본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces Pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UVI-180을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. UVI-180유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선(ultraviolet-light)조사 1시간 후에 최대의 발현 증가를 나타내었다. 반면 알킬화제인 MMS(methyl methanesulfonate)처리에 의해서는 전혀 발현이 증가되지 않았다. 이 결과 UVI-180유전자는 DNA상해에 따라 각기 다른 발현양상을 나타냄을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 null-mutant세포 주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 이 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.
본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UV150과 UV200을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. 분리한 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선 조사 1시간 후부터 발현이 증가되었다. 또한 알킬화제인 Methyl Methanesulfonate (MMS) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible유전자와는 다르게 분리한 UV150유전자는 UV에 UV200유전자는 MMS에 의하여 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 유전자의 기능을 알기 위하여 URA4 유전자를 이용하여 null-mutant 세포주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 분리한 UV150 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.
Both Cobitis lutheri Rendahl and C.striata Ikeda previously regarded as the subspecies of C.taenia are revised here and raised to the species rank based on the distinct color pattern on their body sides in relation to the shpae of lamina circularis and suborbital spine, and distinct distributional patter. C. lutheri was similar to C. striata in chromosome number and karyotype, but chromosomal polymorphism as Robert sonian event was confirmed only in the population of C.lutheri studies. Both, C. kutheri and C..striata have disjunct ranges : the former in western Korea and east-northern China Mainland, the latter in the Smjin River of korea and west-southern Japan. hybridization between C. lutheri and C. striata by secondary contact appeared in the limited zone of the Dongjin River, Chllabuk-do province, korea, but the evidence for habitat segregation between them suggests the possibility that natural hybridization occurs between the two species and introgression results. We consider that the two species were produced as ecological equivalent species in the different branch stream of the Paleo-Hwangho River , The time of recession of sea level during the gracial period.
Chun, Jong Un;Park, Jeong-Seon;Bae, Chang-Hyu;Shin, Jeong-Sheop
한국육종학회지
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제41권2호
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pp.73-83
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2009
To investigate genes related to vernalization and cold- resistance in barley (Hordeum vulgare L. cv. Nagaoka), differentially expressed genes were identified from cold-resistant barley leaves with suppression subtractive hybridization (SSH) and Northern blot analyses. The nucleotide and the deduced amino acid sequences of the putative gene products were compared. The bvrn-7 showed high homology(84%) with gene related to vernalization, and the bvrn-3, bvrn-12, bvrn-28, bvrn-29 and bvrn-36 related to cold-resistant genes had high identity of 88~98% with low temperature-induced genes. The results indicate that the 6 genes were closely related to vernalization and cold-resistance during low temperature treatment.
분열효모 S. pombe의 포자형성은 배지상의 질소원의 고갈에 의하여 유도되어진다. 감수분열로부터 포자형성에 도달하는 과정에는 다수의 특이적인 유전자가 기능을 하고 있다. 본 연구에서는, 전포자막 구축에 필수적인 유전자 spo 5의 발현조절과 유전자의 메커니즘에 관하여 조사하였다. spo 5 유전자를 보유하는 약 5kb의 Hind III DNA 단편을 cloning 하였다. 이 단편으로부터 제한효소지도를 작성하여 얻어진 DNA 단편을 probe로 하여, RNA blot-hybridization를 이행하였다. 이 결과, 최소배지의 hetro matting-type 균주 (CD16-1)로 부터 조제한 mRNA가 검출되었다. 그리고 이 전사산물을 전사레밸에서 해석하기 위하여, homo matting-type (CD16-3) 균주를 질소원이 함유되지 않은 포자형성배지에서 배양한 후, 동일한 방법으로 mRNA를 조제하여 Northern hybridization으로 조사하였다. 그 결과, 이들 세포에서는 3.2kb에서만 전사산물이 검출되었으며, 2.5kb의 mRNA는 검출되지 않았다. 이상의 결과로 부터 spo 5 유전자를 coding하는 전사산물인 2.5kb의 mRNA는 질소원의 고갈된 상태하에서, 접합형 유전자좌의 hetro 접합성을 요구하는 것으로 입증하였다. spo 5 유전자의 전사발현은 질소원이 결핍과 접합형 유전자좌의 구성에 따른 환경요인과 유전적 요인에 의해서 제어되어지고 있다는 것을 입증하였다.
In this study we evaluated the frequency of fusion between TMPRSS2 and ETS family members (ERG, ETV1, ETV4) in prostate cancers in patients from northern China in order to explore differences in fusion rates among regions in northern and southern China, other parts of Asia, Europe, and North America. We examined 100 prostate cancer patients, diagnosed by means of prostate biopsy; fluorescence in situ hybridization (FISH) was used to detect the expression of TMPRSS2, ERG, ETV1 and ETV4 in cancer tissue. Differences in gene fusion rates among different ethnics groups were also analyzed. Of the 100 prostate cancer patients, 55 (55%) had the fusion gene. Among the patients with the fusion gene, 46 (83.6%) patients had the TMPRSS2:ERG fusion product, 8 (14.8%) patients had TMPRSS2:ETV1 fusion, 1 (1.6%) patient had TMPRSS2:ETV4.
항암제에 대한 내성은 내인성 또는 획득한 내성 모두가 암의 치료에 장애가 된다. P-당단백질을 encode하고있는 mdr1 유전자의 발현이 항암제에 대해 내성을 가지고 있는 암세포에서 많이 관찰되고 있으며, 최근에는 시험관적으로 항암제에 대한 내성이 유도된 암세포주들에서 mdr1 유전자가 발현되지 않는 암세포들이 보고되고 있다. 다제내성에 관계하는 또 하나의 유전자인 MRP 발현정도를 L1210세포와 내성인 L1210변이주들에서 조사하였으며, c-myc과 c-fos 유전자의 발현변화를 관찰하였다. RT-PCR을 시행하여 L1210, L1210AdR, L1210VcR에서 MRP 유전자발현을 확인하였으며, Northern hybridization한 결과 L1210세포에 비하여 L1210AdR은 유전자 발현이 40% 정도 감소하였으며, L12l0Cis는 90% 정도의 유전자 발현감소가 관찰되었다. c-myc과 c-fos유전자의 Northern hybridization한 결과 L1210에 비하여 L1210AdR은 발현감소가 나타났으나, L1210VcR과 L1210Cis의 경우는 오히려 발현증가가 관찰되었다.
Protein kinase C an enzyme of signal transduction has been known to regulate cell proliferation activation as well as apoptosis in some cancer cell lines. To explore the role of PKC in the course of cell mediated autoimmune disease such as experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) EAE was induced in Lewis rats(6-8 weeks old) with immunization of myelin basic protein supplemented with complete Freund's adjuvants and affected spinal cords were sampled at days 13 postimmunization(PI) as peak stage of EAE and at days 21 PI as recovery stage. The spinal cords with EAE were subjected to Northern blot analysis and insitu hybridization of PKC delta which is one of prominant isotypes of PKC in the haematopoietic cells. Northern blot analysis showed that levels of PKS delta mRNA in the spinal cords of rats withEAE was significantly increased at days 13 PI in which inflammatory cells including T cells and macrophages in the EAE lesions appeared. however the stage. By in situ hybridization signals of PKC delta in EAE lesions was intensely expressed on the delta is also expressed on some brain cells in normal rat central nervous system This finding suggests that PKC plays an important role on either activation of inflammatory cells including encephalitogenic T cells and macrophages or apoptotic elimination of some inflammatory cells depending on the stge of EAE.
Substance P는 교정력이 가해진 치아의 치주인대 중 인장력을 받는 부위에 많이 분포하는 neuropeptide중의 하나이며, 또한 여러 조직에서 neurogenic inflammation을 야기하는 neuropeptide중의 하나로도 알려져 있다. 그러나 중요한 세포외 단백기질인 교원질의 생성에 대한 Substance P의 효과는 잘 알려져 있지 않다. 따라서 이 연구의 목적은 배양치주인대 세포에서 교원질 생성에 대한 Substance P의 효과를 평가하는 것이었다. collagenase-digestion method로 교원질 생성을 평가하였고 mRNA 수준에서 작용효과를 평가하기 위하여 Northern blot hybridization을 시행하였다. 이 연구는 또한 교원질 생성에 대한 prostaglandin과 gelatinase 생성도 포함하였으며 변성된 교원질의 분해를 평가하기 위하여 zymography를 이용하였다. 비교원성 단백질, 교원성 단백질, 상대교원질에 대한 dose-dependent effect를 보면 Substance P는 비교원성 단백질 합성을 증가시켰으나 교원성 단백질 합성은 감소시킨다. 그리하여 총 단백합성에 대한 상대적인 교원질 생성을 나타내는 상대교원질은 $7\%$에서 $3.6\%$로 감소시켰다. 세포를 indomethacin과 동시에 처리할 때 substance P의 교원질 합성 억제효과는 나타나지 않았다. 이것은 Substance P의 교원질 합성 억제효과가 prostaglandin의 생성 때문이라는 것을 의미한다. Substance P의 교원질 합성 억제효과가 procollagen mRNA의 정상(steady-state)수준에 부합하는가를 평가하기 위하여 northern blot hybridization을 시행한 결과 Substance P는 ${\alpha}1(1)$ procollagen mRNA의 양적 변동을 일으키지 않았다. Substance P의 교원질 생성 억제효과는 전사이후의 어떤 단계에서 이루어지는 현상임을 나타낸다. 치주인대세포에서 gelatinase 생성에 대한 Substance P의 효과를 알아보기 위하여 zymography를 이용하였다. zymogram 을 보면 Substance P는 치주인대세포에서 gelatinase 생성에는 아무 효과도 나타내지 않음들 알 수 있다. Substance P의 교원질 생성 억제효과가 치주인대세포에 대해 선택적인가 아닌가를알아보기 위하여 MC3T3-E1세포를 이용하였는데 Substance P는 MC3T3-E1세포의 교원질 합성에는 영향을 미치지 않았다. 이상에서 Substance P는 인간의 치주인대세포에서 교원질 합성을 억제하였다. 이 효과는 procollagen mRNA와 gelatinase 생성의 정상(steady-state) 수준의 변화 때문이 아니라 prostaglandin 생성과 연관이 있음을 알았다.
To develope the genetic source of oak wild silkworm, Antheraea yamamai, the cDNA library was constructed with poly A+ mRNA isolated from posterial silk gland of fifth instar larvae. Titer of the cDNA library was about 5.1$\times$105 pfu in total. We presumed that the titer covered almost all transcripts existed in Antherea yamamai. From cDNA library of Antheraea yamamai, fibroin heavy chain gene, which is specifically expressed from posterial silk gland of Antheraea yamamai, was screened using oligonuclotide probe specific to alanine rich motif of fibrin heavy chain gene of Antheraea pernyi. As a result, fibroin clones isolated from 5$\times$104 plaques showed the highest homolgy (95%) with that of Antherea pernyi in nucleotide of Anthereaea yamamai and Bombyx mori shows that there is no homologous sequence in the 3+ partial 채야후 region Genomic southern hybridization suggested that one copy is present. Northern hybridization showed that fibroin transcript was approximateely 9 kb in length.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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