• 제목/요약/키워드: disk diffusion method

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Comparison of Virulence Factors, Phylogenetic Groups and Ciprofloxacin Susceptibility of Escherichia coli Isolated from Healthy Students and Patients with Urinary Tract Infections in Korea

  • Park, Min;Park, Soon-Deok;Kim, Sa-Hyun;Woo, Hyun-Jun;Lee, Gyu-Sang;Kim, Hyun-Woo;Yang, Ji-Young;Cho, Eun-Hee;Uh, Young;Kim, Jong-Bae
    • 대한의생명과학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.146-151
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    • 2012
  • Urinary tract infection (UTI) is one of the most common bacterial infections and is predominantly caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC). UPEC strains generally possess several genes encoding virulent factors, which are mostly adhesins, toxins, bacteriocin and siderophores. E. coli is composed of four main phylogenetic group (A, B1, B2, D) and virulent extra-intestinal strains mainly belong to groups B2 and D. Prescription of ciprofloxacin, a kind of fluoroquinolone group antibiotics, is increasing now a days, but resistance to this drug is also increasing. A total of 188 strains of E. coli were collected. Thirteen strains were collected from healthy students in 2011 and 175 strains from patients with urinary tract infection in 2010. Virulence factor genes (papC, fimG/H, sfaD/E, hlyA, cnf1, and usp) were amplified by polymerase chain reaction (PCR) methods for phylogenetic group (A, B1, B2, D) detection. Ciprofloxacin susceptibility test was performed by disk diffusion method. The identified virulence factors (VFs), phylogenetic groups and ciprofloxacin resistance in 13 E. coli strains isolated from healthy students were papC (15.4%), fimG/H (76.9%), sfaD/E (30.8%), hlyA (23.1%), cnf1 (23.1%), usp (7.7%), phylogenetic group A (23%), B1 (8%), B2 (46%), D (23%) and ciprofloxacin resistance (7.7%), while those of in 175 E. coli strains isolated from patients with UTI were papC (41.1%), fimG/H (92.5%), sfaD/E (30.3%), hlyA (10.3%), cnf1 (30.3%), usp (27.4%), phylogenetic group A (9.1%), B1 (5.1%), B2 (60.6%), D (25.1%) and ciprofloxacin resistance (29.7%). In this study, 10 out of 13 E. coli strains (76.9%) from healthy students were found to possess more than one virulence factor associated with adhesion. In addition, one E. coli strain isolated from healthy students who had never been infected with UPEC showed ciprofloxacin resistance. According to these results between the virulence factors and phylogenetic groups it was closely associated, and UPEC strains isolated from patients showed high level of ciprofloxacin resistance.

탄닌산을 함유한 친환경농자재(공시번호 2-4-064)의 식물병원세균 기내 억제효과 (In Vitro Screening of Tannic Acid-based Eco-friendly Farming Material (notice no. 2-4-064) against Plant Pathogenic Bacteria)

  • 한규석;주호종;홍진성;정종상;박덕환
    • 한국유기농업학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.945-955
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    • 2016
  • 지금까지 주요 식물병원세균에 대한 방제대책은 화학적 방제방법에 의존하여왔다. 그러나 항생제와 같은 화학적 방제방법은 저항성 균주의 출현으로 인해 효율성이 감소함에 따라 대체방법의 개발이 요구되어지고 있는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 주요 7종(그램음성 - 무름병, 감귤 궤양병, 풋마름병, 가지검은마름병 및 과실썩음병; 그램 양성 - 토마토 궤양병 및 더뎅이병)의 식물병원세균에 대한 탄닌산 함유 친환경농자재(공시번호 2-4-064)의 억제효과를 고체배지 확산법과 액체배지 배양법으로 검정하였다. 고체배지 확산법에서는 가지검은마름병원세균을 제외한 6종의 병원세균에 대한 억제효과를 나타내었으며, 액체배지 검정에서는 액체배지법으로 실험가능한 6종의 병원세균의 생장을 억제하였다. 전자현미경을 통한 표면변화를 관찰한 결과, 모든 병원세균의 표면구조의 변화를 발생하여 생장저해 또는 세포사멸을 유도하는 현상이 관찰되었다.

흰 쥐의 감염된 전층피부결손에 대한 항균연고들의 항균효과 및 창상치유 효과의 비교 (Comparison of Antibacterial Ointments for Antibacterial and Wound Healing Effect on Infected Full Thickness Skin Defect in the Mouse)

  • 전소연;이종훈;민경희;홍성희;이원미;채정돈;전진현
    • Archives of Plastic Surgery
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    • 제37권2호
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    • pp.115-121
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    • 2010
  • Purpose: Many topical agents had been used for contaminated wound treatment. Although antimicrobial ointments were widely used as topical agents, their comparative antibacterial and wound healing effects were largely unreported. The purpose of this study was to compare antibacterial effects and wound healing effects of common topical ointments on infected full thickness skin defect in the mouse. Methods: One full thickness skin defects in the mice (n=60) were developed on the back and left open for twenty-four hours. Sixty mice were divided into four groups: group B (dressing with Bactroban$^{(R)}$, n=15), group I (dressing with Iodosorb$^{(R)}$, n=15), group T (dressing with Terramycin$^{(R)}$, n=15), group G (control group, dressing with dry gauze, n=15). The size of wound defects and the grades of wound healing were evaluated at 4, 7, 10 days, and antibacterial effect was evaluated with restricted zone in Mueller Hinton agar by disk diffusion method. After the wound was left open for twenty-four hours, many Staphylococcus aureus was cultured. The wound defect size was decreased in order of Bactroban$^{(R)}$ (B), Iodosorb$^{(R)}$ (I), Terramycin$^{(R)}$ and gauze dressing group in all days, but difference among experimental groups was not statistically significant. The grade score of wound healing was increased in order of Bactroban$^{(R)}$, Iodosorb$^{(R)}$, Terramycin$^{(R)}$ and gauze dressing group, and the difference was statistically significant. Antibacterial effect for was increased in order of Bactroban$^{(R)}$, Iodosorb$^{(R)}$, Terramycin$^{(R)}$ and gauze dressing group, and the difference was statistically significant. Conclusion: Topical antimicrobial ointments application was effective against wound infections by S. aureus. Bactroban$^{(R)}$ may be an optimal topical treatment for infected wounds according to this study. However, further study is necessary to evaluate the clinical efficacy of antimicrobial ointments and to search for the mechanisms that explain their effects.

잔디 병해 방제를 위한 항균성 약용식물의 탐색 (Screening of Antifungal Medicinal Plants for Turfgrass Fungal Disease Control)

  • 권수민;김대호;장태현;전민구;김인섭;김익휘
    • 아시안잔디학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.176-181
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    • 2010
  • 잔디에 발생하는 주요 병해로 한지형 잔디에서 갈색잎마름병(Rhizoctonia solani AG1-1), 동전마름병(S. homoeocarpa), 피시움마름병(Pythium. spp.), 탄저병(C. graminicola)과 난지형 잔디에서 누른잎마름병(R. cerealis), 라이족토니아마름병 (R. solani AG2-2)이다. 본 연구에서는 이들 잔디 주요 병원균 6종에 대한 한약재 23종의 항진균 활성을 알아보았다. 디스크 확산법으로 항진균 활성이 있는 한약재를 선발하였고, 선발된 한약재를 대상으로 균사생육억제 효과를 실험하여 검정하였다. 항진균 활성 시험 결과, 한약재 23종 중고삼 외 11종의 시료에서 항진균 활성이 있었으며, 균사생육 억제효과를 통한 검정에서는 10 mg/10 ml(1000배) 추출물 첨가 배지에서 잔디 병원균 6종 중 1종이라도 균사 억제율이 80% 이상인 추출물은 고삼, 울금, 대황, 황련, 족두리풀로 나타났다. 특히 고삼 추출물은 실험 대상인 잔디 병원균 6종에 대해 모두 항진균 활성이 나타났고, 울금 추출물 10 mg/10 ml(1000배), 5 mg/10 ml(2000배), 2 mg/10 ml(5000배) 첨가 배지에서 S. homoeocarpa 에 대해 100% 균사 생육 억제 효과를 나타내었다. 그리고 Pythium spp. 균사 억제효과가 100%인 것은 고삼, 대황, 황련으로 나타났다.

mecA Gene Transferrability and Antibiogram of Zoonotic Staphylococcus intermedius from Animals, Staff, and the Environment in Animal Hospitals in Korea

  • Youn, Jung-Ho;Hwang, Sun-Young;Kim, So-Hyun;Koo, Hye-Cheong;Shin, Sook;Moon, Bo-Youn;Lim, Suk-Kyung;Park, Yong-Ho
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권2호
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    • pp.425-432
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    • 2010
  • Staphylococcus intermedius is a common cause of otitis externa, pyoderma, and wound infections in companion animals. Although S. intermedius infections are rare in humans, it is zoonotic, with several case reports describing fatal human infections. Presently, we sought to isolate S. intermedius strains from various sources at animal hospitals nationwide in Korea, examine their antibiotic susceptibilities, and determine the possibility of horizontal transmission between animals and humans. Pulsed-field gel electrophoresis (pFGE) was used to compare the mecA gene in S. intermedius strains from humans, animals, and the environment in animal hospitals. A total of 119 S. intermedius strains were isolated from 529 samples. Using the disk diffusion method, over 90% of the isolates were found to be susceptible to cephalothin, amoxicillin-clavulanic acid, vancomycin, imipenem, nitroflurantoin, and amikacin, whereas 97.5% and 98.3% of the isolates were resistant to penicillin and ampicillin, respectively. Among the 39 S. intermedius strains harboring mecA, similar PFGE patterns were observed between seven isolates from an animal, two isolates from veterinary staff, and the environment in one animal hospital, and single isolates from an animal and a veterinarian at another hospital. This result suggests the possibility of horizontal transmission of S. intermedius containing mecA between humans, animals, and the environment in animal hospitals and also emphasizes on the importance of S. intermedius with mecA as a possible emerging threat to public health.

한국인 소아에서 분리한 Helicobacter pylori 균주의 항균제 내성률 (Antimicrobial Resistance of Helicobacter pylori Isolated from Korean Children)

  • 김유미;이연주;오석희;성흥섭;김미나;김경모
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제14권1호
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    • pp.45-51
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    • 2011
  • 목 적: Helicobacter pylori (H. pylori) 제균 치료의 적절한 항균제 선택의 기반이 되기 위해 소아에서 H. pylori 항균제 내성률을 알아보고자 하였다. 방 법: 2003년 7월부터 2009년 4월까지 상복부 통증으로 본원을 방문한 환자 중 위 문부 생검 조직 배양에서 H. pylori 가 동정된 균주를 대상으로 항균제 감수성 검사를 시행하였다. 감수성 검사는 clarithromycin과 amoxicillin은 디스크 확산법으로, tetracycline과 metronidazole은 E-test를 시행하였다. 치료 원칙은 감수성 결과가 확인 된 환자는 감수성 결과에 따라 항균제를 선택 하였고, BAM (bismuth subsalicylate, amoxicillin, metronidazole) 또는 OAC (omeprazole, amoxicillin, clarithromycin)를 바탕으로 한 경험적 삼제요법을 택하였다. 치료 실패 시에는 bismuth (또는 bismuth subsalicylate)를 포함한 사제요법을 선택하였다. 결 과: 33명의 환자가 배양검사 양성을 보였고 28명의 환자에서 감수성 검사를 시행하였다. 이 중 항균제 내성을 보인 환아는 9명(32.1%)으로 그 중 7명(25%)이 clarithromycin 내성 균주를 보였고 5명(17.8%)이 metronidazole 내성 균주를 보였다. 대상이 적어 통계적인 분석을 하지 못하였으나 Clarithromycin과 metronidazole의 내성률이 시기적으로 감소하는 추세를 보였다. 결 론: 본 연구는 단일 병원에서 소수의 환아를 대상으로 이루어진 연구로 한계가 있으나, 간접적으로 국내소아 환아에서 분리된 H. pylori의 균주에서도 높은 항균제 내성과 시기적으로 내성률이 변하는 것을 알 수있었다. 따라서 소아 환자에서 적절한 항균제 선택을 제시하기 위한 보다 광범위한 연구가 필요한 것으로 생각한다.

어린이집 소아에서의 황색포도알균의 비강 보균율에 관한 연구 (Nasal Carriage of Staphylococcus aureus from Healthy Children Attending Day Care Center)

  • 김영민;오지은;김소희;이진아;최은화;이환종
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제17권1호
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    • pp.9-15
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    • 2010
  • 목 적 : 국내 어린이집을 다니는 소아를 대상으로 황색포도알균의 비강 내 보균율과 이런 보균율에 영향을 끼치는 요인들에 대해 알아보고자 하였다. 방 법: 2008년 9월에서 10월까지 서울 지역에 위치한 7개 어린이집의 소아 중 서면 동의를 받은 428명을 대상으로 설문지를 통해 인구학적 자료 및 의료기관 관련 위험 요인에 대한 자료를 수집하였다. 또한 어린이집의 소아들의 비강을 도찰하여 얻은 검체를 증균 및 선택배지에 접종한 후 생화학적 검사를 통해 황색포도알균을 동정 및 분리하였고 디스크 확산법을 통해 메티실린 감수성을 결정하였다. 결 과:대상 환아의 평균 연령은 55개월 이었으며 남녀비는 1.1:1.0이었고 최근 1년 이내에 입원력 및 수술력이 있는 환아는 각각 9.2%, 3.6%였고 항생제 사용력은 약 40%에서 확인되었다. 전체 428명의 소아 중 163명에서 비강 내 황색포도알균이 분리되어 황색포도알균의 비강 내 보균율은 38.1%였으며 분리된 균주의 24.5%는 메티실린 내성 균주였다. 연령이 증가함에 따라 황색포도알균의 비강 내 보균율도 증가 추세를 보였다. 비강 내 MRSA 보균이 9.3%의 소아에서 확인되었으며 이들 대부분이 의료기관 관련 위험요소가 없는 소아였다. 결 론:국내 소아의 약 38% 및 9%가 비강 내 황색포도알균 및 MRSA 보균자임을 확인하였으며, 특히 분리된 MRSA의 95%가 CA-MRSA 균주였다. 향후 비강내 황색포도알균의 보균율의 변화 및 CA-MRSA 보균율의 변화에 대해 지속적인 연구가 필요하겠다.

대학 동물병원 임상 검체로부터 분리된 혐기성 세균과 항생제 감수성 양상 (Isolation of Anaerobic Bacteria from Clinical Specimens in Veterinary Medical Teaching Hospital)

  • Park, Se-won;Chung, Jin-young;Hwang, Cheol-yong;Youn, Hwa-young;Han, Hong-ryul
    • 한국임상수의학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.15-19
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    • 2004
  • 치료 실시중 세균의 항생제 내성 발현은 임상 분야의 중요한 문제점중 하나인데 중요한 원인중 하나는 원인세균의 분리와 그에 따른 항생제 감수성 검사 결과에 바탕을 두지 않은 무분별하며 적절치 않은 항생제를 선택함에 있다. 따라서 본 연구에서는 대학동물 병원에 내원한 임상증례로부터 채취한 임상검체에서 협기성 세균을 분리 동정하고 항생제 감수성 양상을 검사하고자 하였다. 이를 위해 2001년 5월부터 2002년 10월까지 서울대학교 동물병원에 내원한 개, 고양이 및 토끼로부터 채취한 임상검체에 대해 협기성 배양을 실시하고 분리 동정된 세균에 대해서는 표준 디스크 검사법을 이용해 항생제 감수성을 평가하였다. 총 13주; Bacteroidesspp. (3주), Fusobacterium spp. (2주), Peptostreptococcus spp. (2주), Porphyromonas gingivalis (2주), Prevotella spp. (3주), Propionibacterium acnes (1주)의 혐기성 세균이 분리동정 되었으며 항생제 감수성 검사에서는 Fusobucterium varium 1주만이 norfloxacin 에 저항성을 나타내었으나 그 외 모든 분리주가 검사대상 항생제에 대한 감수성이 있는 것으로 나타났다.

대전지역 소재 대학병원에 blaOXA-23 유전자를 가지고 있는 다제내성 Acinetobacter baumannii의 확산 (Clonal Dissemination of Multidrug Resistant Acinetobacter baumannii Isolates Harboring blaOXA-23 at One University Hospital in Daejeon, Korea)

  • 성지연
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.94-101
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    • 2016
  • Acinetobacter species는 중요한 기회감염균으로 빈번하게 원내감염을 일으킨다. 뿐만 아니라 다제내성을 보이는 경우가 많아 치료를 위한 항균제 선택이 매우 제한적이다. 본 연구에서는 Acinetobacter species 68균주를 대상으로 하여 다양한 carbapenemase 유전자를 조사했다. 디스크확산법으로 항균제 감수성 양상을 조사했으며 다중 중합효소연쇄반응을 통해 carbapenemase 유전자를 포함하고 있는 균주를 선별하였고 PCR과 염기서열분석을 통해 최종적으로 carbapenemase 유전형을 확인했다. 한편 REP-PCR 방법으로 균주간의 clonality를 분석했다. 본 연구에서 A. baumannii 균주는 분석된 모든 항균제에 대해 높은 내성을 나타냈으나 non-A. baumannii 균주는 분석된 항균제 중 aztreonam과 cefotaxime을 제외한 항균제에 모두 감수성을 보였다. A. baumannii 51 균주는 $bla_{OXA-51}$ 유전자를 가지고 있었으며 그 중 37(72.5%)균주는 $bla_{OXA-23}$ 유전자도 동시에 가지고 있었다. 본 연구에서 39 균주의 다제내성 A. baumannii 가 분리되었는데 그 중 37균주가 $bla_{OXA-23}$ 유전자를 가지고 있었다. $bla_{OXA-23}$ 유전자를 포함하고 있는 균주들은 I (n=22) 형 또는 II (n=15) 형의 REP-PCR band 패턴을 보였는데 이는 대전에 위치한 일개의 대학병원에 $bla_{OXA-23}$ 유전자를 포함하고 있는 다제내성 균주들이 수평 확산 되어 있음을 의미한다. 다제내성 A. baumannii 균주에 의한 감염 및 집락화를 막기 위해서는 지속적으로 내성을 유발하는 인자를 조사하고 MDR균주의 출현 및 확산을 감시할 필요가 있을 것으로 사료된다.

경북지역의 닭으로부터 CTX-M-14 생성 장내세균 분리동정 (CTX-M-14 Producing Enterobacteriaceae Isolated from Chickens at Gyeongsang Provinces)

  • 성지연;권택영
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.118-123
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    • 2016
  • 지난 반세기 동안 세균 감염증 치료 또는 성장촉진을 목적으로 가금류에게 광범위하게 항균제를 사용해 왔다. 그러나 항균제 내성의 증가는 사람에게 보편적으로 사용되는 항균제들에 대한 내성을 유도하여 치료를 위한 항균제 선택에 제약을 주어 치료에 어려움을 가중시키고 있다. 본 연구에서는 경상도 지역에서 사육된 닭으로부터 분리된 장내세균을 대상으로 ${\beta}-lactam$, quinolone, 및 aminoglycoside 계열 항균제에 대한 내성유전자의 빈도를 조사하였다. 그리고 항균제 감수성 검사를 시행하여 내성유전자와의 관련성을 알아보았다. 본 연구에서 총 43균주의 장내세균이 40마리의 닭의 맹장으로부터 분리되었으며 디스크확산법을 이용하여 항균제 감수성 검사를 시행하였다. 그리고 중합효소연쇄반응과 염기서열분석을 통해 플라스미드 매개 항균제 내성 유전자를 조사하였다. 총 43균주 중 2균주가 $bla_{CTX-M-14}$ 유전자를 포함하고 있었으며 qnrS 및 aac(6')-Ib-cr 유전자도 각각 2균주와 5균주에서 확인되었다. 총 43균주를 대상으로 항균제 감수성을 조사한 결과 cefepime, ceftazidime, 및 cefaclor를 제외한 모든 항균제에 대해 0.0%부터 23.3%까지의 낮은 감수성률을 보였다. 본 연구에서는 닭으로부터 분리된 대장균에 플라스미드 매개 항균제 내성유전자가 확산되어 있음을 확인하였다. 항균제 내성 유전자의 확산을 막기 위해서는 지속적인 항균제 내성유전자의 조사와 감시가 필요할 것으로 사료된다.