• Molecules and Cells
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• 제23권3호
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• pp.280-286
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• 2007

L-asparaginase (EC 3.5.1.1) catalyzes the hydrolysis of the amide group of L-asparagine, releasing aspartate and $NH_4{^+}$. We isolated a low temperature-inducible cDNA sequence encoding L-asparaginase from soybean leaves. The full-length L-asparaginase cDNA, designated GmASP1, contains an open reading frame of 1,258 bp coding for a protein of 326 amino acids. Genomic DNA blotting and fluorescence in situ hybridization showed that the soybean genome has two copies of GmASP1. GmASP1 mRNA was induced by low temperature, ABA and NaCl, but not by heat shock or drought stress. E. coli cells expressing recombinant GmASP1 had 3-fold increased L-asparaginase activity. A possible function of L-asparaginase in the early response to low temperature stress is discussed.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.79.1-79
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• 2003

Two pathogen-induced hot pepper transcription factors (CaNACl and CapIfl) were introduced into‘MicroTom’tomato by Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation. We used to nptII containing kanamycin resistance gene as a selection marker. Both transformed and non-transformed plants were transferred to pot after rooting test in vitro. To approximate the levels of caNACl transcript in leaves of wild-type and transgenic plants, RNA blots were hybridized with double-stranded full-length CaNACl probe at moderate stringency, Although the relative signal strength for hybridization fluctuated among the samples on different blots, transgenic plant lines N-1, N-2 and N-3 consistently displayed increased levels of CaNACl transcript relative to other transgenic lines and wild-type plants. Of all the transgenic lines examined, line N-7 had the least amount of CaNACl transcript. Role of these transcription factors in pathogen defense will be examined by overexpression in tomato.

• Journal of Korean Vacuum Science & Technology
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• 제5권2호
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• pp.33-37
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• 2001

We measured x-ray magnetic circular dichroism of Co films on Pd(111) surface with and without Pd capping layer at the Co L$_2$,$_3$ edges. Perpendicular magnetization and orbital-moment enhancement are induced by the capping layer. The increase of perpendicular magnetic anisotropy induced by capping layer is considered to result from the increase of surface anisotropy due to the hybridization at the surface.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제30권1호
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• pp.15-20
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• 2002

Diacylglycerol Kinase (DGK)는 E. coli 및 진핵세포에서의 신호전달에 관여하며, 또한 미생물에서 생리적 자극에 따라 다른 발현 양상을 보이는 것으로 밝혀져 있다. Bacillus subtilis에서 이 유전자에 대한 환경에서의 자극 신호들, 즉 pH 변화, 삼투압의 변화 및 온도의 변화에 따른 발현양상을 연구하였다. 이미 동정된 dgk locus의 KpnI-HindIII의 0.45 kb의 DNA fragment를 probe로 하여 Dot blot, Northern blot analysis를 통해 발현량을 조사해 본 결과 dgk 유전자는 pH변화, 삼투압의 변화 및 온도의 변화에 대응하여 발현되는 유전자임을 알 수 있었다. 특히 낮은 pH, 고 삼투압, 및 저온에서 dgk 유전자의 발현량이 많아짐을 확인 할 수 있었다. Northern hybridization에서 약 2.5kb의 mRNA가 관찰되었다. dgk gene의 ORF size는 약 0.4 kb로 관찰된 transcript size와는 일치하지 않았다. 따라서 Streptococcus mutans의 dgk gene과 마찬가지로 B. subtilis의 dgk 유전자도 polycistronic mRNA로 발현되는 것을 추정할 수 있었으며, 염색체상의 dgk gene에서 상류의 ORF2까지의 크기가 약 2.5 kb로 관찰된 mRNA size와 동일하였다. dgk gene 상류의 ORF2영역의 0.6 kb의 DNA fragment를 probe로 하여 northern blot hybridization을 수행한 결과, 2.5 kb의 mRNA가 관찰되었으며 발현되는 형태도 dgk probe를 이용한 결과와 동일하였다. 따라서 dgk gene은 상류부위의 ORF2 gene과 operon을 형성하여 polycistronic mRNA로 전사되는 것으로 판단된다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제35권3호
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• pp.257-273
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• 2019

Tomato (Solanum lycopersicum) is one of the most widely grown and economically important vegetable crops in the world. Tomato chlorosis virus (ToCV) is one of the recently emerged viruses of tomato distributed worldwide. ToCV-tomato interaction was investigated at the molecular level for determining changes in the expression of tomato genes in response to ToCV infection in this study. A cDNA library enriched with genes induced in response to ToCV infection were constructed and 240 cDNAs were sequenced from this library. The macroarray analysis of 108 cDNAs revealed that the expression of 92 non-redundant tomato genes was induced by 1.5-fold or greater in response to ToCV infection. The majority of ToCV-induced genes identified in this study were associated with a variety of cellular functions including transcription, defense and defense signaling, metabolism, energy, transport facilitation, protein synthesis and fate and cellular biogenesis. Twenty ToCV-induced genes from different functional groups were selected and induction of 19 of these genes in response to ToCV infection was validated by RT-qPCR assay. Finally, the expression of 6 selected genes was analyzed in different stages of ToCV infection from 0 to 45 dpi. While the expression of three of these genes was only induced by ToCV infection, others were induced both by ToCV infection and wounding. The result showed that ToCV induced the basic defense response and activated the defense signaling in tomato plants at different stages of the infection. Functions of these defense related genes and their potential roles in disease development and resistance to ToCV are also discussed.

• Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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• 제32권3호
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• pp.216-221
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• 2006

Cyclosporin A-induced gingival hyperplasia is frequently found in the patients who have been received an immunosuppressant for the organ transplantation. However, its exact mechanism is still unknown. The expression of FGF-5 and FGF-7 were studied in cyclosporine A-induced gingival hyperplasia (CGH) and inflammatory gingival hyperplasia (IGH). Immunohistochemistry and in situ hybridization were used for localization of protein and mRNA. The expression of FGF-5 and FGF-7 was different from CGH and IGH. FGF-5 and FGF-7 was strongly expressed in fibroblast in CGH (P<0.005 and P<0.05, respectively). FGF-5 mRNA was localized in the middle portion of connective tissue. FGF-7 mRNA was also identified in fibroblasts and mast cells. In conclusion, FGF-5 and FGF-7 were produced excessively by fibroblasts in CGH. Considering their known functions, their expression in CGH is important for production of collagen and proliferation of fibroblasts.

• Mycobiology
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• 제34권2호
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• pp.73-78
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• 2006

Inter-specific hybridization between Pleurotus pulmonarius and P. florida was attempted through PEG-induced protoplast fusion to select a fusant. The protocol for protoplast release, regeneration and fusion in these two Pleurotus species was standardized using the variables controlling the process. The mixture of mycolytic enzymes, i.e. commercial cellulase, crude chitinase and pectinase, KCl (0.6 M) as osmotic stabilizer, pH 6 of the phosphate buffer and an incubation time of 3 hours resulted in the maximum release of protoplasts from 3-day-old mycelia of P. florida ($5.3{\sim}5.75{\times}10^{7}$ protoplasts/g) and P. pulmonarius ($5.6{\sim}6{\times}10^{7}$ protoplasts/g). The isolated protoplasts of P. florida regenerated mycelium with 3.3% regeneration efficiency while P. pulmonarius showed 4.1% efficiency of regeneration. Polyethyleneglycol (PEG)-induced fusion of protoplasts of these two species resulted in 0.28% fusion frequency. The fusant produced fruiting bodies on paddy straw but required a lower temperature of crop running ($24{\pm}2^{\circ}C$) than its parents which could fruit at $28{\pm}2^{\circ}C$. The stable fusant strain was selected by testing for the selected biochemical markers i.e. Carbendazim tolerance and utilization of the lignin degradation product, vanillin.

• Journal of Radiation Protection and Research
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• 제24권1호
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• pp.45-53
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• 1999

각 염색체에 특이한 DNA probe를 이용하는 FISH기법은 방사선에 의해 유발된 상호전좌 및 삽입 등의 염색체의 구조적 변화를 측정하는 매우 효과적인 방법으로서 그 활용성이 증가되고 있다. 본연구는 방사선 피폭시 생물학적 선량측정법으로서 FISH기법을 활용하기 위하여 사람의 1, 2, 4번 염색체에 특이한 probe를 이용하여 고선량 단일 피폭시 유발된 각종 염색체 이상빈도를 관찰하고 이를 PAINT분류체계에 의해 분석하였다. 방사선 조사에 의한 염색체 이상빈도는 상호전좌(t)와 이동원염색체(dic)의 수가 선량 증가에 따라 같이 증가하는 것을 알 수 있으며 color junction의 수도 선량에 따라 증가하는 것을 알 수 있었다. 상호전좌의 빈도는 이동원 염색체의 빈도보다 상대적으로 높게 나타났다. 삽입(ins), 무동원염색체(ace), 및 환상염색체(r)의 수도 선량 증가에 따라 같이 증가하는 것을 알 수 있었다. 기존의 염색체재배열 분석방법과 비교해 볼 때 FISH기법은 다양한 형태의 염색체재해열을 보다 쉽게 관찰할 수 있게 하며 생물학적 선량제로서 중요한 역할을 할 것이라 기대된다.

• 대한치과교정학회지
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• 제26권1호
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• pp.83-94
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• 1996

Substance P는 교정력이 가해진 치아의 치주인대 중 인장력을 받는 부위에 많이 분포하는 neuropeptide중의 하나이며, 또한 여러 조직에서 neurogenic inflammation을 야기하는 neuropeptide중의 하나로도 알려져 있다. 그러나 중요한 세포외 단백기질인 교원질의 생성에 대한 Substance P의 효과는 잘 알려져 있지 않다. 따라서 이 연구의 목적은 배양치주인대 세포에서 교원질 생성에 대한 Substance P의 효과를 평가하는 것이었다. collagenase-digestion method로 교원질 생성을 평가하였고 mRNA 수준에서 작용효과를 평가하기 위하여 Northern blot hybridization을 시행하였다. 이 연구는 또한 교원질 생성에 대한 prostaglandin과 gelatinase 생성도 포함하였으며 변성된 교원질의 분해를 평가하기 위하여 zymography를 이용하였다. 비교원성 단백질, 교원성 단백질, 상대교원질에 대한 dose-dependent effect를 보면 Substance P는 비교원성 단백질 합성을 증가시켰으나 교원성 단백질 합성은 감소시킨다. 그리하여 총 단백합성에 대한 상대적인 교원질 생성을 나타내는 상대교원질은 $7\%$에서 $3.6\%$로 감소시켰다. 세포를 indomethacin과 동시에 처리할 때 substance P의 교원질 합성 억제효과는 나타나지 않았다. 이것은 Substance P의 교원질 합성 억제효과가 prostaglandin의 생성 때문이라는 것을 의미한다. Substance P의 교원질 합성 억제효과가 procollagen mRNA의 정상(steady-state)수준에 부합하는가를 평가하기 위하여 northern blot hybridization을 시행한 결과 Substance P는 ${\alpha}1(1)$ procollagen mRNA의 양적 변동을 일으키지 않았다. Substance P의 교원질 생성 억제효과는 전사이후의 어떤 단계에서 이루어지는 현상임을 나타낸다. 치주인대세포에서 gelatinase 생성에 대한 Substance P의 효과를 알아보기 위하여 zymography를 이용하였다. zymogram 을 보면 Substance P는 치주인대세포에서 gelatinase 생성에는 아무 효과도 나타내지 않음들 알 수 있다. Substance P의 교원질 생성 억제효과가 치주인대세포에 대해 선택적인가 아닌가를알아보기 위하여 MC3T3-E1세포를 이용하였는데 Substance P는 MC3T3-E1세포의 교원질 합성에는 영향을 미치지 않았다. 이상에서 Substance P는 인간의 치주인대세포에서 교원질 합성을 억제하였다. 이 효과는 procollagen mRNA와 gelatinase 생성의 정상(steady-state) 수준의 변화 때문이 아니라 prostaglandin 생성과 연관이 있음을 알았다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제45권4호
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• pp.823-834
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• 1998

연구배경: 유리규산(silica) 자극에 의해 폐장내 대식세포에서 형성되는 proinflammatory cytokines인 IL-1$\beta$, IL-6, TNF-$\alpha$와 fibrogenic cytokine인 TGF-$\beta$, PDGF는 섬유화 과정에 매우 중요한 역할을 한다. 그러나 이러한 cytokine 의 역할과 상호관련성에 대해서는 아직 확실히 밝혀진 바없다. 본 연구는 Balb/C mouse의 폐장단구세포를 silica로 자극시 형성되는 IL-6, TNF-$\alpha$ 폐섬유화의 발생과 유지에 중요한 역할을 할 것으로 기대되는 TGF-$\beta$ 의 생성을 관찰하고 TGF-$\beta$의 생성에 proinflammatory cytokine이 미치는 영향에 대해서 알아보고자 하였다. 방 법: Balb/C 의 폐장대식세포를 silica로 자극한 후 IL-6, TNF-$\alpha$ TGF-$\beta$의 양을 bioassay로 측정하였고 mRNA의 발현을 in situ hybridization을 통해 관찰하였으며, 대식세포의 TGF-$\beta$ 생성에 대한 IL-1$\beta$, IL-6, TNF-$\alpha$의 영향을 알기 위하여 L-1, IL-6, TNF-$\alpha$에 대한 중화항체를 이용하여 대식세포의 TGF-$\beta$의 생성 억제 유, 무를 관찰하였다. 결 과: Silica로 대식세포자극시 TNF-$\alpha$는 초기 4 시간째 최고의 생성능을 보였으며, IL-6 는 silica 0.2 ${\mu}g/ml$의 농도에서 배양 8 시간째 생성능이 가장 높았고 배양 12 시간째는 다시 감소하였다가 24시간째 증가하는 biphasic한 소견을 보여 주었다. TGF-$\beta$는 silica의 양과 관계없이 배양 24시간째 자연생성능뿐 아니라, silica로 자극시에도 증가되었다. Silica와 TNF-$\alpha$ 50ng/ml을 함께 자극시 TGF-$\beta$의 생성은 현저히 증가되었으며, TNF-$\alpha$ 50 ng/ml과 IL-6 50 ng/ml으로 동시 자극시에는 TNF-$\alpha$에 의한 TGF-$\beta$의 형성이 증가하는 경향을 보였다. TNF-$\alpha$의 중화항체를 전처치 후 silica 자극시 TGF-$\beta$의 생성능을 억제시킴을 관찰할 수 있었다. Anti-IL-$\beta$, anti-IL-6, anti-TNF-$\alpha$ antibody 모두를 통시에 투여하였을 때도 silica에 의한 TGF-$\beta$의 생성능을 억제시킴을 관찰할 수 있었다. Silica 자극 후 대식세포의 in situ hybridization에서 TNF-$\alpha$ mRNA는 2시간째부터 발현되었고 IL-6 mRNA는 4 시간째부터 발현된 후 8 시간째 소실되었고 TGF-mRNA는 12 시간째 가장 강한 발현을 보였다. 결 론: Silica 자극에 의해 폐장대식세포는 자극 초기에는 TNF-$\alpha$가 가장먼저 형성되고 후기에 TGF-$\beta$가 형성되며 TNF-$\alpha$가 TGF-$\beta$ 형성에 중요한 역할을 할 것으로 사료되었다.