Pharmacogenomics is the study that examines how genetic variations affect the ways in which people respond to drugs. The ways people respond to drugs are complex traits that are influenced by many different genes. Pharmacogenomics intends to develop rational means of optimizing drug therapy, with respect to the patients' genotype, to maximize efficacy with minimal adverse drug reactions. Pharmacogenomics has the potential to revolutionize the practice of medicine, and promises to usher in an area of personalized medicine, in which drugs and drug combinations are optimized for each individual's unique genetic makeup. Indeed, pharmacogenomics is exploited as an essential step for target discovery and drug development in the pharmaceutical industry. The goal of the personalized medicine is to get the right dose of the right drug to the right patient at the right time. In this article, we will review the use of pharmacogenomics in drug discovery and development.
Park, Jong Kook;Seo, Jung Seon;Lee, Suk Kyeong;Chan, Kenneth K;Kuh, Hyo-Jeong
Biomolecules & Therapeutics
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제26권6호
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pp.591-598
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2018
Epigenetic silencing is considered to be a major mechanism for loss of activity in tumor suppressors. Reversal of epigenetic silencing by using inhibitors of DNA methyltransferase (DNMT) or histone deacetylases (HDACs) such as 5-Aza-CdR and FK228 has shown to enhance cytotoxic activities of several anticancer agents. This study aims to assess the combinatorial effects of genesilencing reversal agents (5-Aza-CdR and FK228) and oxaliplatin in gastric cancer cells, i.e., Epstein-Barr virus (EBV)-negative SNU-638 and EBV-positive SNU-719 cells. The doublet combinatorial treatment of 5-Aza-CdR and FK228 exhibited synergistic effects in both cell lines, and this was further corroborated by Zta expression induction in SNU-719 cells. Three drug combinations as 5-Aza-CdR/FK228 followed by oxaliplatin, however, resulted in antagonistic effects in both cell lines. Simultaneous treatment with FK228 and oxaliplatin induced synergistic and additive effects in SNU-638 and SNU-719 cells, respectively. Three drug combinations as 5-Aza-CdR prior to FK228/oxaliplatin, however, again resulted in antagonistic effects in both cell lines. This work demonstrated that efficacy of doublet synergistic combination using DNMT or HDACs inhibitors can be compromised by adding the third drug in pre- or post-treatment approach in gastric cancer cells. This implies that the development of clinical trial protocols for triplet combinations using gene-silencing reversal agents should be carefully evaluated in light of their potential antagonistic effects.
국내 주요 잠재적 위해식품에 오염된 미생물 조합에 대한 위해순위 결정은 식품안전관리의 우선순위를 정하는데 매우 중요하다. 본 연구에서 사용한 Risk Ranger는 위해식품과 위해미생물 조합에 대해 11가지 정보를 Microsoft Excel Spreadsheet에 입력하여 간단하게 위해순위를 결정하는 도구이다. 본 연구에서는 국내의 23개의 잠재적 위해식품과 위해미생물 조합의 위해순위를 결정하기 위하여 Risk Ranger의 활용성을 조사하였다. 연구결과 E. coli 위해미생물에 대하여 신선편의식품 샐러드가 가장 높은 위해순위 79를 나타내었다. 초밥의 V. parahaemolyticus, 육가공식품의 Salmonella, 햄버거 패티의 E. coli O157:H7 오염에 대한 위해순위는 0으로 본 연구에서 조사된 품목 중 가장 낮은 위해순위를 나타내었다. 이는 발표된 모니터링 연구에서 불검출로 나온 결과에 기인한다. Risk Ranger는 위해성의 순위를 간단하게 평가할 수 있는 장점을 가지지만, 정확한 data가 부족한 경우 결과의 정확성에 한계를 가진다. 또한 문헌조사 결과 국내의 위해식품 섭취빈도 조사, 원재료의 위해미생물 오염도, 위해미생물에 미치는 가공과정 영향에 대한 자료가 매우 부족한 것으로 나타났다. 본 연구는 위해순위 결정 도구로서 Risk Ranger 활용성을 소개하며 위해식품과 위해미생물 조합의 위해순위 결과는 국내 식품안전관리의 중요한 기초 자료로 활용될 수 있을 것이다.
Tuberculosis (TB) remains a major global health problem, and the incidence of TB cases has not significantly decreased over the past decade in Korea. The standard short course regimen is highly effective against TB, but requires multiple TB-specific drugs and a long treatment duration. Recent studies using late-generation fluoroquinolones and/or high-dose rifapentine-containing regimens to shorten the duration of TB treatment showed negative results. Extending the treatment duration may be considered in patients with cavitation on the initial chest radiograph and positivity in sputum culture at 2 months of treatment for preventing TB relapse. Current evidence does not support the use of fixed-dose combinations compared to separate drugs for the purpose of improving treatment outcomes. All patients receiving TB treatment should be monitored regularly for response to therapy, facilitation of treatment completion, and management of adverse drug reactions. Mild adverse effects can be managed with symptomatic therapy and changing the timing of the drug administration, but severe adverse effects require a discontinuation of the offending drugs.
In order to find less toxic antiherpetic agents, antiviral activities of quercitrin against two strains of pathogenic viruses such as herpes simplex virus type 1 (HSV-1) and type 2 (HSV-2) were determined in Vero cells using plaque reduction assay in vitro. Quercitrin showed a concentration-dependent decrease in plaque formation of HSV-1 and HSV-2. It also exhibited more potent antiherpetic activity on HSV-1 with 50% effective concentration (EC$_{50}$) of 20.4 $\mu$g/ml than on HSV-2 with EC$_{50}$ of 30.4 $\mu$g/ml. The combined antiherpetic effects of quercitrin with nucleoside antiherpetic agents, acyclovir and vidarabine, were examined on the multiplication of these two strains of herpesviruses in Vero cells by the combination assay. The results of combination assay were evaluated by the combination index (CI) that was calculated by the multiple drug effect analysis. The combinations of quercitrin with acyclovir and vidarabine on HSV-1 showed more potent synergism with CI values of 0.27-0.81 for 50%, 70%, 90% effective levels than those on HSV-2 with CI values of 1.03~2.20..20.
The purpose of this investigation was to extract the bioactive agents from Alpinia officinarum Hance. The methanol with ethylacetate extracts alone and combined were examined for their activities against VRE (vancomycin-resistant enterococci) and pathogenic yeast in vitro. The incidence of infections caused by VRE and other pathogenic microorganisms and the importance of using novel synergistic drug combinations has become important. Previously, we reported the antimicrobial effects of the butanol extract from Lonicera japonica and have evaluated combinations of solvent extracts, with a focus on the MeOH and EtOAc extracts from A. officinarum. In the present study, enhanced inhibitory effects were achieved by employing a combination of the two solvent extracts. The MeOH and EtOAc combination was especially effective against four VRE strains: E. faecalis (K-10-22), E. faecaium (K-11-212), E. faecalis (K-10-57) and E. faecalis (K-10-361) with MIC values of 12.5, 12.5, 6.25 and 25 ${\mu}g/ml$, respectively. Thus, the combination was more effective than other antibiotics such as kanamycin, gentamicin or tetracycline against bacteria including E. coli, Staphylococcus aureus, and Micrococcus luteus. In addition, the combination was effective against yeasts such as Candida albicans, Candida tropicalis and Cryptococcus neoformans.
To search for less toxic antiherpetic agents, the inhibitory effects of natural naringenin on the plaque formation of herpes simplex virus type 1 (HSV-1) and type 2 (HSV-2) in Vero cells were examined by the plaque reduction assay in vitro. Naringenin inhibited plaque formations of HSV-l and HSV-2 in a dose dependent manner. It also exhibited more potent antiherpetic activity on HSV-l with selectivity index (SI) of 19.1 than on HSV-2 with SI of 5.7 The combined antiherpetic effects of naringenin with nucleoside antiherpetic agents, acyclovir and vidarabine, were examined on the multiplication of these two strains of herpesviruses in Vero cells by the combination assay. The results of combination assay were evaluated by the combination index (CI) that was calculated by the multiple drug effect analysis. The combinations of naringenin with acyclovir on HSV-l and HSV-2 showed more potent synergism with CI values of 0.28∼0.81 for 50%, 70%, 90% effective levels than those with vidarabine with CI values of 0.86-3.28.
This study investigated the antibacterial activities of sophoraflavanone G from Sophora flavescens in combination with two antimicrobial agents against oral bacteria. The combined effect of sophoraflavanone G and the antimicrobial agents was evaluated using the checkerboard method to obtain a fractional inhibitory concentration(FIC) index. The sophoraflavanone G+ampicillin(AM) combination was found to have a synergistic effect against S. mutans, S. sanguinis, S. sobrinus, S. gordonii, A. actinomycetemcomitans, F nucleatum, P. intermedia, and P. gingivalis, whereas the sophoraflavanone G+gentamicin(GM) combination had a synergistic effect against S. sanguinis, S. criceti, S. anginosus, A. actinomycetemcomitans, F nucleatum, P. intermedia, and P. gingivalis. Neither combination exhibited any antagonistic interactions(FIC index>4). In particular, the MICs/MBCs for all the bacteria were reduced to one-half$\sim$one-sixteenth as a result of the drug combinations. A synergistic interaction was also confirmed by time-kill studies for nine bacteria where the checkerboard suggested synergy. Thus, a strong bactericidal effect was exerted through the drug combinations, plus in vitro data suggested that sophoraflavanone G combined with other antibiotics may be microbiologically beneficial rather than antagonistic.
Since tuberculosis (TB) remains a major global health concern and the incidence of multi-drug resistant (MDR)-TB is increasing globally, new modalities for the detection of TB and drug resistant TB are needed to improve TB control. The Xpert MTB/RIF test can be a valuable new tool for early detection of TB and rifampicin resistance, with a high sensitivity and specificity. Late-generation fluoroquinolones, levofloxacin, and moxifloxacin, which are the principal drugs for the treatment of MDR-TB, show equally high efficacy and safety. Systemic steroids may reduce the overall TB mortality attributable to all forms of TB across all organ systems, although inhaled corticosteroids can increase the risk of TB development. Although fixed dose combinations were expected to reduce the risk of drug resistance and increase drug compliance, a recent meta-analysis found that they might actually increase the risk of relapse and treatment failure. Regarding treatment duration, patients with cavitation and culture positivity at 2 months of TB treatment may require more than 6 months of standard treatment. New anti-TB drugs, such as linezolid, bedaquiline, and delamanid, could improve the outcomes in drug-resistant TB. Nontuberculous mycobacterial lung disease has typical clinical and immunological phenotypes. Mycobacterial genotyping may predict disease progression, and whole genome sequencing may reveal the transmission of Mycobacterium abscessus. In refractory Mycobacterium avium complex lung disease, a moxifloxacin-containing regimen was expected to improve the treatment outcome.
Anti-cancer drug resistance is a major problem in colorectal cancer (CRC) research. Although several studies have revealed the mechanism of cancer drug resistance, molecular targets for chemotherapeutic combinations remain elusive. To address this issue, we focused on the expression of cellular prion protein ($PrP^C$) in 5-FU-resistant CRC cells. In 5-FU-resistant CRC cells, $PrP^C$ expression is significantly increased, compared with that in normal CRC cells. In the presence of 5-FU, $PrP^C$ increased CRC cell survival and proliferation by maintaining the activation of the PI3K-Akt signaling pathway and the expression of cell cycle-associated proteins, including cyclin E, CDK2, cyclin D1, and CDK4. In addition, $PrP^C$ inhibited the activation of the stress-associated proteins p38, JNK, and p53. Moreover, after treatment of 5-FU-resistant CRC cells with 5-FU, silencing of $PrP^C$ triggered apoptosis via the activation of caspase-3. These results indicate that $PrP^C$ plays a key role in CRC drug resistance. The novel strategy of combining chemotherapy with $PrP^C$ targeting may yield efficacious treatments of colorectal cancer.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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