Communications for Statistical Applications and Methods
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제18권5호
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pp.637-644
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2011
Partially ranked data refers to the situation in which there are p distinct objects; however each judge specifies only first s (s < p) choices. The group theoretic formulation for partially ranked data analysis was set up by Critchlow (1985). We propose a graphical method for partially ranked data by quantifying objects and judges. In a plot for judges, the interpoint distances can be interpreted as Spearman or Kendall distances between two rankings given by respective judges. Similarly, we also construct a plot for objects with a sensible relationship to the previous plot for judges. This study extends the Han and Huh (1995) quantification method of fully ranked data using Gabriel's (1971) biplot technique for multivariate data matrix.
The nonparametric method was employed to obtain detailed broadband attenuation characteristics of horizontal Fourier spectra without generally assigned constraint that derived path terms be zeros at a reference distance. Instead, path terms fer a reference distance were obtained based on the physical phenomenon that the seismic phase is stable over the hypocentral distance range from 200km to 400km so that the Q-values evaluated at several distances inside that region should be the same. The inverted path terms show three distinct linear regions roughly divided by hypocentral distances at 65km and 115km. Also complex behavior at the near distance range below 100km was revealed which can not be properly fitted by combination of single $Q_{0}$$f^{η}$ model and any geometrical spreading models.s.
We report three types of evolutions of EUV bright points (EBPs) which are characterized by their height variations. We analyzed three EBPs during their lifetimes observed by STEREO/SECCHI/EUVI and we obtained heights, sizes, and intensities. Moreover, we investigated their underlying magnetic bipoles observed by SOHO/MDI and we measured distances and fluxes of the two opposite fragments. We found three distinct changes in the heights of the EBPs: upward, downward, and flat. In the upward case, the EBP showed a small and dark structure first, and then changed to a large and bright loop. In the downward case, the EBP first appeared as a large and dark loop structure, and then evolved to a compact and bright loop system. Finally, in the flat case, the height and the size of the EBP didn't change significantly. We found that those EBPs were associated with three distinct contact types of their underlying magnetic fragments, emerging, cancelling, and shearing, respectively. In all cases, both flux emergences and flux cancellations were observed during the lifetimes of the BPs. The flux emergence was dominant in the initial phase and the flux cancellation was significant when the intensity reached its maximum. In addition, we found a remarkable correlation between the heights of the EBPs and the distance of the opposite magnetic fragments.
This paper represents an efficient algorithm to segment objects from the background using multiple images of distinct luminous intensities. The proposed algorithm obtains images with different luminous intensities using a camera flash. From the multiple intensities for a pixel, a saturated luminous intensity is estimated together with the slope of intensity rate. Then, we measure the sensitivities of pixels from their slopes. The sensitivities show different patterns according to the distances from the light source. Therefore, the proposed algorithm segments near objects using the sensitivity information by minimizing an energy function. Experimental results on various objects show that the proposed algorithm provides accurate results without any user interaction.
The layered perovskite oxide, KSr2Nb3O10, was synthesized. The interlayer potassium cations were readily exchanged by protons in hydrochloric acid solution to give the protonation compound, HSr2Nb3O10·0.5H2O. The intercalation compounds, [NH3(CH2)nNH3]xSr2Nb3O10, were also obtained by acid-base reactions between the protonation compound and organic bases, 1,n-alkyldiamines. The interlayer distances in the intercalation compounds were linearly increased with the increase of the number of carbon (Δc/Δn=1.05 Å) in 1,n-alkyldiamines. The intercalated alkyldiammonium ions formed a paraffin-like monolayer with average tilting angle (θ) of ca. 56°. The intercalation reactions occurred stoichiometrically. The thermal decomposition process of the intercalation compounds showed distinct three steps due to the desorption of hydrated water, the decomposition of organic moiety, and the decomposition of Sr-related compounds.
Picea jezoensis (Sieb. et Zucc.) Carriere is one of the major and widespread components of the cold-temperate and boreal forests in Russian Far East, northeast China, Korea, and Japan. However, it is restricted to a highly fragmented range in South Korea with small populations. Mean expected heterozygosity $(H_e)$ based on 22 loci in 11 isozyme systems was 0.077 for four sampled populations that covered the whole distribution range of P. jezoensis in South Korea. This value is within the range reported for conifers, but it is very low compared to that of other spruce species as well as that of P. jezoensis populations in Russian Far East. Most populations had a slight excess of heterozygotes and the Wright's $F_{IS}$ (-0.019) was comparable to that previously reported for other spruce species. In all of the four populations, the Wilcoxon sign-rank test indicated no greater heterozygosity than that expected for populations at mutation-drift equilibrium, suggesting that the populations have not been bottlenecked recently. Despite a fragmented range and isolated populations, population differentiation was not high $(F_{ST}=0.047)$ and the number of migrants per generation was 5.09. Nei's genetic distances were also small $({\bar{D}}=0.005)$ but strongly related to geographic distances between populations, suggesting an Isolation by Distance. The northernmost isolate, Mt. Gyebang population was genetically distinct from the other three populations. Implications for the conservation of genetic variation of P. jezoensis in South Korea were discussed.
Silva, Cynthia;Jesus, Ederson C.;Torres, Ana P. R.;Sousa, Maira P.;Santiago, Vania M. J.;Oliveira, Valeria M.
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제20권3호
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pp.447-459
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2010
Bacterial diversity of two distinct wastewater treatment systems, conventional activated sludge (CAS) and membrane bioreactor (MBR), of petroleum refineries were investigated through 16S rRNA gene libraries. Sequencing and phylogenetic analysis showed that the bacterial community composition of sludge samples was distinct between the two wastewater treatment systems. MBR clones belonged predominantly to Class Betaproteobacteria, represented mainly by genera Thiobacillus and Thauera, whereas CAS clones were mostly related to Class Alphaproteobacteria, represented by uncultured bacteria related to Order Parvularculales. Richness estimators ACE and Chao revealed that the diversity observed in both libraries at the species level is an underestimate of the total bacterial diversity present in the environment and further sampling would yield an increased observed diversity. Shannon and Simpson diversity indices were different between the libraries and revealed greater bacterial diversity for the MBR library, considering an evolutionary distance of 0.03. LIBSHUFF analyses revealed that MBR and CAS communities were significantly different at the 95% confidence level ($P{\leq}0.05$) for distances $0{\leq}D{\leq}0.20$. This work described, qualitatively and quantitatively, the structure of bacterial communities in industrial-scale MBR and CAS processes of the wastewater treatment system from petroleum refineries and demonstrated clearly differentiated communities responsible for the stable performance of wastewater treatment plants.
We present the properties of galaxies in filaments around the Virgo cluster with respect to their vertical distance from the filament spine. Using the NASA-Sloan Atlas and group catalogs, we select galaxies that do not belong to groups in filaments. The filament member galaxies are then defined as those located within 3.5 scale length from the filament spine. The filaments are mainly (~86%) composed of low-mass dwarf galaxies of logh2M∗/M⊙ < 9 dominantly located on the blue cloud in color-magnitude diagrams. We observe that the g - r color and stellar mass of galaxies correlate with their vertical distance from the filament spine in which the color becomes red and stellar mass decreases with increasing vertical filament distance. The galaxies were divided into two subsamples in different stellar mass ranges, with lower-mass (logh2M∗/M⊙ ≤ 8) galaxies showing a clear negative g-r color gradient, whereas higher-mass (logh2M∗/M⊙ > 8) galaxies have a flat distribution against the vertical filament distance. We observe a negative EW(Hα) gradient for higher-mass galaxies, whereas lower-mass galaxies show no distinct variation in EW(Hα) against the vertical filament distance. In contrast, the NUV - r color distribution of higher-mass galaxies shows no strong dependence on the vertical filament distance, whereas the lower-mass galaxies show a distinct negative NUV - r color gradient. We do not witness clear gradients of HI fraction in either the higher- or lower-mass subsamples. We propose that the negative color and stellar mass gradients of galaxies can be explained by mass assembly from past galaxy mergers at different vertical filament distances. In addition, galaxy interactions might be responsible for the contrasting features of EW(Hα) and NUV - r color distributions between the higher- and lower-mass subsamples. The HI fraction distributions of the two subsamples suggest that ram-pressure stripping and gas accretion could be ignorable processes in the Virgo filaments.
To reexamine taxonomic status of endemic Mogera wogura coreana from Korea, we first obtained partial 12S rRNA sequences (893 bp) and complete cytochrome b gene sequences (1140 bp) of this subspecies, and these sequences and partial cytochrome b sequences (402 bp) were compared to the corresponding haplotypes of M. wogura from East Asia, obtained from GenBank. The one of three 12S rRNA haplotypes in M. w. coreana was identical to one 12S rRNA haplotype of M. w. robusta from East Asia: 10 complete and 13 partial cytochrome b haplotypes of M. w. coreana formed a single clade with one complete and four partial cytochrome b haplotypes of M. w. robusta, respectively. We considered that M. w. coreana from Korea is an endemic subspecies with only morphological differences, although it is necessary to reexamine the subspecies status of M. w. coreana. Additionally, in the 12S rRNA and complete cytochrome b sequences, M. wogura from Japan was distinct from the two continental subspecies of M. w. coreana and M. w. robusta with average distances of 1.76 and 5.65%, respectively; insular M. wogura, with within-group distances of 2.09 and 4.38%, respectively, was also genetically more divergent than the mainland M. wogura, with within-group distances of 0.08 and 0.57%, respectively. Thus, we considered that insular M. wogura of Japan dispersed into neighboring East Asian continent, which is opposite to the traditional hypothesis on the origin of Japanese M. wogura.
한국의 산양 (Naemorhedus caudatus)의 유전정보를 종보전에 활용하기 위하여, 한국의 2개 장소에서 채집한 6마리의 미토콘드리아 cytochrome b 유전자 염기서열(606 bp)의 양상을 조사하였다 상응하는 중국의 산양의 염기서열은 GenBank에서 얻어서 이용하였다. 한국의 산양의 4개 haplotype의 각각과 중국의 산양의 한 haplotype간의 nucleotide Tamura-Nei 거리는 0.0650부터 0.0803 가지의 변이를 보였으며, 산양은 소과 내에서 높은 수준의 염기서열 다양성을 나타냈다 한국의 산양에서, 양구표본의 3개 haplotype간의 거리는 0.0151부터 0.0185로, 양구집단의 유전자 다양성이 낮은 수준으로 감소되었음을 보여준다. 또한 양구의 3개 haplotype의 각각과 삼척의 한 haplotype간의 거리는 0.0343에서 0.0479였다. 지리적 거리의 멀어짐에 따르는 유전자 거리의 증가가 서식처 단절에 의해 야기되었다고 판단됨으로, 한국의 산양의 유전자 다양성의 감소를 막기 위한 여러 가지 보전 대책이 즉각적으로 수행되어야 할 것이다 산양의 분류학적 검토를 위하여 GenBank에 있는 히말라야산양 (N. goral)의 염기서열 (276 bp)도 이용하였으며, 산양은 히말라야산양과 뚜렷한 차이가 없었다. 산양과 히말라야 산양은 동종으로 판단할 수가 있지만, 두 종의 보다 많은 표본을 이용한 후속 연구가 필요하다
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[게시일 2004년 10월 1일]
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