• 제목/요약/키워드: drug embedding

검색결과 10건 처리시간 0.021초

약물 정보 문서 임베딩을 이용한 딥러닝 기반 약물 간 상호작용 예측 (Prediction of Drug-Drug Interaction Based on Deep Learning Using Drug Information Document Embedding)

  • 정선우;유선용
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국정보통신학회 2022년도 춘계학술대회
    • /
    • pp.276-278
    • /
    • 2022
  • 모든 약물은 신체 내에서 특정한 작용을 하며, 많은 경우 합병증 또는 기존 약물치료 중 새롭게 발생하는 증상에 의해 약물이 혼용되는 경우가 발생한다. 이런 경우 신체 내에서 예상치 못한 상호작용이 발생할 수 있다. 따라서 약물 간 상호작용을 예측하는 것은 안전한 약물 사용을 위해 매우 중요한 과제이다. 본 연구에서는 다중 약물 사용 시 발생 가능한 약물 간 상호작용 예측을 위해 약물 정보 문서를 이용해 학습시키는 딥러닝 기반의 예측 모델을 제안한다. 약물 정보 문서는 DrugBank 데이터를 이용해 약물의 작용 기전, 독성, 표적 등 여러 속성을 결합해 생성되었으며, 두 약물 문서가 한 쌍으로 묶여 딥러닝 기반 예측 모델에 입력으로 사용되고 해당 모델은 두 약물 간 상호작용을 출력한다. 해당 연구는 임베딩 방법이나 데이터 전처리 방법 등 다양한 조건의 변화에 따른 실험 결과의 차이를 분석하여 차후 새로운 약물쌍 간 상호작용을 예측하는 데에 활용이 가능하다.

  • PDF

바이오용 압전디스크방식 마이크로 펌프 설계 및 제작 (II) -임베드방식의 압전모듈의 최적설계 및 제작- (Design and Fabrication of PZT Disc Actuated Micro Pump for Bio-Applications (II): Optimal Design & Fabrication of Embedding-type PZT Module)

  • 김형진;장인배;서영호;김병희
    • 한국생산제조학회지
    • /
    • 제21권3호
    • /
    • pp.362-367
    • /
    • 2012
  • Though a micro pump is a crucial element in miniaturized bio-fluidic systems or drug delivery systems, most of the conventional micro pumps still have some limitations to miniaturize their controller system and to obtain the sufficient back pressure which can rise over the inner pressure of human body or experimental animals. In this paper, to overcome these limitation, a new PZT disc and its controller were designed and fabricated to get the sufficient flowrate and the back pressure with guaranteeing embeddability of the controller into pumping body. The amplitudes of the disc deflections were as large as 40 ${\mu}m$ at 200 V - 100 Hz condition. As results of experiments, the flow rate and the back pressure increase when the frequency increases. The obtainable maximum flow rate and back pressure are 5.2 ml/min at 95 Hz and 13.14 kPa at 90 Hz respectively.

우수 의약품 제조 기준 위반 패턴 인식을 위한 연관규칙과 텍스트 마이닝 기반 t-SNE분석 (Violation Pattern Analysis for Good Manufacturing Practice for Medicine using t-SNE Based on Association Rule and Text Mining)

  • 이준오;손소영
    • 품질경영학회지
    • /
    • 제50권4호
    • /
    • pp.717-734
    • /
    • 2022
  • Purpose: The purpose of this study is to effectively detect violations that occur simultaneously against Good Manufacturing Practice, which were concealed by drug manufacturers. Methods: In this study, we present an analysis framework for analyzing regulatory violation patterns using Association Rule Mining (ARM), Text Mining, and t-distributed Stochastic Neighbor Embedding (t-SNE) to increase the effectiveness of on-site inspection. Results: A number of simultaneous violation patterns was discovered by applying Association Rule Mining to FDA's inspection data collected from October 2008 to February 2022. Among them there were 'concurrent violation patterns' derived from similar regulatory ranges of two or more regulations. These patterns do not help to predict violations that simultaneously appear but belong to different regulations. Those unnecessary patterns were excluded by applying t-SNE based on text-mining. Conclusion: Our proposed approach enables the recognition of simultaneous violation patterns during the on-site inspection. It is expected to decrease the detection time by increasing the likelihood of finding intentionally concealed violations.

주름 개선을 위한 한.양방의 치료 동향 및 절개침을 사용한 잔주름 치료법 소개 (Eastern and Western Treatments for Improving Wrinkles and Treatment of Fine Wrinkles with Subcision)

  • 조승필;이광호
    • Journal of Acupuncture Research
    • /
    • 제29권2호
    • /
    • pp.29-36
    • /
    • 2012
  • The purpose of this article is to review all the wrinkle treatments reported so far, and to introduce a method of dermal subcision, especially localized fine wrinkles. In order to remove wrinkles, laser, ulthera and drug therapy are commonly used in western medicine while Miso facial rejuvenation acupuncture, $Jung-An$ acupuncture and needle-embedding therapy are used in oriental medicine. However, as researches on fine wrinkles have been insufficiently conducted until now. Dermal subcision stated in this study is considered to be a safe and effective way to ameliorate fine linear-shaped wrinkles around or below eyes and mouth by increasing the circulation of qi and blood. also, reproducing dermal layer. More and further related cases and researches are expected in the future.

리팜피신 마이크로펠렛의 제조에 관한 연구 (Preparation and In-Vitro Evaluation of Gelatin Micropellets Containing Rifampicin)

  • 김기만;김현수;김승인;김영일
    • Journal of Pharmaceutical Investigation
    • /
    • 제18권1호
    • /
    • pp.23-30
    • /
    • 1988
  • The sustained-release micropellets containing rifampicin were prepared by spray congealing micropelleting technique using gelatin as the embedding matrix, and hardened by treating with the formalin-isopropanol mixture. Dissolution of rifampicin from micropellets was significantly retarded, and greatly dependent on formalin concentration, hardening time and pH of the dissolution medium. It was found that this prolongation was more distinguished in pH 1.2 dissolution medium rather than pH 7.4, which might be attributed to the swelling characteristics of gelatin used in the dissolution medium. In-vitro dissolution kinetics indicated that the drug release followed the first-order process.

  • PDF

약물-표적 단백질 연관관계 예측모델을 위한 쌍 기반 뉴럴네트워크 (Pairwise Neural Networks for Predicting Compound-Protein Interaction)

  • 이문환;김응희;김홍기
    • 인지과학
    • /
    • 제28권4호
    • /
    • pp.299-314
    • /
    • 2017
  • In-silico 기반의 약물-표적 단백질 연관관계 예측은 신약 탐색 단계에서 매우 중요하다. 그러나 기존의 예측모델은 입력 값이 고정적이며 표적 단백질의 특질 값이 가공된 데이터로 한정됨으로써 예측 모델의 확장성과 유연성이 부족하다. 본 논문에서는 약물-표적 단백질 연관관계를 예측하는 확장 가능한 형태의 머신러닝 모델을 소개한다. 확장 가능한 머신러닝 모델의 핵심 아이디어는 쌍기반의 뉴럴 네트워크로써, 약물과 단백질의 미가공 데이터를 사용하여 특질을 추출하고 특질 값을 각각의 뉴럴 네트워크 레이어에 입력한다. 이 방법은 추가적인 지식없이 자동적으로 약물과 단백질의 특질을 추출한다. 또한 쌍기반 레이어는 특질 값을 풍부한 저차원의 벡터로 향상 시킴으로써 입력 값의 차이로 인한 편향 학습을 방지한다. PubChem BioAssay(PCBA) 데이터 셋에 기반한 5-폴드 교차 검증법을 통하여 제안한 모델의 성능을 평가했으며, 이전의 모델보다 우월한 성능을 보였다.

개에서 요도를 포매한 평활근육종의 수술적 처치 및 예후 (Prognosis and Surgical Treatment of the Urethra Embedding Leiomyosarcoma in a Dog)

  • 김지현;이준암;김일화;장동우;강현구
    • 한국임상수의학회지
    • /
    • 제31권4호
    • /
    • pp.307-312
    • /
    • 2014
  • 충북대학교 동물의료센터에 16년령 암컷 시츄견이 복부팽만과 배뇨, 배변곤란을 주증으로 내원하였다. 신체검사 시 복부에서 10 cm 가량의 종양이 촉진되었으며 방사선 상에서 확인되었고, 방광은 종양에 의해 배꼽 쪽으로 변위되어 있었다. 초음파 상에서 종양은 불균질한 실질과 국소적으로 무에코성 영역을 가지고 있었다. 혈액검사 소견상 혈소판증가증과 약한 호중구증가증이 나타났으며, 혈액화학치 검사 결과 ALP 상승을 확인할 수 있었다. 개복술을 시행하여 자궁경과 방광 사이의 $10.5{\times}9.6cm$ 크기의 단단한 종양이 요도를 포매하고 있는 것을 확인하고 주위조직과 둔성분리 후 절제하였다. 조직병리학적 검사와 면역화학 적 검사 결과 종양은 평활근육종으로 진단되었다. 수술 후 일주일 뒤 배뇨곤란을 주증으로 재 내원하였다. 배뇨곤란의 원인을 찾기 위하여 요도조영술을 실시하였으나 물리적인 폐색 등 특별한 원인을 찾을 수 없었다. 방광근과 방광조임근에 작용하는 몇몇 약물요법 등을 시행하였지만 반응이 없어 중장기의 보존요법이 지시되었으며 배뇨곤란 증상은 술 후 27일차에 갑작스럽게 호전되어 환자는 원활한 배뇨를 하게 되었다. 본 증례는 요도를 포매하고 있는 복강 내 종양의 수술 후 예후와 배뇨곤란과 같은 후유증을 나타낼 수 있음을 시사하고 있다.

의생명과학 기반 기학습된 워드 임베딩을 이용한 의생명과학 논문 속의 돌연변이-약물 관계 추출 연구 (Research on Identifying Mutation-Drug Relationship in Biomedical Literature Using Biomedical Context based pre-trained word embedding)

  • 김호준;원성연;강승우;이규범;김병건;김선규;강재우
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국정보처리학회 2017년도 춘계학술발표대회
    • /
    • pp.774-777
    • /
    • 2017
  • 의생명과학분야가 계속 발전됨에 따라 매일 평균 3천여 편에 달하는 방대한 양의 의생명과학분야 문헌들이 나오고 있다. 많은 연구가 진행될수록, 새로이 규명된 관계를 습득하고 체계화하는 일이 연구자와 의료계 종사자들에게 더 중요해지고 있다. 하지만 현재로서는 의생명과학분야에 어느 정도의 지식이 있는 사람이 직접 논문을 읽고 해당 논문에서 밝히고 있는 정보를 정리해야만 하는 상황이며, 이로는 기하급수적으로 쌓이는 정보의 양을 대처하기 어렵다. 이를 해결하기 위해 본 논문에서는 기계 학습을 통한 생명의료 객체관계 자동추출 연구를 이용하여 의생명과학분야의 정보를 체계화 하고자 한다. 본 논문에서는 돌연변이와 약물이 함께 등장하는 논문을 뽑아내어 글을 자연어 문장 단위로 나누었다. 추출한 돌연변이와 약물 간의 관계를 직접 사람에 의해 참거짓을 판명하였고, 해당 데이터셋을 기계학습에 이용하여 돌연변이와 약물 간의 관계를 학습시켰다. 최종적으로 GoogleNews의 기사들로 기학습된 워드임베딩, 의생명과학분야 문헌들을 이용하여 기학습된 워드임베딩을 이용하여 학습의 성능을 비교하였고, 의생명과학-문맥 특이적인 워드임베딩이 갖는 강점을 보고한다. 해당 연구를 통해 실제로 논문을 읽지 않고도 의생명과학분야 논문의 핵심적인 내용을 뽑아내는 자동화 시스템을 구축하는 데에 이바지하고, 의생명공학 연구자들의 연구에 핵심적인 도움이 되는 디딤돌이 되고자 한다.

장기간 알콜투여가 생쥐 비장의 세포성 면역 저해에 미치는 면역조직화학적 연구 : T 림프구, IL-2 수용기 및 NK세포의 변화를 중심으로 (Imunohistochemical study on the inhibition of cell mediated immunity in spleen of mouse by chronic alcohol administration : Based on the change of T lymphocytes, IL-2 receptors, and NK cells)

  • 김진택;박인식;안상현
    • 동국한의학연구소논문집
    • /
    • 제5권
    • /
    • pp.197-207
    • /
    • 1996
  • As a mood-altering drug, long-term alcohol consumption have significant harmful effects on the human body and people's mental functioning. This study observed that the suppression of cell mediated immunity induced in spleen of ICR mouse by long-term alcohol administration. After 8% alcohol voluntary administered for 120 days, the splenic tissue irnmunohistochemically stained by following ABC method that used monoclonal antibody including L3T4(CD4), Ly-2(CD8), IL-2 receptor(CD25R) and NK-1.1(CD56) after embedding with paraffin. The results were as follows. 1. The size of marginal zone in splenic white pulp was diminished and the number of macrophage in marginal zone was decreased in test group than control group. 2. After alcohol administration, the number of Helper T lymphocyte, cytotoxic T lymphocyte, and IL-2 receptor were decreased in periarterial lymphatic sheaths of white pulp and penicilla artery of red pulp and the degree of CD4, CD8, and CD25R positive reaction were soften. 3. In test group, the number of NK cell were decreased. These results indicated that the secretion of lymphokine as IL-2 was inhibited by long-term alcohol administration and subsequently prevent to activate and proliferate splenic T lymphocytes and NK cells as cell mediated immunity component.

  • PDF

임신·수유부의 올바른 영양관리를 위한 카드뉴스 형식의 교육자료 개발 (Development of Education Materials as a Card News Format for Nutrition Management of Pregnant and Lactating Women)

  • 한영희;김정현;이민준;유택상;현태선
    • 대한지역사회영양학회지
    • /
    • 제22권3호
    • /
    • pp.248-258
    • /
    • 2017
  • Objectives: The purpose of the study was to develop a series of education materials as a card news format to provide nutrition information for pregnant and lactating women. Methods: The materials were developed in seven steps. As a first step, the needs of pregnant and lactating women were assessed by reviewing scientific papers and existing education materials, and by interviewing a focus group. The second step was to construct main categories and the topics of information. In step 3, a draft of the contents in each topic was developed based on the scientific evidence. In step 4, a draft of card news was created by editors and designers by editing the text and embedding images in the card news. In step 5, the text, images and sequences were reviewed to improve readability by the members of the project team and nutrition experts. In step 6, parts of the text or images or the sequences of the card news were revised based on the reviews. In step 7, the card news were finalized and released online to the public. Results: A series of 26 card news for pregnant and lactating women were developed. The series covered five categories such as nutrition management, healthy food choices, food safety, favorites to avoid, nutrition management in special conditions for pregnant and lactating women. The satisfaction of 7 topics of the card news was evaluated by 140 pregnant women, and more than 70% of the women were satisfied with the materials. Conclusions: The card news format materials developed in this study are innovative nutrition education tools, and can be downloaded on the homepage of the Ministry of Food and Drug Safety. Those materials can be easily shared in social media by nutrition educators or by pregnant and lactating women to use.