• 한국패류학회지
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• 제26권4호
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• pp.285-290
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• 2010

본 연구는 우리나라 무안, 태안, 여수, 제주 지역 및 중국 영성, 대련 지역의 낙지 개체군의 종 및 집단분석을 위해 미토콘드리아 CO1유전자의 염기서열을 조사하였다. 유전자 분석은 총 60 개체로부터 6개의 haplotype이 조사되었다. 제주 개체군인 경우 모든 개체 (N = 10) 가 다른 집단에서는 관찰되지 않은 A haplotype으로 구성되어 있어 다른 지역과 뚜렷한 차이를 나타내었다. 이들 haplotype은 MEGA 4 분석에 의해 두 개의 clade로 나뉘어지는데 하나는 무안, 태안, 여수, 중국 대련집단이었고 다른 하나는 제주, 중국 영성집단으로 나뉘는 구조를 하고 있었다. 집단 간 유연관계 분석에서도 같은 현상이 관찰되었다. Group A에 속하는 무안, 태안, 여수, 대련 집단의 낙지 개체군은 group B (제주, 영성) 에 속하는 집단 개체군 보다 유전적 거리가 아주 가까웠다. 본 연구에서 사용한 CO1 universal primer는 종 판별 유전자 마커로서 낙지류에서도 유용하게 활용될 수 있었으나 partial CO1 유전자 내의 변이가 많지 않기 때문에 집단분석에는 한계가 있으나, 지역적 거리 및 장벽 그리고 서식지 차이 등에서 오는 제한적 gene flow에 대한 논의는 가능할 것으로 판단된다.

• 대한약리학회지
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• 제23권2호
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• pp.113-121
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• 1987

국소마취제가 mitochondria에서의 전자이동 및 superoxide라디칼의 생성 그리고 지질의 과산화에 따른 malondialdehyde생성에 미치는 영향을 관찰하였다. 국소마취제는 전자이동계 의 효소활성도에 영향을 나타내었다. NADH dehydrogenase, NADH oxidase와 NADH-ubiquinone oxidoreductase의 활성도는 lidocaine, procaine과 dibucaine에 의하여 효과적으로 억제되었고 cocaine에 의하여 약간 억제되었다. Succinate dehydrogenase, succinate cytochrome c oxidoreductase와 succinate-ubiquinone oxidoreductase 활성도는 lidocaine 과 dibucaine에 의하여 억제되었으나 succinate oxidase는 국소마취제에 의하여 활성화되었다. 국소마취제는 dihydroubiquinone-cytochrome c oxidoreducatse와 cytochrome c oxidase의 활성도를 억제하였다. 이와 같은 반응에서 국소마취제에 대한 complex I segment의 반응이 다른 complex segment보다 크게 나타났다. 국소마취제는 succinate 또는 NADH에 의한 superoxide 생성과 이에 대한 antimycin의 자극효과를 억제하였다. 또한 국소마취제는 산소라디칼에 의한 지질의 과산화를 억제하였다. 이상의 결과로부터 국소마취제는 mitochondria의 전자전달 과정 중 Complex I segment때 또는 인접한 부위에 작용하여 전자이동을 억제함으로써 superoxide 생성과 지질의 과산화를 억제할 것으로 시사되었다.

• 한국동물학회지
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• 제31권1호
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• pp.62-70
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• 1988

미토콘드리아가 포함하고있는 결정한유물의 미새구조와 면역황금표식법에 의한 분석을 위하여 우심근 세포의 미토콘드리아에서 전자전달체에 관여하는 효소를 분리하였다. 우심근 미토콘드리아에서 분리된 효소는 실험토끼에 주사하여 (복합체I,NADH-conezyme Q reductase; 복합체 III,Ubiquinol-cytochrome-c-oxldoreductase; 복합체 IV, Cytochrome-c-oxidase)들에 대한 면역항체를 얻었다. 이들 면역항체들은 우심근과 정상인의 골격근 미토콘드리아와 미토콘드리아에 결정함유물을 포함하는 mitochondrical myopathy환자의 골격근 미토콘드리아에 반응시켜 황금입자를 표식하고 전자현미경을 이용하여 이들 면역항체반응을 관찰하였다. 미토콘드리아가 포함하는 결정함유물의 미세구조에는 paracrystalline inclusions body와 multilamellar strudure inclusion body그리고 구형결정함유물(globular crystalline inclusions body) 및 윤형구조 (whirl shaped structure)의 크리스테 중심에 있는 구형결정함유물 등의 4종류로관찰되었다. 복합체 I,복합체 Iv의 효소에 대한 항체를 우심근과 정상인 골격근 그리고 mitochondrical myopathy환자의 골격근에 동일한 면역반응을 시켰을때 미토콘드리아 크리스테에 부착하는 황금입자의 표식 정도는 각각의 근조직에서 유사한 반응이 관찰되었다. 복합체 III의 효소에 대한 항체는 우심근과 정상인의 골격근에서는 유사한 반응이 나타났으나 mitochondrical myopathy환자의 골격근에서는 극히 소수의 황금입자가 관찰되었다. 구형결정함유물은 복합체 I,III,IV의 3종류의 효소에 대한 면역반응 결과 황금입자표식은 관찰되지 않았다. 따라서 mitochondrical myopathy환자의 미토콘드리아에는 복합에 III의 효소가 결핍되었으며 구형결정함유물은 전자전달체 효소들인 복합체 I,III,Iv 효소단백질과는 상관없는 물질로 생각된다.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제7권2호
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• pp.181-189
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• 2003

We describe here the complete nucleotide sequence and the exon-intron structure of the luciferase gene of the firefly, Pyrocoelia rufa. The luciferase gene of the P. rufa firefly consisted of six introns and seven exons coding for 548 amino acid residues. From the translational start site to the end of last exon, however, the genomic DNA length of the P. rufa luciferase gene from the Korean and Chinese samples spans 1,968 bp and 1983 bp, respectively, and 3 amino acid residues were different to each other. Additionally, we also analyzed mitochondrial cytochrome oxidase I(COI) gene of the Chinese P. rufa fireflies. Analysis of DNA sequences from the mitochondrial COI protein-coding gene revealed 4 mitochondrial DNA sequence-based haplotypes with a maximum divergence of 0.7％. With the 20 P. rufa haplotypes found in Korea, phylogenetic analyses using PAUP and PHYLIP subdivided the P. rufa into three clades, termed clades A and B for the Korean sample, and clade C for the Chinese sample.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권3호
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• pp.301-307
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• 2005

Genetic variants of Hanwoo mtDNA in the region of cytochrome oxidase subunit I, II and III complex were detected using restriction enzymes. PCR primers were designed based on the bovine mtDNA sequence, and 6 primer sets (Mt4, Mt5, Mt6, Mt7, Mt8 and Mt9) were used. A total of 20 restriction enzymes were used, and 6 restriction enzymes, which were Hinf I, Pvu II, Rsa I, Eco RI, Bgl II, and Msp I, showed genetic polymorphisms. Significant associations between genetic variants and weight traits were observed at WT15 (p<0.05) and WT18 (p<0.01) with Pvu II for Mt9, Bgl II for Mt6 and Rsa I for Mt8 segments in the region of cytochrome oxidase subunit complex. Significant associations were also observed at Mt9-Pvu II and Mt6-Bgl II segments for WT9 (p=0.01), WT12 (p=0.02), respectively. These results suggest that genetic variants of mtDNA in the region of cytochrome oxidase subunit complex may be candidate segments for improvement of animal growth as weight traits.

• 생태와환경
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• 제53권3호
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• pp.265-274
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• 2020

보구치는 난류성으로 전 세계적으로 널리 분포하며 해양 저층에 주로 서식하는 어종이다. 광양만에 서식하는 보구치의 미토콘드리아 DNA에서 cytochrome c oxidase subunit I (COI) 유전자를 발굴하고 해양 어류종에서의 계통유전학적인 위치를 분석하였다. 발굴된 미토콘드리아 DNA 내 605 bp COI 시컨스의 다중배열 결과 광양만 보구치들에서는 높은 염기서열 상동성을 확인하였다 (98~100%). 하지만 광양만 내해와 외해의 어획지점에 따라 염기서열 변이가 다르게 나타나는 것을 확인하였다. 외해지점의 보구치들에서 COI 내 염기서열 변이가 높게 나타났다(43.2~70.3%). 나아가 13종 어류의 COI 계통유전학적 분석결과 광양만 보구치는 타이완에서 보고된 보구치와 하나의 계통군 (clade)으로 묶이고 진화적 거리는 0.036으로 나타났다. 또한 민어(M. miiuy)와 대두이석태(Pennahia Macrocephalus)에 속한 어종과 진화적 거리가 가까운 것으로 나타났다(0.041~0.048). 본 연구의 결과는 국내산 보구치의 분자 계통유전학적 정보를 제공함으로 연안환경에 따른 어류자원 모니터링 및 종다양성 관리에 주요한 유전적 자료로 활용될 것이다.

• 한국어류학회지
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• 제21권4호
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• pp.287-290
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• 2009

줄종개(Cobitis tetralineata)와 왕종개(Iksookimia longicorpa)간 자연잡종으로 추정되는 개체를 유전적으로 동정하기 위하여 핵 recombination activating gene 1 (RAG1)과 미토콘드리아 cytochrome c oxidase I (COI) 유전자들의 염기서열을 분석하였다. RAG1 염기서열을 분석한 결과 850 bp 중에서 두 친어종들 간에 총 23개의 치환이 관찰되었고, 자연잡종 개체의 electropherogram에서는 이들 치환이 관찰된 모든 위치들에서 double peak들이 관찰되어, 멘델의 유전법칙을 따랐다. 그리고 모계를 통해 자손에게 유전되는 특징을 가지는 미토콘드리아 유전자들 중에서 COI 염기서열을 비교한 결과 잡종 개체는 줄종개와 염기서열이 100% 일치하여 그 모계는 줄종개임이 명확히 밝혀졌다.

• Molecules and Cells
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• 제22권3호
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• pp.323-327
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• 2006

DNA barcoding, an inventory of DNA sequences from a standardized genomic region, provides a bio-barcode for identifying and discovering species. Several recent studies suggest that the sequence diversity in a 648 bp region of the mitochondrial gene for cytochrome c oxidase I (COI) might serve as a DNA barcode for identifying animal species such as North American birds, insects and fishes. The present study tested the effectiveness of a COI barcode in discriminating Korean bird species. We determined the 5' terminus of the COI barcode for 92 species of Korean birds and found that species identification was unambiguous; the genetic differences between closely related species were, on average, 25 times higher than the differences within species. We identified only one misidentified species out of 239 specimens in a genetic resource bank, so confirming the accuracy of species identification in the banking system. We also identified two potential composite species, calling for further investigation using more samples. The finding of large COI sequence differences between species confirms the effectiveness of COI barcodes for identifying Korean bird species. To bring greater reliability to the identification of species, increased intra- and interspecies sampling, as well as supplementation of the mitochondrial barcodes with nuclear ones, is needed.

• 한국응용곤충학회지
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• 제62권2호
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• pp.83-87
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• 2023

애긴노린재는 긴노린재과에 속하며 한국을 포함한 동아시아 국가의 다양한 곡물 및 관상용 식물의 주요 해충으로 여겨진다. 본 연구에서는 애긴노린재의 17,367 bp 미토콘드리아 유전체에서 13개의 protein-coding genes, 22개의 transfer RNA genes, 2개의 ribosomal RNA genes과 non-coding A+T rich region를 확인하였다. G+C content는 23%로 나타났고 다른 긴노린재과와의 염기서열 유사성이 N. cymoides (94.5%), N. fuscovittatus (91.7%)으로 높은 것을 발견하였다. 애긴노린재의 미토콘드리아 유전체 정보는 향후 긴노린재과의 진화 연구와 해충 방제를 위한 정보로 널리 사용될 수 있다.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제34권1호
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• pp.23-26
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• 2018

Because of the potential negative influence on their hosts, ecto-parasites are of prime importance to numerous species. Ticks are among these, distributed worldwide, and potentially transmitting diseases while sucking blood of diverse hosts. The leopard cat (Prionailurus bengalensis euptilura Elliot, 1871) is the only felid left in the Republic of Korea following widespread anthropogenic disturbances that have resulted in the extinction of both Panthera species: the Siberian tiger(Panthera tigris altaica Temminck, 1844) and Amur leopard (P. pardus orientalis(Schlegel, 1857)). This study identifies ticks collected from a roadkill leopard cat retrieved in Seosan area in the Republic of Korea. Two ticks attached to the facial area of the carcass were identified as Japanese hard ticks, Ixodes nipponensis, based on mitochondrial cytochrome oxidase I. The matching sample was from Japan with 99.7% similarities, and the only available sequence on GenBank. This study reconfirms that I. nipponensis parasitizes the endangered leopard cat P. bengalensis euptilura.