• 제목/요약/키워드: genetic evaluation

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안동-임하 연결도수로 설치에 따른 가용 수자원량에 관한 연구 (Study on Potential Water Resources of Andong-Imha Dam by Diversion Tunnel)

  • 추연문;지홍기;권기대;김철영
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제15권2호
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    • pp.1126-1139
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    • 2014
  • 도시화 및 산업화에 따른 온실가스의 증가로 전 세계적인 이상기후 현상이 빈번하게 발생하고 있으며, 국내에서도 이러한 현상의 하나로 홍수와 가뭄의 영향이 지속적으로 심화되고 있다. 기후변화는 이수, 치수, 환경 등 다양한 측면에서 물 관리 전반에 걸쳐 복잡성을 가중시키고 불확실성을 확대시키는 등 많은 영향을 초래한다. 또한 과거와는 달리 하천유지수량, 환경용수량 등 다양한 용수수요의 증가에 따라 제한된 가용수자원의 추가적인 확보를 위한 분석과 연구가 필요하다. 본 연구에서는 안동댐과 임하댐 유역을 대상으로 기후변화 시나리오와 토양수분 저류구조 Tank 모형을 이용하여 장기 유출량을 산정하였고, 연결도수로를 통해 병렬 연결된 안동댐과 임하댐의 저수지 연결모의운영을 수행하여 임하댐에서 안동댐으로 전환되는 추가 가용 수자원량을 분석, 비교함으로서 미래 기후변화가 가용수자원 확보에 미치는 영향을 정량적으로 평가하였다. 대표농도경로 기후변화 시나리오 중 RCP 6.0과 RCP 8.5를 이용하여 대상유역의 상세 수문자료를 생산하여 과거 유역의 관측 강수량 자료와 경향성을 분석한 결과 시나리오별 모두 5%~9%의 범위로 강수량이 증가하는 것으로 분석되었으며, 목적함수를 이용한 민감도 분석을 통해 가장 높은 적합도를 나타낸 개체군의 크기는 1000 이었으며 교차비율은 80% 이었다. 본 연구의 결과를 이용하여 미래 기후변화에 대응한 물 관리 측면에서 저수지 운영의 효과를 극대화하고 장기적으로 안정적이고 풍부한 용수공급 계획을 수립하는데 도움이 될 것으로 기대된다.

고추 유전자원의 탄저병(Colletotrichum acutatum) 저항성 평가 (Evaluation of Resistance to Colletotrichum acutatum in Pepper Genetic Resources)

  • 김상규;노나영;허온숙;고호철;곽재균;허윤찬
    • 식물병연구
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    • 제18권2호
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    • pp.93-100
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    • 2012
  • 농업유전자원센터에 보존하고 있는 896점의 고추(C. annuum 430점, C. baccatum 219점, C. chacoense 14점, C. frutescens 70점, C. pubescens 2점, 미동정 8점)에 C. acutatum을 접종 후 $28^{\circ}C$에서 14일간 배양 후 탄저병 발병 정도를 평가하였다. 무상처 분무 접종에서 총 49점이 C. acutatum에 저항성을 나타내었으며, 그 중 9점은 고도의 저항성을 나타내었다. 고도의 저항성을 나타내는 자원들은 C. baccatum 4점, C. chacoense 1점, C. frutescens 4점이었다. 무상처 분무 접종에서 탄저병 저항성을 나타내는 자원 중 42점을 상처 접종법으로 탄저병균을 접종하였다. 그 중 5점은 접종 5일 후에도 병반의 크기가 3%미만으로 나타나 저항성을 나타내었으며, 이들은 모두 C. baccatum이었다. 저항성을 보이는 5점은 탄저병 저항성 육성을 위한 자원으로 이용가능 할 것이다.

The Effect of Transformation on the Virulence of Streptococcus pneumoniae

  • Zhang Xue-Mei;Yin Yi-Bing;Zhu Dan;Chen Bao-De;Luo Jin-Yong;Deng Vi-Ping;Liu Ming-Fang;Chen Shu-Hui;Meng Jiang-Ping;Lan Kai;Huang Yuan-Shuai;Kang Ge-Fei
    • Journal of Microbiology
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    • 제43권4호
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    • pp.337-344
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    • 2005
  • Although pneumococcus is one of the most frequently encountered opportunistic pathogen in the world, the mechanisms responsible for its infectiveness have not yet been fully understood. In this paper, we have attempted to characterize the effects of pneumococcal transformation on the pathogenesis of the organism. We constructed three transformation-deficient pneumococcal strains, which were designated as Nos. 1d, 2d, and 22d. The construction of these altered strains was achieved via the insertion of the inactivated gene, comE, to strains 1, 2 and 22. We then conducted a comparison between the virulence of the transformation-deficient strains and that of the wild-type strains, via an evaluation of the ability of each strain to adhere to endothelial cells, and also assessed psaA mRNA expression, and the survival of hosts after bacterial challenge. Compared to what was observed with the wild-type strains, our results indicated that the ability of all of the transformation-deficient strains to adhere to the ECV304 cells had been significantly reduced (p < 0.05), the expression of psaA mRNA was reduced significantly (p < 0.05) in strains 2d and 22d, and the median survival time of mice infected with strains Id and 2d was increased significantly after intraperitoneal bacterial challenge (p < 0.05). The results of our study also clearly indicated that transformation exerts significant effects on the virulence characteristics of S. pneumoniae, although the degree to which this effect is noted appears to depend primarily on the genetic background of the bacteria.

Detection of mcr-1 Plasmids in Enterobacteriaceae Isolates From Human Specimens: Comparison With Those in Escherichia coli Isolates From Livestock in Korea

  • Yoon, Eun-Jeong;Hong, Jun Sung;Yang, Ji Woo;Lee, Kwang Jun;Lee, Hyukmin;Jeong, Seok Hoon
    • Annals of Laboratory Medicine
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    • 제38권6호
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    • pp.555-562
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    • 2018
  • Background: The emerging mobile colistin resistance gene, mcr-1, is an ongoing worldwide concern and an evaluation of clinical isolates harboring this gene is required in Korea. We investigated mcr-1-possessing Enterobacteriaceae among Enterobacteriaceae strains isolated in Korea, and compared the genetic details of the plasmids with those in Escherichia coli isolates from livestock. Methods: Among 9,396 Enterobacteriaceae clinical isolates collected between 2010 and 2015, 1,347 (14.3%) strains were resistant to colistin and those were screened for mcr-1 by PCR. Colistin minimum inhibitory concentrations (MICs) were determined by microdilution, and conjugal transfer of the mcr-1-harboring plasmids was assessed by direct mating. Whole genomes of three mcr-1-positive Enterobacteriaceae clinical isolates and 11 livestock-origin mcr-1-positive E. coli isolates were sequenced. Results: Two E. coli and one Enterobacter aerogenes clinical isolates carried carried IncI2 plasmids harboring mcr-1, which conferred colistin resistance (E. coli MIC, 4 mg/L; E. aerogenes MIC, 32 mg/L). The strains possessed the complete conjugal machinery except for E. aerogenes harboring a truncated prepilin peptidase. The E. coli plasmid transferred more efficiently to E. coli than to Klebsiella pneumoniae or Enterobacter cloacae recipients. Among the three bacterial hosts, the colistin MIC was the highest for E. coli owing to the higher mcr-1-plasmid copy number and mcr-1 expression levels. Ten mcr-1-positive chicken-origin E. coli strains also possessed mcr-1-harboring IncI2 plasmids closely related to that in the clinical E. aerogenes isolate, and the remaining one porcine-origin E. coli possessed an mcr-1-harboring IncX4 plasmid. Conclusions: mcr-1-harboring IncI2 plasmids were identified in clinical Enterobacteriaceae isolates. These plasmids were closely associated with those in chicken-origin E. coli strains in Korea, supporting the concept of mcr-1 dissemination between humans and livestock.

한우 거세우 성장형질과 도체형질에 대한 환경효과 분석 (Analysis of Environment Effects on the Growth and Carcass Traits in Hanwoo Steers)

  • 이재구;최연호;박병호;최재관;나종삼;최태정
    • 농업생명과학연구
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    • 제45권6호
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    • pp.109-114
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    • 2011
  • 본 논문은 한우 거세우의 각 월령별 체중과 18개월 체척, 도체형질에 대하여 출생지, 후대검정차수, 측정일령, 도축일, 도축일령등의 환경효과가 영향을 미치는지 알아 보기위하여 실시하였다. 이 연구에 사용된 자료는 농협중앙회 한우개량사업소에서 2004년부터 2008년까지 후대 검정한 38차에서 47차까지의 거 세우 1,838두의 성장형질과 도체형질 자료를 이용하였고, 성장형질은 18개월령 체척자료와 6개월, 12개월, 18개월, 24개월 체중을, 도체형질은 24개월령 도축성적을 이용하였다. 각 형질에 대한 환경효과 분석을 위해 각 월령별 체중에 대해서는 고정효과를 출생지, 후대검정차수로 하였고 공변량을 측정일령으로 하였다. 도체형질은 도축일을 고정효과로 도축일령을 공변량으로 하였다. 18개월 체척의 경우는 고정효과를 출생지, 후대검정차수로 하였고, 공변량을 18개월 체척측정일령으로 하였다. 분석결과 24개월 체중에서는 출생지 효과가 유의성이 낮은 것으로 나타났다. 도체형질인 도체중, 등심단면적, 육량지수, 등지방 두께는 도축일에 따른 유의적인 차이가 존재하는 것으로 나타났지만 도축일령에 따른 유의적인 차이는 없었다. 근내지방도에 대해서는 도축일령과 도축일 모두 영향을 미치는 것으로 나타났다. 또한 체척형질은 흉심, 고장폭, 흉위에서 출생지 효과는 영향이 없는 것으로 나타났다. 따라서 본 연구결과는 한우 유전평가 모형 설정 시 활용 가능한 것으로 예상된다.

한국 재래종 강낭콩 유전자원의 phytochemical 및 항산화 활성 평가 (Evaluation of Phytochemical econtents and antioxidant activity of Korean common bean (Phaseolus vulgaris L) landraces)

  • 이경준;신명재;조규택;이기안;마경호;정종욱;이정로
    • 한국국제농업개발학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.357-369
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    • 2018
  • 1. 본 연구는 한국 재래종 강낭콩 209자원의 phytochemical 및 항산화활성을 평가하였다. 2. 항산화활성은 DPPH, ABTS, FRAP, SOD를 분석하였으며 phytochemical은 kaempferol, myricetin, quercetin, naringenin 함량을 각각 분석하였다. 3. 항산화활성은 강낭콩 자원 간 다양한 분포를 보였으며 DPPH의 경우 62.3~643.9 (IC50), ABTS의 경우 0.28~1.49 mgAAE/g, FRAP의 경우 0.41~5.44 mgAAE/g, SOD의 경우 50.4 ~ 299.8 (IC50)로 나타났다. 4. Relative antioxidant capacity index (RACI)로 강낭콩 자원의 항산화활성을 비교한 결과 IT104587이 가장 높은 항산화활성을 보였으며 IT189598이 가장 낮은 항산화활성을 보였다. 5. 분석된 Phytochemical 중에서 한국 재래종 강낭콩에서는 Kaempferol이 가장 높은 함량을 나타냈다. 6. PCA 분석 결과 209자원은 3개의 그룹으로 나뉘었으며 이중 그룹 III에 속한 46자원의 강낭콩이 낮은 항산화활성 및 phytochemical 함량을 보였다. 7. 본 연구 결과는 한국 재래종 강낭콩의 항산화활성 및 phytochemical 정보를 제공하며 이 정보는 강낭콩 품종 개발을 위한 기초 정보로 사용될 수 있을 것이다.

사용자 참여형 웨어러블 디바이스 데이터 전송 연계 및 딥러닝 대사증후군 예측 모델 (Deep Learning Algorithm and Prediction Model Associated with Data Transmission of User-Participating Wearable Devices)

  • 이현식;이웅재;정태경
    • 한국산업정보학회논문지
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    • 제25권6호
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    • pp.33-45
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    • 2020
  • 본 논문은 최근 다양한 종류의 웨어러블 디바이스가 헬스케어 도메인에 급증하여 사용되고 있는 상황에서 최신 첨단 기술이 실제 메디컬 환경에서 개인의 질병예측이라는 관점을 바라본다. 사용자 참여형 웨어러블 디바이스를 통하여 임상 데이터와 유전자 데이터, 라이프 로그 데이터를 병합하여 데이터를 수집, 처리, 전송하는 과정을 걸쳐 딥뉴럴 네트워크의 환경에서 학습모델의 제시와 피드백 모델을 연결하는 과정을 제시한다. 이러한 첨단 의료 현장에서 일어나는 메디컬 IT의 임상시험 절차를 걸친 실제 현장의 경우 대사 증후군에 의한 특정 유전자가 질병에 미치는 영향을 측정과 더불어 임상 정보와 라이프 로그 데이터를 병합하여 서로 각기 다른 이종 데이터를 처리하면서 질병의 특이점을 확인하게 된다. 즉, 이종 데이터의 딥뉴럴 네트워크의 객관적 적합성과 확실성을 증빙하게 되고 이를 통한 실제 딥러닝 환경에서의 노이즈에 따른 성능 평가를 실시한다. 이를 통해 자동 인코더의 경우의 1,000 EPOCH당 변화하는 정확도와 예측치가 변수의 증가 값에 수차례 선형적으로 변화하는 현상을 증명하였다.

Luzhong mutton sheep: inbreeding and selection signatures

  • Tao, Lin;He, Xiaoyun;Wang, Fengyan;Zhong, Yingjie;Pan, Linxiang;Wang, Xiangyu;Gan, Shangquan;Di, Ran;Chu, Mingxing
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제62권6호
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    • pp.777-789
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    • 2020
  • Intense artificial selection has been imposed to Luzhong mutton sheep population in the past years. Improvements on growth and reproductive performance are two breeding goals in the present herd. Although some progresses were phenotypically observed possibly due to inbreeding induced by strong selection in terms of these traits, the genomic evaluation was poorly understood. Therefore, a high-density SNP array was used to characterize the pattern of runs of homozygosity (ROH), estimate inbreeding and inbreeding depressions on early growth performance and litter size based upon ROH, and scan positive selection signatures of recent population. Consequently, a low inbreeding level was observed which had negative effects on litter size, but not on early growth performance. And 160 genes were under selection, of which some were reported to be linked to several traits of sheep including body weight, litter size, carcass and meat quality, milk yield and composition, fiber quality and health, and the top genes were associated with growth (growth hormone [GH]- growth hormone receptor [GHR]- Insulin-like growth factor 1 [IGF1] axis) and litter size (bone morphogenic proteins [BMPs]-associated). The effectiveness of previous breeding measures was highlighted, but purging selection was proposed to alleviate the inbreeding depression on litter size, providing some genomic insights to breeding management of Luzhong mutton sheep.

결빙 증식 최소화를 위한 다중 익형 형상 최적설계 (Design Optimization of Multi-element Airfoil Shapes to Minimize Ice Accretion)

  • 강민제;이혁진;조현승;명노신;이학진
    • 한국항공우주학회지
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    • 제50권7호
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    • pp.445-454
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    • 2022
  • 항공기가 빙점 이하의 습도가 높은 구름대를 지날 때 액적이 항공기와 충돌하면 날개, 동체 등 항공기 구성품에 결빙이 발생한다. 특히 항공기의 날개에 결빙이 증식되면 공력 성능의 저하와 비행 안정성의 감소 등의 치명적인 안전 문제를 초래할 수 있다. 본 연구에서는 항공기 날개에 적용되는 고양력 장치인 다중 익형의 결빙 증식량이 최소가 되도록 형상 최적설계를 수행하였다. 3차원 Reynolds-Averaged Navier-Stokes 지배 방정식을 이용하여 공력해석을 수행하였고, 다물리 전산해석을 통해 결빙의 형상 및 증식량을 예측하였다. 최적설계의 목적함수는 결빙 증식량 최소화로 설정하였고, 설계변수는 Slat과 Flap의 전개 각도와 위치를 정의하는 형상 변수 6개를 선정하였다. 설계 과정에서 목적함수의 평가는 크리깅 근사모델을 사용하여 대체하였고 유전자 알고리즘을 적용하여 최적 형상을 도출하였다. 최적화를 수행한 결과, Slat과 Flap에 최적의 전개 각도와 위치를 적용하였을 때 결빙 증식량이 약 8% 감소하였다.

AFLPs에 의한 Aegilops의 계통발생학적 재평가 (Application of AFLPs to Phylogenetic Analysis of Aegilops)

  • 박용진;심재욱
    • 한국작물학회지
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    • 제42권6호
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    • pp.790-799
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    • 1997
  • 각 게놈형간의 근연관계 및 배수체종의 게놈분석에 관한 새로운 접근을 시도하고자, Aegilops 19종 및 재배밀(T. aestivum)을 공시하여 AFLP 분석을 실시하여 얻은 결과는 다음과 같다. 1. AFLPs를 이용한 Aegilops종들간 근연관계를 분석한 결과, 7개의 primer 조합에서 총 207개의 다형 band를 조사하였으며 조합당 평균 다형 band수는 29.8개 이었다. 2. 각 게놈간 유연관계로 보아 Ae. heldreichii ($M^h$) 는 Ae. comosa (M)와 Ae. uniaristate(N)의 중간위치의 게놈으로 나타났고, UM게놈을 가진 4배체종의 M게놈 공여종으로 판단되었다. 그리고 Ae. squarrosa는 재배밀의 D게놈 공여종임을 확인하였다. 3. 6배체성 Ae. triaristate(UMN)는 4배체성 Ae. triaristate(UM)보다는 Ae. columnaris(UM)와 더 근연인 것으로 나타났다. 그리고 Ae. ventricosa(DN)은 U게놈이 N게놈보다 더 근연인 것으로 나타났다. 4. AFLPs에 의한 군집형성은 5개의 군집으로 구분되었고 이는 기본적으로 Gihara의 Section군과 일치하였고, 다양성분석, 게놈분석 등에 보다 효율적인 것으로 평가되었다.

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