• 생명과학회지
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• 제17권11호
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• pp.1453-1463
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• 2007

본 연구는 유해성 적조생물인 Cochlodinium polykrikoides의 유전적 계통진화를 설명하기 위하여 24 종의 개체에 대한 SSU을 대상으로 분석했다. C. polykrikoides는 와편모조류와 밀접한 단일 계통군을 형성하고 있다. Neighbor-joining 혹은 parsimony 분석에 의하면 C. polykrikoides는 Gymnodiniales 보다 Prorocentrals 목 (order)에 훨씬 근접한 100% 유연관계를 보이고 있으며, 과 (family)로 분석해 보면 Gymnodiniaceae에 속해 있고, 특히 Prorocentrum micans와는 매우 밀접한 관계를 보이고 있다. 형태적으로는 Gyrodinium속 (genus)에 가깝지만, 유전적으로는 Gymnodinium 속에 근접하고 있다. C. polykrikoides는 와편모조류 중에서 독립적인 계통군을 유지하고 있다. 따라서 p. micans는 Gymnodinium의 조상으로 추측되며, C. polykrikoides는 P. micans와 Gymnodinium 속의 중간단계인 것으로 보인다.

• 미생물학회지
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• 제52권2호
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• pp.183-191
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• 2016

유기산을 생산하는 발효미생물을 획득하기 위해 갯벌, 심해, 염전 등의 퇴적토와 해초시료 등의 시료에 대해 methanogen 배지, acetogen 배지, Clostridium용 배지 등을 이용하여 농후 배양을 실시하였다. 총 8개 시료로부터 65주의 혐기성 미생물을 분리하였으며 이 중 신규성이 높거나 활용성이 높다고 알려진 11종에 대해 계통분석, 성장 양식(growth pattern), 유기산 생산 평가 등을 시도하였다. 분석이 수행된 균주 중 Bacteroidia 강에 속하는 1주 외에는 모두 Clostridia 강에 속하였으며 성장속도는 $1.2h^{-1}$ 이상이었다. 분석이 수행된 7종 중 6종은 아세트산을 생성하였으며, 부가적으로 2균주는 부틸산을, 4균주는 개미산을 생산하였다. 또한 MCWD5 균주는 제공된 포도당의 약 40%를 세포외 고분자물질로 전환시키는 것으로 나타났다. 본 연구를 통하여 국내 연안해역에서 분리된 신규 혐기성 미생물들은 유기산, 고분자 다당류를 생산하는 등 높은 응용성을 지님을 확인할 수 있었다.

• KSBB Journal
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• 제26권2호
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• pp.100-106
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• 2011

Strain BCNU 5011 was isolated from forest soil samples collected in the Taebaek mountain in the Gangwon province, Korea. The biochemical, physiological and 16S rRNA sequence analysis strongly indicated that this isolate was most closely related to Paenibacillus polymyxa. A maximum production level of antimicrobial substances of Paenibacillus sp. BCNU 5011 was achieved under aerobic incubation at $30^{\circ}C$ for 3 days in SST broth.Paenibacillus sp. BCNU 5011 showed a broad spectrum of activity against Gram positive and Gram negative bacteria, including methicllinresistant Staphylococcus aureus (MRSA). Paenibacillus sp. BCNU 5011 was also shown to inhibit the growth of different potential human pathogenic bacteria and fungi in vitro. Peptide extract showed better antimicrobial activity than solvent extracts. But active antimicrobial compounds might be included in both peptide extract and solvent extracts. Further separation, purification and identification of active principles leads project to develop antimicrobial agents and anti-MRSA agents.

• KSBB Journal
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• 제18권4호
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• pp.294-300
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• 2003

본 연구에서는 L. fermentum KLB12을 열 전처리 함으로서 제제화 과정 동안 거치게 되는 열 스트레스에 대한 내성이 증진됨을 확인하고, 최적의 열 전처리 조건을 수행하였다. 또한 열 전처리 뿐만 아니라, 저온과 열 전처리 조건에도 열 스트레스에 대한 간섭 효과를 확인하였다. 그리고 내성 증진에 신규 단백질 합성이 필요함을 확인하였으며 나아가, 2-D electrophoresis를 통하여 7개의 신규 단백질을 확인하였다. 따라서 이 균주를 제제화하기 위한 방법으로 열 전처리를 이용할 경우 생균력 유지에 큰 효과를 얻을 수 있다고 사료된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제9권5호
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• pp.631-636
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• 1999

The thermostable endo-chitosanase gene from the isolated strain Bacillus sp. KFB-C108 was identified on the basis of a phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequence, and was cloned into plasmid pUCl8 using E. coli $DH5\alpha$ as the host strain. Positive clones carrying recombinant plasmids (pKCHO I and pKCHO II) containing chitosanase activity were selected using the direct activity staining method. Detailed physical maps showed the two plasmid inserts were identical except that the KCHO II insert (2.6 kb) was 1.8 kb smaller than that of the KCHO I. The recombinant plasmids were analyzed to determine the essential region for chitosanase activity, and a 1.3-kb fragment (KCHO-6) was subcloned into pTrc99A using the EcoRI and BamHI sites to construct pTrc99A/KCHO-6(pTrEB13). The resulting plasmid exerted high chitosanase activity upon transformation of E. coli $DH5{\alpha}cells$, overproducing about 20 times more in the cloned cells than in the wild-type cells. The cloned chitosanase protein exhibited the same molecular weight and catalytic activity similar to those of Bacillus sp. KFB-C108. The cloned enzyme was an endo-type that produced a chitosan tetramer as the major reaction product; however, it produced no monomers or dimers.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제25권8호
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• pp.1349-1360
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• 2015

The rhizospheric zone abutting plant roots usually clutches a wealth of microbes. In the recent past, enormous genetic resources have been excavated with potential applications in host plant interaction and ancillary aspects. Two Pseudomonas strains were isolated and identified through 16S rRNA and rpoD sequence analyses as P. fluorescens QAU67 and P. putida QAU90. Initial biochemical characterization and their root-colonizing traits indicated their potential role in plant growth promotion. Such aerobic systems, involved in gluconic acid production and phosphate solubilization, essentially require the pyrroloquinoline quinine (PQQ)-dependent glucose dehydrogenase (GDH) in the genome. The PCR screening and amplification of GDH and PQQ and subsequent induction of mutagenesis characterized their possible role as antioxidants as well as in growth promotion, as probed in vitro in lettuce and in vivo in rice, bean, and tomato plants. The results showed significant differences (p ≤ 0.05) in parameters of plant height, fresh weight, and dry weight, etc., deciphering a clear and in fact complementary role of GDH and PQQ in plant growth promotion. Our study not only provides direct evidence of the in vivo role of GDH and PQQ in host plants but also reveals their functional inadequacy in the event of mutation at either of these loci.

• 한국토양비료학회지
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• 제47권4호
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• pp.290-298
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• 2014

A bacterial strain with the potential ability to solubilize heavy metals was isolated from heavy metal contaminated soils collected from abandoned mines of Boryeong area in South Korea. The bacterial strain with the highest degree of metal resistance was shown to have close proximity with Shewanella xiamenensis FJ589031, according to 16S rRNA sequence analysis, and selected for investigating the mobilization of metals in soil or plant by the strain. The strain was found to be capable of solubilizing metals both in the absence and in the presence of metals (Co, Pb and Cd). Metal mobilization potential of the strain was assessed in a batch experiment and the results showed that inoculation could increase the concentrations of water soluble Co, Pb and Cd by 48, 34 and 20% respectively, compared with those of non-inoculated soils. Bacterial-assisted growth promotion and metal uptake in sunflower (Helianthus annuus) was evaluated in a pot experiment. In comparison with non-inoculated seedlings, the inoculation led to increase the growth of H. annuus by 24, 18 and 16% respectively in Co, Pb and Cd contaminated soils. Moreover, enhanced accumulation of Co, Pb and Cd in the shoot and root systems was observed in inoculated plants, where metal translocation from root to the above-ground tissues was also found to be enhanced by the strain. Plant growth promotion and metal mobilizing potential of the strain suggest that the strain could effectively be employed in enhancing phytoextraction of Co, Pb and Cd from contaminated soils.

• Journal of Microbiology
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• 제35권3호
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• pp.165-171
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• 1997

A sulfer-oxidizing bacterium was isolated from mine wastewater and characterized. The isolate was gra-negative, rod (0.2 * 1.2-1.5.mu.m), nonmotiloe, catalase positive, and oxidase prositive. The opotimal pH and temperature for growth were 7.0 and 30.deg.C. respectively. The optimum thiosulfate concentration was 70 mM and the maximum growth rate was 0.081 hr. The major ubiquinone contained in the isolate was Q-8. The cellular fatty acid composition was $C_{16 : 0}$, $C_{18 : 1}$, $C_{17cyc}$,and $C_{19cyc}$ as nonpolar fatty acids, and 3-OH C10 : 0 and 3-OH $C_{12 : 0}$ as hydroxylated fatty acids. The isolate was a facultative chemolithoautotroph which can grow autotrophically on sodium thiosulfate and sodium sulfide and which can grow heterotrophically on yeast extract. It can also grow mixotrophically on sodium thiosulfate and yeast extract. Comparison of the 16S rRNA gene sequence of the isolate with that of Thiobacillus species and Paracoccus thiocyanatus revealed that it is closely related to T. caldus which belongs to the .betha.-subclass of the class Proteobacteria. However, the isolated could not grow at extremely low pH (pH 1-3.5). On the basis of the phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic data, the isolate was tentatively named Thiobacillus sp. strain C.ain C.

• 생태와환경
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• 제47권spc호
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• pp.39-47
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• 2014

바이칼호에 서식하는 2종의 스폰지 체내 및 주변 물로부터 92개의 저온성 균주를 분리하고 각 균주들의 기질 분해능을 조사하였다. 그 결과 섬유소와 지방에 대한 분해 활성도를 갖는 균주는 38.0, 34.8%로 비교적 적었으나 전분과 단백질 분해 활성도를 갖는 균주는 78.3, 57.6%로 높은 비율로 나타났다. 분리한 세균을 염기서열의 유사도에 따라 분류하기 위하여 Genomic Fingerprinting을 실시한 후 31개 균주를 선별하여 동정한 결과, Baikalospongia sp.에서 분리한 13균주는 모두 Pseudomonas속으로 확인된 반면, Lubomirskia sp.에서 분리한 14균주는 Pseudomonas ssp., Buttiauxella agrestis, Pseudomonas fluorescens, Yersinia ruckeri, Bacillus ssp., Paenibacillus ssp., Bacillus thuringiensis, Bacillus simplex, Brevibacterium ssp., Acinetobacter lwoffii로 다양하게 동정되었다. 그러나 총 31개 균주 중 18개가 Pseudomonas속으로 동정된 것은 타감작용에 의한 다른 세균 성장의 방해 때문으로 평가되며, 이러한 일반적인 배양 방법의 한계점을 극복하기 위해서는 스폰지의 서식처와 세균의 검출 방법에 대하여 보다 다양한 심층적인 연구가 이루어져야 할 것으로 생각된다.

• 미생물학회지
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• 제53권4호
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• pp.309-315
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• 2017

호산성미생물은 pH가 낮은 환경에서 살아가는 미생물로서 산화, 환원 반응을 통하여, 금속을 포함한 물질들의 순환에 영향을 미친다. 본 연구에서는, 국내의 폐광산 및 제주 곶자왈 지역의 산성토양으로부터 배양을 통해 50여 종 이상의 미생물을 분리하였으며, 분자계통학적 분석을 통하여 최종, Gammaproteobacteria 강에 속하는 미생물 6종, Actinobacteria 강에 속하는 미생물 5종, Betaproteobacteria 강에 속하는 미생물 4종, Alphaproteobacteria 강에 속하는 미생물 2종, Bacilli 강에 속하는 미생물 2종을 얻을 수 있었다. 이들은 공통적으로 낮은 pH의 조건에서 살아가는 미생물임을 확인 할 수 있었다. 본 연구를 통하여 확보한 산성토양내의 미생물들의 생리적 특징은 앞으로의 다양한 국내 미생물 자원의 활용에 기초적인 지식을 제공할 것으로 기대된다.