• 제목/요약/키워드: chain components

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컨투어 트리를 이용한 삼차원 볼륨 영상의 대화형 시각화 기법 개발 (Development of Interactive 3D Volume Visualization Techniques Using Contour Trees)

  • 손봉수
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제16권11호
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    • pp.67-76
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    • 2011
  • 본 논문은 삼차원 볼륨 영상으로부터 컨투어 트리를 이용하여 볼륨 영상의 구조를 보여주고 등위면과 그 요소들을 대화형으로 선택하고 시각화하여 영상의 깊은 이해를 돕는 새로운 기법과 프로그램의 개발에 관하여 기술한다. 이 기법의 특징은 컨투어 트리를 사용자가 이해하기 쉽게 2차원 평면상에 배치하는 새로운 알고리즘과, GPU의 병렬구조를 활용하여 등위면 요소를 효율적으로 추출할 수 있도록 하는 알고리즘을 제시한 데 있다. 이러한 알고리즘의 구현을 통해 본 연구진이 개발한 프로그램은 컨투어 트리를 이용하여 등위면 요소를 추출하는 대화형 사용자 인터페이스와 기존의 등위면 및 볼륨 렌더링이 융합된 시각화를 가능하게 해주는 특징이 있다. 본 논문에서 제안하는 기법의 우수성을 검증하기 위하여, 제안된 알고리즘을 삼차원 생의학 영상에 적용하여 그 성능을 측정해 보았다. 그 결과 제안된 컨투어 트리 배치 기법에 기반한 사용자 인터페이스를 이용하여 주어진 영상의 관심 영역인 폴리펩타이드 체인과 뇌실 그리고 대퇴골을 나타내는 등위면 요소를 각각 대화형으로 선택하고 이를 기존 방법에 비교하여 3배~4배이상 빠른 속도로 계산할 수 있었다.

Changes in the components of salivary exosomes due to initial periodontal therapy

  • Arisa Yamaguchi;Yuto Tsuruya;Kazuma Igarashi;Zhenyu Jin;Mizuho Yamazaki-Takai;Hideki Takai;Yohei Nakayama;Yorimasa Ogata
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제53권5호
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    • pp.347-361
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    • 2023
  • Purpose: Exosomes are membrane vesicles that are present in body fluids and contain proteins, lipids, and microRNA (miRNA). Periodontal tissue examinations assess the degree of periodontal tissue destruction according to the probing depth (PD), clinical attachment loss (CAL), bleeding on probing, and X-ray examinations. However, the accurate evaluation of the prognosis of periodontitis is limited. In this study, we collected saliva from patients before and after initial periodontal therapy (IPT) and compared changes in the clinical parameters of periodontitis with changes in the components of salivary exosomes. Methods: Saliva was collected from patients with stage III and IV periodontitis at the first visit and post-IPT. Exosomes were purified from the saliva, and total protein and RNA were extracted. Changes in expression levels of C6, CD81, TSG101, HSP70, and 6 kinds of miRNA were analyzed by western blots and real-time polymerase chain reaction. Results: Patients with increased C6 expression after IPT had significantly higher levels of periodontal inflamed surface area (PISA), miR-142, and miR-144 before and after IPT than patients with decreased C6 expression after IPT. Patients with decreased and unchanged CD81 expression after IPT showed significantly higher PD, CAL, and PISA before IPT than after IPT. Patients with decreased and unchanged TSG101 expression after IPT had significantly higher PD before IPT than after IPT. Patients with increased HSP70 expression after IPT had significantly higher PD and PISA before and after IPT than patients with unchanged HSP70 after IPT. The expression levels of miR-142, miR-144, miR-200b, and miR-223 changed with changes in the levels of C6, CD81, TSG101, and HSP70 in the salivary exosomes of periodontitis patients before and after IPT. Conclusions: The expression levels of proteins and miRNAs in salivary exosomes significantly changed after IPT in periodontitis patients, suggesting that the components of exosomes could serve as biomarkers for periodontitis.

C6 Rat Glioma Cell에서 리튬에 의한 성장 억제와 Insulin-like Growth Factor System Components의 발현과의 관계 (Relationships of the Lithium-Induced Growth Inhibition of C6 Rat Glioma Cell to Expression of the Insulin-like Growth Factor System Components)

  • 김인애;진은정;조은정;손시환;이철영
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권4호
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    • pp.563-570
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    • 2004
  • Insulin-like growth factors(IGF)s-I과 -II ligands와 이들의 receptors 및 6종류의 IGF-binding proteins(IGFBPs)로 구성된 IGF systim은 여러 종류의 세포의 생존, 증식 및 분화에 있어서 매우 중요한 역할을 한다. 리튬은 in vitro에서 여러 종류의 세포의 생존과 증식의 조절제로 알려져 있다. 본 연구는 IGF-I, IGF-I receptor 및 IGF carrier로서 주로 IGFBP-3를 발현하는 rat C6 glioma cell에서 LiCl로 유도된 세포 생존 및 증식의 변화와 IGF system components의 발현간의 관계를 구명하고자 수행되었다. 10%혈청을 함유하는 배양액에서 0, 2mM, 혹은 5mM LiCl을 첨가하여 C6 cell을 24시간 배양했을 시 세포의 생존률과 세포 수는 리튬 첨가에 의해 영향을 받지 않았다. 그러나 72시간 배양 했을 때 C6 cell은 명백히 리튬의 첨가수준에 따라 반응하였다. 0, 2m, 5mM LiCl 첨가수준에서 72시간 배양한 C6 cell은 각각 전형적인 세포분열, 세포분열 중지 및 세포사멸 양상을 보였다. 더욱이 사멸돼가는 세포는 reverse transcription-polymerase chain reaction으로 조사한 IGF-I, IGF receptor 및 IGFBP-3의 발현수준이 저하되었다. 흥미롭게도 혈청을 첨가하지 않은 배양조건 하에서 IGFBP-3에 대한 antisense oligodeoxyribonucleotide를 10${\mu}M$ 수준의로 첨가하여 배양했을 때도 표적 mRNA는 물론 세포 수도 줄었다. 종합하자면, C6 cell에서 리튬의 독성 효과의 일부는 이 제제에 의한 IGF system components의 발현 억제 효과에 의해 매개될 소지가 크다. 이러한 관점에서 IGRBP-3는 적어도 이 세포의 정상적인 증식을 위해 꼭 필요한(‘prrmissive') 역할을 할 수 있다는 점을 시사한다.

ICT 기반 다중 가치사슬의 동적 플랫폼에서의 공존 모형: 의료서비스를 중심으로 (A Coexistence Model in a Dynamic Platform with ICT-based Multi-Value Chains: focusing on Healthcare Service)

  • 이현정;장용식
    • 지능정보연구
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    • 제23권1호
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    • pp.69-93
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    • 2017
  • ICT는 제조기반 산업사회에서 가치사슬의 효율성/효과성의 지원을 목적으로 도입되었으나 정보기반 산업사회에서는 ICT가 시장 가치 창출의 주체가 되어 다중 가치사슬의 형성 가능성을 기대하게 하였다. 즉, ICT의 발전은 공급 및 수요의 다변화와 다양성의 동인이 되면서 가치를 창출하기 시작했고, 이를 중심으로 하는 신 가치 사슬의 등장은 구 가치사슬과의 충돌의 문제를 야기하였다. 즉, 다중 가치사슬이 존재 가능한 플랫폼에서는 가치사슬 간의 충돌, 중첩, 생성, 상실 등의 동적 상황 등에 따른 신/구 가치의 창출과 소멸 등이 발생하게 된다. 예를 들어, ICT에 기반을 둔 우버택시 서비스는 신 가치사슬을 형성하여 택시서비스 시장에서 신/구 가치사슬간의 충돌을 야기했다. 제조기반 산업사회에서는 단일 가치사슬의 시장 선점이 중요하였으나, ICT 기반 융합 제품/서비스/정보가 유통되는 플랫폼에서는 시장 상황 변수의 동적 변화에 따라 다중의 가치사슬이 존재하면서 서로 충돌과 공존을 야기하게 되었다. 따라서 ICT에 기반을 둔 지능형 정보사회의 발전과 함께 시장가치 최대화를 위해 다중 가치사슬 간 충돌 최소화와 공존의 최대 가능성을 높일 수 있는 모형의 제시가 중요하다. 본 연구에서는 먼저 의료서비스 시장을 중심으로 하는 다중 가치사슬의 동적 플랫폼 형성에 대해 논의한다. 즉, 의료서비스 시장에 ICT 기반 원격 및 지능형 의료서비스 등이 구 시장에 진입함으로써 발생하는 가치사슬 간의 충돌을 최소화하고 공존 가능성을 높이기 위한 공존 요인 변수에 대해 논의 한다. 이를 위해 다중의 공급과 소비 및 서비스가 존재 가능한 다중 가치사슬이 충돌 및 중첩하는 과정에서 공존 요인 변수 등에 기반하여 가치 사슬들을 동적으로 생성/변화/소멸 및 공존하기까지 의료서비스 플랫폼에 대해 논의한다. 또한 플랫폼 내의 각 가치사슬의 생산가치의 증가와 가치사슬 간의 상호 작용에 의한 부가가치의 창출 등에 의해 플랫폼의 총 가치가 증가 될 수 있음을 논의한다. 마지막으로 공존 모형을 제안하고 실험을 통해 가치사슬 간의 공존 가능성을 제시한다.

3-Azidopropane-1,2-diol로 쇄연장된 GAP/PTMG 폴리우레탄의 상거동 (Phase Behaviors of the GAP/PTMG Polyurethanes Chain Extended with 3-Azidopropane-1,2-Diol)

  • 김형석;유종성;권정옥;김정수;이동선;노시태;장영욱;김동국;권순길
    • 공업화학
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    • 제21권4호
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    • pp.377-384
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    • 2010
  • 에너지 함유 쇄연장제인 3-azidopropane-1,2-diol (AzPD)로 쇄연장된 에너지 함유 폴리우레탄의 특성을 고찰하기 위하여 비교연구법을 수행하였다. 이를 위하여 AzPD, 1,4-BD, 또는 1,5-PD 쇄연장제를 갖는 poly(glycidyl azide)/poly(tetramethylene oxide)계 에너지 함유 세그멘티드 폴리우레탄(energetic segmented polyurethane, GAP/PTMG ESPU)을 dimethyl formamide (DMF) 용매에서 합성하여 상거동을 고찰하였다. 상거동은 fourier transform infrared.attenuated total reflection spectroscopy (ATR FT.IR), differential scanning calorimetry (DSC), 및 dynamic mechanical analysis (DMA)를 이용하여 분석하였다. ATR FT.IR spectrum 분석결과 7일 경과 시편의 GAP/PTMG AzESPU의 수소결합하지 않은 C=O 분율이 0.5로 각각 0.44 및 0.41인 GAP/PTMG BDESPU 및 GAP/PTMG PDESPU 보다 높았고, 제조 후 60일 경과 시편의 경우 0.26~0.29의 범위로 큰 차가 없었다. 제조 후 7일 경과 GAP/PTMG AzESPU 시편의 DMA curves는 무정형 고분자의 거동과 유사하였으며, GAP/PTMG BDESPU과 GAP/PTMG PDESPU는 고무평탄구간과 연성 흐름 구간을 갖는 점탄성 거동을 나타냈다. 그러나, 제조 후 60일 경과 GAP/PTMG AzESPU의 DMA curves는 GAP/PTMG PDESPU와 같이 고무평탄구간과 연성 흐름 구간을 갖는 점탄성 거동을 나타냈다. ATR FT-IR, DSC 및 DMA 분석을 이용한 상거동 고찰로부터 AzPD로 쇄연장된 GAP/PTMG ESPU는 1,4-BD 또는 1,5-PD로 쇄연장된 GAP/PTMG ESPU보다 구성성분간의 상혼합이 잘 이루어지나 적절한 조건에서 상형평에 도달되면 GAP/PTMG PDESPU와 유사한 TPE의 점탄성 거동을 나타냈다.

수문·수리학적 / 지반공학적 불확실성을 고려한 제방의 복합위험도 산정 (Estimating the compound risk integrated hydrological / hydraulic / geotechnical uncertainty of levee systems)

  • 남명준;이재영;이철우;김기영
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제50권4호
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    • pp.277-288
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    • 2017
  • 본 연구에서는 발생가능한 홍수시나리오를 기반으로 하천제방의 복합위험도를 산정하고자 하였다. 이를 위해 불확실성을 고려한 수문학적/수리학적/지반공학적의 위험도를 각각 MCMC (Markov Chain Monte Carlo), MCS (Monte Carlo Simulation), FOSM (First-Order Second Moment) 기법을 활용하여 해석하였으며, 이들 각각의 확률을 연계하여 결합확률 형태로 나타내었다. 적용대상 유역은 낙동강에 위치한 강정고령보를 기점으로 상 하류 12.5 km 구간으로 선정하였으며, 구간내의 총 6구간의 제방이 포함된다. 수문시나리오는 제방 월류가 발생하는 100년/200년 빈도 신뢰구간 상한치(97.5%)의 홍수량이 사용되었고, 이에 따른 홍수위 해석을 수행하여 월류위험도를 산정하였으며 월류가 발생하지 않는 구간에서는 침투, 사면안정, 수위급강하 등 제방의 지반공학적 위험도를 산정하였다. 기존 결정론적 위험도 해석보다 확률론적 위험도 해석에 의한 복합위험도가 제방설계에 보다 안정적, 경제적인 상승효과를 가져올 수 있을 것이며, 향후 수변구조물 설계에 지표로 사용될 수 있을 것으로 기대된다.

Effects of Chlorhexidine digluconate on Rotational Rate of n-(9-Anthroyloxy)stearic acid in Model Membranes of Total Lipids Extracted from Porphyromonas gingivalis Outer Membranes

  • Jang, Hye-Ock;Kim, Dong-Won;Kim, Byeong-Ill;Sim, Hong-Gu;Lee, Young-Ho;Lee, Jong-Hwa;Bae, Jung-Ha;Bae, Moon-Kyoung;Kwon, Tae-Hyuk;Yun, Il
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제8권2호
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    • pp.83-88
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    • 2004
  • The purpose of this study was to provide a basis for studying the molecular mechanism of pharmacological action of chlorhexidine digluconate. Large unilamellar vesicles (OPGTL) were prepared with total lipids extracted from cultured Porphyromonas gingivalis outer membranes (OPG). The anthroyloxy probes were located at a graded series of depths inside a membrane, depending on its substitution position (n) in the aliphatic chain. Fluorescence polarization of n-(9-anthroyloxy)stearic acid was used to examine effects of chlorhexidine digluconate on differential rotational mobility, while changing the probes' substitution position (n) in the membrane phospholipids aliphatic chain. Magnitude of the rotational mobility of the intact six membrane components differed depending on the substitution position in the descending order of 16-(9-anthroyloxy)palmitic acid (16-AP), 12, 9, 6, 3 and 2-(9-anthroyloxy)stearic acid (12-AS, 9-AS, 6-AS, 3-AS and 2-AS). Chlorhexidine digluconate increased in a dose-dependent manner the rate of rotational mobility of hydrocarbon interior of the OPGTL prepared with total lipids extracted from cultured OPG, but decreased the mobility of membrane interface of the OPGTL. Disordering or ordering effects of chlorhexidine digluconate on membrane lipids may be responsible for some, but not all of its bacteriostatic and bactericidal actions.

미강유중(米糠油中)의 Sterol조성(組成) (Sterol Composition of Rice Bran Oil)

  • 정태명;양민석;하봉석
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제27권2호
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    • pp.119-128
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    • 1984
  • 미강유(米糠油)의 부(不)검화물(化物)을 분석(分析)하여 sterol조성(組成)을 살펴본 결과(結果)는 다음과 같았다. 4-Desmethylsterol로서는 10개가 동정(同定)되었으며 이 중(中) sitosterol이 주성분(主成分)을 이루고 있었다. 2개의 소량성분(少量成分)인 ${\Delta}^7$-stigmastenol(3%)과 ${\Delta}^7$-avenasterol(1%)를 제외(除外)하면 모두가 ${\Delta}^5$-sterol였으며 소위(所謂) ${\Delta}^5$형(型) sterol분포(分布)를 보이고 있었다. 4-monomethylsterol fraction에서는 9개가 확인(確認)되었으나 cycloeucalenol, citrostadienol, gramisterol가 주성분(主成分)이었다. 환계(環系)의 구조가 다양(多樣)하여 sterol의 생합성경로(生合成經路)의 중간단계(中間段階)임을 보여주고 있다. 4,4-Dimethylsterol(triterpene alcohol)로서는 4개가 동정(同定)되었으나 이들은 모두 9,19-cyclopropanering을 가지고 있다. 이들중(中) sterol생합성(生合成)의 초기단계(初期段階)의 물질(物質)인 cycloartenol와 24-methylenecyclo-artenol가 이 fraction의 96%를 점(占)하고 있는 것으로 봐서 미(米)강의 4,4-dimethylsterol는 짧은 경로(經路)를 거쳐 쉽게 4-monomethylsterol로 전환(轉換)되는 것 같다. Side chain에서 E-, Z-관계(關係)인 이성체(異性體)가 4-desmethylsterol로서는 fucosterol와 ${\Delta}^5$-avenasterol가 그리고 4-monomethylsterol로서는 28-isocitrostadienol와 citrostadienol로서 각각 1쌍식이 검출(檢出)된 것으로 미루어 볼때 sterol의 생합성과정(生合成過程)에서 side chain에서 보다 환계(環系)에서 먼저 변환(變換)이 일어나는 것으로 보아진다.

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토끼고기의 지방질과 단백질에 관한 연구 -I. 지방성분을 중심으로- (Studies on Lipids and Proteins of Rabbit Meat -I. Emphasis on lipid component of rabbit meat-)

  • 이양자;안홍석
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제10권2호
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    • pp.18-26
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    • 1977
  • Among animals, the rabbit is known to be affected most sensitively by dietary changes and to be most susceptible to atherosclerosis. The exact reason is still unknown as to whether the primary cause is intrinsic (tissue itself) or extrinsic such as a blood factor which could be influenced by various dietary means. It is of utmost importance to check the nutritional quality of rabbit meat before it is accepted and adapted as a daily food item. To evaluate nutritional quality of rabbit meat, studies on various aspects of lipid components were carried out in comparison with other animal meats such as beef, pork and chicken also included in the study was the question whether the cooking and storage conditions influence the composition of fatty acids and cholesterol level. Some results and findings are listed below: 1. The content of linoleic acid (18 : 2), one of the essential fatty acids, was much higher in rabbit meat compared to the other meats. The Percentages of this Polyunsaturated fatty acids, was much higher in rabbit meat compared to the other meats. The percentages of this polyunsaturated fatty acid in terms of total fatty acids were $37.3{\pm}3.7$, 5.9, 14.5, and 21.9% for rabbit, beef, pork, and chicken respectively. The degree of unsaturation was high not only in meat but also in liver and adipose tissue of rabbit. The values of iodine number, the indication of degree of unsaturation, were known to be $102{\sim}107$, $32{\sim}47$, $46{\sim}67$, and $55{\sim}77$ for rabbit, beef, pork, and chicken respectively. Such a high proportion of this polyunsaturated fatty acid contained in rabbit meat could be harmful due to their Peroxidation effect. 2. A small amount of lower (short chain) fatty acids was isolated from rabbit tussues, which were not observed in other animal's tissues. The significance of this small amount of short chain fatty acids contained in rabbit meat remained an open question. 3. The concentration of total cholesterol in rabbit meat was similar to that of otherr but the content of esterified cholesterol was higher in rabbit meat. This was probably due to the perference of cholesterol to esterify with unsaturated fatty acids. By roasting the percentage of Polyunsaturated fatty acids was decreased while saturated palmitic acid was proportionally increased. 4 The composition of fatty acids were affected more by dry heat than moist heat. More research should be pursued to improve methods of preservation and storage to prevent possible peroxidation and rancidity problems of rabbit meat. In the meantime, the public should be informed to eat fresh rabbit meat and not to store it for a long period of time. This study was supported by the Ministry of Science and Technology in Korea.

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Modulated Gene Expression of Toxoplasma gondii Infected Retinal Pigment Epithelial Cell Line (ARPE-19) via PI3K/Akt or mTOR Signal Pathway

  • Zhou, Wei;Quan, Juan-Hua;Gao, Fei-Fei;Ismail, Hassan Ahmed Hassan Ahmed;Lee, Young-Ha;Cha, Guang-Ho
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제56권2호
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    • pp.135-145
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    • 2018
  • Due to the critical location and physiological activities of the retinal pigment epithelial (RPE) cell, it is constantly subjected to contact with various infectious agents and inflammatory mediators. However, little is known about the signaling events in RPE involved in Toxoplasma gondii infection and development. The aim of the study is to screen the host mRNA transcriptional change of 3 inflammation-related gene categories, PI3K/Akt pathway regulatory components, blood vessel development factors and ROS regulators, to prove that PI3K/Akt or mTOR signaling pathway play an essential role in regulating the selected inflammation-related genes. The selected genes include PH domain and leucine- rich-repeat protein phosphatases (PHLPP), casein kinase2 (CK2), vascular endothelial growth factor (VEGF), pigment epithelium-derived factor (PEDF), glutamate-cysteine ligase (GCL), glutathione S-transferase (GST), and NAD(P)H: quinone oxidoreductase (NQO1). Using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR), we found that T. gondii up-regulates PHLPP2, $CK2{\beta}$, VEGF, GCL, GST and NQO1 gene expression levels, but down-regulates PHLPP1 and PEDF mRNA transcription levels. PI3K inhibition and mTOR inhibition by specific inhibitors showed that most of these host gene expression patterns were due to activation of PI3K/Akt or mTOR pathways with some exceptional cases. Taken together, our results reveal a new molecular mechanism of these gene expression change dependent on PI3K/Akt or mTOR pathways and highlight more systematical insight of how an intracellular T. gondii can manipulate host genes to avoid host defense.