• 한국기록관리학회지
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• 제20권4호
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• pp.205-227
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• 2020

이 논문은 한국기록관리학회지를 오픈액세스 학술지로 전환하는 과정을 기록한 것이다. 이 과정을 이해하기 위하여 상용DB업체와 학회, 공공DB운영기관 사이에서 벌어진 저작권을 중심으로 한 갈등과 업체와 도서관 사이의 학술DB 가격에 대한 갈등문제를 설명하였다. 또한 최근 국내의 문헌정보학 분야와 인문사회분야 학회들의 오픈액세스 선언의 의미를 설명하였다. 한국기록관리학회지를 오픈액세스로 전환하는 과정에서 부딪힌 출판비 문제, 논문 유통의 문제, 학술지 출판과 관련한 제도의 변경 등 학술지 출판사로서 실무적인 사안들을 처리한 방법과 과정을 기록하고 문제점들도 드러내고자 했다. 또한 이 논문은 기록관리학회지의 오픈액세스 전환을 학술논문의 지식커먼즈를 실현하려는 과정으로 설명하였다.

• Molecules and Cells
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• 제44권8호
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• pp.602-612
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• 2021

DNA methylation is an important epigenetic mechanism affecting genome structure, gene regulation, and the silencing of transposable elements. Cell- and tissue-specific methylation patterns are critical for differentiation and development in eukaryotes. Dynamic spatiotemporal methylation data in these cells or tissues is, therefore, of great interest. However, the construction of bisulfite sequencing libraries can be challenging if the starting material is limited or the genome size is small, such as in Arabidopsis. Here, we describe detailed methods for the purification of Arabidopsis embryos at all stages, and the construction of comprehensive bisulfite libraries from small quantities of input. We constructed bisulfite libraries by releasing embryos from intact seeds, using a different approach for each developmental stage, and manually picking single-embryo with microcapillaries. From these libraries, reliable Arabidopsis methylome data were collected allowing, on average, 11-fold coverage of the genome using as few as five globular, heart, and torpedo embryos as raw input material without the need for DNA purification step. On the other hand, purified DNA from as few as eight bending torpedo embryos or a single mature embryo is sufficient for library construction when RNase A is treated before DNA extraction. This method can be broadly applied to cells from different tissues or cells from other model organisms. Methylome construction can be achieved using a minimal amount of input material using our method; thereby, it has the potential to increase our understanding of dynamic spatiotemporal methylation patterns in model organisms.

• 한국비블리아학회지
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• 제34권3호
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• pp.109-134
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• 2023

본 연구의 목적은 과학기술분야 연구기관에서 운영되는 기관 연구데이터 리포지터리 운영 현황을 파악하고 활성화 방안을 제시하는 것에 있다. 이를 위해 문헌 연구와 사례 분석, 국내외 기관 리포지터리 담당자와의 인터뷰를 수행하였으며, 리포지터리 규정 및 정책 수립, 연구데이터 공유 인식 개선, 연구데이터 품질 관리 강화를 골자로 하는 기관 연구데이터 리포지터리 운영 활성화 방안을 제안하였다. 첫째, 리포지터리 규정 및 정책 수립 측면에서는 현재 연구데이터와 관련한 규정인 국가연구개발정보 처리기준의 지위 향상과 리포지터리 근거 규정의 명시가 필요하다고 보았다. 둘째, 연구데이터 공유 인식 개선 측면에서 전반적인 연구데이터 교육과 우수 사례 발굴의 필요성을 제안하였다. 셋째, 연구데이터 품질 관리 강화 측면에서 연구자-담당자-위원회의 상호작용과 표준화 작업, 장기 보존을 위한 준비의 필요성을 제안하였다.

• 토지주택연구
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• 제14권3호
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• pp.107-123
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• 2023

안전하고 쾌적한 교육환경 조성 및 교육 질 향상을 위하여, 2021년 「교육시설 등의 안전 및 유지관리 등에 관한 법률」이 제정되었다. 이에 따라 「교육시설 안전 인증 운영 규정」이 수립되었으며, 유치원, 초·중·고등학교 및 특수학교, 대학 및 기타 교육시설의 특성에 따라 3가지 유형으로 분류되어 평가되어진다. 기타 교육시설에는 도서관, 학생수련원이 포함된다. 하지만, 학생수련원, 도서관은 수련, 독서 등의 특수 활동이 발생하는 시설로 학교와 차이점을 두고 있다. 때문에 학생수련원 도서관 시설만의 특수성이 「교육시설 안전 인증 운영 규정」에 반영될 필요가 있다. 이 연구는 기타시설에 해당되는 학생수련원과 도서관의 특수성을 「교육시설 안전 인증 운영 규정」이 어떻게 반영하고 있는지에 대한 분석이 수행되었다. 선행 인증제도 및 가이드라인과 비교 분석되었으며, 현장 조사방법이 이용되었다. 최종적으로 도서관과 학생수련원에 대하여 각각 9가지의 세부 기준 검토가 필요한 것으로 확인되었다.

• 한국비블리아학회지
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• 제34권4호
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• pp.259-283
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• 2023

본 연구는 이제까지의 전자기록 장기보존 정책이 문서유형 위주의 전자기록에 치중한 점과 다양한 행정정보시스템을 통해 생산되는 문서유형 이외의 전자기록 장기보존에 관한 문제 인식에서 시작되었다. 빅데이터 시대의 도래로 데이터 관리에 관한 관심이 높아지는 시점에서, 데이터세트를 장기적으로 보존하기 위한 고유기준 마련이 필요하다. 전자기록의 보존포맷은 해당 유형 전자기록의 고유기준에 의해 선정되며, 이 고유기준은 전자기록 유형에 따른 필수보존속성을 기준으로 마련된다. 이에 본 연구는 데이터세트 유형의 보존포맷선정 고유기준 마련에 앞서 데이터세트 유형의 전자기록에 관한 필수보존속성을 도출하는데 목적이 있다. 이를 위해 미국 NARA와 국가기록원이 수행한 R&D 연구결과를 비교·분석하였다. 연구의 결과로 데이터베이스형 필수보존속성 9개와 구조화데이터형 필수보존속성 7개를 도출하였다.

• BMB Reports
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• 제42권4호
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• pp.232-237
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• 2009

Sterol regulatory element-binding protein (SREBP)-1c plays a crucial role in the regulation of lipogenic enzymes in the liver. We previously reported that an X-chromosome-linked RNA binding motif (RBMX) regulates the promoter activity of Srebp-1c. However, still unknown was how it regulates the gene expression. To elucidate this mechanism, we screened the cDNA library from mouse liver by yeast two-hybrid assay using RBMX as bait and identified scaffold attachment factor B1 (SAFB1). Immunoprecipitation assay demonstrated binding of SAFB1 to RBMX. Chromatin immunoprecipitation assay showed binding of both SAFB1 and RBMX to the upstream region of Srebp-1c gene. RNA interference of Safb1 reduced the basal and RBMX-induced Srebp-1c promoter activities, resulting in reduced Srebp-1c gene expression. The effect of SAFB1 overexpression on Srebp-1c promoter was found only in the presence of RBMX. These results indicate a major role for SAFB1 in the activation of Srebp-1c through its interaction with RBMX.

• 한국작물학회지
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• 제50권4호
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• pp.286-290
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• 2005

Ascorbate peroxidase (APX) plays a crucial role in the detoxification of hydrogen peroxide. APX activity is maintained significantly higher in the paraquat­treated leaves of the paraquat-tolerant Rehmannia glutinos. This study was conducted to understand structural and regulatory characteristics of APX gene in R. glutinosa. A putative APX cDNA clone (RgAPX1) was isolated from a leaf cDNA library using a partially sequenced expressed sequence tag clone. RgAPX1 is consisted of 1148 bp nucleotides and contains an open reading frame encoding a 250 amino acid-long polypeptide. Deduced RgAPX1 amino acid sequence shares higher sequence similarity to cytosolic APXs. RgAPX1. expression was higher in the leaf than in the flower and root. Southern blot result indicates the presence of one or two RgAPX1-related genes in R. glutinosa genome. RgAPX1 transcription was affected differentially by various stresses and phytohormone. The results indicate that RgAPXl is constitutively expressed in most tissues and its expression is modulated for the immediate and efficient detoxification of $H_2O_2$ under normal and stress conditions.

• 한국가금학회:학술대회논문집
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• 한국가금학회 1999년도 제16차 정기총회및학술발표회
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• pp.34-50
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• 1999

A cDNA encoding chicken interferon-gamma (chIFN-${\gamma}$) was amplified from P34, a CD4$^{+}$ T-cell hybridoma by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and cloned into pUC18. THe sequences of cloned PCR products were determined to confirm the correct cloning. Using this cDNA as probe, chicken genomic library from White Leghorn spleen was screened. Phage clones harboring chicken interferon-gamma (chIFN-${\gamma}$) were isolated and their genomic structure elucidated. The chIFN-${\gamma}$ contains 4 exons and 3 introns spanning over 14 kb, and follows the GT/AG rule for correct splicing at the exon/intron boundaries. The four exons encode 41, 26, 57 and 40 amino acids, respectively, suggesting that the overall structure of IFN-${\gamma}$ is evolutionairly conserved in mammalian and avian species. The 5’-untranslated region and signal sequences are located in exon 1. Several AT-rich sequences located in the fourth exon may indicate a role in mRNA turnover. The 5’-flanking region contains sequences homologous to the potential binding sites for the mammalian transcription factors, activator protein-1(AP-1) activator protein-2(AP-2) cAMP-response element binding protein(CREB), activating transcription factor(ATF), GATA-binding fator(GATA), upstream stimulating factor(USF), This suggests that the mechanisms underlying transcriptional regulation of chicken and mammalian IFN-${\gamma}$ genes may be similar.r.

• Molecules and Cells
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• 제42권2호
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• pp.175-182
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• 2019

microRNAs regulate a diverse spectrum of cancer biology, including tumorigenesis, metastasis, stemness, and drug resistance. To investigate miRNA-mediated regulation of drug resistance, we characterized the resistant cell lines to 5-fluorouracil by inducing stable expression of miRNAs using lenti-miRNA library. Here, we demonstrate miR-551a as a novel factor regulating cell survival after 5-FU treatment. miR-551a-expressing cells (Hep3B-lenti-miR-551a) were resistant to 5-FU-induced cell death, and after 5-FU treatment, and showed significant increases in cell viability, cell survival, and sphere formation. It was further shown that myocyte-specific factor 2C is the direct target of miR-551a. Our results suggest that miR-551a plays a novel function in regulating 5-FU-induced cell death, and targeting miR-551a might be helpful to sensitize cells to anti-cancer drugs.

• International Journal of Computer Science & Network Security
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• 제21권12호
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• pp.35-40
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• 2021

The study aimed to realize one of the basic requirements for designing and building the integrated automated system for scientific research at Northern Border University, which includes the establishment of an automated interconnected system to manage all academic and financial operations of scientific research. From receiving the budget of the funded research courses, then the regular financial regulation of all the research team's rewards, the cost of publishing, translation and equipment, then receiving the research plans and linking them financially, preparing the total and detailed financial value for all stages, then financial disbursement operations, financial closure of research when published, and preparing financial reports The research team used the analytical approach to build the main and subsidiary requirements for designing the financial system, and the study concluded that all the elements required for the stages of financial management for scientific research at Northern Border University can be met based on sufficient by sequencing these processes and how they are sequenced as e It is designed in the research study.