• Animal cells and systems
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• 제3권4호
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• pp.413-415
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• 1999

Our previous report demonstrated that the rhp51$^＋$, a recA and RAD51 homolog of the fission yeast, encodes three transcripts of 1.9, 1.6 and 1.3 kb which have at least six polyadenylation sites. The 3'-end of the gene alone can direct the formation of multiple, discrete 3'ends of the transcripts. To identify the regulatory element required for the 3'-end formation of -rhp51$^＋$ deletion mapping analysis was performed. Northern blot analysis revealed that the 254-bp DNA fragment including 4 distinct poly (A) sites downstream from the Hindlll site, is crucial for normal 3'-end formation. Deletion of the 3'-terminal AU rich region caused appearance of read-through RNA, leading to enhancement of survival rate of the rhp51 deletion mutant in response to DNA damaging agent, methylmethane sulfonate (MMS). The results imply that the rhp51$^＋$ system may be useful for molecular analysis of the 3'-end formation of RNA in the fission yeast.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권6호
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• pp.1059-1063
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• 2008

Abnormal phenotypes resulting from haploinsufficiency (HI) are due to the loss of one allele. Recent studies in budding yeast have shown that HI originates from insufficient protein levels or from a stoichiometric imbalance between subunits of protein complexes. In humans, however, HI often involves transcription factors. Therefore, the species differences in HI and the molecular mechanisms of species-specific HI remain under investigation. In this study, HI in fission yeast was systematically surveyed. HI in fission yeast affected genes related to signaling and to basic cellular processes, as observed in budding yeast. These results suggest that there are species differences in HI and that the HI that occurs in fission yeast is intermediate to HI in budding yeast and humans.

• 미생물학회지
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• 제54권4호
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• pp.325-329
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• 2018

PCI 영역을 포함하고 있는 Thp1/PCID2 단백질은 mRNA 전사와 방출을 연결하는, 진화적으로 보존된 TREX-2 복합체의 구성요소이다. 분열효모인 Schizosaccharomyces pombe에서 pci2 (SPBC1105.07c) 유전자는 TREX-2 복합체의 구성요소인 Thp1 (출아효모)/PCID2 (사람)의 분열효모 이종상동체로 추정되는 PCI 영역을 갖는 단백질을 암호화하고 있다. pci2 발현을 억제하면 생장과 mRNA 방출이 모두 억제되었다. 그리고 pci2 유전자의 과발현 또한 생장을 늦추고 $poly(A)^+$ RNA를 핵 안에 약간 축적되게 하였다. 뿐만 아니라 Yeast two-hybrid와 공동침전(Co-immunoprecipitation) 분석 실험에서 Pci2는 TREX-2 복합체의 다른 구성요소인 Sac3, Dss1 단백질들과 물리적으로 상호작용하였다. 이와 같은 관찰들은 S. pombe의 Pci2 단백질도 TREX-2 복합체의 구성요소로서 mRNA 방출에 관여함을 의미한다.

• 생명과학회지
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• 제19권12호
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• pp.1685-1689
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• 2009

파이토킬레이트(PC)는 PCS에 의해 생성되는 작은 폴리펩타이드로서 여러 생물에서 발견되고 있다. PC의 역할은 카드뮴과 같은 중금속을 세포질에서 결합하며 이는 액포막에 존재하는 HMT에 의해서 액포 안으로 이동된다. HMT1은 분열효모에서 처음으로 알려졌으며 이후 선충, 초파리 등에서도 발견되었으며 세포 내 역할은 카드뮴 같은 중금속 해독에 관여를 하고 있다. 하지만 액포가 존재하지 않고 PC를 생성하지 않는 초파리에서의 HMT1의 발견은 그 동안 알려진 HMT1의 역할을 재 조명하게 된다. 따라서 PC를 생성하지 못하는 출아효모에 PC를 생성하는 분열효모 유래 SpHMT1을 발현시켜 카드뮴에 대한 저항성을 분석하였다. SpHMT1을 발현하는 출아효모는 카드뮴에 대한 저항성이 현저하게 증가되었고 이는 SpHMT1이 PC가 존재하지 않는 조건에서도 카드뮴에 대한 해독작용을 하는 것을 암시한다. 또한 SpHMT1을 발현하는 출아효모는 GSH에 대한 저항성을 보였고 카드뮴에 대한 저항성도 GHS에 의해서 더 증가되는 결과를 보였다. 이러한 결과는 HMT1이 PC와 결합된 카드뮴을 액포안으로 이동시키는 가능성보다 GSH와 결합된 카드뮴을 액포 안으로 이동시켜 카드뮴에 대한 해독작용을 한다는 것을 암시한다.

• Journal of Microbiology
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• 제42권4호
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• pp.353-356
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• 2004

In a previous study, a gst gene was isolated from the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. This gene was dubbed gstI, and was characterized using the gstI -lacZ fusion plasmid pYSH2000. In this work, four additional fusion plasmids, pYSHSDl, pYSHSD2, pYSHSD3 and pYSHSD4, were constructed, in order to carry (respectively) 770, 551, 358 and 151 bp upstream regions from the translational initiation point. The sequence responsible for induction by aluminum, mercury and hydrogen peroxide was located in the range between -1,088 and -770 bp upstream of the S. pombe gstI gene. The same region was identified to contain the nucleotide sequence responsible for regulation by Papl, and has one puta­tive Papl binding site, TTACGTAT, located in the range between $-954\~-947$ bp upstream of the gstI gene. Negatively acting sequences are located between -1,088 and -151 bp. These findings imply that the Papl protein is involved in basal and inducible transcription of the gstI gene in the fission yeast S. pombe.

• BMB Reports
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• 제43권3호
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• pp.170-175
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• 2010

Chaperone;Glutathione peroxidase;Peroxiredoxin;Schizosaccharomyces pombe;Thioredoxin peroxidase;To investigate the differences in the functional roles of peroxiredoxins (Prxs) and glutathione peroxidase (GPx) of Schizosaccharomyces pombe, we examined the peroxidase and molecular chaperone properties of the recombinant proteins. TPx (thioredoxin peroxidase) exhibited a capacity for peroxide reduction with the thioredoxin system. GPx also showed thioreoxin-dependent peroxidase activity rather than GPx activity. The peroxidase activity of BCP (bacterioferritin comigratory protein) was similar to that of TPx. However, peroxidase activity was not observed for PMP20 (peroxisomal membrane protein 20). TPx, PMP20, and GPx inhibited thermal aggregation of citrate synthase at 43$^{\circ}C$, but BCP failed to inhibit the aggregation. The chaperone activities of PMP20 and GPx were weaker than that of TPx. The peroxidase and chaperone properties of TPx, BCP, and GPx of the fission yeast are similar to those of Saccharomyces cerevisiae. The fission yeast PMP20 without thioredoxin-dependent peroxidase activity may act as a molecular chaperone.

• 미생물학회지
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• 제52권3호
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• pp.383-387
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• 2016

분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 cdc31 유전자는 진화적으로 잘 보존된 $Ca^{2+}$-결합 centrin/CDC31 계열에 속하며 방추극체(spindle pole body)의 한 성분인 단백질을 암호화하고 있다. 이 논문에서는 S. pombe의 Cdc31 단백질이 방추극체뿐만 아니라 TREX-2 복합체의 구성인자로서 mRNA의 핵에서 세포질로의 방출에 영향을 미치는지 알아보았다. cdc31 유전자의 발현을 억제하면 생장 결함을 보였고, $poly(A)^+$ RNA도 핵 안에 축적되는 현상을 보였다. 한편 cdc31 유전자를 과발현시키면, 생장과 mRNA 방출에 결함을 보이진 않았지만 세포의 길이가 길어지는 형태를 보였다. Yeast two-hybrid 분석에서 Cdc31 단백질은 TREX-2 복합체의 또 다른 구성인자인 Sac3 그리고 Pci2와 상호작용을 하였다. 이와 같은 결과들은 S. pombe의 Cdc31 단백질도 역시 TREX-2 복합체의 구성인자로 mRNA 방출에 관여하고 있음을 시사한다.

• 미생물학회지
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• 제53권1호
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• pp.49-54
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• 2017

Sus1 / ENY2는 진핵생물에 잘 보존된 작은 단백질로 염색사 리모델링과 mRNA 생성과정에 관여한다. Sus1 단백질은 전사 보조활성자인 SAGA 복합체와 핵공과 연관된 TREX2 복합체 등, 핵에 존재하는 2개 복합체의 구성 요소이다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 유전체 데이터에서 Sus1의 이종상동체를 찾아 기능을 분석하였다. 4분체 분석 결과 이 유전자는 생장에 필수적이 아니었으나, Sus1 유전자를 결실시키면 낮은 온도에서 생장이 느렸으며, $poly(A)^+$ RNA도 핵 안에 약간 축적되는 표현형을 보였다. 또한 Sus1-GFP 단백질은 주로 핵에 존재하였다. Yeast two-hybrid 분석과 공동면역침전 실험에서 Sus1 단백질은 TREX-2 복합체의 또 다른 구성인자인 Sac3와 상호작용을 하였다. 이와 같은 결과들은 S. pombe의 Sus1 단백질도 역시 TREX-2 복합체의 구성인자로 mRNA 방출에 관여하고 있음을 시사한다.

• Genomics & Informatics
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• 제16권2호
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• pp.22-29
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• 2018

Incorporation of unique barcodes into fission yeast gene deletion collections has enabled the identification of gene functions by growth fitness analysis. For fine tuning, it is important to examine barcode sequences, because mutations arise during strain construction. Out of 8,708 barcodes (4,354 strains) covering 88.5% of all 4,919 open reading frames, 7,734 barcodes (88.8%) were validated as high-fidelity to be inserted at the correct positions by Sanger sequencing. Sequence examination of the 7,734 high-fidelity barcodes revealed that 1,039 barcodes (13.4%) deviated from the original design. In total, 1,284 mutations (mutation rate of 16.6%) exist within the 1,039 mutated barcodes, which is comparable to budding yeast (18%). When the type of mutation was considered, substitutions accounted for 845 mutations (10.9%), deletions accounted for 319 mutations (4.1%), and insertions accounted for 121 mutations (1.6%). Peculiarly, the frequency of substitutions (67.6%) was unexpectedly higher than in budding yeast (~28%) and well above the predicted error of Sanger sequencing (~2%), which might have arisen during the solid-phase oligonucleotide synthesis and PCR amplification of the barcodes during strain construction. When the mutation rate was analyzed by position within 20-mer barcodes using the 1,284 mutations from the 7,734 sequenced barcodes, there was no significant difference between up-tags and down-tags at a given position. The mutation frequency at a given position was similar at most positions, ranging from 0.4% (32/7,734) to 1.1% (82/7,734), except at position 1, which was highest (3.1%), as in budding yeast. Together, well-defined barcode sequences, combined with the next-generation sequencing platform, promise to make the fission yeast gene deletion library a powerful tool for understanding gene function.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2005년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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• pp.97-100
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• 2005