납자루 Acheilognathus lanceolatus의 유전 변이와 집단 구조를 알아보기 한국의 5개 집단(한강과 금강, 동진강, 섬진강, 낙동강)과 일본의 1개 집단(Katsura River)을 대상으로 AFLP 분석을 수행하였다. 5개의 선택적 프라이머 조합에 의 해 검출된 집단별 유효 밴드의 수는 345~374개였으며, 다형성 밴드 수는 55 (15.0%)~131 (24.9%)개였다. 평균 유전적 다양성은 낙동강 집단이 가장 높은 값을 보였고 한강 집단이 가장 낮은 값을 보였다. 계통도 상에서 각 수계별로 채집된 개체는 각 집단별로 함께 분기하으며, 이들은 높은 bootstrap 값으로 지지되는 2개의 단계통군 또는 집단 그룹으로 나누어졌다. 한편 유전적 분화도($F_{ST}$)는 모든 집단 간에 유의적 차이를 보였다(P<0.01). 집단 그룹 간의 유전적 변이 수준을 알아보기 위해 AMOVA 분석을 실시한 결과 총 25.49%의 변이(P<0.01)을 보여 이들 집단 그룹은 유전적으로 명확히 구분되었다.
본 논문의 목적은 사회보장분야에서 어떠한 이슈가 중요시 되고 있으며, 어떠한 이슈에 빅 데이터 분석기술이 적용가능한지를 전문가 AHP방법을 통해 살펴보는데 있다. 이를 위해 사회보장분야에서 중요시 되고 있는 이슈분석 수행하였으며, 이를 토대로 8개 주요 과제를 도출하였다. 평가기준의 쌍대비교 결과, 정책적 타당성이 사업의 효과성과 실현가능성 보다 중요한 의미를 갖는 지표로 도출되었다. 그리고 세부과제 우순순위 절대평가 결과를 살펴보면, 사회보장분야 부적정 급여 방지와 사각지대 조기 발굴은 빅 데이터 분석을 통해 복지행정의 합리성 증진과 대국민 권리구제를 강화한다는 측면에서 매우 의미 있는 과제로 도출되었다. 본 연구는 사회보장분야에서 빅 데이터 활용 가능여부를 분석하였다는 점에서 의의가 있으며, 향후 빅 데이터 관련 세부과제의 체계적인 추진을 위한 기반연구로 기능할 수 있을 것이다.
Jeon, Hyeong-Kyu;Park, Hansol;Lee, Dongmin;Choe, Seongjun;Kim, Kyu-Heon;Sohn, Woon-Mok;Eom, Keeseon S.
Parasites, Hosts and Diseases
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제54권2호
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pp.181-185
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2016
Human sparganosis is a zoonotic disease caused by infection with larval forms (procercoid/plerocercoid) of Spirometra spp. The purpose of this study was to identify Spirometra spp. of infected snakes using a multiplex PCR assay and phylogenetic analysis of mitochondrial DNA sequence data from the spargana of terrestrial snakes obtained from Korea and China. A total of 283 snakes were obtained that included 4 species of Colubridae comprising Rhabdophis tigrinus tigrinus (n=150), Dinodon rufozonatum rufozonatum (n=64), Elaphe davidi (n=2), and Elaphe schrenkii (n=7), and 1 species of Viperidae, Agkistrodon saxatilis (n=60). The snakes were collected from the provinces of Chungbuk, Chungnam, and Gyeongbuk in Korea (n=161), and from China (n=122). The overall infection rate with spargana was 83% (235/283). The highest was recorded for D. rufozonatum rufozonatum (100%), followed by A. saxatilis (85%) and R. tigrinus tigrinus (80%), with a negative result for E. davidi (0%) and E. schrenkii (0%). The sequence identities between the spargana from snakes (n=50) and Spirometra erinaceieuropaei (KJ599680) or S. decipiens (KJ599679) control specimens were 90.8% and 99.2%, respectively. Pairwise genetic distances between spargana (n=50) and S. decipiens ranged from 0.0080 to 0.0107, while those between spargana and S. erinaceieuropaei ranged from 0.1070 to 0.1096. In this study, all of the 904 spargana analyzed were identified as S. decipiens either by a multiplex PCR assay (n=854) or mitochondrial cox1 sequence analysis (n=50).
본 연구는 PL(Private Level)상품 업체 선정을 위한 평가모델을 다룬다. 제안하는 평가모델은 AHP(Analytic Hierarchy Process)를 기반으로 다수의 평가항목에 대한 가중치를 도출한다. 평가항목은 국내 대형마트에서 활용하는 실 업체 선정기준으로, 특히 매출 비중이 높은 식품품목을 대상으로 한다. 식품품목에 대한 54개의 평가항목을 4단계로 계층화 하며, 이를 기반으로 해당 업계 전문가들을 대상으로 한 설문을 수행한다. 설문을 통해 형성한 쌍대비교를 활용하여 평가항목 별 가중치를 추정하며, 이를 실 산업에서 활용 가능한 정량적 대안으로서 제안한다. 마지막으로, 제안하는 평가모델과 기존의 단순합산방식을 비교하는 평가모델 검증을 포함한다. 연구를 통해 PL상품 업체 선정에 중요도가 높은 요소로 HACCP 검증 및 유효성 평가 (0.279281), 운송(원료 입고 및 제품 출하) (0.117706), 법규 준수 중점 관리 (0.066392)를 선별하였다. 제안하는 평가모델은 기존방식으로 우위를 판단하기 힘든 대안들에 대하여 평가 항목의 중요도를 반영함에 따라 업체 선정이 용이한 결과를 제시함을 검증하였다.
본 연구는 우리나라의 주요양식 품종인 북방전복을 대상으로 지금까지 전복류에서는 사용되지 않았던 mtDNA의 protein coding 영역 ND2, ND5, ND4, ND4L, ND6, ND1의 6개영역과 protein noncoding 영역인 12SrRNA(ribosomal RNA) 을 포함해 총 7개 영역을 이용하여 각 영역의 유전적 변이성 및 개체간 유전적 유연관계 등을 분석하여 각 영역별 특성을 파악하고 이러한 특성을 고려하여 유전학적 분석에 적합한 분자유전마커를 개발하였다. 유전적 변이성은 ND4 영역 (Haplotype diversity = 1.000, Nucleotide diversity = 0.010823) 이 가장 높게 나타났으며, 개체간의 유전적 차이는 ND2 및 ND1 영역이 각각 90% 및 87%로 유의적으로 명확히 구분할 수 있었다. 따라서 유전적 변이성이 가장 높은 ND4 영역과 영역내의 클러스터 간의 유전적 차이가 명확한 ND2 및 ND1 영역을 복합적으로 활용할 경우 북방 전복의 집단유전학 및 계통분류학 분석에 유용한 분자유전마커로 사용할 수 있을 것이라 생각된다.
생물의 종 구분에 이용하는 지표 중 체색은 특징이 뚜렷한 형태 지표로서, 어류의 종 동정에 유용한 형태형질이다. 개볼락은 한국 중부와 남부, 일본 홋카이도 남쪽 등지에 분포하는 상업적으로 중요한 어종으로, 피부에 반점의 유무 및 마킹이 있는 위치에 따라 4개의 아종으로 구분하는 복잡한 체색 특성을 갖는다. 그러나 개볼락의 다양한 체색 패턴과 관련된 유전자 탐색 및 유전자 변이 발굴 등 체색 형성에 관여하는 유전자 규명에 관한 연구는 없다. 이에 따라 본 연구에서는 개볼락의 체색 패턴 관련 유전자 발굴 및 유전자 발현 특성을 규명하기 위한 기초 연구로 체색 타입별 피부 전사체를 프로파일링하였다. 개볼락을 Wild type (반점과 marking 없음)과 Color type (반점과 마킹 모두 있음)으로 구분하였고, 피부 전사체를 RNA-seq 방법을 이용하여 분석하였다. 개볼락 피부 전사체의 발현량을 비교하여 체색 타입별 차등발현유전자 164개를 확보하였다. 이들 차등발현유전자의 기능을 Gene ontology(GO) 분석으로 확인한 결과, 2개는 molecular function, 46개는 biological process, 6개는 cellular component 기능그룹에 속하였다. 차등발현유전자 중 CTL (Galactose-specific lectin nattectin), CUL1 (Cullin-1), CMAS (N-acylneuraminate cytidylyltransferase), NMRK2 (Nicotinamide riboside kinase 2), ALOXE3 (Hydroperoxide isomerase ALOXE3), SLC4A7 (Sodium bicarbonate cotransporter 3) 등은 특정 체색 타입 특이적인 발현양상을 나타냈다. 이번 연구는 개볼락의 체색 패턴 형성에 관여하는 전사체를 탐색한 첫 번째 연구로, 체색 형성 관련 기능유전자 발굴을 위한 후보유전자로 개볼락의 체색 타입별 차등발현유전자를 확보한 것에 의의가 있다. 향후에는 이들 후보유전자의 발현양상 및 기능을 분석하여 개볼락의 복잡한 체색 패턴과 관련된 기능유전자의 특성을 밝히고자 한다.
Objective: Mongolia is one of a few countries that supports over 25 million goats, but genetic diversity, demographic history, and the origin of goat populations in Mongolia have not been well studied. This study was conducted to assess the genetic diversity, phylogenetic status and population structure of Mongolian native goats, as well as to discuss their origin together with other foreign breeds from different countries using hypervariable region 1 (HV1) in mtDNA. Methods: In this study, we examined the genetic diversity and phylogenetic status of Mongolian native goat populations using a 452 base-pair long fragment of HVI of mitochondrial DNA from 174 individuals representing 12 populations. In addition, 329 previously published reference sequences from different regions were included in our phylogenetic analyses. Results: Investigated native Mongolian goats displayed relatively high genetic diversities. After sequencing, we found a total of 109 polymorphic sites that defined 137 haplotypes among investigated populations. Of these, haplotype and nucleotide diversities of Mongolian goats were calculated as 0.997±0.001 and 0.0283±0.002, respectively. These haplotypes clearly clustered into four haplogroups (A, B, C, and D), with the predominance of haplogroup A (90.8%). Estimates of pairwise differences (Fst) and the analysis of molecular variance values among goat populations in Mongolia showed low genetic differentiation and weak geographical structure. In addition, Kazakh, Chinese (from Huanghuai and Leizhou), and Arabian (Turkish and Baladi breeds) goats had smaller genetic differentiation compared to Mongolian goats. Conclusion: In summary, we report novel information regarding genetic diversity, population structure, and origin of Mongolian goats. The findings obtained from this study reveal that abundant haplogroups (A to D) occur in goat populations in Mongolia, with high levels of haplotype and nucleotide diversity.
본 연구는 AHP 적용상의 문제점을 살펴보고 올바른 적용방법을 위한 'AHP 수정가중치모형'을 개발하는 연구이다. 여기서 AHP는 복잡한 의사결정 문제를 계층화 하여 상위수준요인과 하위수준요인들로 분해하고, 그 요인들에 대한 쌍대비교를 통해서 요인들에 대한 상대적인 가중치를 도출하는 방법이다. 하지만 AHP 계층구조에서 각 상위수준요인(대항목)을 구성하는 하위수준요인(소항목)들의 개수가 같을 경우에는 최종가중치가 바르게 나타나지만 각 대항목을 구성하는 소항목들의 개수가 다른 경우에는 심각한 오류가 발생한다. 이에 본 연구에서는 이를 개선할 수 있는 'AHP 수정가중치모형'을 개발하였다. 구체적으로 AHP 분석의 오류가 소항목의 개수, 즉 규모가 다를 때 발생하는 것에 착안하여 소항목 개수의 규모를 상대적으로 같게 만들어서 그 오류를 제거하였다. 그리고 개발된 모형을 다양한 AHP 계층구조에 적용하여 검증하였다. 구체적으로 첫 번째 모형검증에서는 4개의 대항목과 각각 개수가 다른 소항목으로 구성되어 있으며 대항목과 소항목의 중요도가 같다고 가정하였고, 두 번째 모형검증에서는 2개의 대항목과 각각 개수가 다른 소항목으로 구성되어 있으며 모든 대항목과 소항목의 중요도가 다르다고 가정하였다. 그리고 세 번째 모형검증에서는 실제 선행연구에 적용하였다. 그 결과 본 연구에서 개발된 'AHP 수정가중치모형'이 AHP 분석의 문제점을 효과적으로 해결할 수 있었다.
본 논문은 지금까지 미해결 문제로 알려진 정점 색칠 문제에 대한 Erd$\ddot{o}$s-Faber-Lov$\acute{a}$sz 추측을 증명하였다. Erd$\ddot{o}$s-Faber-Lov$\acute{a}$sz 추측은 "k개의 $K_k$-클릭 합 교차 그래프는 k개의 색으로 칠할 수 있다". 즉, x(G)=k이다". Erd$\ddot{o}$s-Faber-Lov$\acute{a}$sz 추측을 증명하기 위해 본 논문은 교차되는 정점수와 한 정점에서 교차되는 클릭수를 구하여 모두 짝수이면 그래프의 최소 차수 ${\delta}(G)$ 정점을 최대독립집합 (minimum Independent set, MIS)에 포함시키는 방법을 적용하고, 둘 중 어느 하나가 홀수이면 최대 차수 ${\Delta}(G)$ 정점을 MIS에 포함시키는 방법을 적용하였다. 알고리즘 수행결과 얻은 MIS 개수가 x(G)=k이다. $3{\leq}k{\leq}8$인 $K_k$-클릭 합 교차 그래프에 대해 실험한 결과 모든 그래프에서 x(G)=k를 얻는데 성공하였다. 결국, "k개의 $K_k$-클릭 합 교차 그래프는 k개의 색으로 칠할 수 있다".는 Erd$\ddot{o}$s-Faber-Lov$\acute{a}$sz 추측은 성립함을 증명하였다.
본 연구에서는 건강 음료로써 식초 음료 시장의 확대에 기여하고자 전문가들을 대상으로 설문하여 델파이와 AHP를 적용하여 식초 음료의 주된 요소들을 유형화, 계층화하였다. 따라서 문헌 연구와 전문가들의 브레인 스토밍을 통해 상위 개념인 원료, 생산방법, 제품특징, 기능성, 패키지 디자인의 5가지에 대해 개방형 설문으로 1차 델파이를 실시하였는데, 그 결과 하위 개념 50개를 도출하였고, 상위 개념으로 마케팅 1개를 추가하였다. 이렇게 1차 델파이에서 도출된 50개의 개념을 폐쇄형 설문으로 2차, 3차 델파이를 실시하였고, 의견의 일치성을 객관적으로 파악하고자 켄달의 W 검증을 실시한 결과, 2차 델파이에서는 11개 항목이 제거되었고, 3차 델파이에서는 16개 항목이 제거되어 총 23개 문항을 도출하였다. 마지막으로 델파이를 통해 도출된 23개 문항의 상대적 중요도를 파악하고자 쌍대 비교를 실시하여 각 항목 간 우선순위를 도출하여 식초 음료의 품질 평가 시, 중요하게 고려해야할 항목을 구성하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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