• 제목/요약/키워드: evolutionary relationship

검색결과 120건 처리시간 0.035초

An Intrusion Detection Method Based on Changes of Antibody Concentration in Immune Response

  • Zhang, Ruirui;Xiao, Xin
    • Journal of Information Processing Systems
    • /
    • 제15권1호
    • /
    • pp.137-150
    • /
    • 2019
  • Although the research of immune-based anomaly detection technology has made some progress, there are still some defects which have not been solved, such as the loophole problem which leads to low detection rate and high false alarm rate, the exponential relationship between training cost of mature detectors and size of self-antigens. This paper proposed an intrusion detection method based on changes of antibody concentration in immune response to improve and solve existing problems of immune based anomaly detection technology. The method introduces blood relative and blood family to classify antibodies and antigens and simulate correlations between antibodies and antigens. Then, the method establishes dynamic evolution models of antigens and antibodies in intrusion detection. In addition, the method determines concentration changes of antibodies in the immune system drawing the experience of cloud model, and divides the risk levels to guide immune responses. Experimental results show that the method has better detection performance and adaptability than traditional methods.

Revised Geology and Geological Structures of the Northeastern Chungnam Basin in the Southwestern Korean Peninsula

  • Yujung Kwak;Seung-Ik Park;Jeong-Yeong Park;Taejin Choi;Eun Hye Jeong
    • 자원환경지질
    • /
    • 제55권6호
    • /
    • pp.597-616
    • /
    • 2022
  • The Chungnam basin is a crucial area for studying the Mesozoic crustal evolutionary history of the Korean Peninsula. This study reports the revised geology and new isotopic ages from the northeastern Chungnam Basin based on detailed geological mapping and LA-ICP-MS zircon U-Pb analysis. Our renewed geologic map defines intra-basin, basin-bounding, and basement fault systems closely related to hydrothermal gold-bearing quartz vein injections. Here, we propose the directions of (micro)structural and geochronological future work to address issues on the relationship between the tectonic process, basin evolution, and hydrothermal fluid migration in the southwestern Korean Peninsula.

Understanding high-mass star formation through KaVA observations of water and methanol masers

  • Kim, Kee-Tae;Hirota, Tomoya
    • 천문학회보
    • /
    • 제44권2호
    • /
    • pp.51.4-51.4
    • /
    • 2019
  • We started a systematic observational study of the 22 GHz water and 44 GHz class I methanol masers in 87 high-mass young stellar objects (HM-YSOs) as a KaVA large program (LP). The primary goal is to understand dynamical evolution of HM-YSOs and their circumstellar structures by measuring spatial distributions and 3-dimensional velocity fields of multiple maser species. In the first-year observations (2016-2017), we made snap-shot imaging surveys of 25 water and 19 methanol maser sources. In the second-year observations (2018-2019), we have carried out monitoring observations of 19 water and 3 methanol maser sources that were selected on the basis of the first-year survey results. By combining follow-up observations with VERA (distances), JVN/EAVN (6.7 GHz methanol masers), and ALMA cycles 3 and 6 (thermal lines/continuum), we will provide novel information on physical properties (density, temperature, size, mass), 3D dynamical structures of disk/jet/outflow/infalling envelope, and relationship between evolutionary of HM-YSOs. In this presentation, we will report the current status and future plans of our KaVA large program.

  • PDF

Listeria monocytogenes Serovar 4a is a Possible Evolutionary Intermediate Between L. monocytogenes Serovars 1/2a and 4b and L. innocua

  • Chen, Jianshun;Jiang, Lingli;Chen, Xueyan;Luo, Xiaokai;Chen, Yang;Yu, Ying;Tian, Guoming;Liu, Dongyou;Fang, Weihuan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제19권3호
    • /
    • pp.238-249
    • /
    • 2009
  • The genus Listeria consists of six closely related species and forms three phylogenetic groups: L. monocytogenes-L. innocua, L. ivanovii-L. seeligeri-L. welshimeri, and L. grayi. In this report, we attempted to examine the evolutionary relationship in the L. monocytogenes-L. innocua group by probing the nucleotide sequences of 23S rRNA and 16S rRNA, and the gene clusters lmo0029-lmo0042, ascB-dapE, rplS-infC, and prs-ldh in L. monocytogenes serovars 1/2a, 4a, and 4b, and L. innocua. Additionally, we assessed the status of L. monocytogenes-specific inlA and inlB genes and 10 L. innocua-specific genes in these species/serovars, together with phenotypic characterization by using in vivo and in vitro procedures. The results indicate that L. monocytogenes serovar 4a strains are genetically similar to L. innocua in the lmo0035-lmo0042, ascB-dapE, and rplS-infC regions and also possess L. innocua-specific genes lin0372 and lin1073. Furthermore, both L. monocytogenes serovar 4a and L. innocua exhibit impaired intercellular spread ability and negligible pathogenicity in mouse model. On the other hand, despite resembling L. monocytogenes serovars 1/2a and 4b in having a nearly identical virulence gene cluster, and inlA and inlB genes, these serovar 4a strains differ from serovars 1/2a and 4b by harboring notably altered actA and plcB genes, displaying strong phospholipase activity and subdued in vivo and in vitro virulence. Thus, by possessing many genes common to L. monocytogenes serovars 1/2a and 4b, and sharing many similar gene deletions with L. innocua, L. monocytogenes serovar 4a represents a possible evolutionary intermediate between L. monocytogenes serovars 1/2a and 4b and L. innocua.

한국 고유종인 자가사리(Liobagrus mediadiposalis) 지역개체군의 분자진화적 유연관계 (Evolutionary Relationship of Liobagrus mediadiposalis (Teleostei: Amblycipitidae) Populations in Korea Inferred from Cytochrome b DNA Sequences)

  • 김맹진;한송헌;양혜영;조미란;정상철;송춘복
    • 한국어류학회지
    • /
    • 제18권4호
    • /
    • pp.329-338
    • /
    • 2006
  • 자가사리 지역개체군의 분자계통 진화적 유연관계를 알아보기 위하여 미토콘드리아 cytochrome b 유전자 서열을 이용하여 분석하였다. 그 결과, 우리나라 자가사리 개체군은 크게 3개의 집단으로 구분되었다. 즉 조상형 자가사리 개체군에서 먼저 낙동강 집단(금호강, 덕천강, 경호강 개체군)이 분화되었으며 그 후 섬진강 집단(동진강, 섬진강, 영산강, 거금도 개체군)과 금강 집단으로 분화되었을 것으로 추정할 수 있었다. 그리고 자가사리 개체군 집단 사이의 염기서열 차이는 금강집단과 섬진강집단 사이의 50~53 bp (4.4~4.7%)에 비해서 금강 집단과 낙동강 집단 사이의 차이는 63~65 bp (5.5~5.7%), 그리고 낙동강 집단과 섬진강 집단 사이에서 58~63 bp (5.1~5.5%)를 나타내어서 금강 집단과 낙동강 집단 사이에서 가장 유전적인 차이가 높은 것으로 나타났다. 이러한 개체군 집단의 분화양상과 유전적인 다형은 수계 형성과 같은 지리적 변화 때문에 생기는 오랫동안의 유전적 격리에 의한 것으로 분화시기 추정결과 이들 개체군 집단들의 격리 시기는 적어도 빙하기 이전으로 거슬러 올라가는 것으로 생각된다.

유전 프로그래밍을 활용한 제조 빅데이터 분석 방법 연구 (Genetic Programming based Manufacutring Big Data Analytics)

  • 오상헌;안창욱
    • 스마트미디어저널
    • /
    • 제9권3호
    • /
    • pp.31-40
    • /
    • 2020
  • 현재 제조 분야 빅데이터 분석을 위하여 black-box 기반 기계 학습 알고리즘을 활용하고 있다. 해당 알고리즘은 높은 분석 정합성 가지는 장점이 있지만, 분석 결과에 대한 해석이 어렵다는 단점이 있다. 그러나 제조업에서는 분석 알고리즘은 제조 공정 원리 기반 해석을 통하여 결과의 근거 및 도출 타당성에 대한 검증이 중요하다. 이러한 기계 학습 알고리즘의 결과 설명력 한계를 극복하기 위하여 유전 프로그래밍을 활용한 제조 빅데이터 분석 방법을 제안한다. 본 알고리즘은 생물학적 진화유전 프로그래밍 알고리즘은 생물학적 진화를 모방한 진화 연산 (선택, 교배, 돌연변이) 반복하면서 최적의 해를 찾아간다. 그리고 해는 수학적 기호를 활용하여 변수 간의 관계로 나타나며, 가장 높은 설명력을 가지는 해가 최종적으로 선택된다. 이를 통하여 입력 및 출력 변수 관계 수식화를 통한 결과를 도출하므로 직관적인 제조 매카니즘에 대한 해석이 가능하며 또한 수식으로 나타낸 변수간의 관계 기반으로 기존 해석이 불가한 제조 원리 도출도 가능하다. 제안 기법은 대표적인 기계 학습 알고리즘과 성능을 비교 분석 결과 동등 또는 우수한 성능을 보였다. 향후 해당 기법을 통하여 다양한 제조 분야 활용 가능성을 검증하였다.

인구 집단의 스케일의 확장이 집단 비율 및 집단 크기 지각에 미치는 영향: 다수편향적 사회적 정보 활용을 중심으로 (On the Effect of Extended Human Group Scale in Perception of Group Ratio and Size at Majority-biased Social Learning)

  • 장재경 ;장대익
    • 인지과학
    • /
    • 제34권1호
    • /
    • pp.39-66
    • /
    • 2023
  • 뉴미디어는 사회적 교류의 장을 인터넷으로 옮겨와 대규모 집단이 시공간의 한계를 뛰어넘어 한 곳에서 소통할 수 있게 만들었다. 최근 연구는 인간의 사회적 능력이 소셜 미디어를 통해 경험하는 확장된 집단 스케일을 따라가지 못하는 사례를 보고하기도 한다. 이러한 맥락에서, 본 연구는 인간의 사회적 정보 지각이 인구 집단 스케일의 확장에 영향을 받는지 다수편향 맥락에서 확인하였다. 인터넷 기반 과제를 통해 구성원의 수로 나타낸 집단 크기와 전체에서 특정 집단이 차지하는 집단 비율이 개인에게 지각되고 다수편향적 사회적 정보 활용에 영향을 주는 심리적 과정을 조사하였으며, 전체 집단 스케일의 확장에 각 과정이 영향을 받는지 살펴보았다. 집단 비율은 다수편향에 정적 영향을 주고 있으며, 그 관계는 비율 지각에 의해 부분매개 되었다. 전체 집단 스케일은 집단 비율과 비율 지각의 관계를 조절하지 않았다. 반면, 집단 크기와 다수편향의 상관은 유의하지 않았다. 전체 집단 스케일은 집단 크기 지각을 조절하였다. 전체 집단 스케일이 작은 조건에서 집단 크기와 크기 지각은 양적 상관을 나타냈지만, 전체 집단의 스케일이 확장된 조건에서 지각된 집단 크기는 유의미하게 작아졌고, 두 변수는 상관을 잃었다. 이러한 결과를 통해 집단 크기 지각과 관련된 심리 기제가 전체 집단 스케일의 확장에 제대로 반응하지 못하고 있음을 확인하였다. 나아가 집단 크기 정보를 처리하는 전문화된 심리 기제가 존재할 가능성과 다수편향이 특이적으로 받아들이는 자극의 형태를 진화심리적 관점에서 논하였다.

미토콘드리아 COI 유전자 서열의 다형성과 반수체형에 근거한 한국산 붉바리(Epinephelus akaara)의 유전적 구조와 계통 유연관계 (Genetic Structure and Phylogenetic Relationship of Red Spotted Grouper (Epinephelus akaara) Based on the Haplotypes and Polymorphisms of Mitochondrial COI Gene Sequences)

  • 한상현;이영돈;백혜자;오홍식;노충환
    • 생명과학회지
    • /
    • 제24권6호
    • /
    • pp.626-632
    • /
    • 2014
  • 한국산 붉바리 집단에서 유전적 구조와 계통 유연관계를 mtDNA COI 유전자 서열의 다형성을 이용하여 조사하였다. COI 유전자 서열을 결정하였고 기존에 보고된 서열들과 비교하였다. 본 연구를 통해 결정된 COI 서열들은 기존에 보고된 EF607565에 대하여 99.1-99.8%의 동일성을 나타내었다. 전체 20가지의 haplotype들이 발견되었고, 한국산 붉바리 집단은 19가지의 haplotype을 나타내었다. 이들 중 Hap_03과 Hap_08은 각각 제주도와 중국-특이적인 COI 서열들을 보였다. 반면, Hap_07은 한국에서 채집된 시료들과 홍콩과 대만에서 보고된 기록 등 여러 COI 서열들을 포함하였다. COI haplotype들의 다형성에 근거한 계통 유전학적 분석을 통해 작성된 NJ tree는 Epinephelus 속 내에서 단계통적인 분지양상을 나타내었고, 이는 붉바리 집단들이 공통의 모계 선조에서 진화한 것임을 나타내었다. 또한 중국해에서 보고된 COI 서열만을 포함하였던 Hap_08은 NJ tree의 중앙부에서 위치하였고, Hap_07의 서열들과도 근연의 관계임을 보여주었다. 이 결과는 중국산 붉바리 역시 동아시아의 다른 집단들과 모계적으로 연관되어있음을 보여주었다. 결과적으로, 동아시아 붉바리 집단들은 모계적으로 연관되어있을 뿐만 아니라 공통의 진화 역사를 공유하고 있으며 여전히 동아시아 해류(Kuroshio 해류)에 의해 영향을 받는 집단이라고 할 수 있다. 본 연구는 붉바리의 유전적 구조와 계통 유연관계를 이해하는 데 도움을 줄 수 있으며, 인공증식과 산업화에 관련된 연구에 있어 중요한 역할을 담당할 것으로 기대된다.

Molecular Phylogeny and Divergence Time Estimation of the Soft Coral Dendronephthya gigantea (Alcyonacea: Nephtheidae)

  • Kim, Boa;Kong, So-Ra;Song, Jun-Im;Won, Yong-Jin
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
    • /
    • 제24권3호
    • /
    • pp.327-332
    • /
    • 2008
  • Soft coral Dendronephthya gigantea (Verrill, 1864) is a conspicuous species dominating shallow sea waters of Jejudo Island, Korea. Recently its whole mitochondrial genome sequencing was completed by us and the sequence information provided an opportunity to test the age of Octocorallia and time of evolutionary separation between some representative orders of the subclass Octocorallia. Molecular phylogenetic analyses based on 13 mitochondrial protein encoding genes revealed a polyphyletic relationship among octocorallians representing two orders (Alcyonacea and Gorgonacea) and four families (Alcyoniidae, Nephtheidae, Briareidae, and Gorgoniidae). Estimates of divergence times among octocorallians indicate that the first splitting might occur around end of or after Cretaceous period (50-79 million years ago (Ma)). The age is relatively young compared to the long history of stony sea corals (>240 Ma). Taken together our result suggests a possible relatively recent radiating evolution at least in the order Alcyonacea and Gorgonacea. Molecular dating and phylogenetic analysis based on much broader taxon sampling and many genes might give an insight into this interesting hypothesis.

Characterization of the Plasmid-Encoded Arsenic Salts Resistance Determinant from Klebsiella oxytoca D12

  • Rhie, Ho-Gun;Lee, Sung-Jae;Lee, Ho-Sa
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제14권3호
    • /
    • pp.593-598
    • /
    • 2004
  • The arsenical resistance (ars) operon was cloned from a 67-kilobase pair (kb) plasmid, which was previously shown to be responsible for arsenic salts resistance in K. oxytoca D12. When plasmid pAE48, carrying the ars operon, was transformed into E. coli, transformed cells displayed enhanced survival in the presence of 4 mM arsenite, 50 mM arsenate, or 0.4 mM antimonite. The nucleotide sequence of the 5.6-kb fragment encoding arsenical resistance revealed five open reading frames (ORFs), which were predicted to encode polypeptides of 12.8 (arsR), 13.4 (arsD), 62.6 (arsA), 45 (arsB), and 16.7 (arse) kilodaltons (kDa). Each ORF was preceded by a ribosome binding site. A putative promoter-like sequence was identified upstream of arsR, and a possible termination site was found downstream of arsC. When the deduced amino acid sequences of the K. oxytoca Dl2 Ars proteins were compared with the amino acid sequences of the E. coli R773 Ars proteins, a significant amino acid similarity was observed (87.9% for ArsR, 89.2% for ArsD, 83.2% for ArsA, 92.6% for ArsB, and 91.3% for ArsC), suggesting an evolutionary relationship of the ars genes of E. coli plasmid R773 and K. oxytoca Dl2.