• Molecular & Cellular Toxicology
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• 제1권4호
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• pp.248-255
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• 2005

To understand the response of cancer cells to anticancer drugs at the gene expression level, we examined the gene expression changes in response to five anticancer drugs, 5-fluorouracil, cytarabine, cisplatin, paclitaxel, and cytochalasin D in NCI-H460 human lung cancer cells. Of the five drugs, 5-fluorouracil had the most distinctive gene expression signature. By clustering genes whose expression changed significantly, we identified three clusters with unique gene expression patterns. The first cluster reflected the up-regulation of gene expression by cisplatin, and included genes involved in cell death and DNA repair. The second cluster pointed to a general reduction of gene expression by most of the anticancer drugs tested. A number of genes in this cluster are involved in signal transduction that is important for communication between cells and reception of extracellular signals. The last cluster represented reduced gene expression in response to 5-fluorouracil, the genes involved being implicated in DNA metabolism, the cell cycle, and RNA processing. Since the gene expression signature of 5-fluorouracil was unique, we investigated it in more detail. Significance analysis of microarray data (SAM) identified 808 genes whose expression was significantly altered by 5-fluorouracil. Among the up-regulated genes, those affecting apoptosis were the most noteworthy. The down-regulated genes were mainly associated with transcription-and translation-related processes which are known targets of 5-fluorouracil. These results suggest that the gene expression signature of an anticancer drug is closely related to its physiological action and the response of caner cells.

• 폴리머
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• 제30권6호
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• pp.572-575
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• 2006

사회적 관심이 되고 있는 전력선과 휴대폰의 전자파 영향에 의한 인체 유해성 문제에 대한 상대적 개념으로 암 치료에 있어서 보조요법의 일환으로 제시될 수 있는 전자파를 이용한 온열치료법 개발을 위한 기초연구로서 고분자계의 젤리팬텀을 제작하였다. 폴리에틸렌을 비롯한 다양한 구성비를 가지는 팬텀 재료의 조합을 통해 CDMA와 PCS 대역에 적용되는 인체 두뇌의 젤리팬텀을 제작한 후 전기적 특성을 분석하였다. 본 연구는 향후 제조된 젤리팬텀을 비롯한 각종 장기의 모의인체에 대한 전기적 특성 값을 분석한 다음, 자성유체를 젤리팬텀에 주입시킨 후 실제 온도상승을 온도감지 적외선 카메라로 촬영하여 확인, 젤리팬텀의 전자기적 특성 분석을 통한 암 치료에 있어서의 새로운 방법론을 제시할 수 있을 것으로 기대된다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제15권3호
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• pp.747-752
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• 2011

마이크로어레이 분류는 전형적으로 분류기 디자인과 에러 추정이 현저하게 작은 샘플에 기반한다는 것과 교차 검증 에러 추정이 대다수의 논문에 사용된다는 주목할 만한 두 가지 특징을 소유한다. 마이크로어레이 난소 암 데이터는 수 만개의 유전자 발현으로 구성되어 있고, 이러한 정보를 동시에 분석하기 위한 어떤 체계적인 절차도 없다. 본 논문에서는, 통계에 따라 유전자의 우선순위를 정함으로써 표지유전자를 선택하였고, 널리 보급되어 있는 분류 규칙인 선형 분류 분석, 3-nearest-neighbor와 결정 트리 알고리즘은 표지 유전자를 선택한 데이터와 선택하지 않는 데이터의 분류 정확도 비교를 위해 사용되어졌다. ANOVA를 이용하여 선택된 표지 유전자를 포함하는 마이크로어레이 데이터 셋에 선영 분류분석 규칙을 적용한 결과 97.78%의 가장 높은 분류 정확도와 가장 낮은 예측 에러 추정치를 나타내었다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제17권12호
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• pp.3009-3015
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• 2013

차세대 시퀀싱(NGS)은 암에서 전사체 싱글 뉴클레오티드 변형 발견과 모든 지놈 발견을 가능하게 한다. 어느 한 위치에서 배열된 다수의 짧은 리드 시퀀스로부터 개인의 유전자형을 결정하는 가장 기초적인 방법이다. Byesian 알고리즘은 사후 유전자형 확률을 사용하여 파라미터 추정한다. 또 다른 방법인 EM 알고리즘은 최대 가능성 추정 방법을 사용해서 관측된 데이터에서 파라미터를 추정한다. 본 논문에서는 새로운 유전자형 조사 시스템을 제안하고 시퀀싱 에러 비율과 체세포 돌연 변이 상태 그리고 유전자형 확률의 사후 추정치에 관한 샘플 크기(S = 50, 100, 500)의 영향을 비교 분석하였다. 그 결과 작은 샘플 크기 50에서도 Byesian 알고리즘을 사용하여 추정한 파라미터가 EM 알고리즘 보다 더 정확하게 실제 파라미터에 근접하였다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제12권2호
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• pp.315-320
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• 2008

오늘날 인간 genome프로젝트와 같은 종합적인 연구의 궁극적 목적을 달성하기 위해서는 이들 연구로부터 획득한 대량의 관련 데이터에 대해 새로운 현실적 의미를 부여할 수 있어야 한다. 이러한 맥락에서 유전자 발현 분석 시스템과 염기 서열 분석 시스템의 구축이 포스트 genome 시대를 맞이하여 새롭게 주복을 받고 있다. 최근에는 종양의 특정 부 클래스가 특정 염색체와 관련되어 있다는 사실이 밝혀지면서, 마이크로어레이는 유전자 발현 정보를 기반으로 암의 분류와 예측을 통한 진단 분야에도 활용되기 시작했다. 본 논문에서는 암에 걸린 흰쥐 외피 기간 세포 분화 실험에서 얻어진 3840 유전자의 마이크로어레이 cDNA를 이용하여 데이터의 정규화를 거쳐 정보력 있는 유전자 목록을 별도로 추출할 수 있는 시스템을 고안하고 보다 정보력 있는 유전자를 선택하기 위해 조합 방법을 제안하였다. 그리고 제안한 시스템과 방법론의 가능성을 실험을 통해 검증하였다. 그 결과 PC-ED 조합이 98.74%의 정확도와 0.04%의 MSE를 보여 단일 유사성 척도를 사용하여 유전자 목록을 생성하고 실험을 수행한 경우보다 분류 성능이 향상되었다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제11권5호
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• pp.969-976
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• 2007

유전자 알고리즘을 이용한 다양한 특징의 분석이 필요한 퍼지 분류기의 설계 방법을 제안한다. 본 논문에서 제안한 퍼지 분류기는 퍼지 논리를 이용한 분류 부분과 유전자 알고리즘을 이용한 규칙 생성 부분으로 구성된다. 유전자 알고리즘을 이용한 규칙 생성 부분에서는 최적의 퍼지 멤버쉽 함수를 결정하고, 각 특징이 규칙에 포함되는지 포함되지 않는지의 여부도 결정하게 된다. 또한, 특정 대상에 대한 인식률을 분석하여 큰 오인식률을 갖는 부분에 세부 특징을 추가하는 방법과 문자열과 population의 최소 크기, 인식률 개선을 위한 반복적 분석 방법을 사용한다. 제안된 퍼지 분류기의 적용 예로서, 아이리스 데이터와 갑상선 종양 세포의 식별을 든다. 본 논문에서 제안한 퍼지 분류기는 아이리스 데이터에 대해 98.67%의 인식률을, 갑상선 종양 세포에 대해서 98.25%의 인식률을 얻었다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제26권4호
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• pp.533-540
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• 2022

전문의는 피부암을 조기에 발견하기 위해 피부경을 사용하여 진단하지만 다양한 형태로 인해 피부 병변을 판단하는 데 어려움이 있다. 최근 높은 성능을 보인 딥러닝을 이용한 피부 병변 분할 방법이 제안되었지만 피부와 피부 병변 경계가 명확하지 않아서 피부 병변을 분할하는 데 문제점이 있었다. 이러한 문제를 개선하기 위해 제안하는 방법은 효과적으로 피부 병변을 분할하기 위해 트랜스포머 블록을 구성하였으며, 네트워크의 각 계층마다 윤곽선 디코더를 구성하여 피부 병변을 자세히 분할하였다. 실험 결과, 제안하는 방법은 기존의 방법보다 Dice coefficient 기준 0.041 ~ 0.071, Jaccard Index 기준 0.067 ~ 0.112의 성능 향상을 보인다.

• 대한세포병리학회지
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• 제12권1호
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• pp.1-15
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• 2001

The Bethesda System (TBS) was first developed in 1988 for the need to enhance the communication of the cytopathologic findings to the referring physician in unambiguous diagnostic terms. The terminology used in this reporting system should reflect current understanding of the pathogenesis of cervical/vaginal disease so the framework of the reporting system should be flexible enough to accommodate advances in medicine including virology, molecular biology, and pathology. Three years after the Introduction of TBS, the second Bethesda workshop was held to set or amend diagnostic criteria for each categories of TBS. TBS 1991 is now widely used. The third Bethesda workshop, The Bethesda System 2001 Workshop, was held in National Cancer institute Bethesda, Maryland from April 30 to May 2, 2001. Again, the goals of this workshop were to promote effective communication and to clarify in reporting cervical cytopathology results to clinicians and to provide with the information to make appropriate decisions about diagnosis and treatment. Nine forum groups were made and there were Web-based bulletin board discussions between October, 2000 and the first week of April, 2001. On the basis of bulletin board comments and discussions, the forum moderators recommended revised terminologies in the Workshop. Hot discussions were followed after the presentation by forum moderators during the workshop. Terminologies confusing clinicians and providing no additional informations regarding patient management were deleted in the workshop to clarify the cervicovaginal cytology results. Any informations related to the patient management were encouraged to add. So 'Satisfactory for evaluation but limited by...' of 'Specimen Adequacy' catergory was deleted. Terminology of 'Unsatisfactory' was further specified as 'Specimen rejected' and 'Specimen processed and examined, but unsatisfactory'. Terminologies of 'Benign Cellular Change' and 'Within Normal Limits' were combined and terminology was changed to 'Negative for intraepithelial lesion or malignancy'. In General categorization, category 'Other' was newly inserted and the presence of 'Endometrial cells' in women over 40 years old can be checked. Although the category 'Benign Cellular Change' was deleted, the organisms or reactive changes of this category can be listed in the descriptive diagnoses. Terminologies of ASCUS and AGUS were changed to atypical squamous cell and atypical glandular cell, respectively. Diagnostic term of 'Adenocarcinoma in situ', which is highly reproducible with reliable diagnostic criteria, was newly Inserted. The category of hormonal evaluation was deleted. Criteria for liquid-based specimen were discussed. Reporting by computer-assisted cytology was discussed and terminology for automated review was newly inserted. This is not the final edition of Bethesda 2001. The final document can be prepared before the ASCCP meeting in which Consensus Guidelines for the Management on Cytology Abnormalities and Cervical Precursors will develop in September 2001.

• 대한한방종양학회지
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• 제9권1호
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• pp.1-14
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• 2003

Objective : Ikiyangeumhaedoc-tang(IYHT) has an effect of nourishing Yin(陰) and Jin(津), and has been used to cancer patient effectively. In order to prove the anticancer's and antimetastic effect of IYHT experimentally, studies were done. Methods : We evaluated the cytotoxic activity on HT-1080 cells as well as inhibitory effect on activity of DNA topoisomerase Ⅰ, cell adhesion, cell invasion and proliferation of HUVEC cells induced by bFGF and measured the expression of mRNA(uPA, MMP2, TIMP2), p-ERK protein, recovery effect of gap junctional intercellular communication by $H_{2}O_2$ and survival time of ICR mice bearing sacoma-180. Results : IYHT showed the inhibitory effect on DNA topoisomerase Ⅰ in the concentration of $100{\mu}g/ml,\;500{\mu}g/ml$ and the dosage-dependent inhibitory effect on the adhesion of HT-1080. The concentration of 1mg/ml of IYHT inhibited 15% of adhesion compared with control. IYHT decreased the expression of uPA, but not in MMP2, TIMP2 by RT-PCR and inhibited the expression of p-ERK effectively in the concentration of more than $500{\mu}g/ml.$ IYHT recovered the inhibited gap junctional intercellular communication by $H_{2}O_2$ to the level of 60% of normal control in the concentration of $400{\mu}g/ml$ but, did not extended the mean survival time of sarcoma 180-bearing mouse. Conclusions : It was concluded that IYHT could be applied usefully for prevention and treatment of human cancer, And also experimental study for the evaluation of molecular biological study and antimetastatic research would be recommended in the near future.

• Journal of Hospice and Palliative Care
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• 제20권1호
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• pp.26-36
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• 2017

목적: 본 연구의 목적은 기독교인과 불교인 말기암환자의 기도경험의 의미를 탐색하고 분석하여, 영적간호 중재 방안으로 기도의 활용가능성을 파악하는데 있다. 방법: Y 대학병원에 입원한13명의 말기암환자가 연구에 참여하였고(기독교 7명, 불교 6명), 심층면담을 통해 자료를 수집하였고, Colaizzzi(1978)가 제시한 현상학적 방법을 사용하여 자료를 분석하였다. 결과: 참여자의 기도경험의 의미는 6개의 범주로 도출되었다: 하나님과의 의사소통, 마음 다스리기, 영적성장, 죽음과 사후세계에 대한 인식, 신비한 체험, 다양한 기도 형태. 결론: 참여자들의 기도경험은 자신들이 믿는 종교의 틀 안에서 서술되었다. 기독교인들에게 기도는 하나님과의 의사소통이었고, 불교인들에게는 스스로의 마음을 다스리는 것이었다. 그들이 믿고 있는 종교에 따라 약간의 차이점은 있었지만 기도경험의 의미는 자신들이 해결할 수 없는 절박한 건강문제를 자신이 믿고 있는 하나님 혹은 자신보다 능력이 있는 신을 의지하여 해결하려 하는 절실한 간구였고, 기도를 통해 자신들을 돌아보게 되면서 다른 사람들을 생각하고 기도하는 영적성장을 경험하고 있었다. 연구결과는 말기암환자들의 기도 경험의 현상에 대한 설명과 함께 기도경험에 대해 보다 폭넓은 지식을 제공하고, 기도가 중요한 대처 방법이었음을 보여주고 있다.