• 제목/요약/키워드: digital PCR

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동상의 임상적 분석 (Clinical Analysis of Frostbite)

  • 최장규;김현철;신홍경
    • Journal of Trauma and Injury
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    • 제28권3호
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    • pp.158-169
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    • 2015
  • Purpose: Frostbite can affect still soldiers. Initial clinical manifestations are similar for superficial and deep frostbite, so early treatment is identical. It is under-estimated by physicians. We try to identify the challenges of managing these complex tissue injuries. Methods: A retrospective analysis of 84 patients hospitalized at AFCH from 2009 to 2015 was conducted. We investigated differences of epidemiological characteristics, identification of soft tissue injury, treatment and complications between superficial (SF: 43; 51.2%) and deep (DF: 41; 48.8%) frostbite. Results: The major (94.0%) developed frostbite in dry circumstances (89.3%). Wet circumstances (66.7%) were more susceptible to DF rather than dry (46.7%). The 38 (45.2%) arrived to specialist within 7days. Most prone sites were feet, followed by hands. Toes had more deep injuries. DF presented more increased levels of ALT, CPK, CKMB, CRP. The bone scan of W+S+ was 48.3%, 87.1% and W+S- was 20.7%, 12.9%, respectively. The treatment resulted in improved or normalized perfusion scan with matching clinical improvement. It was a good tool to assess treatment response. Eighteen normal and 8 stenotic type of PCR resulted in normal with matching clinical improvement. One continuous obstructive waveform led to minor amputation. Twelve underwent both PCR and MRA. Among 6 normal PCR, 5 showed normal and one stenosis in MRA. All 5 stenosis and one obstruction showed the same findings in MRA. It was a good tool to evaluate vascular compromise. They were treated with rapid rewarming (11.6%, 22.0%), hydrotherapy (16.3%, 29.3%), respectively. Six (14.6%) underwent STSG, 2 (4.9%) had digital amputation in DF. Berasil, Ibuprofen, Trental were commonly administered. PGE1 was administered selectively for 6.8, 10.8 days, respectively. Raynaud's syndrome (16.3%), CRPS (4.7%), LOM (14.6%) and toe deformity (4.9%) were specific sequelae. Conclusion: We should recommend intensive foot care education, early rewarming and evacuation to specialized units. The bone scanning and PCR should allow for a more aggressive and active approach to the management of tissue viability.

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비디오와 동기화된 물체의 위치정보 표현 data stream 생성 및 해석기 구현 (Generation and Interpretation of data stream for position data of objects synchronized with video)

  • 나희주;김정환;정문열
    • 한국방송∙미디어공학회:학술대회논문집
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    • 한국방송공학회 2005년도 학술대회
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    • pp.249-254
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    • 2005
  • 본 논문은 디지털 방송 프로그램 진행 중 비디오의 특정 시점에 동기화된 특정 객체의 위치정보를 표현하는 data stream을 생성하고, 그 시점에 해당 위치 정보를 해석하는 해석기에 관한 것이다. 현재의 상용 스트림 생성기는 디지털 방송 표준에서 권고하는 스트림 이벤트의 발생 시각과 셋톱박스에서 디코딩 시에 사용할 참조값을 적절하게 생성하지 못하고 있다. 또한, 셋톱박스에서 동작하는 애플리케이션(Xlet) 역시 STC(System Time Clock), PCR(Program Clock Reference), NPT(Normal Play Time) 등의 시간값을 적절하게 읽어내지 못하고 있다. 더욱이, 현재의 디지털 방송 표준에서는 영상 내 특정 객체를 위해 정보를 제공하는 데에는 한계가 있다. 따라서, 본 논문에서는 다양한 연동형 디지털 방송 프로그램 제작을 위해 비디오의 특정 시점에 동기화된 객체의 위치정보를 표현하는 data stream을 생성하는 방법과, 동기화된 데이터를 처리하는 애플리케이션에 대해서 설명한다.

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디지털 TV 스트림 분석기 구현 (An Implementation of Digital TV Stream Analyzer)

  • 정혜진;김용한
    • 방송공학회논문지
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    • 제6권1호
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    • pp.82-97
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    • 2001
  • 본 논문에서는 디지털 TV 방송 스트림을 분석, 검증하기 위한 시스템을 PC 상에서 소프트웨어 기반으로 구현하였다. 저장되어 있는 MPEG-2 트랜스포트 스트림(transport stream. TS) 파일을 입력으로 받으며 별도의 하드웨어 장치를 사용하지 않는다. 이 분석기는 프로그램 규격 정보 (program specific Information, PSI). TS 섹션. TS 헤더 등 기본 내용 뿐만 아니라, TS 패킷들을 오디오, 비디오, 클록참조값(program clock reference. PCR). 부가 데이터. 널(null) 패킷 등으로 구분하여 그래픽 사용자 인터페이 스 통하여 보여 준다. 또한, 현재 표시되고 있는 75 패킷과 가장 가까운 I 프레임를 디스플레이해 줌으로써 비트스트림 상의 오류 부분을 실제 영상과 쉽게 매팅시킬 수 있도록 해 준다. 본 논문의 분석기는 MPEG-2 비트스트림 적합성 검사 기능도 제공하며, 데이터 방송을 위한 여러 가지 부가 데이터를 기존 MPEG-2 스트림에 삽입하는 기능도 갖고 있다. 본 논문의 분석기를 이용함으로써 저비용으로 방송 스트림을 분석, 검증할 수 있을 뿐만 아니라, 실험실 연구를 위한 대화형 방송 및 데이터 방송용 비트 스트림을 저비용으로 제작할 수 있다.

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Gene Expression Profile and Its Interpretation in Squamous Cell Lung Cancer

  • Park, Dong-Yoon;Kim, Jung-Min;Kim, Ja-Eun;Yoo, Chang-Hyuk;Lee, Han-Yong;Song, Ji-Young;Hwang, Sang-Joon;Yoo, Jae-Cheal;Kim, Sung-Han;Park, Jong-Ho;Yoon, Jeong-Ho
    • Molecular & Cellular Toxicology
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    • 제2권4호
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    • pp.273-278
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    • 2006
  • 95 squamous cell lung carcinoma samples (normal tissue: 40 samples, tumor: 55 samples) were analyzed with 8 K cDNA microarray. 1-way ANOVA test was employed to select differentially expressed genes in tumor with FDR<0.01. Among the selected 1,655 genes, final 212 genes were chosen according to the expression fold change and used for following analysis. The expression of up-regulated 64 genes was verified with Reverse Transcription PCR and 10 genes were identified as candidates for SCC markers. In our opinion, those candidates can be exploited as diagnostic or therapeutic purposes. Gene Ontology (GO) based analysis was performed using those 212 genes, and following categories were revealed as significant biological processes: Immune response (GO: 0006955), antigen processing (GO: 0030333), inflammatory response (GO: 0006954), Cell adhesion (GO: 0007155), and Epidermis differentiation (GO: 0008544). Gene set enrichment analysis (GSEA) also carried out on overall gene expression profile with 522 functional gene sets. Glycolysis, cell cycle, K-ras and amino acid biosynthesis related gene sets were most distinguished. These results are consistent with the known characteristics of SCC and may be interconnected to rapid cell proliferation. However, the unexpected results from ERK activation in squamous cell carcinoma gripped our attention, and further studies are under progress.

비만세포에서 은행잎 플라보놀에 의한 Th2 Cytokine 발현 및 신호전달 억제 기전 효과 (Suppressive effects of Th2 cytokines expression and the signal transduction mechanism in MC/9 mast cells by flavonol derived from Ginkgo biloba leaves)

  • 권혜영;정규진;정광조
    • 디지털융복합연구
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    • 제13권8호
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    • pp.503-514
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    • 2015
  • 은행잎 유래 플라보놀 성분이 갖는 항아토피 활성에 대해 입증된 바는 드물다. 이 논문에서는 MC/9 비만세포에서의 은행잎 플라보놀의 항아토피 효과를 조사하기 위하여 ELISA와 Real-time PCR, western blot으로 은행잎 플라보놀을 분석하였다. 분석 결과 IL-13, MIP-1a의 생성량은 농도 의존적으로 현저하게 감소되었으며 IL-4, IL-5, IL-13, TNF-a 유전자 발현량은 25, 50, $100{\mu}g/m{\ell}$의 농도에서 효과적으로 억제되었다. western blot 분석 결과 c-jun과 NFAT-1단백질 발현이 감소되었음을 확인하였다. 이러한 결과들은 은행잎 유래 플라보놀 성분이 NFAT-1, c-jun 전사인자의 전사를 억제함으로써 MC/9 비만세포에서의 Th2 싸이토카인의 생성을 감소시키는 효과를 갖는 것을 나타낸다. 따라서 은행잎 유래 플라보놀 성분이 아토피 피부염 치료제로서 활용가능성이 있음을 보고하고자 한다.

한국인 전반적 급진성 치주염 환자에서 발견된 TNF-α 유전자의 다변성 (Gene Polymorphism of TNF-α in Korean Generalized Aggressive Periodontitis)

  • 김일신
    • 디지털융복합연구
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    • 제14권1호
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    • pp.321-326
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    • 2016
  • 치주질환은 치아주위 조직에 발현된 염증성 질환이다. 전염증성 사이토카인인 $TNF-{\alpha}$는 국소적인 염증이나 전반적인 염증과 관련이 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구의 목적은 한국인에서 TNF 유전자 다형성과 전반적 급진성 치주염 간의 관계를 알아보고자 하였다. 연구대상은 실험군이 60명, 대조군이 81명 이었다. 협측에서 DNA를 채취하여 각 제한효소를 이용한 PCR-RFLP에 의해 $TNF-{\alpha}-308$과 -238을 측정하였다. 급진성 치주염 환자에서 $TNF-{\alpha}-308$ 유전자형은 A/A 3.2%, A/G 38.7% 그리고 G/G 82.35%가 나타났으며 대조군에서는 각 9.1%, 45.5%, 45.5%로 유의한 차이를 보이는 결과이다. $TNF-{\alpha}-238$의 대립유전자 2의 빈도는 실험군에서 67.6%, 대조군에서 72.2%로 유의한 차이를 보였다. 이러한 결과에 따르면 $TNF-{\alpha}-308$과 -238의 유전자다변성은 한국인의 급진성치주염과 연관이 있을 것으로 생각된다.

전자파에 노출된 생쥐에서 운동량에 따른 뇌의 유전자 변화 (The Gene Expression Level Differences associated with Exercise in the Mouse Brain exposed to Radiofrequency Radiation)

  • 이민선
    • 디지털융복합연구
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    • 제18권1호
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    • pp.241-247
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    • 2020
  • 전자파 노출이 자발운동에 따른 뇌의 유전자 발현에 미치는 영향을 10 주간 4그룹 즉, 정상 그룹, 자발운동 그룹, 전자파 노출 그룹, 전자파 노출 및 자발운동 그룹으로 나누어 조사하였다. 선조체(striata)와 시상하부(hypothalamus)에서 RT-PCR을 수행하였으며, 타이로신수산화효소(TH), FoxO3a, AMPKα, mRNA 발현을 조사하였다. 선조체에서 TH mRNA 발현은 자발운동과 전자파 노출 조건에서 각각 감소하였고, 전자파 노출 및 자발운동 그룹에서 더 많이 감소되었다. 이 결과는 전자파 노출 및 자발운동 그룹에서의 운동량 감소가 선조체에서 도파민이 감소할 수 있음을 시사한다. 선조체에서 FoxO3a mRNA 발현은 자발운동 그룹에서 증가했지만, 전자파 노출 및 자발운동 그룹은 현저히 감소했다. 시상하부에서는 TH mRNA 유전자 발현은 전자파 노출을 받은 자발운동 그룹에서 감소가 유의했으며, FoxO3a mRNA는 발현의 현저한 증가가 있었다. 전자파가 기억력에 미치는 영향도 밝히기 위해 해마에서의 여러 단백질들의 발현을 추후 조사할 것이다.

Lmbr1 Expression in Early Embryo Development Stages in White Leghorn and Chinese Silky

  • Zhang, Ying;Xu, Weizhuo;Li, Ning
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제22권1호
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    • pp.7-12
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    • 2009
  • Lmbr1 is regarded as a key gene that controls the digital model formation in early developmental stages of the chicken. However, there are few reports of lmbr1 expression levels and tendencies in 4-toe and 5-toe chicken species. Therefore, the objective of this study was to compare the lmbr1 expression in White Leghorn (4-toe) and Chinese Silky (5-toe). Firstly, total RNA was extracted from 14 different embryonic development stages (HH3 to HH31) in White Leghorn and Chinese Silky. Secondly, dramatic gene expression changes of lmbr1 were monitored by RT-PCR, which indicated a general up-down-up tendency with subtle differences between these two species. Moreover, Q-PCR reactions were performed to quantitate the expression level of lmbr1 in the 14 selected developmental stages. These data demonstrated a first lmbr1 expression peak of 18.68 and 15.32, a lmbr1 expression trough of 6.61 and 1.80, and a second lmbr1 expression peak of 22.33 and 12.48 in White Leghorn and Chinese Silky, respectively. Finally, embryonic in situ hybridization analysis identified that lmbr1 expressed in the ectoderm in HH21, HH23 and HH24 developmental stages in both species.

온도센서를 사용하지 않는 MEMS 마이크로히터 온도제어시스템 (A Sensorless and Versatile Temperature-Control System for MEMS Microheaters)

  • Bae, Byung-Hoon;Yeon, Jung-Hoon;Flachsbart Bruce R.;Shannon Mark A.
    • 대한전기학회논문지:전기물성ㆍ응용부문C
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    • 제55권11호
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    • pp.544-547
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    • 2006
  • In this paper, we present a temperature-controlled system for MEMS electrical resistance heaters without a temperature sensor. To rapidly control the heater temperature, the microheater system developed consists of a power supply, power amplifier, digital ${\underline{P}}roportional-{\underline{I}}ntegral-{\underline{D}}ifferential$ (PID) controller, and a quarter bridge circuit with the microheater and three resistors are nominally balanced. The microheaters are calibrated inside a convection oven to obtain the temperature coefficient with a linear or quadratic fit. A voltage amplifier applies the supply voltage proportional to the control signal from the PID controller. Small changes in heater resistance generate a finite voltage across the quarter bridge circuit, which is fed back to the PID controller to compare with the set-point and to generate the control signal. Two MEMS microheaters are used for evaluating the developed control system - a NiCr serpentine microheater for a preconcentrator and a Nickel microheater for ${\underline{P}}olymerase\;{\underline{C}}hain\;{\underline{R}}eaction$ (PCR) chip.

Non-invasive evaluation of embryo quality for the selection of transferable embryos in human in vitro fertilization-embryo transfer

  • Jihyun Kim;Jaewang Lee;Jin Hyun Jun
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제49권4호
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    • pp.225-238
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    • 2022
  • The ultimate goal of human assisted reproductive technology is to achieve a healthy pregnancy and birth, ideally from the selection and transfer of a single competent embryo. Recently, techniques for efficiently evaluating the state and quality of preimplantation embryos using time-lapse imaging systems have been applied. Artificial intelligence programs based on deep learning technology and big data analysis of time-lapse monitoring system during in vitro culture of preimplantation embryos have also been rapidly developed. In addition, several molecular markers of the secretome have been successfully analyzed in spent embryo culture media, which could easily be obtained during in vitro embryo culture. It is also possible to analyze small amounts of cell-free nucleic acids, mitochondrial nucleic acids, miRNA, and long non-coding RNA derived from embryos using real-time polymerase chain reaction (PCR) or digital PCR, as well as next-generation sequencing. Various efforts are being made to use non-invasive evaluation of embryo quality (NiEEQ) to select the embryo with the best developmental competence. However, each NiEEQ method has some limitations that should be evaluated case by case. Therefore, an integrated analysis strategy fusing several NiEEQ methods should be urgently developed and confirmed by proper clinical trials.