• 제목/요약/키워드: chemotaxis

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대장균의 주화성에 근거한 박테리아 협동 최적화 (Bacteria Cooperative Optimization Based on E. Coli Chemotaxis)

  • 정희정;정성훈
    • 한국지능시스템학회:학술대회논문집
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    • 한국퍼지및지능시스템학회 2007년도 춘계학술대회 학술발표 논문집 제17권 제1호
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    • pp.241-244
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    • 2007
  • 본 논문에서는 박테리아의 주화성에 기초한 Bacteria Cooperative Optimization(BCO) 알고리즘을 소개한다. BCO는 Ant Colony Optimization (ACO)처럼 자연계에 존재하는 생명체의 행동양식을 모방하여 만든 최적화 알고리즘으로 크게 초기화, 측정, 행동결정, 이동으로 구성된다. 우리는 먼저 BCO 알고리즘을 설명하고 2차원 함수 최적화 문제를 이용하여 BCO알고리즘과 Genetic Algorithm(GA) 그리고 Bacterial Foraging for Distributed Optimization(BFO)의 성능 측정 결과를 기술한다. 실험 결과 BCO의 성능이 GA나 BFO보다 우수함을 보였다.

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Transmembrane Signaling Model of a Serine Chemotaxis Receptor

  • Kim, Kyeong-Kyu;Hisao Yokota;Kim, Sung-Hou
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 1999년도 학술발표회 진행표 및 논문초록
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    • pp.20-20
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    • 1999
  • Bacterial chemotaxis receptors are some of the simplest and most studied transmembrane receptors. Their simple signaling pathway has elements relevant for understanding the mechanisms for signal recognition, transduction through the membrane, relays among the molecules in the pathway, and adaptation to a persistent signal.(omitted)

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Induction of the Neutrophil Migration in Normal Subjects due to Asthmatic Bronchoalveolar Lavage Fluid (BALF)

  • Lee, Ji-Sook;Choi, Eugene;Yang, Eun Ju;Lee, Na Rae;Baek, Seung Yeop;Kim, Eun Jeong;Kim, In Sik
    • 대한의생명과학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.111-116
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    • 2014
  • Human neutrophils play an essential role in the innate immune response and are involved in the pathogenesis of the severe and corticosteroid-resistant asthma. Asthma is characterized by an infiltration of inflammatory cells into the lung and by a cytokine release. The aim of this study is to investigate the effects of a bronchoalveolar lavage fluid (BALF) on the chemotaxis and apoptosis of neutrophils which were isolated from healthy subjects. The BALF of subjects with asthma induces the blood neutrophil chemotaxis in the opposite of that in normal subjects. The IL-8, IL-6, and monocyte chemoattractant protein-1 (MCP-1) levels in BALF were higher in subjects with asthma than in normal subjects. The BALF of normal and asthmatic subjects has no effect on neutrophil apoptosis of BALF. MCP-1 delays the constitutive apoptosis of normal blood neutrophils, but has no effect in normal BALF neutrophils. These results may indicate that inflammatory factors secreted by the lung tissue of patients with asthma trigger the neutrophil chemotaxis and also induce the neutrophil dysregulation.

생약자원으로부터 Monocyte Chemoattractant Protein-1에 의한 Chemotaxis 저해활성 검색 (Screening of Monocyte Chemoattractant Protein-1-Induced Chemotaxis Inhibitors from Medicinal Herbs)

  • 이승웅;권오억;정미연;김영호;이현선;김영국;노문철
    • 생약학회지
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    • 제33권4호통권131호
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    • pp.352-358
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    • 2002
  • Blood monocytes are the precursors for the lipid-laden foam cells of early atherosclerotic lesions. Monocyte chemoattractant protein-1(MCP-1), a CC chemokine, and chemokine receptor 2 (CCR2) play a crucial role in the recruitment of monocytes to the vascular lesion. Using the human monocyte THP-1 cell line, we investigate the inhibitory effects of methanol extracts of 127 medicinal herbs on MCP-1 induced chemotaxis. Seven kinds of methanol extracts of medicinal herbs showed above 40% inhibitory effect with the concentration of $25{\mu}g/ml$. They were divide three fractions of $CHCI_3$, BuOH, $H_2O$ to use solvent partition. Among them, butanol extract of Junci Medulla and $CHCI_3$ extract of Clematidis Radix are showed significant inhibitory activities (above 50% inhibition) at the same concentration.

금은화(金銀花)가 천식(喘息)유발 cytokine 분비와 호산구 chemotaxis에 미치는 영향 (Lonicerae Flos contributes to the chemotaxis of eosinophils and secretion of cytokines in A549 human epithelial cells)

  • 정광진;정승기;이형구;정희재
    • 대한한방내과학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.129-142
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    • 2005
  • Objective : Asthma is known as chronic airway inflammatory disease. This inflammation is conducted by various inflammatory cells including eosihophil. Chemotaxis is one way that circulating inflammatory cells invade a specific lesion. This study examines the degree to which Lonicerae Flos inhibits eosinophil chemotaxis at pulmonary epithelium after allergic stimulation. Material and Methods : Water extracts of Lonicerae Flos and pulmonary epithelial cell lines A549(human type II-like epithelial cells) and human eosinophils were used. Cytotoxic effects of Lonicerae Flos via MTS assay were estimated, as well as the effects of Lonicerae Flos on chemokines from prestimulated A549 cells by sandwich ELISA and RT-PCR. Chemotaxis assay was conducted on prestimulated eosinophils treated with Lonicerae Flos. Result : In this study $TNF-{\alpha}$ and IL-4, $IL-l{\beta}$ were seen to induced the accumulation of chemokines mRNA in the pulmonary epithelial cell lines A549 in a dose-dependent manner. Chemokines were inhibited by Liripois Tuber in a dose-dependent manner and especially, IL-8 and ICAM-l were inhibited considerably at $100\;{\mu}g/ml$ concentration of Lonicerae Flos. The eosinophil migration is inhibited in high concentration of Lonicerae Flos in a dose-dependent manner. Conclusion : These findings indicate that the supression of the expression of chemokines can be accomplished by Lonicerae Flos treatment, raising the possibility that Lonicerae Flos might be of therapeutic value in diseases such as asthma.

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1,2-benzopyrone이 개 말초혈액 백혈구의 유주활성에 미치는 영향 (Effect of 1,3-Benzopyrone on Chemotactic Activity of Peripheral Blood Leukocytes in the Dog)

  • 김지현;강지훈;양만표
    • 한국임상수의학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.84-89
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    • 2005
  • 개 말초혈액 백혈구의 유주성에 있어서 1,2-benzopyrone의 효과를 검토하였다. 백혈구의 유주성은 Boyden chamber 변법으로 측정하였다. 1.2-benzopyrone 그 자체는 PMN과 PBMC의 유주성에 직접적인 효과를 보이지 않았다. PMN과 PBMC는 1,2-benzopyrone으로 배양한 PMN의 배양상층액에 대해서도 유주활성을 보이지 않았다. 그러나 1,2-benzopyrone으로 배앙한 PBMC의 배양상층액은 PBMC에 대해서는 유주활성을 보이지 않았으나 PMN에 대해서는 현저한 유주활성을 나타내었다. 또한 유주인자인 IL-8에 의한 PMN의 유주활성 측정 결과도 1,2-benzopyrone으로 배양한 PBMC의 배양상충액의 그것과 유사하였다. 이러한 유주활성은 anti-IL-8 pAb를 처리했을 때 PMN의 유주활성이 억제되어, 본 유주활성은 PBMC에서 분비되는 IL-8일 것으로 강하게 시사되었다. 이상의 결과로부터, 1,2-benzopyrone은 개 말초혈액 PMN의 유주성에 대하여 면역자극 작용을 가지고 있으며, 이것은 1,2-benzopyrone의 자극에 의해 PBMC에서 분비되는 IL-8양 가용성 물질에 의해 나타나는 것으로 사료되었다

Analysis and Improvement of the Bacterial Foraging Optimization Algorithm

  • Li, Jun;Dang, Jianwu;Bu, Feng;Wang, Jiansheng
    • Journal of Computing Science and Engineering
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    • 제8권1호
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    • pp.1-10
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    • 2014
  • The Bacterial Foraging Optimization Algorithm is a swarm intelligence optimization algorithm. This paper first analyzes the chemotaxis, as well as elimination and dispersal operation, based on the basic Bacterial Foraging Optimization Algorithm. The elimination and dispersal operation makes a bacterium which has found or nearly found an optimal position escape away from that position, which greatly affects the convergence speed of the algorithm. In order to avoid this escape, the sphere of action of the elimination and dispersal operation can be altered in accordance with the generations of evolution. Secondly, we put forward an algorithm of an adaptive adjustment of step length we called improved bacterial foraging optimization (IBFO) after making a detailed analysis of the impacts of the step length on the efficiency and accuracy of the algorithm, based on chemotaxis operation. The classic test functions show that the convergence speed and accuracy of the IBFO algorithm is much better than the original algorithm.

운동성 세균의 환경오염물질 감지를 위한 주화성 분자 기구 (The molecular mechanism of bacterial chemotaxis to environmental pollutants)

  • 김혜은;카토준이치;이상호;심현우;이창수
    • KSBB Journal
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    • 제24권1호
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    • pp.9-16
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    • 2009
  • 일반적으로 운동성세균은 영양분에 대하여 유인반응(정주화성)을 보인다는 것은 100여년의 주화성 연구 역사를 통하여 잘 알려져 있다. 그 중에 일부 환경오염물질을 분해 가능한 운동성 세균은 환경오염물질에 까지 유인반응을 보인다. 이 환경오염물질 감지 기능을 잘 활용한다면 '환경오염원까지 자발적으로 이동하여 그 화학물질을 분해하는 레이더 탑재형 환경정화세균의 개발이 가능할 것이다. 본 고에서는 지금까지 알려진 환경오염물질 감지를 위한 주화성 분자기구를 정리하고 향후 전망을 논하고자 한다.

세포와 흡착면간의 영향을 고려한 흡착형 세포의 3 차원 동적 해석 모델 개발 (Development of Three-dimensional Chemotaxis Model for a Single Crawling Cell, Considering the Interaction between the Cell and Substrate)

  • 송지환;김동철
    • 대한기계학회논문집A
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    • 제35권11호
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    • pp.1355-1360
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    • 2011
  • 흡착형 세포의 이동에 있어 세포와 바닥면간의 상호작용은 매우 중요한 역할을 한다. 본 논문은 주화성에 의한 흡착형 세포의 이동에 있어 세포와 바닥면과의 상호작용에 따른 영향을 보이기 위해 확산계면모델을 바탕으로 한 3 차원의 입체 모델을 제안한다. 세포와 바닥면간의 영향을 표현하기 위해 세포 주위 물질과의 관계를 고려한 경계에너지를 고려하였다. 본 연구에서 적용한 확산계면모델은 경계에너지, 주화성, 확산성을 모두 고려한 다중 메커니즘 모델로서 흡착형 세포이동의 역학적 특성을 정확히 예측하는데 있어 높은 신뢰성을 보일 것이라 기대된다.

대식세포의 식세포활동과 화학주성에 대한 인삼분획물의 영향 (Effect of Ginseng Saponin Fractions on Phagocytosis and Chemotaxis of Murine Macrophages)

  • 신은경;김세창
    • 자연과학논문집
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    • 제8권2호
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    • pp.27-34
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    • 1996
  • 쥐의 복강과 폐포 대식세포를 분리하고 배양하여 효모에 대한 식세포활동 및 화학주성을 관찰하였다. 식세포활동이 일어나는 양상을 wright-Giemsa로 염색하여 사진으로 확인하였다. 복강 대식세포의 경우 diol saponin 처리군에 의해 약 48%까지 식세포활동이 증가되었고 total saponin 처리군에 의해 약 35%까지 식세포활동이 감소되었다. 폐포 대식세포의 경우 모든 인삼분획물 처리군에 의해 최고 50%까지 섭식이 증가되었다. 화학주성은 복강 대식세포의 경우 인삼분획물 처리군 모두 약 17%까지, 폐포 대식세포에서는 diol saponin만 약 16%까지 이동되었다. actin의 증감을 SDS-PAGE로 확인해 보았으나 변화가 없었다.

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