In molecular biology, it is necessary to develop an easy and rapid method to identify a specific DNA sequence. Though Southern and Northern blot techniques have been used widely for the analysis of gene structure and function, those methods are inconvenient in the points that we need to control incubation temperature, time, and other parameters to get the final result. In this study, we report a new method for the rapid analysis of specific DNA sequence with the modification of an immunochromatographic method. The lateral flow DNA analysis strip is composed of a sample pad, a nitrocellulose membrane for the separation and propagation of analytes, and an absorption pad for the generation of capillary action. Capture DNA was immobilized on the membrane by UV cross-linking and target DNA was labeled with Cy-5 for signaling. The samples containing target DNA were applied onto the sample pad, incubated for 15 min for separation, and scanned with a GSI fluorescence scanner. Though the hybridization reaction occurs in a short time without any washing steps, there appears to be little cross hybridization between the different sequences. The result showed a possibility that the new method can be used for the rapid identification of specific DNA sequence among the samples.
Shim, Won-Bo;Dzantiev, Boris B.;Eremin, Sergei A.;Chung, Duck-Hwa
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.19
no.1
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pp.83-92
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2009
Individual immunochromatographic assays (ICG) for ochratoxin A (OTA) and zearalenone (ZEA) were optimized and used in the development of a one-step simultaneous immunochromatographic assay (OS-ICG) for the rapid multianalysis of two mycotoxins in corn samples. The nitrocellulose membrane of the OS-ICG was treated with OTA-bovine serum albumin (BSA), ZEA-ovalbumin (OVA), and anti-mouse IgG in the OTA test, ZEA test, and control zones, respectively. Monoclonal antibody-gold conjugates (OTA3 MAb-gold and ZEA2C5 MAb-gold) were sprayed onto the conjugate pad. The visual detection limits were 2.5 and 5 ng/ml for OTA and ZEA, respectively, and the results were obtained within 15 min after starting the analysis. An efficient, simple, and rapid extraction method using 30% MeOH/PBS was established and validated by analyzing the corn samples spiked with OTA/ZEA mixtures (0/0, 5/10, 10/20, and $20/30\;{\mu}g/kg$). The cut-off values of the OS-ICG for the spiked corn were 5 and $10\;{\mu}g/kg$ for OTA and ZEA, respectively. Natural corn samples were analyzed by OS-ICG, direct competitive enzyme-linked immunosorbent assay (DC-ELISA), and HPLC. Results of the OS-ICG were in good agreement with those obtained by DC-ELISA and HPLC. The developed OS-ICG offers a rapid, easy-to-use, and portable analytical system and can be used as a convenient qualitative tool for the on-site simultaneous determination of OTA and ZEA in cereals, food, and agricultural products in one analytical cycle.
Proceedings of the Korea Society of Environmental Toocicology Conference
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2003.10a
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pp.174-174
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2003
There are many synthetic chemicals, such as di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) and dibutyl phthalate (DBP), used in chemical reaction processes in industry. The establishment of toxicity and detection of synthetic chemicals that may pose a genetic hazard in our enviornment is subjects of great concern at present DEHP, a ubiquitous phthalate plasticizer, induces a wide range of developmental and reproductive toxicities in mammals. DEHP belongs to the large diverse class of peroxisome proliferator compounds, which include herbicides, hypolipidemic drugs. DBP is a plasticizer used to products containing nitrocellulose, polyvinyl acetate, and polyvinyl chloride such as food wraps and blood bags. DBP is also used in cosmetics as a solvent and fixative for perfumes, a suspension agent for solids, an antifoamer, a skin emollient, and hair spray The present study was performed to examine patterns of gene expression in MCF-7 cells following DEHP and DBP exposure. Changes in gene expression were determined by microarray analysis using KISTCHIP-400 including 401 endocrine related genes based on public database and research papers. Of the genes analysis, we determined that genes detected by array showed a 2-fold or greater change in their expression level(increase or decrease). The results of this study demonstrate that a number of genes were differentially expressed in MCF-7 cells but these changes were not significant. Therefore, we keep going this study using microarray analysis and future studies will examine changes of gene expression on time-course and does treatment in variable cell lines.
Cronobacter sakazakii (C. sakazakii) is a foodborne pathogen, posing a high risk of disease to infants and immunocompromised individuals. In order to develop a quick, easy, and sensitive assay for detecting C. sakazakii, a rabbit anti-C. sakazakii immunoglobulin G (IgG) was developed using sonicated cell protein from C. sakazakii. The developed anti-C. sakazakii (IgG) was of good quality and purity, as well as species-specific. The developed rabbit anti-C. sakazakii IgG was attached to the surface of a sulforhodamine B-encapsulated liposome to form an immunoliposome. A test strip was then prepared by coating goat anti-rabbit IgG onto the control line and rabbit anti-C. sakazakii IgG onto the test line, respectively, of a plastic-backed nitrocellulose membrane. A purple color signal both on the test line and the control line indicated the presence of C. sakazakii in the sample, whereas purple color only on the control line indicated the absence of C. sakazakii in the sample. This immunochromatographic strip assay could produce results in 15 min with a limit of detection of $10^7CFU/ml$ in C. sakazakii culture. The immunochromatographic strip assay also showed very good specificity without cross-reactivity with other tested Cronobacter species. Based on these results, the developed immunochromatographic strip assay is efficient for the detection of C. sakazakii and has high potential for on-site detection.
Journal of Korean Society of Industrial and Systems Engineering
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v.36
no.3
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pp.142-149
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2013
Among ammunitions which are stored in a war field, the lifespan of propelling gunpowder is affected by storage environment such as storage temperature, humidity, and exposure to sunlight. These are because Nitrocellulose (NC) which is the main component of propelling gunpowder can be naturally disassembled to unstable substances similar with other nitric acid ester. We can't prevent it fundamentally from being disassembled, but to restrain induction of automatic disassembly by decomposition product, a decomposition product ($NO_2$, $NO_3$, and $HNO_3$) and tranquillizer DPA (Diphenylamine), having high reactivity, are added into a propellant. For this, it will decrease the velocity of tranquillizer which can also affect the velocity of producing the decomposition product of NC, storage temperature or humidity of propelling gunpowder is higher, drop of tranquillizer content is much faster. Therefore, to extend storage lifespan of propelling gunpowder, it is really important to control storage temperature or humidity inside the magazine. Hereupon, according to the manufacture of small scale model magazine and the result of performing experiments and measuring variation of inside temperature (storage temperature), using roof types that have a steel slate structure of magazine among ground magazines, this research shows the differences in details.
Kim, Mi-Soon;Lee, Young-Min;Kim, Seong-Keun;Seo, Ji-Hyun;Ji, Kyung-Hee;Oh, Ji-Yoon;Ko, Ki-Dong;Ko, Gwang-Pyo
Journal of Environmental Health Sciences
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v.35
no.3
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pp.162-168
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2009
The aim of this study is to investigate microbial sanitary condition of public baths in Seoul, Korea. A total of 28 water samples were collected from 14 different public baths and sudatoriums. The prevalence of fecal indicator microorganisms such as total coliform, fecal coliform, and Escherichia coli was characterized. In addition, bacteria in water was membrane filtered by 0.45um nitrocellulose membrane, and the filter was analyzed by both cultivation and PCR amplification of partial 16S rRNA gene. The levels of chlorine were measured for each of water samples. More than 40% of 14 collected water samples, the concentrations of total coliform bacteria exceeded the water quality for bath water guideline. There was no significant correlation between chlorine residue and the presence of total coliform. Various microorganisms including pathogenic microorganisms were identified from cultivation and subsequent analysis of 16s rRNA gene sequences. Our results suggest that appropriate hygiene practice and continuous monitoring is needed for reducing health risk associated with public bathhouses.
1. CM-Sephadex C-50-120 column을 사용하여 HLF를 효과적으로 정제하였다. CM-Sepha-dex 50-120 column chromatography를 수행한 결과, HLF는 NaCl 350 mM-500 mM 사이에서 용출되었으며, 용출된 분획을 SDS-PAGE를 수행해서 단일 band를 확인하였다. Anti-HLF antibody를 이용한 Western blotting 결과 nitrocellulose paper 상에 단일 band 가 나타나므로 HLF 가 효과적으로 정제되었다는 것을 알 수 있었다. 2. Con A, PWM, PWA LPS 등의 자극원으로 단핵구와 대식세포를 자극한 다음 BLF를처리한 배 양액을 IL-1 bioassy한 결과는 Con A 33%, PMA 33%, PWM 15%, LPS 35% 이고, HLF로 처리하여 IL-1 bioassay를 한 결과는 Con A 15%, PMA 22%, PWM 10%, LPS 5%로 감소된 것으로 나타났다. 3. K-562 세포를 이용한 colony forming assay에서 BLF가 10 g/ml일 때는 30%, 30 g/ml일 때는 35%, HLF는 10 g/ml일 때는 5%,30 g/ml일 때는 30%의 저해를 나타냈다. 4. Lactoferrin의 면역증강효과를 알아보기 위하여 hapten인 VCR-BSA를 투여 한 후, 생성되는 항체생성능력을 ELISA로 비교하였다. 그 결과 HLF 및 BLF 투여군에서 대조군에 비하여 adjuvant 효과를 관찰할 수 있었다. 또한 이때 macrophage 수는 대조군에 비하여 HLF와 BLF를 투여한 군이 증가됨을 알 수 있었다. 이러한 결과로 미루어 볼 때 LF는 macrophage를 활성화 시켜서 항체 생성 능력을 증가시키는 효과가 있음을 관찰할 수 있었다. 5. Balb/c mouse의 thymus로부터 분리한 CD4- CD8- 세포를 BLF로 처리하여 24 시간 배양한 후 CB4$^-$ CD8$^-$ 세포의 분화를 측정한 결과, CD4$^-$를 CD4$^+$ 로 분화하였다. 그리고 HLF로 처리하여 24 시간 배양 후 CD4$^-$ CD8$^-$ 세포의 분화를 측정한 결과, CD4$^-$ CD8$^-$를 CD4$^+$ CD8$^+$ 로 분화하였다. 6. Lactoferrin이 T cell의 IL-2 production에 미치는 영향은 PMA 처리군, PMA+OKT3처리군, LF 단독 처리군 보다 PMA+OKT3+LF를 처리한 군이 IL-2 생성에 영향을 미쳤다. 7. Lfcin B의 단일크론항체에 의해 인식되어지는 Lfcin B의 항원결정기는 ‘QWR’로 밝혀졌다.
Park, Hee-Myung;Yoo, Jong-Hyun;Almeida, Raul A.;Oliver, Stephen P.
Journal of Veterinary Clinics
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v.24
no.3
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pp.305-307
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2007
Lactoferrin-binding proteins (LBP) has not been well characterized in Streptococcus uberis isolated from milk of bovine mastitis and to date this protein is considered to be an important virulence factor in Streptococcal mastitis. To determine the more efficient extraction method of LBP from four S. uberis strains, we used two different extraction methods (mutanolysin and sodium dodecyl sulfate) in this study. Bacterial proteins extracted were electrophoresed by 10% polyacrylamide gels in the presence of sodium deodecyl sulfate and gels were transferred onto nitrocellulose membrane. Rabbit anti-bovine lactoferrin antibody and HRP-conjugated donkey anti-rabbit IgG antibody were used to detect LBP. This Western blotting analysis demonstrates that extraction method with SDS extracted 110 kDa and 112 kDa LBPs more efficiently compared to the mutanolysin extraction method.
Rapid serodiagnostic methods for Toxoplasma gondii infection in cats are urgently needed for effective control of transmission routes toward human infections. In this work, 4 recombinant T. gondii antigens (SAG1, SAG2, GRA3, and GRA6) were produced and tested for the development of rapid diagnostic test (RDT). The proteins were expressed in Escherichia coli, affinity-purified, and applied onto the nitrocellulose membrane of the test strip. The recombinant SAG1 (rSAG1) showed the strongest antigenic activity and highest specificity among them. We also performed clinical evaluation of the rSAG1-loaded RDT in 182 cat sera (55 household and 127 stray cats). The kit showed 0.88 of kappa value comparing with a commercialized ELISA kit, which indicated a significant correlation between rSAG1-loaded RDT and the ELISA kit. The overall sensitivity and specificity of the RDT were 100% (23/23) and 99.4% (158/159), respectively. The rSAG1-loaded RDT is rapid, easy to use, and highly accurate. Thus, it would be a suitable diagnostic tool for rapid detection of antibodies in T. gondii-infected cats under field conditions.
In this paper, conservation treatment processes for the wooden furniture in the Presidential Archives are introduced. Conservation treatment strategies for modern wooden cultural heritage have been increasingly studied. The current study uses materials similar to those used by the existing conservation treatment method. Material analysis showed that the chair(Lee136-2) and desk(Yun37) in the Presidential Archives are made of Dipterocarpaceae, and both are coated with two layers of varnishing. FT-IR analysis showed that the varnish has a similar spectrum to that of a nitrocellulose-based lacquer(Lee136-2) and top coat(Yun37) and confirmed that a synthetic material was used. Pollutants had adhered to the surface of the wooden furniture and it was also in structurally unstable condition because of cracks and damage to the varnish and wood. Therefore, a conservation treatment was carried out to restore the damaged areas to their original appearance using similar kinds of materials, based on data obtained by materials analysis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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