Kim, Yu-Jin;Lee, Ok-Ran;Lee, Sung-Young;Kim, Kyung-Tack;Yang, Deok-Chun
Journal of Ginseng Research
/
v.36
no.4
/
pp.449-460
/
2012
Plants have versatile detoxification systems to encounter the phytotoxicity of the wide range of natural and synthetic compounds present in the environment. Glutathione S-transferase (GST) is an enzyme that detoxifies natural and exogenous toxic compounds by conjugation with glutathione (GSH). Recently, several roles of GST giving stress tolerance in plants have demonstrated, but little is known about the role of ginseng GSTs. Therefore, this work aimed to provide further information on the GST gene present in Panax ginseng genome as well as its expression and function. A GST cDNA (PgGST) was isolated from P. ginseng cDNA library, and it showed the amino acid sequence similarity with theta type of GSTs. PgGST in ginseng plant was induced by exposure to metals, plant hormone, heavy metals, and high light irradiance. To improve the resistance against environmental stresses, full-length cDNA of PgGST was introduced into Nicotiana tabacum. Overexpression of PgGST led to twofold increase in GST-specific activity compared to the non-transgenic plants, and the GST overexpressed plant showed resistance against herbicide phosphinothricin. The results suggested that the PgGST isolated from ginseng might have a role in the protection mechanism against toxic materials such as heavy metals and herbicides.
Im, Subin;Kim, Ho-Il;Kim, Dasom;Oh, Sang Heon;Kim, Yoon-Young;Ku, Ja Hyeong;Lim, Yong Pyo
Korean Journal of Agricultural Science
/
v.45
no.4
/
pp.583-590
/
2018
Genus Typha L. (Typhaceae; Cattail in common) is one of the hydrophytic plants found in semi-aquatic regions. About nine to 18 species of the genus exist all over the world. In Korea, the most commonly found cattail species are T. laxmanni and T. angustifolia. The aim of this study was to prepare a cDNA library and sequences and analyze expressed sequence tags (ESTs) from these species, T. laxmanni and T. angustifolia. In the case of T. laxmanni, we observed that 715 out of 742 ESTs had high quality sequences, whereas the remaining 27 ESTs were low quality sequences. In this study, we identified 77 contigs, 393 unassembled clones and 65.7% singletons. Furthermore, in the case of T. angustifolia, we recorded 992 high quality EST sequences, and by excluding 28 low quality sequences from among them, we retrieved 120 contigs, 348 unassembled clones and 48.9% singletons. The basic local alignment search tool (BLAST) and Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) database results enabled us to identify the functional categories, i.e., molecular function (16.5%), biological process (22.2%) and cellular components (61.3%). In addition, between these two species, the no hits and anonymous genes were 4.2% and 11.7% and 6.2% and 11.2% in T. laxmanni and T. angustifolia, respectively, based on the BLAST results. The study concluded that they have certain species-specific genes. Hence, the results of this study on these two species could be a valuable resource for further studies.
Cinnamate-4-hydroxylase (C4H) is a key enzyme in the phenylpropanoid pathway, which is responsible for synthesizing a variety of secondary metabolites that participate in development and adaptation. In this study, we isolated a full-length cDNA of the C4H gene from the Korean black raspberry (Rubus sp.) and found that this gene existed as a single gene. By comparing the deduced amino acid sequence of Rubus sp. C4H with other sequences reported previously we determined that this sequence was highly conserved among widely divergent plant species. In addition, quantitative real time PCR studies indicated that the C4H gene had a differential expression pattern during fruit development, where gene expression was first detected in green fruit and was then remarkably reduced in yellow fruit, followed by an increase in red and black fruit. To investigate the two peaks in expression observed during fruit development and ripening, we measured the flavonoid content. The content of the major flavanol of Korean black raspberry fruits was determined to be highest at the beginning of fruit development, followed by a gradually decrease according to the developmental stages. In contrast, the content of anthocyanins during the progress of ripening was dramatically increased. Our results suggest that the C4H gene in Korean black raspberry plays a role during color development at the late stages of fruit ripening, whereas the expression of C4H gene during the early stages may be related to the accumulation of flavanols.
Park, Myoung-Ryoul;Ryu, Sang-Soo;Yoo, Nam-Hee;Yu, Chang-Yeon;Yun, Song-Joong
Korean Journal of Medicinal Crop Science
/
v.13
no.5
/
pp.270-275
/
2005
Superoxide dismutases (SOD) are metalloenzymes that convert $O_2^-\;to\;H_2O_2$. Rehmannia glutinosa is highly tolerant to paraquat-induced oxidative stress. The primary objective of this study was to characterize regulation of SOD gene expression in R. glutinosa in response to oxidative stresses and hormones. A full-length putative SOD clone (RgCu-ZnSOD1) was isolated from the leaf cDNA library of R. glutinosa using an expressed sequence tag clone as a probe. RgCu-ZnSOD1 cDNA is 777 bp in length and contains an open reading frame for a polypeptide consisted of 152 amino acid residues. The deduced amino acid sequence of the clone shows highest sequence similarity to the cytosolic Cu-ZnSODs. The two to three major bands with several minor ones on the Southern blots indicate that RgCu-ZnSOD1 is a member of a small multi-gene family. RgCuZnSOD1 mRNA was constitutively expressed in the leaf, flower and root. The expression of RgCu-ZnSOD1 mRNA was increased about 20% by wounding and paraquat, but decreased over 50% by ethylene and $GA_3$. This result indicates that the RgCu-ZnSOD1 expression is regulated differentially by different stresses and phytohormones at the transcription level. The RgCu-ZnSOD1 sequence and information on its regulation will be useful in investigating the role of SOD in the paraquat tolerance of R. glutinosa.
The genome sequence of various Flammulina species has recently been reported, thereby revealing a diverse genetic repertoire. In this study, we identified laccase genes and analyzed their structural characteristics in Flammulina elastica (F. elastica) genome. Through genome analysis and bioinformatics approaches, three laccase genes (Fe-lac1, -lac2, and -lac3) were identified, ranging from 1,548 to 1,602 bp in length. These genes contained a copper ion-binding region with ten histidine residues and one cysteine residue and a disulfide bond-forming region with four cysteine residues. Full-length cDNA sequencing analysis revealed that laccase genes contain 12 to 16 introns and signal peptides between 17 and 22 bp in the N-terminus. Structural characterization of the laccase genes identified in this study should help in better understanding the biomass decomposition of F. elastica.
Full length complementary DNA encoding apolipoprotein A-I (apoA-I) was isolated and characterized in mud loach (Misgurnus mizolepis). Mud loach apoA-I cDNA encoding 24 bp of 5'-untranslated region (UTR), 762 bp of single open reading frame (ORF) consists of 254 amino acids and 293 bp of 3'-UTR excluding stop codon and poly (A+) tail. Two overlapping polyadenylation signals (AATAAAATAAA) was found 9 bp prior to the poly (A+) tail. Mud loach apoA-I represented considerable homology to those from other teleost species at amino acid level with conserving common features of vertebrate apoA-I. Molecular phylogenetic analysis inferred the phylogenetic hypothesis that was generally in accordance with the previous taxonomic relationship. Apolipoprotein A-I mRNA was detected in various tissues, but the mRNA levels were quite varied depending on tissues based on semi-quantitative RT-PCR. Liver and brain showed the significantly higher levels of apoA-I transcripts than other tissues. mRNA expression of apoA-I was quite low in very early stage of embryonic development, however dramatically enhanced from 8 hours post fertilization. This increased mRNA level was retained consistently up to 14 days post hatching.
ALG-2 (apoptosis linked gene-2) is a 22 kDa calcium-binding protein necessary for apoptosis induced by various stimuli in lymphocyte. The transactivation of human ALG-2 was assessed in yeast as a fusion protein with the DNA binding domains (DBDs) of LexA. The C-terminal of hALG-2 (93-191 amino acid) exhibited transacitivation of the reporter gene, LacZ, whereas the full-length hALG-2 (1-91 amino acid) and its N-terminal (1-98 amino acid) did not. The transactivation of LacZ reporter was driven more strongly (more than 2.7-fold increase) by the C-terminus of hALG-2 than by the B42, as a positive control for transactivation. Hence, our data suggested a possible regulatory role of the N-termini of hALG-2 upon transactivation.
Park, Seong-Whan;Kim, Kee-Young;Chen, Liang;Lee, Jai-Heon
Journal of Plant Biotechnology
/
v.29
no.2
/
pp.99-104
/
2002
Suppression subtractive hybridization (SSH) was used to isolate wound-induced cDNAs from wounded soybean. One of low-temperature-inducible cDNA, slti182 showed high homology with genes encoding 1-asparaginase. The full length cDNA of slti182, deginated GmASP1, is 1258 bp long and contains an open reading frame consisted of 326 amino acids. CmASP1 protein showed the highest identity (84%) with putative asparaginase from A. thaliana (AB012247), but it showed only 55% identity with another isoform of A. tathaliana (Z34884). The expression of GmASP1 during low temperature stress started to increase 3 hours after treatment, reached the maximum at 6 hour, and then decreased to the initial level at 48 hours. The amount of GmASP1 transcripts increased again when low-temperature-treated plants were transferred to room temperature, The present study suggests that GmASP1 may function to accelerate the protein synthesis which is important in the early response to low temperature.
Extensive research of the Potato virus X(PVX) has been performed in in vitro transcription system using the bacteriophage T7 promoter. We constructed an efficient T-DNA based binary vector, pSNU1, and modified vectors carrying PVX replicons. The suitability of the construct to transiently express PVX RNA using Agrobacterium tumefaciens was tested by analysis of infectivity in plants. The expressed PVX RNA was infectous and systemically spread in three plant species including Nicotiana benthamiana, N. tabacum cv. Xanthi-nc, and Capsicum annuum cv. Chilsungcho. The PVX full length construct, pSPVXp31, was caused severe mosaic symptoms on N. benthamiana, severe necrotic lesions on C. annuum while milder symptoms and delayed mosaic symptoms were appeared on the systemic leaves on N. tabaccum. RT-PCR analysis confirmed the presence of PVX RNAs on both inoculated and systemic leaves in all three plant species tested. Our results indicated that PVX replicons were efficiently expressed PVX RNA in at least three tested species. Further investigation win be needed to elucidate the mechanism of PVX replication, translation, movement and assembly/disassembly processes.
Caldesmon (CaD), one of microfilament-associated proteins, plays a key role in microfilament assembly in mitosis. We have investigated the effects of overexpression of the high molecular weight isoform of CaD (h-CaD) on the physiology of vascular smooth muscle cells (VSMCs). Rat aortic VSMCs were stably transfected with plasmids carrying a full length human h-CaD cDNA under control of cytomegalovirus promoter. The majority of the overexpressed h-CaD appears to be localized predominantly on cytoskeleton structures as determined by detergent lysis. The overexpression of h-CaD, however, does not decrease the level of endogenous low molecular weight isoform of CaD. h-CaD overexpressing VSMCs (h-CaD/VSMCs) show a decreased growth rate than that of vector-only transfected cells when determined by $[^3H]thymidine$ uptake and cell counting after fetal bovine serum (FBS) stimulation. h-CaD/VSMCs were smaller than vector-transfected cells by 18% in cell diameter. These data suggest that overexpression of h-CaD can inhibit the poliferation and the cell volume of VSMCs stimulated by growth factors and that the gene therapy with h-CaD may be helpful to prevent the conditions associated with hypertrophy and/or hyperplasia of VSMCs after arterial injuries.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.