• 제목/요약/키워드: cytochrome b

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DIFFERENTIAL INDUCTION OF RAT LIVER MICROSOMAL CYTOCHROME-DEPENDENT MONOOXYGENASE AND UDP-GLUCURONOSYLTRANSFERASE ACTIVITIES BY VARIOUS NARCOTIC DRUGS

  • Hong, Young-Sook;Pae, Young-Sook
    • Toxicological Research
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    • 제5권1호
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    • pp.17-25
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    • 1989
  • Chronic adminstraction of morphine to adult male rats has long been known to lower hepatic cytochrome p-450 content and its dependent mixed-function oxidase activity. Following the treatment of adult male rats with morphine, pethidine pentazocine and codeine and also by concomitant adminstration of naloxone activities of microsomal electron transfer in the adult male rats were examined. In present study, the acute treatment of mature male rats with a dose of narcotic drugs higher than that used chronically also reduces their hepatic cytochrome p-450.

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한국산 짱뚱어(Boleophthalmus pectinirostris)와 남방짱뚱어(Scartelaos gigas) (Gobiidae)의 분자유전학적 계통연관과 DNA 다형화 (Phylogenetic Relationship and DNA Polymorphism of Boleophthalmus pectinirostris and Scartelaos gigas (Teleostei: Gobiidae) of Korea)

  • 최기호;정의영;박갑만
    • 한국어류학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.149-156
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    • 2013
  • 우리나라 망둑어과 어류 중 말뚝망둥어아과에 속하며 형태학적으로 흡사한 짱뚱어 (B. pectinirostris)와 남방짱뚱어(S. gigas)를 대상으로 12S rRNA, 16S rRNA 및 mitochondria cytochrome b 유전자의 염기서열 분석을 통해, 종내 및 종간의 분자유전학적 특성을 파악하고자 하였다. 짱뚱어 종내 개체간 유전적 차이를 밝히기 위해 mitochondria내에 3가지 유전자를 분석한 결과, 순천지역과 군산지역간의 염기서열은 12S rRNA는 총 434 bp (base pair)의 염기서열을 얻었으며 이를 비교 분석한 결과, 순천지역과 군산지역의 집단 간에는 100% 동일한 염기서열을 보였고, 16S rRNA 유전자는 총 484 bp의 염기서열 중 99.6%의 차이로 단지 2 bp가 치환된 것으로 나타났고, mitochondria cytochrome b 유전자의 경우, 444 bp의 염기서열을 얻었으며 두 지역 간 염기서열은 100%의 일치도를 보였다. 한국산 짱뚱어를 대상으로 한 동일한 종내에서 서식지 (서해, 남해)에 따른 유전적 차이나 지리적 거리의 차이가 있을 것으로 예상하였으나 이상의 3가지 유전자를 비교해 본 결과를 종합해 보면, 종내 개체 변이와 지역별 변이는 일어나지 않은 것으로 밝혀졌다. 또한 짱뚱어와 남방짱뚱어 2종간 비교 (inter-species)에서는 순천지역 짱뚱어와 해남지역 남방짱뚱어를 12S rRNA 유전자와 16S rRNA 유전자 및 mitochondria cytochrome b 유전자 염기서열을 비교 분석한 결과, 각각 96.1% (17 bp), 94.0 (29 bp), 그리고 82.9% (76 bp)로 나타나 두 종의 유전학적 차이는 크게 나타났다. 따라서 본 연구에서 나타난 짱뚱어와 남방짱뚱어 두 종간에 3.9~17.1%를 보여 서로 다른 종으로 볼 수 있을 것으로 사료되었다.

유기주석화합물이 해산 어류의 간장 MFO 효소계에 미치는 영향 (Effects of Tributyltin in vitro on Hepatic Monooxygenase System in Marine Fishes)

  • 전중균;이미희;이지선;심원준;이수형;허형택
    • 환경생물
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    • 제21권1호
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    • pp.18-25
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    • 2003
  • 본 연구는 내분비교란물질로 알려진 TBTC가 해양생물에게 미치는 영향을 조사하는 연구의 일환으로, 이 화합물에 노출시킨 어류의 간장 MFO 효소계의 반응을 in vitro로 조사하였다. 대상 어류는 개복치(Mola mola), 숭어(Mugil cephalus), 강도다리(Ptatichthys stellatus), 청어(Clupeu pallasii), 붕장어(Astroconger myriaster), 조피볼락 (Sebastes schlegeli), 참돔(Pugrus major), 넙치(Paralichthys olivaceus)이며, 이들의 간장 미크로좀을 2mM의 TBTC와 in vitro (3$0^{\circ}C$, 20분)로 배양하고 cytoch-rome P45O (CYP), cytochrome b5, NAD(P)H -cytochro-me c 환원효소를 비롯한 탈알킬화 효소들(EROD, PROD, MROD, ECOD)의 변화를 조사하였다. TBTC는 환원효소의 측정 시에는 DMSO에, 그리고 그 밖의 효소 측정시에는 메탄올에 녹여 2% 농도로. 첨가하였다. 어류의 간장 CYP 함량은 TBTC와 배양 후 대부분(6 어류/8어류)에서 10% 이하로 크게 저해되었으나, cyto-chrome b5함량은 변함이 없었다. 하지만 NAD(P)H 의존성 환원효소의 반응은 어류에 따라 달랐고, CYP 외에 두 환원효소도 모두 영향을 받아 저해되는 타입 1(개복치, 조피볼락, 청어, 강도다리, 참돔), CYP 외에 NADH 의존성 환원효소만 저해되는 타입 2(붕장어, 숭어)및 CYP 저해되지만 두 환원효소는 영향을 받지 않거나 오히려 유도되는 타입 3 (넙치)으로 구분되었다. 그리고 대부분(7/8)의 어류에서는 NADH 의존성 환원효소가 NADPH 의존성 환원효소에 비해 더욱 저해되는 경향을 보였다. TBTC는 어류의 탈알킬화 효소에도 영향을 미쳤고, 어류별 EROD활성의 저해는 개복치, 참돔, 붕장어, 조피볼락(잔존율 1~7%)>숭어, 청어 (14~30%)>넙치, 강도다리(56~65%)의 순이었으며, ECOD 활성의 저해도 개복치, 참돔, 붕장어 (36~38%)>조피볼락(63%))숭어, 청어, 넙치, 강도다리(90%)의 순으로 비슷한 경향이었다. 한편, 넙치와 강도다리에서는 PROD가 MROD보다 더욱 심하게 저해되었다. 이처럼 어류 간장의 약물대사 효소계는 TBTC에 의한 저해 정도가 어류에 따라 심한 차이를 보였다.

Cytochrome c Peroxidase: A Model Heme Protein

  • Erman, James E.;Vitello, Lidia B.
    • BMB Reports
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    • 제31권4호
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    • pp.307-327
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    • 1998
  • Cytochrome c peroxidase (CcP) is a yeast mitochondrial enzyme which catalyzes the reduction of hydrogen peroxide to water using two equivalents of ferrocytochrome c. The CcP/cytochrome c system has many features which make it a very useful model for detailed investigation of heme protein structure/function relationships including activation of hydrogen peroxide, protein-protein interactions, and long-range electron transfer. Both CcP and cytochrome c are single heme, single subunit proteins of modest size. High-resolution crystallographic structures of both proteins, of one-to-one complexes of the two proteins, and a number of active-site mutants are available. Site-directed mutagenesis studies indicate that the distal histidine in CcP is primarily responsible for rapid utilization of hydrogen peroxide implying significantly different properties of the distal histidine in the peroxidases compared to the globins. CcP and cytochrome c bind to form a dynamic one-to-one complex. The binding is largely electrostatic in nature with a small, unfavorable enthalpy of binding and a large positive entropy change upon complex formation. The cytochrome c-binding site on CcP has been mapped in solution by measuring the binding affinities between cytochrome c and a number of CcP surface mutations. The binding site for cytochrome c in solution is consistent with the crystallographic structure of the one-to-one complex. Evidence for the involvement of a second, low-affinity cytochrome c-binding site on CcP in long-range electron transfer between the two proteins is reviewed.

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Genetic Differentiation in the Mitochondrial Cytochrome b Gene of Korean Brown Frog, Rana dybowskii (Amphibia: Ranidae)

  • Kim, Yu-Ri;Yang, Dong-Eun;Lee, Hyuk;Lee, Jung-Eun;Lee, Hyun-Ick;Yang, Suh-Yung;Lee, Hei-Yung
    • Animal cells and systems
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    • 제3권2호
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    • pp.199-205
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    • 1999
  • The nucleotide sequences of a 504 bp segment of the mitochondrial cytochrome b gene were analyzed to survey the intraspecific variation of the brown frog, Rana dybowskii, collected from nine populations in South Korea. Comparisons of sequence divergence of the cytochrome b gene suggest that the populations examined are clearly classified into two types (type 1 and type 2), diverged from each other by a high value of 14.3-15.9% sequence divergence. The two types are distributed allopatrically in most populations, but only one population occurs sympatrically. In the Tonghae population, their spawning grounds differ in that type 1 spawns in the puddle and type 2 spawns in the mountain creek. Based on the genetic divergences of the cytochrome b gene sequences, the phylogenetic status of Korean R. dybowskii is elucidated by comparing it with related brown frogs distributed in an area adjacent to the Korean Peninsula. Interspecific sequence divergences among type 1, type 2 and other related brown frog species (Russian R. dybowskii, R. pirica, R. ornativentris, R. chensinensis: 2n=24 chromosomes) used in this study ranged from 11.7 to 16.3%. R. dybowskii in Tsushima is very similar to our type 1 (sequence divergence=0-1.6%) and R. chensinensis in western China is closest to our type 2 (sequence divergence=6.8-7.5%).

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Genetic Relationships of Korean Treefrogs (Amphibia; Hylidae) Based on Mitochondrial Cytochrome b and 12S rRNA Genes

  • Jung Eun Lee;Dong Eun Yang;Yu Ri Kim;Hyuk Lee;Hyun Ick Lee;Suh-Yung Yang;Hei Yung Lee
    • Animal cells and systems
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    • 제3권3호
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    • pp.295-301
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    • 1999
  • The nucleotide sequence of a 447 base pair fragment in the mitochondrial cytochrome b gene and the complete sequence of the mitochondrial 12S ribosomal RNA gene, 938 bp, were analyzed to infer inter- and intraspecific genetic relationships of Hyla japonica and H. suweonensis from Korea and H, japonica from Japan. In the mitochondrial cytochrome b gene, genetic differentiation among H. japonica populations were 9.62% and 15.66% between H. japonica and H. suweonensis. Based on the Tamura-Nei distance, the level of sequence divergence ranged from 0.45% to 2.75% within Korean H. japonica, while 8.31%-8.87% between Korean and Japanese H. japonica and 11.51%-12.46% between H. japonica and H. suweonensis. In the neigh-bor-joining tree, Korean populations of H. japonica were clustered first at 2.22% and followed by Japanese H. japonica and H. suweonensis at 8.51% and 12.29%, respectively. In mitochondrial 12S rRNA gene, genetic differentiation between H. japonica and H. suweonensis nras 7.17% (68 bp) including 7 gaps. Based on Tamura-Nei distance, the level of sequence divergence ranged 3.53% between Korean and Japanese H. japonica and from 4.93% to 5.41% between H. japonica and H. suweonensis. Phenogram pattern of the 12S rRNA gene sequence corresponded with that of the mitochondrial cytochrome b gene.

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Phylogenetic Relationships among Groupers (Genus Epinephelus) Based on Mitochondrial Cytochrome b DNA Sequences

  • KANG Geo Young;SONG Choon Bok
    • 한국수산과학회지
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    • 제37권5호
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    • pp.414-422
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    • 2004
  • To infer phylogenetic relationships among Epinephelus species inhabiting coastal regions of Korean peninsula, mitochondrial cytochrome b genes from 9 species belonging to the subfamily Epinephelinae were PCR-amplified, cloned and sequenced. Aligned cytochrome b sequences of 10 species containing one additional sequence from GenBank were 1,140 base pairs in length, including 439 variable and 330 parsimony informative sites. The cytochrome b genes of 10 species, as other vertebrates studied to date, exhibit unequal base compositions: an entirely low G content ($15.2{\pm}0.3{\%}$on average) and almost equal T, C and A contents ($29.3{\pm}0.8{\%},\;30.7{\pm}1.0{\%},\;and\;24.8{\pm}0.5{\%}$ on average, respectively).In third codon positions, transitional substitutions especially between Epinephelus species and outgroup species are almost certainly saturated or near saturation. Phylogenetic analyses were performed with sequence data from 8 Epinephelus species and 2 outgroup species (Cephalopholis urodela and Vaviola louti) by using distance-based (neighbor-joining and minimum evolution) and parsimony-based (maximum parsimony) methods. The results showed that the monophyly of the genus Epinephelus was supported by relatively high bootstrap values. However, phylogenetic relationships among E. areolatus, E. moara, E. septemfasciatus, and Epinephelus sp were poorly resolved. Within the genus Epinephelus, three resolved monophyletic groups were found: clade 1 included E. akaara and E. awoara;, clade 2 included E. fasciatus and E. merra; and clade 3 included E. akaara, E. awoara, E. fasciatus, E. merra, E. areolatus, E. moara, E. septemfasciatus and Epinephelus Sp.

한국산 쉬리, Coreoleuciscus splendidus (잉어과)의 종내 집단간 분자 유전 변이 (A molecular Genetic Variation among Intra-poplations of Korean shiner, Coreoleuciscus splendidus Mori (Cyprinidae))

  • 송호복;박갑만
    • 한국어류학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.78-86
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    • 2006
  • 한국산 쉬리, Coreuleuciscus splendidus의 종내 집단간 유전자 다양성을 알기 위해 6개 주요강(북한강, 남한강, 금강, 오십천, 낙동강, 섬진강)으로부터 채집된 개체를 대상으로 16S rRNA 유전자와 미트콘드리아 cytochrome b 유전자에 근거하여 비교 분석하였다. 미트콘드리아 cytochrome b 유전자의 657 bp 길이의 염기서열 분석결과, 6개 집단간에 차이는 98.2~99.9%로 나타났으며 지리적으로 격리된 집단간에 높은 유전적 다양성을 보였다. 16S rRNA 유전자는 697 bp의 염기서열을 얻었으며, 종내 변이는 큰 차이가 없이 거의 동일하였다. 16S rRNA 유전자의 6개 집단간에는 97.7%에서 99.7%의 높은 유사성을 보였다.

Mitochondrial Cytochrome b gene의 분석에 의한 한국산 미꾸리과 어류(Cobitidae)의 계통 (Molecular Phylogeny of Korean Loaches Inferred from Mitochondrial DNA Cytochrome b Sequences)

  • 김소영;김익수;장광엽;장미희
    • 한국어류학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.223-229
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    • 2000
  • 한국산 미꾸리과 어류의 계통유전학적 관계를 고찰하고자 8종의 mitochondrial cytochrome b의 유전자 서열을 비교한 결과 대부분 이전의 형태학적 연구의 결과와 일치하였다. 그러나 종개속 Orthrias과 쌀미꾸리속 Lefua의 분류학적 위치는 미꾸리과 Cobitidae와 paraphyletic group으로 나타났으며 이 두 속의 sequence divergence는 0.184~0.272으로 나타나 미꾸리과와 잉어과 사이의 divergence와 유사하였다. 한편 참종개속 Iksookimia 2종과 북방종개 Cobitis melanoleuca는 각각 다르게 분화한 결과를 보여 주었으며 또한 중국산 미꾸리와 한국산 영덕 미꾸리의 sequence divergence는 0.099로 종간의 divergence를 보여주어 주목되었다. 미꾸리과 어류 가운데 참종개속의 일부 어류는 분류학적 위치로 보아 이들의 기원이 미꾸리과의 속간 잡종기원으로 생각된다.

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쥐 근조직의 Cytochrome Oxidase에 대한 비교 연구 (Comparative Study on Cytochrome Oxidase of Rat Muscle Tissues)

  • Song, Eun-Sook
    • 한국동물학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.70-74
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    • 1986
  • 쥐 골격근의 크루드 미토콘드리아에 있는 시토크롬 옥시다제의 활성을 비교 하였다. 붉은색의 빠른 트윗치 근육은 가장 높은 효소 활성을 나타냈고, 흰색의 빠른 트읫치 근육은 가장 낮았으며, 붉은 색이며 느린 트윗치 근육은 그 중간이었다. 위 세가지 타입의 근육에서 힘 염색한 결과 시토크롬 옥시다제의 전기영동상의 이동성이 다르게 나타났다. 이동성의 순서는 타입 I > 타입 $II_A$ > 타입 $II_B$이었다. 면역학적 전기영동의 결과는 위의 결과를 뒷받침 하였다.

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