Kim, Jeong-Ho;Jeoung, Myoung-Il;Hyun, Ick-Hwa;Kim, Young-Ho
The Plant Pathology Journal
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제20권3호
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pp.165-171
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2004
A total of 62 isolates of Bipolaris cactivora causing cactus stem rots were isolated from major cactus-growing areas in Korea. Colony morphology of the isolates on potato-dextrose agar was differentiated into aerial (CA) and non-aerial mycelial types (CB). CA had profound aerial mycelium with grayish brown (CA-l), light brownish (CA-2), and brownish (CA-3) pigmentations; respectively, while CB had dark brownish pigmentations. CA had conidia of less dark pigmentation and acute terminal end. CB had darker and more round-end conidia. Twenty-eight amplified fragments were produced by polymerase chain reaction (PCR) with a set of 2 random primers. The sizes of amplified DNA fragments ranged approximately from 0.1 to 2.3 kb. The isolates were classified into 2 major genomic DNA random amplified polymorphic DNA (RAPD) groups at the genomic similarity of 97.7% and 95.1%, respectively. Cluster analysis of genetic similarity among the isolates generated a dendrogram that clearly separated all isolates into SA or SB. This result suggests that there may be two morphotypes of B. cactivora in Korea that may differ in their genetic constitutes.
Proceedings of the Korean Society of Plant Pathology Conference
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한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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pp.136.1-136
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2003
Bacterial grain rot by Burkholderia gluae cause severe damage in seedling and grain of rice after heading season. This seed-borne pathogen play a role as first infection agent that could be cause disease following cropping season. Until now the direct isolation of the bacteria has some trouble by interference of other bacteria existed inside seed. This study established convenient identification method as simple isolation with KB medium from seed showing symptom and using PCR identification. By this isolation method, B. glumae was isolated from 40 to 50% in brown rice and inner hull, however, there were saprophytic bacteria and fungi outer hull. In PCR identification with Ogf4 and Ogr3 primer to these 25 isolates, the amplified products were presented in all of the collections but not in 10 saprophytic germs. The isolation rate was constant to 3 months stored seeds. This result provide a rapid and convenient isolation and identification of B. glumae.
Fungal isolates belong to Fusarium solani (perfect stage : Nectria haematococca) were isolated form pea, ginseng roots and soybean during 1995 and 1996 in Korea. Thirty-five isolates were identified as F. solani f. sp. pisi based on the morphological characteristics and their pathogenicity. Microconidia formed on the long conidiophore were ovoid or oblong sizing 5~14 x 2.5~5.0 $\mu\textrm{m}$. Macroconidia were formed on carnation leaf agar media with 4.8~5.3 x 32.0~40.7 $\mu\textrm{m}$ in size. They belonged to $\beta$-type since their 3-septate macroconidia were smaller than $5\mu\textrm{m}$ in width. Chlamydospores were smooth- or rough- walled and formed in terminal or lateral branches of hyphae, intercalary, or in chains. Most isolates were highly virulent to pea seedlings, producing dark brown or rot lesions. This is the first report of f. solani f. sp. pisi being pathogenic to pea in Korea.
A stem spot disease was observed on Gymnocalycium mihanovichii (Korean name: Bimoran), a scion of graftcactus, in major growing areas of Goyang and Eumseong, Korea during 2008 and 2009. Typical symptoms were initial blackish brown lesions produced mainly on areoles and scars of injured stem tissues, gradually becoming large black spots. A causal organism isolate CD2-7A isolated from the infected stems was identified as Alternaria alternata based on its morphological characteristics and confirmed by the DNA sequencing analysis of ITS, glyceraldehydes-3-phosphate dehydrogenase (gpd), and allergen Alt a1 (Alt a 1) genes. Artificial inoculation of the fungal isolate CD2-7A produced the same rot symptoms on the cactus stems, from which the same fungus was isolated and identified. This is the first report of the black spot caused by A. alternata in the grafted cactus.
To characterize benzimidazole-resistant and -sensitive Monilinia fructicola populations, the fungal isolates were obtained from peach plants showing brown rot and bloosom blight. Benzimidazole-sensitive isolates did not grow on potato dextrose agar(PDA) amended with $\geq1.0{\mu}g$ active ingredient(a.i.)/ml of the fungicides. However, benzimidazole-resistant isolates grew on PDA regardless of the tested concentrations of fungicides. Benzimidazole-resistant isolates did not grow on diethofencarb-PDA, but sensitive isolates grew on the same PDA. In the nucleotide sequences of $\beta$-tubulin gene, only codon 198(GAG: glutamic acid), a target site for benzimidazole, was replaced with GCG(alanine) in all of the resistant isolates, and this substitution seems to play an important role in the development of resistance. Other interesting codons such as 165(GCT), 200(TTC), and 241(GCT) were not changed among the isolates. Benzimidazole-resistant and -sensitive isolates were clustered clearly in random amplified polymerphic DNA analyses and the results revealed that low levels of genetic diversity between benzimidazole-sensitive and -resistant isolates of M. fructicola in the investigated regions.
To evaluate the natural decay durability of valuable domestic softwoods which are used for preservative treatment in our country, we carried out decay test by European standard method. Of all test wood species, Japanese larch (Larix leptolepis) showed slightly high natural decay durability compared to other 4 wood species, Japanese red pine (Pinus densiflora), pitch pine (Pinus rigida), Japanese cedar (Cryptomeria japonica), and scots pine (Pinus sylvestris). However, all of evaluated domestic softwood species in this study caused high weight losses over about 30% in heartwood by test fungus, Poria placenta. We can hardly expect a good natural decay durability from these softwood species. According to the classification of the natural durability of European standard (EN 350-1), they are classified into "Not durable" or "Slightly durable". Therefore, if using these softwoods as exterior materials, we must do preservative treatment to ensure durability.
$\beta$-Glucosidase from Laetiporus sulphureus among the enzymes related to lignocellulosic biomass degradation to sugars for using alternative bioethanol production was characterized. The highest activity of $\beta$-glucosidase was obtained on cellobiose at shaking culture. For the characterization and purification of $\beta$-glucosidase culture solution was concentrated and then purified by FPLC using ion exchange and size exclusion column. According to the results of SDS-PAGE, native PAGE and microfluidic system of purified enzyme, protein band was observed at about 132 kDa. Optimal pH and temperature of purified $\beta$-glucosi-dase were 5.0 and $60^{\circ}C$, respectively. In the kinetic properties of $\beta$-glucosidase on various substrates such as sophorose, gentiobiose and cellobiose, $K_m$ was 0.81, 1.07 and 1.70 mM, respectively.
The year of 2003 was characterized as a cool humid year. Low temperature and frequent rains were continued during March to July, resulting in 1.6 times higher rainfalls and 32% less sunshine period compared to the average yean Due to 2003's climatic condition, rice blast, and bacterial leaf blight occurred severely. Higher rainfalls caused severe epidemic of phytophthora disease and, in case of red-pepper, 55% of cultivation acreage was devastated by the disease over the country. Besides, crop diseases which become severe under cool-humid conditions, such as gray mold, sclerotinia rot, downy mildew, increased significantly compared to the previous year. In fruit trees, brown spot of apple, and pear scab occurred severely causing much yield loss.
Lee, Min-Woong;Hur, Hyeon;Chang, Kwang-Choon;Lee, Tae-Soo;Ka, Kang-Hyeon;Jankovsky, L.
Mycobiology
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제36권4호
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pp.199-202
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2008
Inonotus obliquus is a fungus that causes white heart rot on several broad-leaved species. This fungus forms typical charcoal-black, sterile conks (chaga) or cinder conks on infected stems of the birche (Betula spp). The dark brown pulp of the sterile conk is formed by a pure mycelial mass of fungus. Chaga are a folk remedy in Russia, reflecting the circumboreal distribution of I. obliquus in boreal forest ecosystems on Betula spp. and in meridional mountain forests on beech (Fagus spp.) in Russia, Scandinavia, Central Europe, and Eastern Europe. Distribution at lower latitudes in Western and Southern Europe, Northern America, Asia, Japan, and Korea is rare. Infected trees grow for many years without several symptoms of decline. The infection can penetrate through stem injuries with exterior sterile conks developing later. In the Czech Republic, cinder conk is found on birches inhabiting peat bogs and in mountain areas with a colder and more humid climate, although it is widespread in other broad leaved species over the Czech Republic. The most common hosts are B. pendula, B. pubescens, B. carpatica, and F. sylvatica. Less frequent hosts include Acer campestre, Acer pseudoplatanus, Alnus glutinosa, Alnus incana, Fraxinus excelsior, Quercus cerris, Q. petraea, Q. robur, Q. delachampii, and Ulmus sp.
In the study, we confirmed morphological traits and calculated the Risk Class of 25 mould species, including Tyromyces palustris, through decomposition rate of substrate for characteristic confirmation of injured microorganisms. We received the injured microorganisms in wood and it was pure cultivated. We observed growth traits and decomposition rate of substrate. Also, it allows the calculation of Risk Class to be worried in the case of growth in wooden cultural properties. As a result, Tyromyces palustris, representative of brown-rot, has the characteristics about decomposition rate of substrate - Cellulose ; more active(+++), Lignin ; more active(+++), Xylan ; more active(+++), Starch ; active(++). We classified Tyromcyes palustris as a first Risk Class and as a second Risk Class about Schizophyllum commune et al(9 species, See table 1. We look forward to offering standard data base for evaluating Risk Class as a matter of applying preventive conservation in wooden cultural properties through our study.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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