• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제14권8호
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• pp.1051-1056
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• 2001

Data for teat number for Landrace (L), Yorkshire (Y), crossbred of Landrace and Yorkshire (LY), and crossbred of Landrace, Yorkshire and Chinese indigenous Min Pig (LYM) were analyzed using Gibbs sampling. In Bayesian inference, flat priors and some informative priors were used to examine their influence on posterior estimates. The posterior mean estimates of heritabilities with flat priors were $0.661{\pm}0.035$ for L, $0.540{\pm}0.072$ for Y, $0.789{\pm}0.074$ for LY, and $0.577{\pm}0.058$ for LYM, and they did not differ (p>0.05) from their corresponding estimates of REML. When inverse Gamma densities for variance components were used as priors with the shape parameter of 4, the posterior estimates were still corresponding (p>0.05) to REML estimates and mean estimates using Gibbs sampling with flat priors. However, when the inverse Gamma densities with the shape parameter of 10 were utilized, some posterior estimates differed (p<0.10) from REML estimates and/or from other Gibbs mean estimates. The use of moderate degree of belief was influential to the posterior estimates, especially for Y and for LY where data sizes were small. When the data size is small, REML estimates of variance components have unknown distributions. On the other hand, Bayesian approach gives exact posterior densities of variance components. However, when the data size is small and prior knowledge is lacked, researchers should be careful with even moderate priors.

• 한국가축번식학회지
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• 제27권2호
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• pp.163-167
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• 2003

본 연구는 미경산돈의 첫 발정과 종부시 품종에 따른 체중, 연령, 체장, 체고, 흉위, 등지방 두께, estradiol-l7$\beta$, cortisol 그리고 progesterone 농도에 미치는 영향을 조사하여 앞으로 돼지 번식능력 향상을 위한 기초자료를 제공하고자 실시하였다. 본 연구에 공시된 듀록, 랜드레이스, 요크셔 미경산돈은 충남축산위생 연구소 산하 축산시험장에서 2000년부터 2002년까지 생산한 자돈을 선발하고 육성하여 이용하였다 미경산돈의 첫 발정과 종부시 듀록종이 랜드레이스종이나 요크셔종 보다 체중이 더 무거웠고 연령이 많았으며, 흉위도 컸다. 첫 발정과 종부시 체장은 품종간에 차이가 없었고, 체고는 듀록종과 요크셔종이 랜드레이스종에 비하여 높았다. 첫 발정시 등지방 두께는 요크셔종, 듀록종 그리고 랜드레이스종 순으로 얇았으며, 첫 종부시에는 차이가 없었다. 미경산돈의 첫발정시 혈청 estradiol-l7$\beta$의 농도는 랜드레이스종이 45.0 pg/ml로 요크셔종의 27.4pg/ml 이나 듀록종의 21.8 pg/ml 보다 높았으나 첫 종부시에는 18.5-31.9 pg/ml로 품종간에 차이가 없었다. 혈청 cortisol의 농도는 첫 발정과 종부시 듀록종이 랜드레이스종이나 요크셔종에 비하여 높게 나타나 품종간에 차이를 나타내었다. 혈청 progesterone의 농도는 첫 발정과 종부시 품종간에 차이가 없었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제49권5호
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• pp.559-568
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• 2007

최근 들어 유전자 또는 DNA 분절의 반복수 변이 (CNV)에 관한 연구가 다수 수행되었으며, 그 분석 방법 및 기기 또한 다양하게 발달되었다. 본 연구는 Landrace 품종의 KIT 유전자 CNV 탐지를 위하여 다른 분석 방법들에 비하여 정확도가 높은 정량적 OLA 기법(qOLA)을 이용하였다. qOLA와 pyrosequencing assay의 조합하여 분석한 결과를 Landrace 44두에 대한 좌표 분석을 한 결과 I1/I1 또는 I3/i(IBe), I1/I2 또는 I3/IP, I1/I3, I1/IP 또는 I2/i(IBe), I2/I2, I2/IP의 6 genotype으로 분류되었으며, PROC FASTCLUS procedure을 이용한 통계 분석과 좌표 분석을 상호 비교한 결과 genotype의 분류가 100% 일치하였다. 기기간의 차이점을 조사하기 위해 qOLA_3100과 qOLA _3130의 관측치 비교를 실시한 결과 동일한 genotype 분류결과를 얻었다. 또한 정밀성 및 정확도 비교에서 qOLA_3100의 경우 표준편차와 변이계수의 평균이 2.33과 4.10로 qOLA_3130(2.67과 4.81)에 비하여 낮게 나타났다. qOLA 반응전 PCR 산물에 대하여 proteinase K 처리효과를 분석한 결과 pro- teinase K를 처리한 경우 전기영동 분석시 noise peak들이 제거되었으며 각 genotype의 이론적 비율에 보다 정확히 일치하였다.

• 생명과학회지
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• 제22권6호
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• pp.713-722
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• 2012

Landrace와 Berkshire의 longissimus dorsi muscle으로부터 단백질 발현양상의 차이를 보기 위하여 2-DE실험을 통하여 분석한 결과 Landrace 에서 특이적으로 발현 양이 증가한 단백질들은 serum albumin precursor, troponin T (TnT; slow skeletal muscle), myoglobin였다. Berkshire에서 특이적으로 발현 양이 증가한 단백질들은 heat shock 27 kDa protein 1, troponin T (fast skeletal muscle), muscle creatine kinase, phosphoglucomutase 1, triosephosphate isomerase (Tpi 1), adenylate kinase isoenzyme 1 (AK1)였다. Landrace의 longissimus dorsi muscle에서는 slow skeletal muscle과 연관된 단백질들이 발현된 반면에 Berkshire에서는 fast skeletal muscle, 물질대사경로, 에너지 생산과 관련된 단백질들이 발현되었다. Berkshire를 이용하여 성장단계별로 단백질 발현을 분석해 본 결과 growing Berkshire에서 발현이 증가한 단백질은 aldehyde dehydrogenase 1 family, member L1 (ALDHL1)와 muscle creatine kinase이고 finishing Berkshire에서 발현이 증가한 단백질은 heat shock 27 kDa protein 1, TnT (slow skeletal muscle), TnT (fast skeletal muscle), serum albumin precursor, PGM 1, AK 1, Tpi 1였다. 이 결과는 Finishing Berkshire의 등심에서는 growing Berkshire에 비교하여 골격근육, 에너지물질대사, 세포골격 등이 보다 활성화된 것으로 사료된다.

• 농업생명과학연구
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• 제45권1호
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• pp.101-107
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• 2011

본 연구에 이용한 재료는 2001년부터 2008년까지 한국 종돈장에서 농장검정된 Yorkshire종, Landrace종의 암컷 48,101두의 자료를 이용하였다. 일반성분 분석은 품종별, 산차별, 년도별, 계절별 및 농장별로 분석하였고, 각 성장형질별 1산차 산자수 분석은 48,101두의 자료를 이용하여 성장형질 그룹별로 분석하였다. 일반 성분 분석에서 품종의 정육율 (p<0.05)을 제외한 부분에서 고도의 유의성(p<0.01)을 나타내었다. 일당증체량에서는 Landrace종 ($640.48{\pm}0.749g$)이 Yorkshire종 ($624.22{\pm}0.608g$)보다 우수하였으며, 등지방 두께에서는 Yorkshire종 ($13.44{\pm}0.030mm$)이 Landrace종 ($12.50{\pm}0.037mm$)보다 두껍게 나타났다. 각 품종에 대한 성장형질별 1산차 산자수 와 사산두수에서 Yorkshire종은 종료일령 161~165일령그룹을 기점으로 산자수가 감소하는 경향을 보였으며, 일당증체량 620~640 g그룹과 등지방두께 13~14 mm그룹에서 산자수가 가장 많이 나타났다. Landrace종의 경우 일당증체량그룹에서 일당증체량이 증가할수록 산자수와 사산두수가 증가하는 경향을 보였다. 등지방두께그룹에서 11 mm미만 구간에서 산자수가 가장 많았고, 등지방두께가 증가할수록 산자수는 감소하는 경향을 보였다.

• 한국축산식품학회:학술대회논문집
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• 한국축산식품학회 2004년도 정기총회 및 제33차 춘계 학술대회
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• pp.258-261
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• 2004

Sixteen primary free amino acids were determined for each 10 longissimus muscles of Yorkshir, Landrace and Korean native black pig. Eight amino acids at 7 d classified three breeds at ca. 80% confidence. The difference in free amino acids for aged meats could be one of factors responsible for more desirable palatability of Korean native black pig.

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2018년도 추계학술대회
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• pp.250-250
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• 2018

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제24권12호
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• pp.1644-1650
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• 2011

This study was conducted to detect quantitative trait loci (QTL) affecting meat quality in an $F_2$ reference population of Korean native pig and Landrace crossbreds. The three-generation mapping population was generated with 411 progeny from 38 $F_2$ full-sib families, and 133 genetic markers were used to produce a sex-average map of the 17 autosomes. The data set was analyzed using least squares Mendelian and parent-of-origin interval-mapping models. Lack-of-fit tests between models were used to characterize the QTL for mode of gene expressions. A total of 10 (32) QTL were detected at the 5% genome (chromosome)-wise level for the analyzed traits. Of the 42 QTL detected, 13 QTL were classified as Mendelian, 10 as paternal, 14 as maternal, and 5 as partial expressed QTL, respectively. Among the QTL detected at 5% genome-wise level, four QTL had Mendelian mode of inheritance on SSCs 5, 10, 12, and 13 for cooking loss, drip loss, crude lipid and crude protein, respectively; two QTL maternal inheritance for pH at 24-h and shear force on SSC11; three QTL paternal inheritance for CIE b and Hunter b on SSC9 and for cooking loss on SSC15; and one QTL partial expression for crude ash on SSC13, respectively. Most of the Mendelian QTL (9 of 13) had a dominant mode of gene action, suggesting potential utilization of heterosis for genetic improvement of meat quality within the cross population via marker-assisted selection.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제31권6호
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• pp.812-819
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• 2018

Objective: An experiment was conducted to identify and characterize the circular RNA expression and metabolic characteristics in the liver of Jinhua pigs and Landrace pigs. Methods: Three Jinhua pigs and three Landrace pigs respectively at 70-day were slaughtered to collect the liver tissue samples. Immediately after slaughter, blood samples were taken to detect serum biochemical indicators. Total RNA extracted from liver tissue samples were used to prepare the library and then sequence on HiSeq 2500. Bioinformatic methods were employed to analyze sequence data to identify the circRNAs and predict the potential roles of differentially expressed circRNAs between the two breeds. Results: Significant differences in physiological and biochemical traits were observed between growing Jinhua and Landrace pigs. We identified 84,864 circRNA candidates in two breeds and 366 circRNAs were detected as significantly differentially expressed. Their host genes are involved in lipid biosynthetic and metabolic processes according to the gene ontology analysis and associated with metabolic pathways. Conclusion: Our research represents the first description of circRNA profiles in the porcine liver from two divergent phenotype pigs. The predicted miRNA-circRNA interaction provides important basis for miRNA-circRNA relationships in the porcine liver. These data expand the repertories of porcine circRNA and are conducive to understanding the possible molecular mechanisms involved in miRNA and circRNA. Our study provides basic data for further research of the biological functions of circRNAs in the porcine liver.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제30권8호
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• pp.1061-1065
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• 2017

Objective: This study was conducted to locate quantitative trait loci (QTL) influencing fatty acid (FA) composition in a large $F_2$ intercross between Landrace and Korean native pigs. Methods: Eighteen FA composition traits were measured in more than 960 $F_2$ progeny. All experimental animals were genotyped with 165 microsatellite markers located throughout the pig autosomes. Results: We detected 112 QTLs for the FA composition; Forty seven QTLs reached the genome-wide significant threshold. In particular, we identified a cluster of highly significant QTLs for FA composition on SSC12. QTL for polyunsaturated fatty acid on pig chromosome 12 (F-value = 97.2 under additive and dominance model, nominal p-value $3.6{\times}10^{-39}$) accounted for 16.9% of phenotypic variance. In addition, four more QTLs for C18:1, C18:2, C20:4, and monounsaturated fatty acids on the similar position explained more than 10% of phenotypic variance. Conclusion: Our findings of a major QTL for FA composition presented here could provide helpful information to locate causative variants to improve meat quality traits in pigs.