• 제목/요약/키워드: mRNA quality control

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돼지 Duroc 품종에서 미토콘드리아 유전체 서열의 특성과 집단의 유전적 다양성 (Complete Mitochondrial Genome Sequence and Genetic Diversity of Duroc Breed)

  • 조인철;한상현;최유림;고문석;이정규;이준헌;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권6호
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    • pp.937-946
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    • 2004
  • Duroc 품종은 돼지 사육에 있어 산육성과 육질 향상을 위해 이용되고 있다. 본 연구는 육종에 많이 이용되는 Duroc 품종의 모계 특이적인 서열의 검색과 계통유전학적 유연관계의 정립을 위하여 미토콘드리아 유전체의 전체 염기서열을 결정하고 집단 내 다형성을 조사하였다. mtDNA 전체 서열의 길이는 16,584-bp 이고, D-loop과 tRNA, rRNA 유전자 영역에서는 삽입/결실이 확인되었다. 4개의 coding gene (COⅡ, COⅢ, ND3, ND4)에서 불완전한 종결코돈을, ND4L과 ND2 유전자는 선택적 개시코돈 양상을 보였다. Duroc 집단에 대한 분석 결과 조절영역에서의 특이적인 11-bp 중복 단위가 일부 개체(15.2%)에서 발견되었고, ND2의 개시코돈과 CYTB 유전자에서도 다형현상을 보였다. 각각의 유전자 영역에서의 다형성은 서로 연관되어 있었고, 그 결과 Duroc 집단은 크게 두 가지 haplotype으로 구분되었다. 계통수에서 Duroc mtDNA 서열은 유럽계열 cluster에 위치하였으나, haplotype 분석과 기존에 연구결과들을 종합해 보면 Duroc 품종은 여러 모계선조 집단에서 기원한 것으로 보이며, 유럽과 아시아 계열 모두가 품종 형성에 이용된 것으로 사료된다된 것으로 사료된다.

A Comparison of Natural (D-α-tocopherol) and Synthetic (DL-α-tocopherol Acetate) Vitamin E Supplementation on the Growth Performance, Meat Quality and Oxidative Status of Broilers

  • Cheng, K.;Niu, Y.;Zheng, X.C.;Zhang, H.;Chen, Y.P.;Zhang, M.;Huang, X.X.;Zhang, L.L.;Zhou, Y.M.;Wang, T.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권5호
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    • pp.681-688
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    • 2016
  • The present study was conducted to compare the supplementation of natural (D-${\alpha}$-tocopherol) and synthetic (DL-${\alpha}$-tocopherol acetate) vitamin E on the growth performance, meat quality, muscular antioxidant capacity and genes expression related to oxidative status of broilers. A total of 144 1 day-old Arbor Acres broiler chicks were randomly allocated into 3 groups with 6 replicates of 8 birds each. Birds were given a basal diet (control group), and basal diet supplemented with either 20 IU D-${\alpha}$-tocopherol or DL-${\alpha}$-tocopherol acetate for 42 days, respectively. The results indicated that treatments did not alter growth performance of broilers (p>0.05). Compared with the control group, concentration of ${\alpha}$-tocopherol in the breast muscle was increased by the supplementation of vitamin E (p<0.05). In the thigh, ${\alpha}$-tocopherol content was also enhanced by vitamin E inclusion, and this effect was more pronounced in the natural vitamin E group (p<0.05). Vitamin E supplementation increased the redness of breast (p<0.05). In the contrast, the inclusion of synthetic vitamin E decreased lightness of thigh (p<0.05). Dietary vitamin E inclusion reduced drip loss at 24 h of thigh muscle (p<0.05), and this effect was maintained for drip loss at 48 h in the natural vitamin E group (p<0.05). Broilers given diet supplemented with vitamin E showed decreased malondialdehyde (MDA) content in the breast (p<0.05). Additionally, natural rather than synthetic vitamin E reduced MDA accumulation in the thigh (p<0.05). Neither natural nor synthetic vitamin E supplementation altered muscular mRNA abundance of genes related to oxidative stress (p>0.05). It was concluded that vitamin E supplementation, especially the natural vitamin E, can enhance the retention of muscular ${\alpha}$-tocopherol, improve meat quality and muscular antioxidant capacity of broilers.

황기 추출물이 5-Fluorouracil을 투여한 생쥐의 골수억제 및 삶의 질에 미치는 영향 (Effect of Astragalus Membranaceus Extract against Improvement of Myelosuppression and Quality of Life in 5-Fluorouracil Treated Mice)

  • 권창현;유화승;방선휘;이영민;이연월;손창규;조종관
    • 대한한방내과학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.304-320
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    • 2007
  • 목적 : 황기추출물이 생쥐의 5-FU로 유발된 골수억제와 삶의 질 저하의 개선에 미치는 효과를 연구하고자 한다. 방법 : 골수억제에 미치는 영향이 평가를 위해 Complete Blood Count, Histological Analysis of BM, Cell Colony Forming Assay for Hematopoietic Progenitor를 시행하고, 삶의 질에 미치는 영향을 평가하기 위해 Swimming Test, Survival Rate, Nitric Oxide (NO) Assay, $^{51}Cr$ Release Assay in NK Cell, mRNA Expressions of $IL-1{\beta}$, IL-2, IL-4, IL-6, IL-10, $TNF-{\alpha}$, $IFN-{\gamma}$, $TGF-{\beta}$ and GM-CSF in Spleen Cells를 시행하였다. 결과 : 황기추출물을 골수억제를 호전시켜 말초혈액수치를 회복시키고, 골수파괴를 보호하는 효과를 보이며, 대조군에 비해 혈구생성을 촉진시키며, 대조군에 비해 생존율과 수영시간을 증가시키며, 대식세포와 자연살상세포의 활동성을 증가시키며, 종양면역과 관련된 싸이토카인(IL-2, IL-6, $IFN-{\gamma}$)의 발현을 증가시켰다. 결론 : 5-FU로 유발된 골수억제와 삶의 질 저하의 개선에 미치는 황기추출물의 유용성이 기대되며 향후 이에 대한 지속적인 연구가 필요할 것으로 사료된다.

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마늘발효액의 첨가 급여가 산란계의 산란말기 생산성, 계란 품질 및 혈액성상에 미치는 영향 (Effect of Dietary Fermented Garlic Solution on Performance, Egg Quality and Blood Composition in Finishing Period of Laying Hens)

  • 임천익;강창원;천현수;최호성;류경선
    • 한국가금학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.201-207
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    • 2018
  • 본 연구는 산란 후기사료에 마늘발효액을 수준별로 첨가 급여시 산란계의 생산성, 계란품질 및 혈액성상에 미치는 영향을 구명하고자 실시하였다. 79주령 로만브라운 산란계를 4개 처리구 6반복으로 반복 당 18수씩 총 432수를 배치하였고, 각 처리구에 마늘발효액을 0%, 0.05%, 0.10% 및 0.20%로 4주간 급여하였다. 산란 수와 난중은 매일 조사하였고, 계란품질, 난황지방산 및 혈액성상은 사양실험 종료 후 분석하였다. 본 연구결과, 산란율과 사료요구율은 마늘발효액 급여구에서 대조구에 비하여 수치적으로 개선되었지만, 처리구간에 통계적 차이가 없었고, 난각강도와 두께도 마늘발효액 첨가수준에 따른 유의성이 없었다. 계란의 난백 높이와 호우유닛은 마늘발효액 첨가수준에 따라 일관적으로 증가하여 0.20%급여구에서 제일 높게 나타났으며, 대조구에 비하여 통계적으로 차이를 보였다(P<0.05). 난황지방산은 마늘발효액의 0.10%와 0.20% 첨가구에서 포화지방산은 감소되었고, 단일불포화지방산과 전체 불포화지방산은 현저하게 증가하였다(P<0.05). 혈중 알부민, AST 및 ALT은 처리구간에 차이가 없었지만, 중성지방과 콜레스테롤은 0.20% 급여구에서 대조구에 비해 매우 감소하였다(P<0.05). 또한 HDL콜레스테롤은 마늘발효액 0.10%와 0.20% 급여구에서 대조구에 비하여 유의적으로 증가하였고(P<0.05), 세포성 면역능 지표인 IL-2 mRNA와 CD4+CD8+의 비율도 0.10%와 0.20% 급여구에서 다른 처리구에 비하여 통계적으로 높게 나타났다(P<0.01). 본 실험 결과, 산란 말기 사료에 마늘발효액 0.20% 수준의 급여로 대조구에 비하여 계란품질과 건강 및 혈중 면역인자는 개선되었다.

Inhibition of mitoNEET induces Pink1-Parkin-mediated mitophagy

  • Lee, Seunghee;Lee, Sangguk;Lee, Seon-Jin;Chung, Su Wol
    • BMB Reports
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    • 제55권7호
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    • pp.354-359
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    • 2022
  • MitoNEET, a mitochondrial outer membrane protein containing the Asn-Glu-Glu-Thr (NEET) sequence, controls the formation of intermitochondrial junctions and confers autophagy resistance. Moreover, mitoNEET as a mitochondrial substrate undergoes ubiquitination by activated Parkin during the initiation of mitophagy. Therefore, mitoNEET is linked to the regulation of autophagy and mitophagy. Mitophagy is the selective removal of the damaged or unnecessary mitochondria, which is crucial to sustaining mitochondrial quality control. In numerous human diseases, the accumulation of damaged mitochondria by impaired mitophagy has been observed. However, the therapeutic strategy targeting of mitoNEET as a mitophagy-enhancing mediator requires further research. Herein, we confirmed that mitophagy is indeed activated by mitoNEET inhibition. CCCP (carbonyl cyanide m-chlorophenyl hydrazone), which leads to mitochondrial depolarization, induces mitochondrial dysfunction and superoxide production. This, in turn, contributes to the induction of mitophagy; mitoNEET protein levels were initially increased before an increase in LC3-II protein following CCCP treatment. Pharmacological inhibition of mitoNEET using mitoNEET Ligand-1 (NL-1) promoted accumulation of Pink1 and Parkin, which are mitophagy-associated proteins, and activation of mitochondria-lysosome crosstalk, in comparison to CCCP alone. Inhibition of mitoNEET using NL-1, or mitoNEET shRNA transfected into RAW264.7 cells, abrogated CCCP-induced ROS and mitochondrial cell death; additionally, it activated the expression of PGC-1α and SOD2, regulators of oxidative metabolism. In particular, the increase in PGC-1α, which is a major regulator of mitochondrial biogenesis, promotes mitochondrial quality control. These results indicated that mitoNEET is a potential therapeutic target in numerous human diseases to enhance mitophagy and protect cells by maintaining a network of healthy mitochondria.

Insights into the Gut Microbiota of Freshwater Shrimp and Its Associations with the Surrounding Microbiota and Environmental Factors

  • Zhao, Yanting;Duan, Cuilan;Zhang, Xu-xiang;Chen, Huangen;Ren, Hongqiang;Yin, Ying;Ye, Lin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권6호
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    • pp.946-956
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    • 2018
  • The gut microbiota of aquatic animals plays a crucial role in host health through nutrient acquisition and outcompetition of pathogens. In this study, on the basis of the high-throughput sequencing of 16S rRNA gene amplicons, we examined the bacterial communities in the gut of freshwater shrimp (Macrobrachium nipponense) and in their living environments (sediment and pond water) and analyzed the effects of abiotic and biotic factors on the shrimp gut bacterial communities. High bacterial heterogeneity was observed in the freshwater shrimp gut samples, and the result indicated that both the surrounding bacterial community and water quality factors (particularly dissolved oxygen and temperature) could affect the shrimp gut bacterial community. Despite the observed heterogeneity, 57 genera, constituting 38-99% of the total genera in each of the 40 shrimp gut samples, were identified as the main bacterial population in the gut of M. nipponense. In addition, a high diversity and abundance of lactic acid bacteria (26 genera), which could play significant roles in the digestion process in shrimp, were observed in the shrimp gut samples. Overall, this study provides insights into the gut bacterial communities of freshwater shrimp and basic information for shrimp farming regarding the application of probiotics and disease prevention.

식물생장촉진 Bacillus sp. SB19 균주의 케일 처리에 대한 가뭄 스트레스 완화 효과 (Mitigation Effect of Drought Stress by Plant Growth-promoting Bacterium Bacillus sp. SB19 on Kale Seedlings in Greenhouse)

  • 김다연;이상엽;김정준;한지희
    • 한국유기농업학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.833-847
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    • 2016
  • 가뭄은 농작물의 생산성을 저해하는 주요 원인 중 하나이며, 잎을 먹는 쌈채류의 경우 물 부족 스트레스에 더 치명적일 수 있다. 본 연구는 케일 유묘에 대한 식물생육촉진 균주(PGPB)의 가뭄 내성 효과를 알아보기 위해 수행되었다. 쌈채류의 토양 및 근권 토양으로부 터 형태학적으로 구분되는 146개의 콜로니를 분리하고 온실 생물검정을 통해 케일 생육촉진이 우수한 균주 SB19를 최종 선발하였다. SB19 균주는 케일 재배 토양으로부터 분리하였으며 16S rRNA 유전자 염기서열 분석 결과 Bacillus sp.로 확인되었다. Bacillus sp. SB19 균주를 처리한 케일에 7일 간 수분 부족 스트레스를 유도하고 7일째에 가뭄 피해 조사 후 모든 처리구에 1회 관수하였다. 이후 다시 7일 간 수분 부족 스트레스를 주어 14일째에 케일의 내건성 증진 여부를 조사하였다. 가뭄 조건 7일째에 $10^6$$10^7cell\;mL^{-1}$ 농도의 SB19 균주를 처리한 케일에서 무처리와 비교하여 가뭄 스트레스 경감 효과를 보였다. 7일째에 모든 처리구에 관수 후 다시 가뭄 스트레스를 주었을 때에도 $10^6$$10^7cell\;mL^{-1}$ 농도의 SB19 균주 처리구에서 무처리구와 비교하여 가뭄 피해 경감 효과가 있었으며, 7일째와 14일째 모두에서 $10^7cell\;mL^{-1}$ 농도의 SB19 균주 처리구에서 가뭄 피해의 완화 정도가 가장 효과적인 것으로 나타났다. $10^6cell\;mL^{-1}$ SB19 균주 처리구에서는 물 부족으로 인한 잎의 노화가 $10^7cell\;mL^{-1}$ 농도 처리구에 비해 빠르게 발생하였다. 본 연구 결과를 바탕으로 유용 미생물과 식물의 상호작용이 식물의 물 이용률을 증진시키는 중요한 역할을 하고 약한 가뭄 조건에서 쌈채류의 품질을 향상시킬 수 있는 방안이 될 수 있을 것이라고 예측한다. 즉, 미생물학적인 환경 스트레스 극복 방법으로서의 가치를 뒷받침하는 것이라 할 수 있다.

간 각질 세포 및 마우스 비장 세포를 이용한 방풍통성산의 항알러지 효능 연구 (In vitro Anti-allergic Effects of Bangpungtongseong-san in Human Keratinocytes and Primary Mouse Splenocytes)

  • 정수진;이미영;서창섭;신현규
    • 동의생리병리학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.168-173
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    • 2015
  • Bangpungtongseong-san(BPTSS, Fangfengtongsheng-san in Chineses) is a traditional herbal formula comprising 18 medicinal herbs. In the present study, we performed the simultaneous analysis for four compounds of BPTSS and examined anti-allergic effects in human keratinocytes and mouse splenocytes. The column for separation of four compounds was used Luna C18 column and maintained at 40℃. The mobile phase for gradient elution consisted of two solvent systems. The analysis was carried out at a flow rate of 1.0 mL/min with PDA detection at 254 and 280 nm. To evaluate production and expression of Th2 chemokines, ELISA and RT-PCR were conducted in tumor necrosis factor (TNF)-α and interferon (IFN)-γ-stimulated HaCaT cells with or without BPTSS or silymarin, a positive control for skin inflammation. To measure Th2 cytokines, primary mouse splenocytes were treated with BPTSS and performed ELISA for interleukin (IL)-4, 5, 13. Calibration curves were acquired with r2>0.9999. The contents of geniposide, liquiritin, baicalin, and glycyrrhizin in BPTSS were 5.06 ㎎/g, 7.33 ㎎/g, 27.56 ㎎/g, and 7.81 ㎎/g, respectively. BPTSS reduced TARC and RANTES production and mRNA expression in TNF-α and IFN-γ-treated HaCaT cells. BPTSS inhibited IL-4, 5, and 13 production in mouse splenocytes. Our data will be a helpful information to upgrade quality control and anti-allergic effects of BPTSS.

Simultaneous Determination of α-Amanitin and β-Amanitin in Mouse Plasma Using Liquid Chromatography-High Resolution Mass Spectrometry

  • Bang, Young Yoon;Lee, Min Seo;Lim, Chang Ho;Lee, Hye Suk
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제12권3호
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    • pp.112-117
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    • 2021
  • α-Amanitin and β-amanitin are highly toxic bicyclic octapeptides responsible for the poisoning of poisonous mushrooms such as Amanita, Galerina, and Lepiota by inhibiting RNA polymerase II, DNA transcription, and protein synthesis. A sensitive, simple, and selective liquid chromatography-high resolution mass spectrometric method using parallel reaction monitoring mode was developed and validated for the simultaneous determination of α- and β-amanitin in mouse plasma to evaluate the toxicokinetics of α- and β-amanitin in mice. Protein precipitation of 5 μL mouse plasma sample with methanol as sample clean-up procedure and use of negative electrospray ionization resulted in better sensitivity and less matrix effect. The calibration curves for α- and β-amanitin in mouse plasma were linear over the range of 0.5-500 ng/mL. The intra- and inter-day coefficient of variations and accuracies for α- and β-amanitin at four quality control concentrations were 3.1-14.6% and 92.5-115.0%, respectively. The present method was successfully applied to the toxicokinetic study of α- and β-amanitin after an oral administration of α- and β-amanitin at 1.5 mg/kg dose to male ICR mice.

Bacillus subtilis BC-P1 균주를 이용하여 제조한 청국장의 발효 및 품질 특성분석 (Fermentation and Quality Characteristics of Cheonggukjang Fermented with Bacillus subtilis BC-P1)

  • 박성용;방미애;오병준;박정훈;송원섭;최경민;정의수;부희옥;조승식
    • 미생물학회지
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    • 제49권3호
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    • pp.262-269
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    • 2013
  • 본 연구진은 청국장에서 수종의 미생물을 분리하였으며, 이중 소화 효소능이 뛰어난 균주를 선별하였으며, 유전학적 분석결과를 통해 본 균주가 Bacillus 속 균주임을 확인하고 Bacillus subtilis BC-P1이라 명명하였다. Bacillus subtilis BC-P1을 starter로 사용하여 청국장을 제조하였으며, protease, xylanase, chitinase activity, 혈전 분해능, 영양성분 분석 및 아미노산 분석을 통하여 B. subtilis BC-P1를 starter로 활용한 청국장 제품의 개선 가능성을 타진하였다. Bacillus subtilis BC-P1를 starter로 제조한 청국장은 기존 제품에 비해 우수한 소화효소 생성능을 보였으며, 특히 혈전분해효소 생성능이 우수함을 확인하였고, 대조군에 비해 증가된 환원당 및 총 아미노산 함량을 확인 할 수 있었다. 따라서 본 균주를 starter로 하여 청국장을 제조할 경우 기능성분, 생리활성의 증가, 품질 향상을 기대할 수 있을 것으로 판단되며, 향후 대규모 생산시 균주, 제조 조건에 관한 연구가 필요할 것으로 사료된다.