Mi-Jin Kim;Hyun Su Kang;Yong Ho Shin;Yong Chull Jeun
Research in Plant Disease
/
v.29
no.4
/
pp.433-439
/
2023
Bacterial leaf blight in carrot is one of the most important diseases in the worldwide. In the past decade, its introduction into Korea is causing great concern due to the potential damage to carrot crops domestically. This bacterial disease is caused by Xanthomonas hortorum pv. carotae (Xhc). This study aimed to isolate and identify bacterial strains from the soil of carrot farms in Jeju Island. The bacterial isolates showing characteristics similar with those of Xhc were selected when cultured on artificial media. Through DNA sequencing and analysis based on NCBI data, some of the selected bacterial strains were identified as Xhc. Furthermore, the bacterial strains caused the typical symptom of bacterial leaf blight after inoculation on carrot leaves. The results of this study showed the potential establishment of Xhc in the soil of Jeju Island and it may be valuable data for establish a strategy preventing the domestic spread of carrot bacterial leaf blight in the future.
Ji, Seung Hyun;Paul, Narayan Chandra;Deng, Jian Xin;Kim, Young Sook;Yun, Bong-Sik;Yu, Seung Hun
Mycobiology
/
v.41
no.4
/
pp.234-242
/
2013
A total of 62 bacterial isolates were obtained from Gomsohang mud flat, Mohang mud flat, and Jeju Island, Republic of Korea. Among them, the isolate CNU114001 showed significant antagonistic activity against pathogenic fungi by dual culture method. The isolate CNU114001 was identified as Bacillus amyloliquefaciens by morphological observation and molecular data analysis, including 16SrDNA and gyraseA (gyrA) gene sequences. Antifungal substances of the isolate were extracted and purified by silica gel column chromatography, thin layer chromatography, and high performance liquid chromatography. The heat and UV ray stable compound was identified as iturin, a lipopeptide (LP). The isolate CNU114001 showed broad spectrum activity against 12 phytopathogenic fungi by dual culture method. The semi purified compound significantly inhibits the mycelial growth of pathogenic fungi (Alternaria panax, Botrytis cinera, Colletotrichum orbiculare, Penicillium digitatum, Pyricularia grisea and Sclerotinia sclerotiorum) at 200 ppm concentration. Spore germ tube elongation of Botrytis cinerea was inhibited by culture filtrate of the isolate. Crude antifungal substance showed antagonistic activity against cucumber scleotiorum rot in laboratory, and showed antagonistic activity against tomato gray mold, cucumber, and pumpkin powdery mildew in greenhouse condition.
Immunosuppressive effects of reticuloendotheliosis virus (REV) infection in chickens were investigated. Primary antibody responses to Newcastle disease virus (strain B1) and sheep red blood cells were significantly low in chickens inoculated with the local isolate 89-74 of REV compared to those of uninfected chickens. In chickens infected with REV strain T or 89-74, blastogenesis of spleen cells and peripheral blood lymphocytes (PBL) to concanavalin A (Con A) was severely suppressed. When specific pathogen free (SPF) chickens were inoculated with the isolate, the suppressive effect was observed up to 7 weeks of age while, in the contact infected chickens, the suppression was absent. Similar suppressive effects were observed in chickens inoculated with REV strain T at 2, 3 and 4 weeks of age. When spleen cells or PBL from uninfected chickens were co-cultured with spleen cells or PBL from chickens infected with REV at 1 day-old or 2 week-old, the blastogenesis of the normal cells was suppressed. The suppressive effect of PBL from REV-infected chickens on normal lymphocytes was abrogated by the treatment with trypsin. However the suppressive activity of the REV-infected PBL was not influenced at removing machrophage from the cell suspension by incubation in plastic petri dishes. In addition to the immunosuppression, chickens infected with the REV isolate showed abnormal feather development (nakanuke), anemia, paralysis and retarded growth. Three out of 11 chickens inoculated with the isolate at day-old died between 6 and 9 weeks of age by bacterial infections.
During the traditional production process of yugwa, a Korean traditional oil-puffed snack, three bacterial isolates, 12, 37, and B1 from waxy rice slurry were characterized by using the molecular techniques, and the quality of the yugwa prepared by using three isolates was examined in relation to physical and sensory properties. Isolates 37 and B1 were identified as Lactobacillus sp. by 16S rDNA sequence analysis, while isolate 12 was as Bacillus amyloliquefaciens by gyrA sequence analysis. Waxy rice inoculated with isolate 12 demonstrated the lowest hardness and the highest peak and [mal viscosity. Yugwa prepared from isolate 12-inoculated waxy rice indicated the lowest hardness and the highest volume expansion, the key characteristics of yugwa. This result presents the possibility for the use of a starter in the commercial production of yugwa and other rice-based snacks.
Attempts to isolate the naturally occurring ultra-violet resistant bacteria from environmental sources were made. The isolates, designated No.29, 100, and 107, among numbers of bacterial isolates revealed a remarkable resistance to UV ray, whose degree of resistance in dose/response kinetics was comparable to that of an endospore-former, Bacillus subtilis. In a range of 100-300 $Jm^{-2}$/min of UV irradiation, the isolates exhibited 500-1000 fold resistance compated with E. coli. The isolated appeared to possiss cell-bound pigment of organge or crimson-red. The isolate 29 is spherical in pairs or tetrads, whereas the isolates 100 and 107 are rod. All are Gram-gositive bacteria and seemed to be non-endospore-bearer. A number of biochemical studies pursued on the isolates suggested that they are quite different to each other. Electron microscopic examination and the physiological characters of the isolate 29 suggested that this UV resistant spherical bacterium might be one species of Deinococcus, probably Deinococus radiophilus. Since there is no documents on UV resistant, Gram-positive, non-sporeformer bacillus so far, the isolates 100 and 107 might be turned out as new kinds of UV resistant bacteria occurring in nature by further investigation.
Putra, Ludwinardo;Natadiputri, Griselda Herman;Meryandini, Anja;Suwanto, Antonius
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.29
no.6
/
pp.944-951
/
2019
Lipases are industrial enzymes that catalyze both triglyceride hydrolysis and ester synthesis. The overexpression of lipase genes is considered one of the best approaches to increase the enzymatic production for industrial applications. Subfamily I.2. lipases require a chaperone or foldase in order to become a fully-activated enzyme. The goal of this research was to isolate, clone, and co-express genes that encode lipase and foldase from Burkholderia territorii GP3, a lipolytic bacterial isolate obtained from Mount Papandayan soil via growth on Soil Extract Rhodamine Agar. Genes that encode for lipase (lipBT) and foldase (lifBT) were successfully cloned from this isolate and co-expressed in the E. coli BL21 background. The highest expression was shown in E. coli BL21 (DE3) pLysS, using pET15b expression vector. LipBT was particulary unique as it showed highest activity with optimum temperature of $80^{\circ}C$ at pH 11.0. The optimum substrate for enzyme activity was $C_{10}$, which is highly stable in methanol solvent. The enzyme was strongly activated by $Ca^{2+}$, $Mg^{2+}$, and strongly inhibited by $Fe^{2+}$ and $Zn^{2+}$. In addition, the enzyme was stable and compatible in non-ionic surfactant, and was strongly incompatible in ionic surfactant.
Lee, Sang Jun;Park, Eun Hee;Han, Yun Hee;Kim, Young Ok;Park, Seong Wook
Fisheries and Aquatic Sciences
/
v.16
no.1
/
pp.41-44
/
2013
We developed a poly(butylene succinate) (PBS) indicator plate and isolated a marine bacterial colony capable of biodegrading PBS based on the appearance of a clear zone. Growth of the PBS-2 isolate was observed over 4 days of culture at $37^{\circ}C$ in PBS-tryptone basal liquid medium, but not in PBS-deprived control medium. The PBS-2 isolate was named Paenibacillus sp. PBS-2 based on 16S rDNA gene sequencing. The PBS-biodegrading marine bacterium isolated in this study will contribute to the effective management of PBS waste problems in marine environments.
A promising biocontrol agent, A2l-4, against Phytophthora blight of pepper was selected from 351 bacterial isolates collected from rhizosphere soils and roots of onion (Allium fistulosum L.). The isolate A21-4 was identified as Serratia plymuthica based on its 16S rRNA sequence and key characteristics as compared with that of an authentic culture of S. plymuthica (ATCC No. 6109D01). The isolate readily colonized on roots of various crops including pepper when inoculated on seed and not. Strain A2l-4 showed narrow spectrum of antibiotic activity, as revealed in its strong inhibitory activity to the genera Pythium and Phytophthora, but not to Fuasrium and Rhizoctonia. In pot experiments, none of the pepper seedlings treated with A2l-4 were infected by Phytophthora capsici, while 86% of the control plants were killed by the pathogen.
Twelve bacterial strains capable of growing on phenol minimal medium were isolated from iron foundry activated sludge by enrichment culture, and amount them, one isolate which was the best in cell growth and phenol degradation was selected and identified as Acinetobacter junii POH. The optimal temperature, initial pH and phenol concentration in the above medium were 3$0^{\circ}C$, 7.5 and 1000 ppm, respectively. Cell growth of Acinetobacter junii POH dramatically increased 20 hrs cultivation-time and reached a almost stationary phsae 40 hrs cultivation-time then phenol was degraded about 98%. Cell growth was inhibited y phenol at concentrations over 1500 ppm. The isolate was resistant to several antibiotics as well as various heavy metal ions. The growth-limiting log P value of Acinetobacter junii POH on organic solvents was 2.9 in the LB medium. Therefore, it is suggested that Acinetobacter junii POH could be effectively used for the biological treatment of wastewater containing the presence of heavy metal ions and organic solvents.
Young Ho Joo;Seung Min Jeong;Jiyoon Kim;Myeong Ji Seo;Chang Hyun Baeg;Seong Shin Lee;Byeong Sam Kang;Ye Yeong Lee;Jin Woo Kim;Sam-Churl Kim
Journal of The Korean Society of Grassland and Forage Science
/
v.43
no.3
/
pp.148-155
/
2023
This study was aimed to isolate bacterial inoculants producing chitinase and evaluate their application effects on corn silage. Four corn silages were collected from four beef cattle farms to serve as the sources of bacterial inoculants. All isolates were tested against Fusarium graminearum head blight fungus MHGNU F132 to confirm their antifungal effects. The enzyme activities (carboxylesterase and chitinase) were also measured to isolate the bacterial inoculant. Based on the activities of anti-head blight fungus, carboxylesterase, and chitinase, L. buchneri L11-1 and L. paracasei L9-3 were subjected to silage production. Corn forage (cv. Gwangpyeongok) was ensiled into a 10 L mini silo (5 kg) in quadruplication for 90 days. A 2 × 2 factorial design consists of F. graminearum contamination at 1.0104 cfu/g (UCT (no contamination) vs. CT (contamination)) and inoculant application at 2.1 × 105 cfu/g (CON (no inoculant) vs. INO (inoculant)) used in this study. After 90 days of ensiling, the contents of CP, NDF, and ADF increased (p<0.05) by F. graminearum contamination, while IVDMD, acetate, and aerobic stability decreased (p<0.05). Meanwhile, aerobic stability decreased (p<0.05) by inoculant application. There were interaction effects (p<0.05) on IVNDFD, NH3-N, LAB, and yeast, which were highest in UCT-INO, UCT-CON, CT-INO, and CT-CON & INO, respectively. In conclusion, this study found that mold contamination could negatively impact silage quality, but isolated inoculants had limited effects on IVNDFD and yeast.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.