Seung Hyeok Soung;Jaeho Song;Seung Yeol Shin;Song-Ih Han
Journal of Species Research
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제12권4호
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pp.267-276
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2023
To obtain unrecorded bacterial species in Korea, various soils of coastal areas were collected from the Republic of Korea in 2022. After plating the samples on marine agar and incubating aerobically and anaerobically, approximately 1,700 bacterial strains were isolated and identified using 16S rRNA gene sequences. A total of 20 strains showed ≥98.7% 16S rRNA gene sequence similarity with validly published bacterial species but not reported in Korea, indicating they are unrecorded bacterial species in Korea. The unrecorded bacterial strains belonged to four phyla, six classes, 15 orders, 16 families, and 19 genera which were assigned to Blastomonas and Sphingomonas of the class Alphaproteobacteria; Pseudidiomarina, Kushneria, Salinicola, and Salinisphaera of the class Gammaproteobacteria; Evansella, Virgibacillus, and Paenibacillus of the class Bacilli; Cyclobacterium of the class Cytophagia; Pedobacter of the class Sphingobacteriia; and Demequina, Ornithinimicrobium, Blastococcus, Jatrophihabitans, Kineococcus, Glaciihabitans, Aeromicrobium and Streptomyces of the class Actinomycetes. The details of the 20 unreported species, including Gram reaction, morphology, biochemical characteristics, and phylogenetic position are also provided in the description of the strains.
Da Som Kim;Seung Yeol Shin;Heeyoung Kang;Jae Ho Song;Song-Ih Han
Journal of Species Research
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제13권3호
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pp.310-317
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2024
Various samples from island and coastal ecosystems in South Korea were investigated to discover unrecorded bacterial species. Soils from these areas, along with seawater samples, were plated on marine agar and R2A agar (containing 3% sea salt). From these samples, approximately 1,070 bacterial strains were isolated as single colonies and identified using 16S rRNA gene sequences. A total of 20 strains, which exhibited at least 98.7% similarity in their 16S rRNA gene sequences to those of validly published bacterial species not yet reported in Korea, were identified as unrecorded bacterial species. These strains belonged to three phyla, six classes, 10 orders, 14 families, and 16 genera. These were assigned as follows: Thioclava, Breoghania, Acidovorax, Erythrobacter, Paracoccus, Jiella, Aurantimonas, and Qipengyuania within the class Alphaproteobacteria; Pseudomonas, Cobetia, and Rheinheimera within the class Gammaproteobacteria; Aequorivita, Leeuwenhoekiella, and Polaribacter within the class Flavobacteriia; Algoriphagus within the class Cytophagia; and Microbacterium within the class Actinobacteria. The unreported species underwent further taxonomic characterization, which included assessments of Gram reaction, colony and cell morphology, biochemical and phylogenetic characteristics.
Fisheries' biological resources were considered public resources before the 1990s. Every country could access and use these resources without regulation. However, the United Nations adopted the Convention on Biological Diversity and the privileges and rights to these resources were attributed to countries. This research starts with the research background and social and academic value of "The Jasan Eobo (or Report on Marine Organisms in the Coastal Waters near Heuksan Island)" by Jeong Yak-Jeon, who pioneered the new field of Fisheries Science and Marine Biology in Korea in the early 1800s. We also searched for recent results from the Marine Bio-Diversity Research Activities of the Korean National Council for Conservation of Nature (KNCCN) and the Ministry of Maritime Affairs and Fisheries (MOMAF). KNCCN reported that marine bio-diversity comprised approximately 6,500 species in 1996, and the Ministry of Maritime Affairs and Fisheries reported there were about 10,000 species in 2007. Among these marine species, plankton account for about 25%, seaweeds 11%, invertebrates 52%, and vertebrates 12% in Korean Coastal Areas. The Ministry for Food, Agriculture, Forestry, and Fisheries (MIFAFF) enacted a law for Agriculture and Fisheries Resources Management in 2012; this law includes the preservation of marine ecosystems, the conservation of wetlands and the preservation of fisheries resources, and describes the boundary of taxonomy for new species and unknown species that could be identified in the near future. To follow the new regulation for Access to General Resources and Benefit-Sharing, this research suggests (1) the importance of taxonomy for new species and unknown species as a goal of "No Name = No Information", (2) integrated research on bio-diversity, species distributions and the abundance of fisheries resources, both in local areas and in Korean Coastal Areas, and (3) the observance of international regulations or agreements for benefit-sharing without additional damage in the future.
Species composition in the coastal waters off Ulleungdo of Korea were examined based on catches bimonthly collected by trammel net in 2013. A total of 711 individuals and 181.9 Kg were caught and catches were composed of 4 classes 15 orders 27 families 52 species including 44 Pisces, 4 Gastropoda, 3 Cephalopoda, and 1 Echinodermata. The dominant species in biomass were File fish (Thamnaconus modestus), Atka mackerel (Pleurogrammus azonus), and Greenling (Hexagrammos otakii). Data were summarized using hierarchical cluster analysis (HCA) and detrended correspondence analysis (DCA) to examine similarity in species composition for each month, and community structure in Ulleungdo was divided into two groups. Community structures in February, April and December with low temperature and well-mixed surface water were distinguished from those in June, August and October with high temperature and strong stratification, which could be attributed to temporal changes in dominant species. Atka mackerel and Spear squid mainly caught in February and April, disappearing in June, August and October, and File fish outburst was shown in October. Because the water off Ulleungdo has been under low human pressure, it could be a good case study to elucidate effects of climate change on community structure and ecosystem in the East sea. Continuous surveys and further studies are required to demonstrate migration route and distribution of dominant species and long-term changes in community structure in the water of Ulleungdo.
Coastal fisheries in Korean waters have highly complexity with a variety of fishing gears, and scale of those fisheries is smaller than that of offshore fisheries. As a result, important spawning and nursery grounds for many species of fish has been destroyed. The pragmatic ecosystem-based approach was developed for the assessment of fisheries resources in Korean waters by Zhang et al. (2009; 2010). As for the species risk index (SRI), common squid caught by coastal gillnet in the Uljin region had the highest risk. As for the fisheries risk index (FRI), coastal gillnet in the Uljin coastal waters had the highest risk. For the common squid which had the highest SRI, resources management strategies must be established such as catch prohibition of length and period with TAC. For the coastal gillnet in the Uljin region which had the highest FRI, it is judged to need management plans for conserving biodiversity as reducing the catch of non-target species and discards. Also to protect existing habitat, illegal fishery should be prohibited, and fishing gears should be designed in the environmental-friendly way considering when fishing gears lost.
Objective : The purpose of this dissertation is to make a list of the phaeophyta growing naturally in the Korean coastal waters, and to carry out a survey on the current distribution status to investigate the phaeophyta which can be used as medicinal herbs. Methods : References and research papers about herbology published at home and abroad were examined. Results : The results of this study were as follows : A total of 63 genera and 145 species of phaeophyta was found in the Korean coastal waters among which 11 genera and 15 species(approximately 11%) were medicinal plants. Out of the 145 species of phaeophyta 27 species belonged to Sargassum, and out of the 15 species of medicinal plants 4 species belonged to Sargassum. Among the medicinal parts 11 species belonged to algae. Sixteen species had cold property, and 16 species had salty flavors. Thirteen species had the efficacy of liver meridian, and 15 species had the potency of YEONKYUN, which helps to remove hard clots generated in human body. No toxic drugs were detected. Conclusion : There were totaled to 63 genera and 145 species in Phaeophyta in Korea and among them medicinal plants are 11 genera, 15 species, some 11% in total. Thirteen species had the efficacy of liver meridian, and 15 species had the potency of YEONKYUN, which helps to remove hard clots generated in human body. No toxic drugs were detected.
Coastal marine ecosystem plays important role of spawning and nursery grounds for fisheries resources. Yongil Bay is one of major coastal marine ecosystems, which is located in the southwestern East Sea of Korea. Species composition and abundance of marine organism in the Yongil Bay were investigated by season from March to November 2009. Gill net and pot fisheries were used for survey of pelagic and demersal species composition, and collected 106 species, 67 families, and 7 taxa of fisheries resources from the coastal ecosystem. Species were included 2 species in Ascidiacea, 2 species in Bivalvia, 6 in Cephalopoda, 22 in Crustacea, 5 in Echinodermata, 12 in Gastropoda, and 57 in Pisces. Diversity indices (Shannon index, H') showed seasonal variation with low value of 2.11 in winter, and high value of 2.63 in autumn. Main dominant species were Asterias amurensis, Pleuronectes yokohamae, Siphonalia spadicea fuscolineata, Trachurus japonicas, Sillago japonica, Conger myriaster, Volutharpa ampullaceal, Engraulis japonicus, Asterina pectinifera, and Portunus (Portunus) sanguinolentus that were occupied over 71.5% of total individuals, and 52.9% of wet weight. Seasonal variations of fisheries resources composition were discussed on correlationships with those of environmental factors in the coastal ecosystem of the Yongil Bay in Korea. Those results from this study will provide scientific data and information to develop the ecosystem-based coastal fisheries assessment and management system in Korea.
본 연구에서는 우리나라의 갯벌에서 조사대상으로 삼는 멸종위기야생생물이자 해양보호생물, 흰발농게(Austruca lactea)의 전체 개체수 추정 방법을 검토하였다. 일반적으로 무한모집단에 대한 전수조사는 불가능하며 이는 갯벌 내 제한된 서식처에서 개체수를 추정하더라도 마찬가지이다. 표본으로부터 추정되는 서식 밀도 역시 다양한 생물학적, 생태학적 요인들로 인해 높은 변동성을 보인다. 서식처 경계와 면적은 측정 오차뿐만 아니라 생물의 주기성이나 리듬 활동(주야, 간만 주기 등)에 따라서도 달라진다. 따라서 밀도와 서식처 면적으로 산출되는 전체 개체수는 일시적인 것으로 간주되어야 한다. 이 같은 추정은 인천 송도 갯벌에서 3년 간 관찰된 흰발농게(A. lactea)의 평균 밀도와 표준오차 범위 그리고 공간분포의 시공간적 변동성에 근거하면 타당한 것으로 볼 수 있었다. 본 연구에서는 로지스틱 회귀모형의 출현 확률인 50%를 기준으로, 서식처 보존 가치의 중요성을 반영하는 잠재적 서식처 면적을 전체 개체수 추정의 대안으로 제시하였다. 보편성을 갖춘 모형으로부터 예측되는 잠재적 서식처는 대상종의 주요 환경조건이 급격하게 변하지 않는다면 시간에 따라 일정한 모습을 유지할 것이다. 특정종을 대상으로 개발되는 모형은 추후 서식처 복원/조성 사업에서도 원하는 생물의 정착을 유도하는데도 활용이 가능할 것으로 기대된다.
The species and size compositions of fishes in the coastal waters off Taean were determined using samples collected with a two-sided fyke net in 2008. A total of 22 species, 2,371 individuals and 1,351 kg of fish were collected during the study. Of the fish collected, semi-benthic fishes such as Sebastes schlegelii, Mugil cephalus and Chelon haematocheilus were the most abundant (77.5% and 76.4% for total number of individuals and biomass, respectively). Benthic fishes such as Pleuronectus yokohamae and Paralichthys olivaceus were collected in almost all seasons but were low in abundance (5.3% and 4.1% for total number of individuals and biomass, respectively). Seasonal migrants were plentiful; specifically, Seriola quinqueradiata was abundant in November while Konosirus punctaus was common in July. Seasonal migrants of small-sized fish have been known to be abundant in the coastal water of western Korea including the study area, but few fish less than 100 mm were collected due to the large mesh size (30 mm) of the net used.
The population variation of Spanish mackerel (Scomberomorus niphonius) according to its major prey abundance was analyzed using monthly catches of coastal set net fisheries in the southern waters off Gyeongsangnam-do and eastern waters off Gyeongsangbuk-do of Korea from 2006 to 2019. The abundance of Spanish mackerel and its prey species fluctuated almost simultaneously with time lags of +2 to -2 months between the set net fisheries in the southern and eastern waters. The generalized additive model revealed that the abundance of Spanish mackerel was influenced by its prey species such as hairtail and anchovy in southern waters, and common mackerel and horse mackerel in eastern waters. The model deviance explained 49% and 42% of Spanish mackerel abundance in southern and eastern waters respectively. These results suggest that the abundance of Spanish mackerel is affected by seasonal migratory prey fish species in the coastal areas and can be linked to their northerly migration.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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