Kim, Ji-Young;Kim, Youngsoo;Lee, Kyoung;Kim, Chi-Kyung
Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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제6권1호
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pp.56-60
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2001
The pcbC gene encoding (4-chloro-)2,3-dihydroxybiphenyl dioxygenase was cloned from the genomic DNA of Pseudomonas sp. P20 using pKT230 to construct pKK1. A recombinant strain, E. coli KK1, was selected by transforming the pKK1 into E. coli XL1-Blue. Another recombinant strain, Pseudomonas sp. DJP-120, was obtained by transferring the pKK1 of E. coli KK1 into Pseudomonas sp. DJ-12 by conjugation. Both recombinant strains showed a 23.7 to 26.5 fold increase in the degradation activity to 2,3-dihydroxybiphenyl compared with that of the natural isolate, Pseudomonas sp. DJ-12. The DJP-120 strain showed 24.5, 3.5, and 4.8 fold higher degradation activities to 4-chlorobiphenyl, catechol, and 3-methylcatechol than DJ-12 strain, respectively. The pKK1 plasmid of both strains and their ability to degrade 2,3-dihydroxybiphenyl were stable even after about 1,200 generations.
Khan, Minhaj Ahmad;Hamid, Rifat;Ahmad, Mahboob;Abdin, M.Z.;Javed, Saleem
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제20권11호
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pp.1597-1602
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2010
Chitinase is one of the most important mycolytic enzymes with industrial significance. This enzyme is produced by a number of organisms including bacteria. In this study, we describe the optimization of media components with increased production of chitinase for the selected bacteria, Stenotrophomonas maltophilia, isolated from soil. Different components of the defined media responsible for influencing chitinase secretion by the bacterial isolate were screened using Plackett-Burman experimental design and were further optimized by Box-Behnken factorial design of response surface methodology in liquid culture. Maximum chitinase production was predicted in medium containing 4.94 g/l chitin, 5.56 g/l maltose, 0.62 g/l yeast extract, 1.33 g/l $KH_2PO_4$, and 0.65 g/l $MgSO_4{\cdot}7H_2O$ using response surface plots and the point prediction tool of the DESIGN EXPERT 7.1.6 (Stat-Ease, USA) software.
A bacterial strain, which showed the high protease activity at low temperature and the high tolerance for the surfactant, was isolated from soil and identified as Xanthomonas sp. YL-37. The optimal temperature, initial pH, and cultivation time for the production of the alkaline protease by Xanthomonas sp. YL-37 were 20$\circC , 11.0, and 84 hours, respectively. In the jar fermenter culture of Xanthomonas sp. YL-37, the alkaline protease activity was about 15,000 DU/ml/-broth after cultivating for 108 hours. The optimal pH and temperature for the protease activity were 70$\circC and 11.0, respectively. The protease was relatively stable at the pH range of 7.0~12.0 and at the temperatures below 50$\circC . The protease activity at 20$\circC was about the level of 40% of its activity at 70$\circC . The enzyme was suggested as a serine protease because the enzyme activity was inhibited by phenylmethane sulfonyl fluoride, a serine modifier.
It is well known that actinomycetes would be useful for screening of biologically active compounds. Not only to isolate diverse actinomycete strains but to ferment those strains effectively would be important. Seven hundred and forty six strains were isolated from Cheju province, 216 strains were from Chungnam province, 158 strains were from the natural caves at Chungbuk and Kangwon provinces and 202 strains were from Chungwon area at Chungbuk province. All of these 1,322 strains were fermented on a small scale using two different media and tested for their antimicrobial activities against four bacterial strains and one yeast strain. As the result, 12.3% of those isolates were active against Staphylococcus aureus KCTC 1916, 7.6% were Staphylococcus aureus KCTC 1928, 3.9% were Escherichia coli KCTC 1924, 3.0% were Candida albicans KCTC 1940, and 2.2% were Salmonella typhimurium KCTC 1926. About 40% of those isolates showed antimicrobial activities at both two media but the others showed at either one. According to the genus of isolated strains, Streptomyces and Micromonospora showed activities with higher frequencies than others.
A bacterial strain, designated T116, degrading terephthalic acid (TPA) was isolated from the soil around Taegu industrial area into which dye works wastewater flow. The isolate was identified as pseudomonas sp. based on its morphological and physiological characteristics. Degradation of TPA by the strain T116 was confirmed with UV scanning and HPLC. About 90% and 98% of TPA were degraded after 36 and 60 hours, respectively, during the culture in a liquid medium containing 0.1% TPA. Addition of KH2PO4 at a final concentration of 100ppm enhanced the chemical oxygen demand (COD) removal rate about 50% from dye works wastewater by Pseudomonas sp. T116. Optimum pH and temperature for COD reduction from wastewater were 7.0 and 3$0^{\circ}C$, respectively. The bacterium was applied to the continuous culture for the treatment of dye works wastewater whose TPA concentration and CODMn were 2,200ppm and 1,620ppm, respectively. It was observed that 90-95% of COD was eliminated after 4 days culture in the continuous culture with a retention time of 37 or 47 hours.
Ahmed, Mohammed Dahiru;Taher, Muhammad;Maimusa, Alhaji Hamusu;Rezali, Mohamad Fazlin;Mahmud, Mohammed Imad Al-deen Mustafa
Natural Product Sciences
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제23권1호
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pp.5-8
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2017
An antimicrobial compound has been isolated from the leaves of Glochidion superbum. The compound was determined as methyl 3, 4, 5-trihydroxybenzoate (methyl gallate), based on ultraviolet (UV), infrared (IR), nuclear magnetic resonance (NMR) and mass spectroscopy (MS) analysis. The isolated compound exhibited potent antimicrobial activity against three clinical isolates of methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) by qualitative agar disc diffusion method and quantitative broth dilution method. Agar disc diffusion was done in a dose-dependent manner for each bacterial isolate at disc potencies of 25, 50, 100, and $150{\mu}g/disc$. The zones of inhibition were on average equal to 12.27, 14.20, 15.43, and 24.17 mm respectively. The inhibition zones were compared with that of vancomycin disc at $30{\mu}g$ as a reference standard. The MIC and MBC values were $50{\mu}g/ml$ and $100{\mu}g/ml$ respectively. The results of anti MRSA activity were analyzed using one-way ANOVA with Turkey's HSD and Duncan test. In conclusion, methyl gallate which was isolated from G. superbum showed the inhibition activity against methicillin resistant S. aureus.
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is one of the severe nosocomial infectious agents. The traditional diagnostic methods including biochemical test, antibiotic susceptibility test and PCR amplification are time consuming and require much work. The Surface enhanced Raman spectroscopy (SERS) biosensor is a rapid and powerful tool for analyzing the chemical composition within a single living cell. To identify the biochemical and genetic characterization of clinical MRSA, all isolates from patients were performed with VITEK2 gram positive (GP) bacterial identification and Antibiotic Susceptibility Testing (AST). Virulence genes of MRSA also were identified by DNA based PCR using specific primers. All isolates, which were placed on a gold coated nanochip, were analyzed by a confocal Raman microscopy system. All isolates were identified as S. aureus by biochemical tests. MRSA, which exhibited antibiotic resistance, demonstrated to be positive gene expression of both femA and mecA. Furthermore, Raman shift of S. aureus and MRSA (n=20) was perfectly distinguished by a confocal Raman microscopy system. This novel technique explained that a SERS based confocal Raman microscopy system can selectively isolate MRSA from non-MRSA. The study recommends the SERS technique as a rapid and sensitive method to detect antibiotic resistant S. aureus in a single cell level.
국내에서 저온기에 하천 및 하천형 호수에서 대발생하는 소형원반 규조 stephanodiscus hantzschii 제어를 위하여 팔당호 상류인 경안천 수역에서 세균 Pseudomonas putida 및 섬모충 Stentor roeseli 를 각각 분리하고, 이들의 단일 및 혼합적용시 조류제어효과를 조사하였다. 세균단일처리군에서는 접종 7일만에 98%이상의 규조를 제거한 반면, 섬모충 단일 처리군에서는 약 80%정포를 제어하였다. 두 생물제재를 혼합적용한 경우, 배양 5일만에 배양계내에서 더 이상 규조가 관찰되지 않았다. 이 결과는 살조세균과 섬모충의 두 생물재제 혼합적용이 규조 Stephanodiscus hantzschii 대발생을 제어하는데 매우 효과적이며 현장적용 가능성이 높다는 것을 제시한다.
Silver nanoparticles production by the green chemistry approach was investigated using an isolated marine actinomycetes strain. The isolated strain was identified as Streptomyces albidoflavus based on chemotaxonomic and ribotyping properties. The strain revealed production of silver nanoparticles both extracellular and intracellularly. Surface Plasmon Resonance analysis with the function of time revealed that particle synthesis by this strain is reaction time dependent. The produced particles were spherical shaped and monodispersive in nature and showed a single surface plasmon resonance peak at 410 nm. Size distribution histograms indicated production of 10-40-nm-size nanoparticles with a mean size of 14.5 nm. FT-IR spectra of nanopartilces showed N-H, C-H, and C-N stretching vibrations, denoting the presence of amino acid/peptide compounds on the surface of silver nanoparticles produced by S. albidoflavus. Synthesized nanoparticles revealed a mean negative zeta potential and electrophoretic mobility of -8.5 mV and -0.000066 $cm^2/Vs$, respectively. The nanoparticles produced were proteinaceous compounds as capping agents with -8.5 mV zeta potential and revealed antimicrobial activity against both Gram-negative and -positive bacterial strains. Owing to their small size, these particles have greater impact on industrial application spectra.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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