diversity and richness, but also could be helpful for enhancing the balance of gut microbial composition. In this work, we demonstrate that zerumbone could restore the composition of intestinal microbiota.
Kim, Jun-Soo;Hong, Jin-Ki;Kim, Kyung-Soo;Cho, Yong-Chan;Bae, Kwan-Ho
Journal of agriculture & life science
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v.45
no.3
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pp.9-18
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2011
This study was performed to investigate species diversity of understory in Mt. Biryong. The quadrat size was installed based on the result of analysis of Species-Area Curve. The vascular plants were enlisted 107 taxa: 47 families, 80 genera, 91 species, 11 varieties, 2 subspecies, and 3 forms. The three taxa such as Carex okamotoi, Philadelphus schrenkii var. schrenkii, and Weigela subsessilis were enlisted from the surveyed sites as the Korean endemic plants. Due to the list from the Korea Forestry Administration, Rhododendron micranthum was enlisted as the rare plant. The growth from was categorized followed by forbs, shrubs and trees, respectively.
Park, Pue Hee;Kim, Mi Seon;Lee, Young Ran;Park, Pil Man;Lee, Dong Soo;Yae, Byeong Woo
Korean Journal of Breeding Science
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v.43
no.5
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pp.399-404
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2011
Genetic diversity among 28 Cymbidium varieties was evaluated by using a sequence-related amplified polymorphism (SRAP) marker system. The SRAP marker which was based on the open reading frames (ORFs) regions was developed primarily for Brassica species, but has been applied to various crops. A total of 30 SRAP primer combinations were initially screened. Twenty-eight SRAP primer combinations showed high polymorphism among the 28 Cymbidium varieties, which were consisted of breeding varieties and their parents in National Institute of Horticultural & Herbal Science (NIHHS). The amplified DNA fragments were separated by denaturing acrylamide gels and detected silver staining method. One hundred ninety six polymorphic bands (7 per primer) were generated and ranged from 0.3 to 1.0 kb in size. Polymorphic fragments were scored for calculating simple matching coefficient of genetic similarity and cluster analysis with multi-variate statistical package (MVSP) 3.1. The mean genetic similarity coefficient value was 0.588. The results showed that the correlation between $F_1$ varieties and their parents was high. These studied SRAP markers will be useful tools for genotype identification, germplasm conservation, genetic relationships in Cymbidium.
Objective: This research was conducted to study the genetic diversity in several Indonesian cattle breeds using microsatellite markers to classify the Indonesian cattle breeds. Methods: A total of 229 DNA samples from of 10 cattle breeds were used in this study. The polymerase chain reaction process was conducted using 12 labeled primers. The size of allele was generated using the multiplex DNA fragment analysis. The POPGEN and CERVUS programs were used to obtain the observed number of alleles, effective number of alleles, observed heterozygosity value, expected heterozygosity value, allele frequency, genetic differentiation, the global heterozygote deficit among breeds, and the heterozygote deficit within the breed, gene flow, Hardy-Weinberg equilibrium, and polymorphism information content values. The MEGA program was used to generate a dendrogram that illustrates the relationship among cattle population. Bayesian clustering assignments were analyzed using STRUCTURE program. The GENETIX program was used to perform the correspondence factorial analysis (CFA). The GENALEX program was used to perform the principal coordinates analysis (PCoA) and analysis of molecular variance. The principal component analysis (PCA) was performed using adegenet package of R program. Results: A total of 862 alleles were detected in this study. The INRA23 allele 205 is a specific allele candidate for the Sumba Ongole cattle, while the allele 219 is a specific allele candidate for Ongole Grade. This study revealed a very close genetic relationship between the Ongole Grade and Sumba Ongole cattle and between the Madura and Pasundan cattle. The results from the CFA, PCoA, and PCA analysis in this study provide scientific evidence regarding the genetic relationship between Banteng and Bali cattle. According to the genetic relationship, the Pesisir cattle were classified as Bos indicus cattle. Conclusion: All identified alleles in this study were able to classify the cattle population into three clusters i.e. Bos taurus cluster (Simmental Purebred, Simmental Crossbred, and Holstein Friesian cattle); Bos indicus cluster (Sumba Ongole, Ongole Grade, Madura, Pasundan, and Pesisir cattle); and Bos javanicus cluster (Banteng and Bali cattle).
Finger millet (Eleusine coracana) is widely cultivated in tropical regions worldwide owing to its high nutritional value. Finger millet is more tolerant against biotic and abiotic stresses such as pests, drought, and salt than other millet crops; therefore, it was proposed as a candidate crop to adapt to climate change in Korea. In 2019, we used expressed sequence tag simple sequence repeat (EST-SSR) markers to evaluate the genetic diversity and structure of 102 finger millet accessions from two geographical regions (Africa and South Asia) to identify appropriate accessions and enhance crop diversity in Korea. In total, 40 primers produced 116 alleles, ranging in size from 135 to 457 bp, with a mean polymorphism information content (PIC) of 0.18225. Polymorphism was detected among the 40 primers, and 13 primers were found to have PIC values > 0.3. Principal coordinate and phylogenetic analyses, based on the combined data of both markers, grouped the finger millet accessions according to their respective collection areas.Therefore, the 102 accessions were classified into two groups, one from Asia and the other from Africa. We have conducted an in-depth study on the finger millet landrace pedigree. By sorting out and using the molecular characteristics of each pedigree, it will be useful for the management and accession identification of the plant resource. The novel SSR markers developed in this study will aid in future genetic analyses of E. coracana.
Choi, Hyun-Seok;Jeong, Su Yeon;Lee, Keon Hee;Jeong, Jun Seong;Park, Jeong Sun;Jeong, Na Ra;Kim, Min Jee;Lee, Wonhoon;Kim, Iksoo
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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v.43
no.2
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pp.67-77
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2021
Salurnis marginella Guérin-Méneville, 1829 (Hemiptera: Flatidae) is an invasive species first reported in 2003 in Iksan, which is located in the mid-western region of South Korea, and subsequently found in the nearby regions in 2005. However, molecular-perspective reports on their invasive characteristics are not yet available. In this study, population genetic characteristics of Korean S. marginella were evaluated using the mitochondrial COI region and sequencing 124 individual samples collected in 11 Korean localities. A total of 12 haplotypes were identified with a maximum sequence divergence of 1.368% (9 bp). Haplotype diversity was relatively higher than that of other insect species invaded into Korea, providing 2-6 haplotypes per populations, indicating that introduction to Korea may have happened rather extensively and consistently. Nucleotide diversity (π) was the highest in Iksan but owing to the limited sample size (three individuals) from this locality, additional studies are required for drawing conclusive inference regarding the place of entry to Korea. Ulsan, the easternmost population in the present study, revealed nearly the lowest diversity estimates, such as the lowest H and the second-lowest π; a unique haplogroup with a higher frequency; and an independent genetic cluster, suggesting that the introduction of S. marginella to Ulsan was an independent event. Further collection in Korea and neighboring countries, including the original distributional range is necessary to elucidate the invasive dynamics of S. marginella
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[게시일 2004년 10월 1일]
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