Type 2 diabetes mellitus(T2DM) is included in metabolic disorders characterized by hyperglycemia, which causes many complications, and requires long-term treatment resulting in massive medical expenses each year. There have been many studies to solve this problem, but the existing studies have not been accurate by learning and predicting the data at specific time point. Thus, this study proposed a model using RNN to increase the accuracy of prediction of T2DM. This work propose a T2DM prediction model based on Korean Genome and Epidemiology study(Ansan, Anseong Korea). We trained all of the data over time to create prediction model of diabetes. To verify the results of the prediction model, we compared the accuracy with the existing machine learning methods, LR, k-NN, and SVM. Proposed prediction model accuracy was 0.92 and the AUC was 0.92, which were higher than the other. Therefore predicting the onset of T2DM by using the proposed diabetes prediction model in this study, it could lead to healthier lifestyle and hyperglycemic control resulting in lower risk of diabetes by alerted diabetes occurrence.
Lee, Seokhyun;Lee, Ra Ham;Kim, Sung-Jo;Lee, Hak-Kyo;Na, Chong-Sam;Song, Ki-Duk
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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v.32
no.12
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pp.1942-1949
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2019
Objective: Leukocyte cell-derived chemotaxin 2 (LECT2) is associated with several physiological processes including inflammation, tumorigenesis, and natural killer T cell generation. Chicken LECT2 (chLECT2) gene was originally identified as one of the differentially expressed genes in chicken kidney tissue, where the chickens were fed with different calcium doses. In this study, the molecular characteristics and gene expression of chLECT2 were analyzed under the stimulation of toll-like receptor 3 (TLR3) ligand to understand the involvement of chLECT2 expression in chicken metabolic disorders. Methods: Amino acid sequence of LECT2 proteins from various species including fowl, fish, and mammal were retrieved from the Ensembl database and subjected to Insilco analyses. In addition, the time- and dose-dependent expression of chLECT2 was examined in DF-1 cells which were stimulated with polyinosinic:polycytidylic acid (poly [I:C]), a TLR3 ligand. Further, to explore the transcription factors required for the transcription of chLECT2, DF-1 cells were treated with poly (I:C) in the presence or absence of the nuclear factor ${\kappa}B$ ($NF{\kappa}B$) and activated protein 1 (AP-1) inhibitors. Results: The amino acid sequence prediction of chLECT2 protein revealed that along with duck LECT2 (duLECT2), it has unique signal peptide different from other vertebrate orthologs, and only chLECT2 and duLECT2 have an additional 157 and 161 amino acids on their carboxyl terminus, respectively. Phylogenetic analysis suggested that chLECT2 is evolved from a common ancestor along with the actinopterygii hence, more closely related than to the mammals. Our quantitative polymerase chain reaction results showed that, the expression of chLECT2 was up-regulated significantly in DF-1 cells under the stimulation of poly (I:C) (p<0.05). However, in the presence of $NF{\kappa}B$ or AP-1 inhibitors, the expression of chLECT2 is suppressed suggesting that both $NF{\kappa}B$ and AP-1 transcription factors are required for the induction of chLECT2 expression. Conclusion: The present results suggest that chLECT2 gene might be a target gene of TLR3 signaling. For the future, the expression pattern or molecular mechanism of chLECT2 under stimulation of other innate immune receptors shall be studied. The protein function of chLECT2 will be more clearly understood if further investigation about the mechanism of LECT2 in TLR pathways is conducted.
Objectives: To expand and provide information on the efficacy of herbal medicines, anti-obesity effects were evaluated. In many studies, plant-derived components with anti-obesity efficacies have been investigated for their potential inhibitory effects on 3T3-L1 preadipocyte cells. The purpose of this study was to investigate the anti-obesity effects of 65 herbal medicine in 3T3-L1 preadipocyte cells. Methods: Preferentially, 3T3-L1 cells were treated with 65 herbal medicines (500 ㎍/mL) during differentiation for 8 days. Next, 3T3-L1 cells were treated with selected herbal medicines at concentrations ranging from 50 to 200 ㎍/mL during differentiation for 8 days. The accumulation of lipid droplets was determined by Oil Red O staining. The expressions of genes related to adipogenesis were measured by reverse transcription polymerase chain reaction and Western blot analyses. Results: Among the 65 kinds of herbal medicines, 13 herbal medicines that been shown to be effective against the accumulation of lipid droplets were selected. Finally, selected Banhasasim-tang and Samhwangsasim-tang showed inhibitory activity on adipocyte differentiation at 3T3-L1 preadipocytes without affecting cell toxicity. In addition, Banhasasim-tang and Samhwangsasim-tang significantly reduced the expression levels of several adipocyte marker genes including peroxisome proliferator activated receptor-γ and CCAAT/enhancer binding protein-α. Conclusions : These results suggest that the ability of Banhasasim-tang and Samhwangsasimtang has inhibited overall adipogenesis and lipid accumulation in the 3T3-L1 cells. Banhasasim-tang and Samhwangsasim-tang may be a promising medicine for the treatment of obesity and related metabolic disorders.
Kim, Bu-Yeon;Jung, Hye-Bin;Lee, Ji-Yeong;Ferrer, Lenny;Purwanto, Henry Syukur;Lee, Jin-Ho
Microbiology and Biotechnology Letters
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v.48
no.4
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pp.506-514
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2020
4-Hydroxybenzyl alcohol (4-HB alcohol) is one of the major active components of Gastrodia elata Blume, with beneficial effects on neurological disorders such as headache, convulsive behavior, and dizziness. Here, we developed a metabolically engineered Corynebacterium glutamicum strain able to produce 4-HB alcohol from 4-hydroxybenzoate (4-HBA). First, the strain APS963 was obtained from the APS809 strain via the insertion of aroK from Methanocaldococcus jannaschii into the NCgl2922-deleted locus. As carboxylic acid reductase from Nocardia iowensis catalyzes the reduction of 4HBA to 4-hydroxybenzaldehyde (4-HB aldehyde), we then introduced a codon-optimized car gene into the genome of APS963, generating the GAS177 strain. Then, we deleted creG coding for a putative short-chain dehydrogenase and inserted ubiCpr encoding a product-resistant chorismate-pyruvate lyase into the pcaHG-deleted locus. The resulting engineered GAS355 strain accumulated 2.3 g/l 4-HB alcohol with 0.32 g/l 4-HBA and 0.3 g/l 4-HB aldehyde as byproducts from 8% glucose after 48 h of culture.
'Angelica' is one of the most traditionally consumed medicinal herbs around Northeast Asia including Korea for treatments of various diseases or health care purposes like hematopoiesis, blood circulation for women, sedative, analgesic, and a tonic medicine etc. Angelica gigas Nakai, a Korean native species of Angelica, is clearly different from the others in containing a high concentration of active ingredients like pyranocoumarines including decursin, decursinol, and decursinol angelate. These compounds have various kinds of positive effects such as anti-tumor activity including the precaution of neutropenia occurred during anticancer drug administration, improvements of metabolic disorders, menstrual irregularity, impairment of renal function, respiration improvement, cognition-enhancement, anti-inflammatory effect, anti-oxidative effect, enhancing fertility and so forth. Thus it implies incredible potentialities in future development for foods and drugs. However, certain purity-related qualities and/or overdose in food products can cause side effects like toxicities; therefore, their safety profiles should also be considered. This review focuses on the positive and negative effects of three pyranocoumarines in Angelica gigas Nakai and some possibilities and considerations for future food and drug products development.
Objectives : Daesiho-tang (DSHT) has been widely used in the treatment of cerebral infarct in traditional medicine. However, there was not report on the anti-obesity-related diseases efficacy of DSHT. In this study, we investigated the effects for the new formulation of DSHT, on the adipocyte differentiation cycle in 3T3-L1 cells. Methods : 3T3-L1 cells were treated with DSHT (50, 100, $200{\mu}g/m{\ell}$) during differentiation for 6 days. Also, the inhibitory effect of DSHT against 3T3-L1 adipogenesis was evaluated in various stage of adipogenesis such as early (0-2day), intermediate (2-4day), and terminal stage (4-6day). The accumulation of lipid droplets was determined by Oil Red O staining. and, the expressions of genes related to adipogenesis were measured by RT-PCR and Western blot analyses. Results : DSHT showed inhibitory activity on adipocyte differentiation at 3T3-L1 preadipocytes without affect cell toxicity as assessed by measuring fat accumulation and adipogenesis. In addition, DSHT significantly reduced the expression levels of several adipocyte marker genes including proliferator activated $receptor-{\gamma}$ ($PPAR-{\gamma}$) and CCAAT/ enhancer-binding $protein-{\alpha}$ ($C/EBP-{\alpha}$). Also, the anti-adipogenic effect of DSHT was strongly limited in the intermediate (2-4 day), terminal stage (4-6 day) of 3T3-L1 adipogenesis. In addition, the DSHT treatment down- regulated mRNA expression levels of $PPAR-{\gamma}$,, $C/EBP-{\alpha}$ in mature 3T3-L1 adipocytes. Conclusions : These results suggest that, the ability of DSHT has inhibited overall adipogenesis and lipid accumulation in the 3T3-L1 cells. The new formulation of DSHT may be a promising medicine for the treatment of obesity and related metabolic disorders.
Unique cartilage matrix-associated protein (UCMA) is an extrahepatic vitamin K-dependent protein rich in γ-carboxylated (Gla) residues. UCMA has been recognized for its ability to promote osteoblast differentiation and enhance bone formation; however, its impact on osteoblasts under hyperglycemic stress remains unknown. In this paper, we investigated the effect of UCMA on MC3T3-E1 osteoblastic cells under hyperglycemic conditions. After exposure to high glucose, the MC3T3-E1 cells were treated with recombinant UCMA proteins. CellROX and MitoSOX staining showed that the production of reactive oxygen species (ROS), which initially increased under high-glucose conditions in MC3T3-E1 cells, decreased after UCMA treatment. Additionally, quantitative polymerase chain reaction revealed increased expression of antioxidant genes, nuclear factor erythroid 2-related factor 2 and superoxide dismutase 1, in the MC3T3-E1 cells exposed to both high glucose and UCMA. UCMA treatment downregulated the expression of heme oxygenase-1, which reduced its translocation from the cytosol to the nucleus. Moreover, the expression of dynamin-related protein 1, a mitochondrial fission marker, was upregulated, and AKT signaling was inhibited after UCMA treatment. Overall, UCMA appears to mitigate ROS production, increase antioxidant gene expression, impact mitochondrial dynamics, and modulate AKT signaling in osteoblasts exposed to high-glucose conditions. This study advances our understanding of the cellular mechanism of UCMA and suggests its potential use as a novel therapeutic agent for bone complications related to metabolic disorders.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Dyslipidemia causes metabolic disorders such as atherosclerosis and fatty liver syndrome due to abnormally high blood lipids. Purple perilla frutescens extract (PPE) possesses various bioactive compounds such as α-asarone, chlorogenic acid and rosmarinic acid. This study examined whether PPE and α-asarone improved dyslipidemia-associated inflammation and inhibited atheroma formation in apolipoprotein E (apoE)-deficient mice, an experimental animal model of atherosclerosis. MATERIALS/METHODS: ApoE-deficient mice were fed on high cholesterol-diet (Paigen's diet) and orally administrated with 10-20 mg/kg PPE and α-asarone for 10 wk. RESULTS: The Paigen's diet reduced body weight gain in apoE-deficient mice, which was not restored by PPE or α-asarone. PPE or α-asarone improved the plasma lipid profiles in Paigen's diet-fed apoE-deficient mice, and despite a small increase in high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C), low-density lipoprotein (LDL)-cholesterol, and very LDL were significantly reduced. Paigen's diet-induced systemic inflammation was reduced in PPE or α-asarone-treated apoE-deficient mice. Supplying PPE or α-asarone to mice lacking apoE suppressed aorta atherogenesis induced by atherogenic diet. PPE or α-asarone diminished aorta accumulation of CD68- and/or F4/80-positive macrophages induced by atherogenic diet in apoE-deficient mice. Treatment of apoE-deficient mice with PPE and α-asarone resulted in a significant decrease in plasma cholesteryl ester transfer protein level and an increase in lecithin:cholesterol acyltransferase reduced by supply of Paigen's diet. Supplementation of PPE and α-asarone enhanced the transcription of hepatic apoA1 and SR-B1 reduced by Paigen's diet in apoE-deficient mice. CONCLUSIONS: α-Asarone in PPE inhibited inflammation-associated atheroma formation and promoted hepatic HDL-C trafficking in dyslipidemic mice.
Seon Kyeong Park;Jangho Lee;Soo Hyun Park;Yu Geon Lee
Food Science and Preservation
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v.30
no.4
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pp.716-728
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2023
The anti-adipogenic activity of Glycyrrhiza uralensis was investigated by examining the effects of its ethanol extract (GUE) on a mouse model with a high-fat diet (HFD) and 3T3-L1 preadipocytes during adipocyte differentiation. GUE administration for eight weeks significantly reduced weight gain in mice fed an HFD. GUE effectively inhibited 3T3-L1 preadipocyte differentiation and lipid droplet accumulation. This inhibitory effect is associated with the downregulation of key adipogenic regulators, including PPARγ and C/EBPα, and the modulation of adipose metabolism regulators, such as Fasn and Fabp4. LC-Q-TOF-MS analysis identified twelve phenolic and flavonoid compounds, including liquiritigenin and licorice saponin, in the GUE. These findings demonstrate that the anti-obesity effect of the GUE is attributed to the biological activity of its phenolic and flavonoid compounds. Therefore, the GUE has potential anti-obesity activity. Moreover, further studies on the isolation of bioactive components from the GUE and the investigation of the underlying molecular mechanisms of the GUE are required to establish its efficacy in metabolic disorders, including obesity.
Yoon-Joo SONG;Sung Won LEE;Hyun-Seok JIN;Sangwook PARK
Korean Journal of Clinical Laboratory Science
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v.56
no.1
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pp.66-72
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2024
Lipid metabolic disorders are commonly encountered in clinical practice. Dyslipidemia and its prevalence rate are strongly associated with the morbidity and mortality of cardiovascular disease worldwide. We conducted a genetic analysis to determine the association between genetic polymorphisms of the ABO gene in adults middle-aged (40~69 years) with dyslipidemia in the Korean population. A total of 6,750 subjects from the Korea Association REsource (KARE) were selected for this study. Using the genetic and epidemiologic data of 4,403 dyslipidemia cases and 2,347 normal controls from the KARE, single nucleotide polymorphisms (SNPs) in ABO gene were analyzed for their genetic correlation. Eleven SNPs out of the ABO gene demonstrated a statistically significant association with dyslipidemia. Among them, rs8176707 in ABO gene statistically showed the most significant correlation with dyslipidemia (P-value=0.002, odds ratio=0.82, 95% confidence interval=0.78~0.86). The minor allele of T polymorphism within the ABO intron genetic region was associated with a decreased risk of dyslipidemia. This study uncovered a significant association between genetic polymorphism in the ABO gene and dyslipidemia. This finding suggest that ABO SNPs markers have a genetic correlation with the etiology of dyslipidemia.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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