• 생명과학회지
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• 제33권1호
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• pp.8-14
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• 2023

Peroxidasin (PXDN)은 촉매 도메인 외에도 세포외기질 모티프를 포함한 다양한 도메인을 가진 heme peroxidase로서, collagen IV (Col IV)에서 sulfilimine 가교를 형성하여 Col IV의 스캐폴드를 강화한다. 우리는 이전 논문에서 PXDN이 sulfilimine 가교 의존적인 기질 assembly를 통하여 내피세포 생존 및 성장 신호전달에 필요하다고 보고하였다. 이 연구에서는 내피세포에서의 PXDN 기능에 있어 peroxidase 활성의 필요성을 조사하였다. 첫번째로 peroxidase 도메인의 활성 부위에 존재하며 고도로 보존된 Q823과 D826을 각각 W823, E826으로 치환한 돌연변이체를 제작하였다. 이러한 돌연변이 단백질을 높게 발현하는 HEK293 클론을 분리하였고, 이들 세포를 무혈청 배지에서 24시간 배양하여 조건 배지를 확보하여 평가하였다. 조건 배지에 대해 비환원 조건으로 Western blot 분석을 실시하였을 때, 돌연변이 단백질은 삼량체를 형성하는 것으로 관찰되었고, proprotein convertase에 의해 야생형 PXDN처럼 절단되는 것을 확인하였다. 그러나, peroxidase 활성은 돌연변이 PXDN이 포함된 조건 배지에서 야생형 PXDN과는 대조적으로 관찰되지 않았다. 또한, sulfilimine 가교 형성 능력도 돌연변이 PXDN에서 소실되었음이 확인되었다. 이에 더하여, PXDN이 depletion된 내피세포에 돌연변이 PXDN이 포함된 조건배지를 가하였을 때, 야생형 PXDN 조건배지와 달리 증식을 촉진시키지 못함을 관찰하였다. 이러한 결과들은 PXDN의 peroxidase 활성이 sulfilimine 가교를 형성하여 내피세포 성장에 영향을 미침을 제안한다.

• Mycobiology
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• 제34권4호
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• pp.159-165
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• 2006

One of the most economically viable processes for the bioconversion of many lignocellulosic waste is represented by white rot fungi. Phanerochaete chrysosporium is one of the important commercially cultivated fungi which exhibit varying abilities to utilize different lignocellulosic as growth substrate. Examination of the lignocellulolytic enzyme profiles of the two organisms Phanerochaete chrysosporium and Rhizopus stolonifer show this diversity to be reflected in qualitative variation in the major enzymatic determinants (ie cellulase, xylanase, ligninase and etc) required for substrate bioconversion. For example P. chrysosporium which is cultivated on highly lignified substrates such as wood (or) sawdust, produces two extracellular enzymes which have associated with lignin deploymerization. (Mn peroxidase and lignin peroxidase). Conversely Rhizopus stolonifer which prefers high cellulose and low lignin containg substrates produce a family of cellulolytic enzymes including at least cellobiohydrolases and ${\beta}-glucosidases$, but very low level of recognized lignin degrading enzymes.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권6호
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• pp.1190-1195
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• 2004

In recent years, there has been an intensive research on decolorization of dye and textile wastewater by various fungal strains. In this study, the decolorization ability of three commercial dyes, acid yellow 99, acid blue 350, and acid red 114, were investigated using 10 fungal strains. Among the fungal strains tested, Trametes versicolor KCTC 16781 completely decolorized all dyes in both solid and liquid experiments, and was also able to decolorize the mixture of those three dyes in liquid experiments. The secretion of the ligninolytic enzymes into the extracellular medium during decolorization by T versicolor KCTC 16781 was also studied. No lignin peroxidase activity was detected, and manganese peroxidase and laccase activities were investigated.

• Journal of Microbiology
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• 제43권6호
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• pp.503-509
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• 2005

The production of manganese peroxidase (MnP) by Irpex lacteus, purified to electrophoretic homogeneity by acetone precipitation, HiPrep Q and HiPrep Sephacryl S-200 chromatography, was shown to correlate with the decolorization of textile industry wastewater. The MnP was purified 11.0-fold, with an overall yield of $24.3\%$. The molecular mass of the native enzyme, as determined by gel filtration chromatography, was about 53 kDa. The enzyme was shown to have a molecular mass of 53.2 and 38.3 kDa on SDS-PAGE and MALDI-TOF mass spectrometry, respectively, and an isoelectric point of about 3.7. The enzyme was optimally active at pH 6.0 and between 30 and $40^{\circ}C$. The enzyme efficiently catalyzed the decolorization of various artificial dyes and oxidized Mn (II) to Mn (III) in the presence of $H_2O_2$. The absorption spectrum of the enzyme exhibited maxima at 407, 500, and 640 nm. The amino acid sequence of the three tryptic peptides was analyzed by ESI Q- TOF MS/MS spectrometry, and showed low similarity to those of the extracellular peroxidases of other white-rot basidiomycetes.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제28권1호
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• pp.59-61
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• 2000

The various extracellular enzymes produced by lactic acid bacteria isolated from kimchi were assayed to improve the shelf-life of kimchi. Peroxidase was not detected in all tested lactic acid bacteria and small amount of ascorbic acid oxidase was detected in Pediococcus pentosaceus and Lactobacillus brevis. In case of $\alpha$-amylase, 27.8 and 20.9 unit/mg were shown in Pediococcus acidilactici and Pediococcus pentosaceus, respectively but $\beta$-amylase and protease activities were very low. The enzyme related to textural property of kimchi, pectinesterase showed low activity but polygalacturonase activity was 0.28 unit/mg in Lactobacillus homohiochii and 0.27 unit/mg in Lactobacillus plantarum.

• Journal of Microbiology
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• 제34권1호
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• pp.101-104
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• 1996

The influences of culture parameters on the decolorization of anthron-type dye, Remazol brilliant blue R(RBBR) by Pleurotus ostreatus were studied in defined media. In the decolorization, 1-10 mM nutrient nitrogen and 40 mM glucose were effective whereas agitation and Tween 80 were not suitable. The decolorization occurred and the activity of extracellular peroxidase was detected during the stationary phase.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제48권4호
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• pp.463-470
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• 2020

삼림지역의 고목에서 분리한 JS18 균주는 합성 멜라닌을 탈색하는 세포 외 분비효소를 생산했다. JS18 균주의 internal transcribed spacer (ITS) 염기서열을 분석하고 계통학적으로 확인한 결과 본 균주는 Trametes velutina로 동정되었다. JS18 균주는 laccase 활성을 나타냈지만 manganese peroxidase 및 lignin peroxidase 활성은 나타내지 않았다. 본 균주를 회분배양한 결과 멜라닌 탈색 활성은 laccase 활성으로부터 유래하는 것으로 확인되었다. Laccase 유도인자로써 Syringic acid 및 CuSO4를 첨가하고 25℃에서 7일간 배양한 결과 배양상등액에서 98 U/ml의 laccase 활성을 나타내었다. GYP 배지에서 배양한 T. velutina의 배양상등액에서 ammonium sulfate 침전, Hi-trap Q Sepharose 컬럼 및 gel filtration을 이용하여 효소를 정제하였고, SDS-PAGE에서 약 67 kDa의 분자량을 나타내었다. 정제된 효소의 멜라닌 탈색율은 효소 단독으로는 24 시간 만에 단지 4% 만을 나타내는 반면, HBT의 존재 하에서는 80%로 향상되었다. 또한 1.5 mM HBT의 농도에서는 최대 81%의 멜라닌 탈색율을 나타내었다. 본 효소의 멜라닌 탈색에 대한 최적 pH 및 온도는 각각 5.0와 37℃를 나타내었다. 본 연구에서는 T. velutina JS18 유래 laccase가 촉매하는 멜라닌 탈색 반응에서 redox mediator로써 HBT의 적용 가능성을 확인하였다.

• 미생물학회지
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• 제42권1호
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• pp.34-39
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• 2006

목재부후균은 리그닌 분해효소로 lignin peroxidase (LIP), Mn-peroxidase (MNP) 및 laccase를 생성하는데 균류에 따라 위의 효소중 하나 혹은 둘 이상의 효소를 분비하거나 전혀 생성하지 않는 균도 있다. 본 실험은 이러한 목재 부후균의 효소생성 양상과 몇 종의 염료화합물 탈색과의 상관관계를 조사하고자 하였다. 조사한 23종 36균주 중 MNP 생성균은 30균주였으며 LIP 혹은 laccase 생성균은 각각 11균주와 12균주였다. 또한 같은 종에서도 효소활성은 다양한 양상을 보여 주었다. 리그닌 분해효소 활성과 비교하여 염료 탈색 정도는 세 효소가 모두 분비되는 백색 부후균의 경우 염료 탈색율이 상대적으로 우수하였고 균주에 따라 차이가 있으나 MNP 활성만을 갖는 균주의 경우, poly R-478 polymeric dye 및 anthron-type dye 인 remazol brilliant blue R염료는 효소 활성도와 다소 유연관계를 보였으며 methylene blue, bromophenol blue및 congo red 염료는 위의 효소들과는 직접적인 관련이 없는 것으로 판단되었으며, 오히려 균사의 생장과 비례하여 탈색율을 나타냈다. LIP, MNP 및 laccase 효소활성이 거의 검출되지 않은 갈색 부후균에서는 bromophenol blue를 제외하고는 염료의 탈색이 10%미만 혹은 전혀 탈색이 되지 앓았다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제34권3호
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• pp.213-221
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• 2007

분리된 무 자엽 조직에 산화질소 (nitric oxide: NO) 공여체인 sodium nitroprusside (SNP) 처리 시 농도 의존방식으로 부정근의 발달을 증진시켰다. 그러나 이러한 NO 증진 효과는 세포외 칼슘 chelator인 0.5 mM EGTA 또는 세포막 칼슘채널 차단제인 0.1 mM $LaCl_3$를 각각 $50\;{\mu}M$ SNP와 함께 혼합처리 시 반전되었다. 또한, 뿌리 발생에서 중심적 역할을 수행하는 것으로 알려진 guaiacol peroxidase (GPX)와 syringaldazine peroxidase (SPX)의 활성도가 SNP 단독 처리된 자엽에서 부정근이 형성되는 동안 현저히 증가하였다. 그러나, SNP와 $LaCl_3$ 혼합처리 시 SNP에 의해 유도된 GPX와 SPX 활성도 증가가 거의 증류수 대조구 수준으로 억제되었다. calmodulin의 anatagonist인 trifuoperazine 역시 SNP로 처리된 자엽에서 부정근 형성을 억제하여 발생된 뿌리의 개수와 길이를 감소시켰으며 동시에 GPX와 SPX를 불활성화 하였다. 결론적으로, 이들 결과는 칼슘이 GPX와 SPX 활성도 조절을 통해 부정근 유도를 이끄는 NO 반응에 포함되어 있음을 나타내는 것이다.

• 통합자연과학논문집
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• 제12권4호
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• pp.142-146
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• 2019

Peroxidasin is a unique member of peroxidase family in that it has extracellular matrix (ECM) motif as well as peroxidase activity. Peroxidasins are involved in consolidation the extracellular matrix during development and in innate immune defense. C. elegans has two functional peroxidasins, PXN-1 and PXN-2, and PXN-2 is known to contribute to innate immune system. However, it is not clear of PXN-1 function in innate immune system. Therefore, this study is focused on the function of PXN-1 and the relationship between PXN-1 and PXN-2 in innate defense system in C. elegans. When pxn-1 was knocked down by RNAi, the worm turned to be more resistant to pathogens, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa and the enhanced resistance was abolished in pxn-1pxn-2 double knock down. By contrast, pxn-2 knock down showed stronger susceptibility to the pathogens. These results suggest that pxn-2 can contribute the pathogen resistance and pxn-1 can suppress the pathogen resistance. To confirm the idea, overexpression experiments were performed. Overexpression of pxn-1 showed more susceptible to pathogens compared to the control and double overexpression of pxn-1pxn-2 overcame the susceptibility of pxn-1 overexpression to the pathogens. On the other hand, pxn-2 overexpression made the worm more resistant to the pathogens and the resistance was maintained in pxn-1pxn-2 double overexpression. The comparison of the susceptibilities to the bacterial pathogens in above mentioned constructs suggests that PXN-1 suppress the function of PXN-2 in defense against bacterial pathogens in Caenorhabditis elegans.